Система учета научной деятельности (ASSA)

Вход

РНФ Лаборатории

Внебюджетные подразделения

Подразделения

Научные результаты

Сотрудники

Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода:

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

2016

2017

Публикации Конференции Гранты

Публикации

2017	Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Программные системы: теория и приложения, 2017, декабрь 2016, 1-12
	Оптогенетическая активация нейрона повышает в нем уровень антиапоптозного белка Bcl-xL Ланшаков Д.А., Дрозд У.С., Дыгало Н.Н. Биохимия, 2017, Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 481 – 486
	Optogenetic stimulation increases level of antiapoptotic protein Bcl-xL in neurons Lanshakov DA, Drozd US, Dygalo NN BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 340-344. Original Russian Text © D. A. Lanshakov, U. S. Drozd, N. N. Dygalo, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 481-486.
	Анализ вклада изменения нейротрофического обеспечения мозга в развитие признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS Е.А. Рудницкая, Н.Г. Колосова, Н.А. Стефанова Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 460 – 469
2016	Механизмы регуляции передачи сигнала этилена у растений Землянская Е.В., Омельянчук Н.А., Ермаков А.А., Миронова В.В. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, Принята в печать. DOI: 10.18699/VJ15.105
	Введение оптогенетических векторов в мозг неонатальным животным для исследования функции нейронов в последующие периоды онтогенеза Д.А. Ланшаков, У.С. Дрозд, Т.А. Запара, Н.Н. Дыгало Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, Том 20, №2
	Компьютерный анализ совместной локализации сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq Дергилев А.И., Спицина А.М., Чадаева И.В., Свичкарев А.В., Науменко Ф.М., Кулакова Е.В., Витяев Е.Е., Чен М., Орлов Ю.Л. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, 20(6):770-778. DOI 10.18699/VJ16.194
	Analysis of differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals Babenko V.N., Bragin A.O., Spitsina A.M., Chadaeva I.V., Galieva E.R., Orlova G.V., Medvedeva I.V., Orlov Y.L. Journal of Integrative Bioinformatics, 2016, 13(4):292. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-292
	ЗНАЧИМОСТЬ ГЕНОМНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ В ИСТОРИИ ФОРМИРОВАНИЯ ДОМАШНИХ ЖИВОТНЫХ Ларкин Д.М., Юдин Н.С. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2016, № 4, стр. 123-128.
	Практическое руководство по редактированию геномов системой CRISPR/Cas9 Мензоров А.Г., Лукьянчикова В.А., Кораблев А.Н., Серова И.А., Фишман В.С. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, 2016;20(6):930-944. DOI 10.18699/VJ16.214
	Структурное моделирование мод связывания НАД+ с ПАРП-1 Иванисенко Н.В., Жечев Д.А., Иванисенко В.А. Вавиловский журнал генетики и селекции., 2016
2015	Methodological aspects of read mapping and assembly of transcriptomes derived from the brain tissue samples of Rattus norvegicus Menshanov, P.N., Dygalo, N.N. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, 5(4):401-406
	Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК Спицина А.М., Орлов Ю.Л., Подколодная Н.Н., Свичкарев А.В., Дергилев А.И., Чен М., Кучин Н. В., Черных И. Г., Глинский Б. М. Программные системы: теория и приложения, 2015, 6:1(23), c. 157–174
	Программы анализа геномных данных секвенирования, полученных на основе технологий ChIP-seq, ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е. В., Спицина А. М., Орлова Н. Г., Дергилев А. И., Свичкарев А. В., Сафронова Н. С., Черных И. Г., Орлов Ю. Л. Программные системы: теория и приложения, 2015, 2(25), c. 129–148
	Altered Hippocampal Neurogenesis and Amygdalar Neuronal Activity in Adult Mice with Repeated Experience of Aggression Dmitry A. Smagin, June-Hee Park, Tatyana V. Michurina, Natalia Peunova, Zachary Glass, Kasim Sayed, Natalya P. Bondar, Irina N. Kovalenko, Natalia N. Kudryavtseva and Grigori Enikolopov Frontiers in Neuroscience, 2015, volume 9, article 443, doi: 10.3389/fnins.2015.00443
2014	МЕТОДОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ КАРТИРОВАНИЯ РИДОВ И СБОРКИ ТРАНСКРИПТОМА ДЛЯ ТКАНЕЙ НЕРВНОЙ СИСТЕМЫ Rattus norvegicus. Меньшанов П.Н. , Дыгало Н.Н. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2014, Т. 18. №4/3. С. 1231-1238.
	Extended effect of chronic social defeat stress in childhood on behaviors in adulthood Kovalenko IL, Galyamina AG, Smagin DA, Michurina TV, Kudryavtseva NN, Enikolopov G PLoS One, 2014, 9(3): e91762
2006	Comparative mapping of cattle chromosome 19: cytogenetic localization of 19 BAC clones Larkin D.M., Astakhova N.M., Prokhorovich M.A., Lewin H.A., Zhdanova N.S. CYTOGENET GENOME RES, 2006, 112, 3-4, 235-240
	Comparative mapping of mink chromosome 8p: in situ hybridization of seven cattle BAC clones Larkin D.M., Prokhorovich M.A., Astakhova N.M., Zhdanova N.S ANIM GENET, 2006, 37, 229-231

Конференции

2016	Computer Analysis of RNA-seq Data of Laboratory Rats with Aggressive Behavior Anatoly O. Bragin*, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel SocBin Bioinformatics 2016
	Search for regulatory context signals in genomic DNA E.E.Vityaev, A.I.Dergilev, I.V.Chadaeva, Y.Y.Vaskin, A.M.Spitsina, E.V.Kulakova, O.V.Vishnevsky, Y.L.Orlov XVIII Международная научно-техническая конференция Нейроинформатика 2016
	Analysis of aggressive behavior by whole RNA sequencing in brain compartments V.N. Babenko, A.O. Bragin, I.V. Medvedeva, I.V. Chadaeva, A.I. Dergilev, A.M. Spitsyna, N.N. Kudriavtseva, A.L. Markel, Y.L. Orlov Нейроинформатика 2016
	Purple-grained barley: marker-assisted devlopment of NILs and genetic dissection Kukoeva T., Gordeeva E., Glagoleva A., Shoeva O., Börner A., Khlestkina E The 1st International Workshop “Plant Genetics and Genomics for Food Security”
	Влияние раннего постнатального стресса на профиль распределения метки активного хроматина H3K4me3 Решетников В.В.,Лепешко А.А., Ершов Н.И., Студеникина А.А., Бондарь Н.П. VII Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология живых существ»
2015	CTCF binding sites and gene expression analysis in genome scale by sequencing data Kulakova E.V., Spitsina A.M., Safronova N.S., Svichkarev A.V., Dergilev A.I., Ponomarenko M.P., Babenko V.N., Hong P., Li G., Orlov Y.L. 7th International Young Scientists School “Systems biology and bioinformatics” SBB-2015
	Analysis of gene location relative to chromosome loops and topological chromosome domains by ChIA-PET and Hi-C Orlov Y.L., Kulakova E.V., Spitsina A.M., Svichkarev A.V., Babenko V.N., Li G. 3D Genome Workshop
	Differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals with aggressive and tolerant behaviors Anatoly O. Bragin, Natalia N. Kudryavtseva, Arcady L. Markel, Yuriy L. Orlov, Ekaterina V. Kulakova, Anastasia M. Spitsina MCCMB-15
	Statistical analysis of chromosome contacts by ChIA-PET and Hi-C technologies Orlov Y.L., Kulakova E., Spitsina A., Babenko V. Future of Biomedicine 2015 Conference
	Computer Tools for Gene Expression Data Processing and Correlation Analysis Babenko V.N., Orlov Y. L., Spitsyina A. M. Podkolodnaya N. Computational systems biology and bioinformatics (CSBio 2015)
	Gene Expression Analysis in Brain Areas of Laboratory Rats with Aggressive Behavior by RNA-seq Data Anatoly O. Bragin, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel CSBio’2015
2014	Implications of hostile environment and social instability in adolescent mice Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Smagin D.A., Michurina T.V., Enikolopov G., Kudryavtseva N.N. BGRS\SB-2014
	Repeated positive fighting experience in male mice: the tool for the study of movement disorders Kudryavtseva N.N., Smagin D.A., Kovalenko I.L.,Vishnivetskaya G.B., Galyamina A.G, Enikolopov G BGRS\SB-2014
	Activation of hippocampal cell proliferation and decrease of c-fos expression in the amygdala under positive fighting experience in male mice Smagin D.A., Kudryavtseva N.N., Enikolopov G.N. BGRS\SB-2014
	Behavioral and neurobiological changes under repeated experience of aggression in male mice Smagin D.A., Enikolopov G.N., Kudryavtseva N.N. X International congress NEUROSCIENCE FOR MEDICINE AND PSYCHOLOGY
	Интеграция геномных и транскриптомных данных о хромосомных контактах в геноме человека, полученных по методу ChIA-PET // Сборник трудов IV международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» Постгеном-2014, 29 октября – 1 ноября 2014, г.Казань. Издательство Казанского (Приволжского) Федерального Университета (ISBN 987-5-00019-293-1) S05-24, С.150. Орлов Ю.Л., Кулакова Е.В, Спицина А.М., Дергилев А.И., Свичкарев А.В., Афонников Д.А., Чен М., Ли Г., Руан Й., Колчанов Н.А. Постгеном-2014 «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»
2012	ANALYSIS OF TRANSCRIPTIONAL AND POSTTRANSCRIPTIONAL REGULATION OF AUXIN CARRIER AtPIN1 Chernova V.V., Ermakov A.A., Doroshkov A.V., Omelyanchuk N.A., Mironova V.V. VIII Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2012)
	THE MODEL FOR AUXIN REGULATED AtPIN1 EXPRESSION IN THE ROOT APICAL MERISTEM А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, С.С. Сангаев, Н.А. Омельянчук, А.В. Кочетов, В.В. Миронова The 2nd International Conference "Plant Genetics, Genomics and Biotechnology"
	Исследование регуляторных районов PIN1 гена Arabidopsis thaliana L. (Study of PIN1 regulatory regions in Arabidopsis thaliana L. А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, И.В. Миронова, С.С. Сангаев, А.В. Кочетов, В.В. Миронова II (X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге, 11-16 ноября 2012 года
2011	Эффекты гипоксии и глюкокортикоидов на двигательную активность и экспрессию белков апоптоза в головном мозге неонатальных крысят. Вечкапова С.О. XLIХ международная студенческая конференция
	Развитие неонатальных крыс и экспрессия белков апоптоза в их мозге после воздействия дексаметазоном и гипоксией. Меньшанов ПН, Вечкапова ОС, Калинина ТС, Дыгало НН. VII Съезд Казахского физиологического общества
	Behavioral and neurodevelopmental effects of ACTH and glucocorticoids in neonatal rats. Dygalo N.N, Kalinina T.S., Shemenkova T.V., Vechkapova S.O., Menshanov P.N., Bulygina V.V. 24th ECNP Congress (European College of Neuropsychopharmacology)
2006	Evolution Highway: large scale analysis of vertebrate genome evolution. 30th International conference on animal genetics Larkin DM 30th International conference on animal genetics, August 20-25, 2006, Porto Seguro, Brazil, plenary lecture

Гранты

2016	Выяснение эпигенетических механизмов отсроченного влияния раннего постнатального стресса на формирование когнитивных расстройств у взрослых особей РНФ, номер гранта 16-15-10131
	Разработка новых методов визуализации и анализа хромосомоспецифичных последовательностей ДНК для FISH-диагностики РФФИ, номер гранта 16-34-00498
	Поиск целевых генов и оптимизация подходов по модификации геномов для получения новых форм злаков с заранее заданными свойствами РНФ, номер гранта 16-14-00086
	Дуплицированные гены в аллополиплоидном геноме пшеницы - вклад в формирование тканеспецифичных регуляторных механизмов РФФИ, номер гранта 16-04-00912
2015	Молекулярно-генетические механизмы формирования окраски овощных и злаковых культур СО РАН, номер гранта 22
2014	Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq) РНФ, номер гранта РНФ № 14-14-00269
	Картирование и изучение структурно-функциональной организации генных локусов дикорастущей пшеницы Triticum dicoccoides. Российский научный фонд, номер гранта 14-14-00161
2013	Роль ауксина и этилена в регуляции активности генов в корне проростка Arabidopsis thaliana L.: полногеномный подход РФФИ, номер гранта 12-04-33112-мол-а-вед
	Функциональные особенности дуплицированных копий генов у злаковых растений РАН, ФАНО, номер гранта 0324-2015-0016
2011	Экспериментально-теоретическое изучение молекулярно-генетических механизмов распределения ауксина в корне растений РФФИ, номер гранта 11-04-01254а
	Исследование эффектов кортикотропина на экспрессию нейроэндокринных регуляторов активности мужской половой системы в раннем постнатальном онтогенезе РФФИ, номер гранта 11-04-00375-а
2008	Анализ функции люлиберина (GnRH-1) в регуляции физиологического апоптоза клеток формирующегося мозга РФФИ, номер гранта 08-04- 00292-а
2006	Создание детальной генетической карты американской норки (Mustela vison) Программа фундаментальных исследований Президиума РАН Подпрограмм II «Динамика генофондов» «Биоразнообразие и динамика генофондов», номер гранта 62/2006

Система учета научной деятельности (ASSA)

РНФ Лаборатории

Подразделения

Бывшие сотрудники

Совместители

Сотрудники научно-образовательного отдела

Публикации

Конференции

Гранты