Система учета научной деятельности (ASSA)

Вход

РНФ Лаборатории

Внебюджетные подразделения

Подразделения

Научные результаты

Сотрудники

Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода:

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

2016

2017

Публикации Конференции Гранты

Публикации

2017	Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Программные системы: теория и приложения, 2017, декабрь 2016, 1-12
	Эффекты непродолжительного воздействия лития на экспрессию антиапоптозного белка Bcl-xL в коре и гиппокампе в ответ на острый стресс Дыгало Н.Н., Баннова А.В., Сухарева Е.В., Шишкина Г.Т., Айриянц К.А., Калинина Т.С. Биохимия, 2017, 2017, том 82, вып. 3, с. 487 – 493.
	Effects of short-term exposure to lithium on antiapoptotic Bcl-xL protein expression in cortex and hippocampus of rats after acute stress Dygalo N.N., Bannova A.V., Sukhareva E.V., Shishkina G.T., Ayriyants K.A., Kalinina T.S. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 345-350. / Original Russian Text © N. N. Dygalo, A. V. Bannova, E. V. Sukhareva, G. T. Shishkina, K. A. Ayriyants, T. S. Kalinina1,2, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 487-493.
	Оптогенетическая активация нейрона повышает в нем уровень антиапоптозного белка Bcl-xL Ланшаков Д.А., Дрозд У.С., Дыгало Н.Н. Биохимия, 2017, Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 481 – 486
	Optogenetic stimulation increases level of antiapoptotic protein Bcl-xL in neurons Lanshakov DA, Drozd US, Dygalo NN BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 340-344. Original Russian Text © D. A. Lanshakov, U. S. Drozd, N. N. Dygalo, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 481-486.
	Анализ вклада изменения нейротрофического обеспечения мозга в развитие признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS Е.А. Рудницкая, Н.Г. Колосова, Н.А. Стефанова Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 460 – 469
	МОЛЕКУЛЯРНОКЛЕТОЧНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ПАТОГЕНЕЗА СПОРАДИЧЕСКОЙ ФОРМЫ БОЛЕЗНИ АЛЬЦГЕЙМЕРА: ИССЛЕДОВАНИЯ in vivo НА МОДЕЛЯХ ГРЫЗУНОВ Н.В. Гуляева, Н.В. Бобкова, Н.Г. Колосова, А.Н. Самохин, М.Ю. Степаничев, Н.А. Стефанова Биохимия, 2017, том 82, вып. 10, с. 1427 – 1443
	Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекс ExpGene А. М. Спицина, А. О. Брагин, А. И. Дергилев, И. В. Чадаева, Н. Н. Твердохлеб, Э. Р. Галиева, Л. Э. Табиханова, Ю. Л. Орлов Програмные системы: теория и приложения, 2017, 2(33), С. 33-56
	Разные этапы развития соцветия пшеницы: Изучение генетического контроля и физиологии. Добровольская О.Б. Бадаева Е.Д. Попова К.И. Красников А.А. Мартинек П. ActaNaturae, 2017, том 9 стр.59
	A study of structural properties of gene network graphs for mathematical modeling of integrated mosaic gene networks Olga V. Petrovskaya, Evgeny D. Petrovskiy, Inna N. Lavrik and Vladimir A. Ivanisenko Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2017
	A study of structural properties of gene network graphs for mathematical modeling of integrated mosaic gene networks Olga V. Petrovskaya, Evgeny D. Petrovskiy, Inna N. Lavrik and Vladimir A. Ivanisenko Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2017
	A study of structural properties of gene network graphs for mathematical modeling of integrated mosaic gene networks Olga V. Petrovskaya, Evgeny D. Petrovskiy, Inna N. Lavrik and Vladimir A. Ivanisenko Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2017
	A study of structural properties of gene network graphs for mathematical modeling of integrated mosaic gene networks Olga V. Petrovskaya, Evgeny D. Petrovskiy, Inna N. Lavrik and Vladimir A. Ivanisenko Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2017
	A study of structural properties of gene network graphs for mathematical modeling of integrated mosaic gene networks Olga V. Petrovskaya, Evgeny D. Petrovskiy, Inna N. Lavrik and Vladimir A. Ivanisenko Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2017
2016	Механизмы регуляции передачи сигнала этилена у растений Землянская Е.В., Омельянчук Н.А., Ермаков А.А., Миронова В.В. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, Принята в печать. DOI: 10.18699/VJ15.105
	Введение оптогенетических векторов в мозг неонатальным животным для исследования функции нейронов в последующие периоды онтогенеза Д.А. Ланшаков, У.С. Дрозд, Т.А. Запара, Н.Н. Дыгало Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, Том 20, №2
	Stress and hypertensive disease: adrenals as a link. Experimental study on hypertensive ISIAH rat strain Yegor V. Antonov, Yuriy V. Alexandrovich, Olga E. Redina, Michael A. Gilinsky & Arcady L. Markel Clinical and Experimental Hypertension, 2016, Volume 38, Issue 5, 415-423
	Компьютерный анализ совместной локализации сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq Дергилев А.И., Спицина А.М., Чадаева И.В., Свичкарев А.В., Науменко Ф.М., Кулакова Е.В., Витяев Е.Е., Чен М., Орлов Ю.Л. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, 20(6):770-778. DOI 10.18699/VJ16.194
	Analysis of differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals Babenko V.N., Bragin A.O., Spitsina A.M., Chadaeva I.V., Galieva E.R., Orlova G.V., Medvedeva I.V., Orlov Y.L. Journal of Integrative Bioinformatics, 2016, 13(4):292. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-292
	ЗНАЧИМОСТЬ ГЕНОМНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ В ИСТОРИИ ФОРМИРОВАНИЯ ДОМАШНИХ ЖИВОТНЫХ Ларкин Д.М., Юдин Н.С. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2016, № 4, стр. 123-128.
	Molecular determinants of the adrenal gland functioning related to stress-sensitive hypertension in ISIAH rats Larisa A. Fedoseeva, Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Yury V. Alexandrovich, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel, Olga E. Redina BMC GENOMICS, 2016, 2016, 17(Suppl 14):989 DOI 10.1186/s12864-016-3354-2
	Практическое руководство по редактированию геномов системой CRISPR/Cas9 Мензоров А.Г., Лукьянчикова В.А., Кораблев А.Н., Серова И.А., Фишман В.С. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, 2016;20(6):930-944. DOI 10.18699/VJ16.214
	Структурное моделирование мод связывания НАД+ с ПАРП-1 Иванисенко Н.В., Жечев Д.А., Иванисенко В.А. Вавиловский журнал генетики и селекции., 2016
2015	Methodological aspects of read mapping and assembly of transcriptomes derived from the brain tissue samples of Rattus norvegicus Menshanov, P.N., Dygalo, N.N. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, 5(4):401-406
	Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК Спицина А.М., Орлов Ю.Л., Подколодная Н.Н., Свичкарев А.В., Дергилев А.И., Чен М., Кучин Н. В., Черных И. Г., Глинский Б. М. Программные системы: теория и приложения, 2015, 6:1(23), c. 157–174
	Программы анализа геномных данных секвенирования, полученных на основе технологий ChIP-seq, ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е. В., Спицина А. М., Орлова Н. Г., Дергилев А. И., Свичкарев А. В., Сафронова Н. С., Черных И. Г., Орлов Ю. Л. Программные системы: теория и приложения, 2015, 2(25), c. 129–148
	Altered Hippocampal Neurogenesis and Amygdalar Neuronal Activity in Adult Mice with Repeated Experience of Aggression Dmitry A. Smagin, June-Hee Park, Tatyana V. Michurina, Natalia Peunova, Zachary Glass, Kasim Sayed, Natalya P. Bondar, Irina N. Kovalenko, Natalia N. Kudryavtseva and Grigori Enikolopov Frontiers in Neuroscience, 2015, volume 9, article 443, doi: 10.3389/fnins.2015.00443
2014	МЕТОДОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ КАРТИРОВАНИЯ РИДОВ И СБОРКИ ТРАНСКРИПТОМА ДЛЯ ТКАНЕЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ Rattus norvegicus. Меньшанов П.Н. , Дыгало Н.Н. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2014, Т. 18. №4/3. С. 1231-1238.
	Extended effect of chronic social defeat stress in childhood on behaviors in adulthood Kovalenko IL, Galyamina AG, Smagin DA, Michurina TV, Kudryavtseva NN, Enikolopov G PLoS One, 2014, 9(3): e91762
2006	Comparative mapping of cattle chromosome 19: cytogenetic localization of 19 BAC clones Larkin D.M., Astakhova N.M., Prokhorovich M.A., Lewin H.A., Zhdanova N.S. CYTOGENET GENOME RES, 2006, 112, 3-4, 235-240
	Comparative mapping of mink chromosome 8p: in situ hybridization of seven cattle BAC clones Larkin D.M., Prokhorovich M.A., Astakhova N.M., Zhdanova N.S ANIM GENET, 2006, 37, 229-231

