ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Хлебодарова Тамара Михайловна, д. б. н.

Подразделение: 013. Лаб. молекулярно-генетич. систем
Должность: ведущий научный сотрудник
Комната: 3102
Email: tamara@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*3102


Сотрудники научно-образовательного отдела

научное руководство которыми осуществляет сотрудник:
Ри Наталья Александровна


Публикации

2017 Chaos and hyperchaos in simple gene network with negative feedback and time delays.
Khlebodarova T.M., Kogai V.V., Fadeev S.I., Likhoshvai V.A.
[J. Bioinf. Comput. Biol.]
Dynamic landscape of the local translation at activated synapses.
Khlebodarova T.M., Kogai V.V., