ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Дорошков Алексей Владимирович, к. б. н.

Подразделение: 014. Лаб. эволюц. биоинформ. и теор. генетики
Совместительство: 014. Лаб. эволюц. биоинформ. и теор. генетики
Должность: научный сотрудник
Комната: 1317
Email: AD@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*1317


Публикации

2016 Diversity of leaf pubescence in bread wheat and relative species
Tatyana A. Pshenichnikova, Alexey V. Doroshkov, Alexander V. Simonov, Dmitry A. Afonnikov, Andreas Bo¨rner
[GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION]
Identification of nuclear genes controlling chlorophyll synthesis in barley by RNA-seq
Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Doroshkov A.V., Gordeeva E.I., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[BMC PLANT BIOL]
Interactions between leaf pubescence genes in bread wheat as assessed by high throughput phenotyping.
Doroshkov A.V., Afonnikov D.A., Dobrovolskaya O.B., Pshenichnikova T.A.
[EUPHYTICA]
Methods of high-throughput plant phenotyping for large-scale breeding and genetic experiments
D. A. Afonnikov, M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. G. Komyshev, T. A. Pshenichnikova
[RUSS J GENET+]
Regions of the bread wheat D genome associated with variation in key photosynthesis traits and shoot biomass under both well watered and water deficient conditions
Svetlana Osipova, Alexey Permyakov, Marina Permyakova, Tatyana Pshenichnikova, Vasiliy Verkhoturov, Alexandr Rudikovsky, Elena Rudikovskaya, Alexandr Shishparenok, Alexey Doroshkov, Andreas Börner
[J Appl Genetics]
Оценка количественных характеристик опушения листьев картофеля с использованием анализа цифровых микроизображений
А.В. Дорошков, А.В. Симонов, А.Д. Сафонова, Д.А. Афонников, И.Е. Лихенко, Н.А. Колчанов
[Достижения науки и техники АПК]
Протокол анализа количественных характеристик опушения листа картофеля
А.В. Дорошков, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Вавиловский журнал генетики и селекции.]
2015 Computer high-throughput approaches to wheat phenotyping: application to leaf pubescence analysis
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A. Simonov A.V.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
Genetic dissection of earliness by analysis of a recombinant chromosome substitution double haploid mapping population of bread wheat (Triticum aestivum L.) in different geographic regions
Tatyana A. Pshenichnikova, Elena K. Khlestkina, Svetlana Landjeva, Alexey V. Doroshkov, Tanya Kartseva, Andreas Bo¨rner, Alexander V. Simonov, Ludmila V. Shchukina, Evgeniya V. Morozova
[EUPHYTICA]
The effect of plant hormones on the manifestation of leaf pubescence genes in bread wheat.
Doroshkov A.V., Simonov A.V., Afonnikov D.A., Kasyanov N.S., Pshenichnikova T.A.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
2013 Генетический контроль опушения листа у изогенных линий мягкой пшеницы сорта Новосибирская 67
Дорошков А.В., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[RUSS J GENET+]
2012 Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image processing technique
Mikhail A. Genaev, Alexey V. Doroshkov, Tatyana A. Pshenichnikova, Nikolay A. Kolchanov, Dmitry A. Afonnikov
[PLANTA]
WheatPGE: A system for analysis of relationships among the phenotype, genotype, and environment in wheat
M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. V. Morozova, T. A. Pshenichnikova and D. A. Afonnikov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Информационная поддержка селекционно-генетического эксперимента у пшеницы в системе WheatPGE
Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Морозова Е.В., Симонов А.В., Афонников Д.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы.
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2011 Анализ особенностей морфологии и наследования опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помощью компьютерных методов фенотипирования.
Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[RUSS J GENET+]
КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА WheatPGE ДЛЯ АНАЛИЗА ВЗАИМОСВЯЗИ ФЕНОТИП-ГЕНОТИП-ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА У ПШЕНИЦЫ
М.А. Генаев, A.В. Дорошков, Е.В. Морозова, Т.А. Пшеничникова, Д.А. Афонников
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2009 Применение компьютерного анализа микроизображений листа для оценки характеристик опушения листа пшеницы Triticum Aestivum L
Дорошков А.В., Арсенина С.И., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[Информационный вестник ВОГИС]

Монографии

2014 Wheat leaf pubescence analysis: methods of computer phenomics
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A.

2013 Cladogenesis.
Ponomarenko M, Gunbin K, Doroshkov A, Kolchanov N


Конференции

2016 An ImageJ plugin for detection of wheat leaf epidermis cellular structure from confocal laser scanning microscopy
U.S. Zubairova, P.Yu. Verman, and A.V. Doroshkov
[BGRS\SB-2016]
2014 A model of trichome spacing pattern formation on growing wheat leaf
Zubairova U., Nikolaev S.V., Doroshkov A., Afonnikov D.
[BGRS/SB-2014]
Генетическое разнообразие опушения листа мягкой пшеницы: описание методом высокопроизводительного фенотипирования
Дорошков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров и ассоциированные генетические симпозиумы]
2013 Компьютерная технология фенотипирования пшеницы.
Афонников Д.А., Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Тарасова И.А., Морозова Е.В. , Симонов А.В.
[Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 19-22 марта 2013]
2012 ANALYSIS OF TRANSCRIPTIONAL AND POSTTRANSCRIPTIONAL REGULATION OF AUXIN CARRIER AtPIN1
Chernova V.V., Ermakov A.A., Doroshkov A.V., Omelyanchuk N.A., Mironova V.V.
[VIII Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology — BGRS\SB-2012)]
Computer approaches ti wheat high-throughput phenotyping
Afonnikov D., Genaev M., Doroshkov A., Denisyuk V., Morozova E., Simonov A., Pshenichnikova T.
[The 2nd International Conference "Plant Genetics Genomics and Biotechnology"]
Prediction of the structure and localization of genes controlling leaf pubescence in wheat Triticum aestivum L. and barley Hordeum vulgare L. based on Arabidopsis thaliana (L.) Henh. genes data
Doroshkov AV, Pshenichnikova TA, Afonnikov DA
[2nd International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
THE MODEL FOR AUXIN REGULATED AtPIN1 EXPRESSION IN THE ROOT APICAL MERISTEM
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, С.С. Сангаев, Н.А. Омельянчук, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[The 2nd International Conference "Plant Genetics, Genomics and Biotechnology"]
Исследование регуляторных районов PIN1 гена Arabidopsis thaliana L. (Study of PIN1 regulatory regions in Arabidopsis thaliana L.
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, И.В. Миронова, С.С. Сангаев, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[II (X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге, 11-16 ноября 2012 года]
2011 Analysis of leaf hairiness morphology wheat: computational approaches using image processing technique.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
Hight througput phenotyping approach to analysis of the leaf hairiness in wheat.
D.A. Afonnikov, A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
2010 Analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L. using the high throughput phenotyping approach.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A. Pshenichnikova, D.A. Afonnikov
[The International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
Using a computer-base image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Trticum aestivum L.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The 7th International Conference on Bioinformatics of Genome regulation and Structure.]
Using the computer-based image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L.
Дорошков А.В.
[The Young Scientists School "Bioinformatics and system biology", Novosibirsk, Russia, 28-29 June 2010]
WheatDB - база данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
WheatPGE - компьютерная система анализа взаимосвязи признаков фенотипа генотипа и окружающей среды у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Электронные библиотеки:перспективные методы и технологии, электронные коллекции. XII Всероссийская научная конференция RCDL'2010. Казань]
WheatPGE — система анализа взаимосвязей фенотип-генотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Молодежный научный форум "ЛОМОНОСОВ - 2010" г. Москва]
Анализ морфологии опушения листа у пшеницы: компьютерный подход с использованием анализа изображений
Афонников Д.А. Дорошков А.В., Генаев М.А.
[Российско-Французского семинар "Геномика, биоинформатика и моделирование в науках о жизни", 18-21 июня 2010]
Визуализация схем скрещивания пшеницы в рамках разработки системы WheatDB
Генев М.А. Дорошков А.В.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
Исследование опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помошью высокоэффективных методов фенотипирования
Дорoшков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
Методы компьютерного анализа в исследовании опушения листа пшеницы TRITICUM AESTIVUM L.
Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
2009 Using the computer-based image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L.
Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[1st Workshop on plant molecular biotechnology - XV Biotechnology summer school. 5-12 july, Gdansk, Poland]
АНАЛИЗ МОРФОЛОГИИ И НАСЛЕДОВАНИЯ ОПУШЕНИЯ ЛИСТА У ЯРОВЫХ СОРТОВ И ГИБРИДОВ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ TRITICUM AESTIVUM L.
Дорошков А.В.
[XLVII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-47) г.Новосибирск, 11 – 15 апреля 2009 г.]
2008 Development of the computer approach for defining leaf hairiness in wheat based on its microscope image processing.
D.A. Afonnikov, S.I. Arsenina, A.V. Doroshkov, T.A.Pshenichnikova.
[The Russian-French Conference “Problems and Prospects in Plant Biotechnology”.]
Структурные и функциональные различия гетерохроматиновых районов политенных хромосом клеток слюнных желёз и слепых придатков желудка Drosophila Melanogaster
Дорошков А.В.
[XLVI Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-46) г.Новосибирск 26 – 30 апреля 2008 г.]