Конференции

2017	ГЕНДЕР-СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ВЛИЯНИЕ ЛЕПТИНА ВО ВРЕМЯ БЕРЕМЕННОСТИ НА РАЗВИТИЕ ОЖИРЕНИЯ В ПОТОМСТВЕ И ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ В ПЛАЦЕНТАХ И МОЗГЕ ПЛОДОВ У МЫШЕЙ Макарова Е.Н., Кожевникова В.В., Денисова Е.И. 23 Съезд Физиологического общества им. И. П. Павлова
	Population structure and phylogeny of the Russian cattle breeds determined by whole genome genotyping. Yudin N.S., Yurchenko A., Aitnazarov R., Plyusnina A., Larkin D.M. Plant & Animal Genome XXV Conference
	Different evolutionary patterns of the universal flavonoid biosynthesis pathway genes in monocot and dicot plant species O.Yu. Shoeva, A.Yu. Glagoleva, E.K. Khlestkina БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	Long-lasting consequences of early life stress in mice: changes in gene expression and H3K4me3 profile. Bondar N.P. , Reshetnikov V.V., Studenikina A.A., Ryabushkina Yu.A., Lepeshko A.A., Ershov N.I., Merkulova T.I. 2017 Annual Meeting, Genes, Brain and Behavior
	Early life stress promotes the changes in whole-genome distribution of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice. Bondar N.P., Ershov N.I., Lepeshko A.A., Reshetnikov V.V., Ryabushkina Yu.A., Merkulova T.I. БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	THE IMPACT OF EARLY LIFE STRESS ON DISTRIBUTION OF H3K4ME3 HISTONE MODIFICATION IN MURINE PREFRONTAL CORTEX: THE ROLE IN GENE EXPRESSION V.V. Reshetnikov, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, Yu.A. Ryabushkina, A.A. Studenikina, N.P. Bondar, T.I. Merkulova 24th Multidisciplinary international neuroscience and biological psychiatry "stress and behavior" conference
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на экспрессию генов глюкокортикоидной и глутаматной систем в головном мозге мышей В.В. Решетников, А.А. Студеникина, Ю.А. Рябушкина, Т.И. Меркулова, Н.П. Бондарь БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на экспрессию генов глюкокортикоидной и глутаматной систем в гипоталамусе у самцов мышей Студеникина А. А., Решетников В. В 55-я Международная научная студенческая конференция МНСК-2017
	Анализ связи функциональных изменений миокарда при старении с изменением экспрессии альфаB-кристаллинов и их фосфорилирования Муралёва Н.А., Девяткин В.А. XXIII Съезд Физиологического общества им. И.П. Павлова.
	Поиск полиморфизмов, потенциально ассоциированных с дисфункцией митохондрий у преждевременно стареющих крыс OXYS В.А. Девяткин, Н.А. Муралёва, Н.Г. Колосова Беляевские чтения : Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Анализ транскрипционной регуляции промотора гена орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana A.A. Егорова, В.В. Горелова, С.В. Герасимова БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
2016	Computer Analysis of RNA-seq Data of Laboratory Rats with Aggressive Behavior Anatoly O. Bragin*, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel SocBin Bioinformatics 2016
	Search for regulatory context signals in genomic DNA E.E.Vityaev, A.I.Dergilev, I.V.Chadaeva, Y.Y.Vaskin, A.M.Spitsina, E.V.Kulakova, O.V.Vishnevsky, Y.L.Orlov XVIII Международная научно-техническая конференция Нейроинформатика 2016
	Analysis of aggressive behavior by whole RNA sequencing in brain compartments V.N. Babenko, A.O. Bragin, I.V. Medvedeva, I.V. Chadaeva, A.I. Dergilev, A.M. Spitsyna, N.N. Kudriavtseva, A.L. Markel, Y.L. Orlov Нейроинформатика 2016
	Genetic and molecular mechanisms crucial for hypertension development in the ISIAH rats. O.E. Redina, L.O. Klimov, M.A. Ryazanova, L.A. Fedoseeva, T.O. Abramova, Yu.V. Alexandrovich, S.E. Smolenskaya, Ye.V. Antonov, N.I. Ershov, V.M. Efimov, A.L. Markel. Десятая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology), BGRS\SB-2016.
	Purple-grained barley: marker-assisted devlopment of NILs and genetic dissection Kukoeva T., Gordeeva E., Glagoleva A., Shoeva O., Börner A., Khlestkina E The 1st International Workshop “Plant Genetics and Genomics for Food Security”
	Влияние раннего постнатального стресса на профиль распределения метки активного хроматина H3K4me3 Решетников В.В.,Лепешко А.А., Ершов Н.И., Студеникина А.А., Бондарь Н.П. VII Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология живых существ»
2015	CTCF binding sites and gene expression analysis in genome scale by sequencing data Kulakova E.V., Spitsina A.M., Safronova N.S., Svichkarev A.V., Dergilev A.I., Ponomarenko M.P., Babenko V.N., Hong P., Li G., Orlov Y.L. 7th International Young Scientists School “Systems biology and bioinformatics” SBB-2015
	Analysis of gene location relative to chromosome loops and topological chromosome domains by ChIA-PET and Hi-C Orlov Y.L., Kulakova E.V., Spitsina A.M., Svichkarev A.V., Babenko V.N., Li G. 3D Genome Workshop
	Differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals with aggressive and tolerant behaviors Anatoly O. Bragin, Natalia N. Kudryavtseva, Arcady L. Markel, Yuriy L. Orlov, Ekaterina V. Kulakova, Anastasia M. Spitsina MCCMB-15
	Statistical analysis of chromosome contacts by ChIA-PET and Hi-C technologies Orlov Y.L., Kulakova E., Spitsina A., Babenko V. Future of Biomedicine 2015 Conference
	Computer Tools for Gene Expression Data Processing and Correlation Analysis Babenko V.N., Orlov Y. L., Spitsyina A. M. Podkolodnaya N. Computational systems biology and bioinformatics (CSBio 2015)
	Gene Expression Analysis in Brain Areas of Laboratory Rats with Aggressive Behavior by RNA-seq Data Anatoly O. Bragin, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel CSBio’2015
2014	Implications of hostile environment and social instability in adolescent mice Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Smagin D.A., Michurina T.V., Enikolopov G., Kudryavtseva N.N. BGRS\SB-2014
	Repeated positive fighting experience in male mice: the tool for the study of movement disorders Kudryavtseva N.N., Smagin D.A., Kovalenko I.L.,Vishnivetskaya G.B., Galyamina A.G, Enikolopov G BGRS\SB-2014
	Activation of hippocampal cell proliferation and decrease of c-fos expression in the amygdala under positive fighting experience in male mice Smagin D.A., Kudryavtseva N.N., Enikolopov G.N. BGRS\SB-2014
	Behavioral and neurobiological changes under repeated experience of aggression in male mice Smagin D.A., Enikolopov G.N., Kudryavtseva N.N. X International congress NEUROSCIENCE FOR MEDICINE AND PSYCHOLOGY
	Интеграция геномных и транскриптомных данных о хромосомных контактах в геноме человека, полученных по методу ChIA-PET // Сборник трудов IV международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» Постгеном-2014, 29 октября – 1 ноября 2014, г.Казань. Издательство Казанского (Приволжского) Федерального Университета (ISBN 987-5-00019-293-1) S05-24, С.150. Орлов Ю.Л., Кулакова Е.В, Спицина А.М., Дергилев А.И., Свичкарев А.В., Афонников Д.А., Чен М., Ли Г., Руан Й., Колчанов Н.А. Постгеном-2014 «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»
2011	Компьютерный анализ дифференциально экспрессирующихся генов у крыс гипертензивной линии НИСАГ. Александрович Ю.В., Орлов А.В., Пыльник Т.О., Смоленская С.Э., Редина О.Е. , Орлов Ю.Л. , Маркель А.Л. II Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика», Новосибирск, 2011
	Эффекты гипоксии и глюкокортикоидов на двигательную активность и экспрессию белков апоптоза в головном мозге неонатальных крысят. Вечкапова С.О. XLIХ международная студенческая конференция
	Развитие неонатальных крыс и экспрессия белков апоптоза в их мозге после воздействия дексаметазоном и гипоксией. Меньшанов ПН, Вечкапова ОС, Калинина ТС, Дыгало НН. VII Съезд Казахского физиологического общества
	Behavioral and neurodevelopmental effects of ACTH and glucocorticoids in neonatal rats. Dygalo N.N, Kalinina T.S., Shemenkova T.V., Vechkapova S.O., Menshanov P.N., Bulygina V.V. 24th ECNP Congress (European College of Neuropsychopharmacology)
2006	Evolution Highway: large scale analysis of vertebrate genome evolution. 30th International conference on animal genetics Larkin DM 30th International conference on animal genetics, August 20-25, 2006, Porto Seguro, Brazil, plenary lecture