Гранты

2017 Изучение особенностей формирования клеточной структуры эпидермиса листа пшеницы при холодовом стрессе
Зубаирова Ульяна Станиславовна, Дорошков Алексей Владимирович

2016 Изучение механизмов формирования клеточной структуры эпидермиса листа однодольных растений на основе автоматической обработки конфокальных изображений
Зубаирова Ульяна Станиславовна Дорошков Алексей Владимирович

2015 Молекулярные механизмы гибели клеток в сетчатке при старении и развитии ретинопатии
Кожевникова Оюна Суранзановна, руководитель Байбородин Сергей Иванович Дорошков Алексей Владимирович Жданкина Анна Александровна ГБОУ ВПО СибГМУ Минздрава России Корболина Елена Евгеньевна Муралёва Наталья Александровна Румянцева Юлия Викторовна Стефанова Наталья Анатольевна Телегина Дарья Викторовна Фурсова Анжелла Жановна

Транскрипционная и посттранскрипционная регуляция ауксином и этиленом экспрессии генов в корне Arabidopsis thaliana
Вибе Даниил Станиславович Дорошков Алексей Владимирович Климова Наталья Викторовна Лавреха Виктория Вадимовна Левицкий Виктор Георгиевич Миронова Виктория Владимировна, руководитель, Новикова Дарья Дмитриевна Ощепков Дмитрий Юрьевич Чернова Василина Владимировна Черных Ольга Александровна

2014 Изучение молекулярных механизмов развития органов растений методами системной биологии
Афонников Д.А., Голушко С.К., Дорошков А.В., Зубаирова У.С., Казанцев Ф.В., Колчанов Н.А., Лавреха В.В., Миронова В.В., Николаев С.В., Новикова Д.Д., Омельянчук Н.А., Пененко А.В., Пшеничникова Т.А., Савина М.С., Саженков С.А., Симонов А.В., Чернова В.В.

2013 Роль ауксина и этилена в регуляции активности генов в корне проростка Arabidopsis thaliana L.: полногеномный подход
Миронова Виктория Владимировна Ермаков Антон Александрович Дорошков Алексей Владимирович Васильев Геннадий Владимирович Казанцев Федор Владимирович Климова Наталья Викторовна Левицкий Виктор Георгиевич Новоселова Екатерина Сергеевна Пономаренко Петр Михайлович Чернова Василина Владимировна


Учебные курсы

2015 Практикум по начальной специализации "Биоинформатика и системная биология"
2013 Биоинформатика и компьютерная геномика
Миронова В.В., Дорошков А.В.


Патенты

2012 Программа автоматического определения количественных характеристик опушения листа (ОЛДетект2) / Software tool for automatically determination of the quantitative characteristics of leaf hairiness in plants (LHDetect2)
Генаев Михаил Александрович, Дорошков Алексей Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Пшеничникова Татьяна Алексеевна

2010 База данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы (ВитПГЕ).
Генаев М.А., Дорошков А.В., Афонников Д.А.


Диссертации

2012 Анализ морфологии и наследования опушения листа у яровых сортов и гибридов мягкой пшеницы Triticum aestivum L. [Кандидат]
© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.