Гранты

2017	Направленная модификация генома для исследования роли пространственной архитектуры ядра в развитии патологий РНФ, номер гранта 17-74- 10143
	Изучение генетических и эпигенетических механизмов программирующего действия материнского лептина в зависимости от пола потомства у мышей РФФИ, номер гранта 17-04-01357 А
	Изучение половых особенностей регуляторного влияния фактора роста фибробластов 21 (FGF21) на углеводно-жировой обмен РНФ, номер гранта 17-15-01036
2016	Выяснение эпигенетических механизмов отсроченного влияния раннего постнатального стресса на формирование когнитивных расстройств у взрослых особей РНФ, номер гранта 16-15-10131
	Разработка новых методов визуализации и анализа хромосомоспецифичных последовательностей ДНК для FISH-диагностики РФФИ, номер гранта 16-34-00498
	Поиск целевых генов и оптимизация подходов по модификации геномов для получения новых форм злаков с заранее заданными свойствами РНФ, номер гранта 16-14-00086
	Дуплицированные гены в аллополиплоидном геноме пшеницы - вклад в формирование тканеспецифичных регуляторных механизмов РФФИ, номер гранта 16-04-00912
2015	Молекулярно-генетические механизмы формирования окраски овощных и злаковых культур СО РАН, номер гранта 22
2014	Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq) РНФ, номер гранта РНФ № 14-14-00269
	Картирование и изучение структурно-функциональной организации генных локусов дикорастущей пшеницы Triticum dicoccoides. Российский научный фонд, номер гранта 14-14-00161
2013	Экспрессия генов, принимающих участие в регуляции водно-солевого гомеостаза и артериального давления у гипертензивных крыс НИСАГ. РФФИ, номер гранта 13-04-01492-А
	Структурно-функциональная организация генов защитного ответа в чужеродно-замещенных линиях пшеницы РФФИ, номер гранта 12-04-33027
	Функциональные особенности дуплицированных копий генов у злаковых растений РАН, ФАНО, номер гранта 0324-2015-0016
2011	Исследование эффектов кортикотропина на экспрессию нейроэндокринных регуляторов активности мужской половой системы в раннем постнатальном онтогенезе РФФИ, номер гранта 11-04-00375-а
2008	Молекулярно-генетические механизмы комплексных поведенческих, морфологических и физиологических признаков: экспериментальное исследование на селекционных моделях животных. Программа Президиума РАН
	Анализ функции люлиберина (GnRH-1) в регуляции физиологического апоптоза клеток формирующегося мозга РФФИ, номер гранта 08-04- 00292-а
2006	Создание детальной генетической карты американской норки (Mustela vison) Программа фундаментальных исследований Президиума РАН Подпрограмм II «Динамика генофондов» «Биоразнообразие и динамика генофондов», номер гранта 62/2006

Система учета научной деятельности (ASSA)

РНФ Лаборатории

Подразделения

Бывшие сотрудники

Совместители

Сотрудники научно-образовательного отдела

Публикации

Конференции

Гранты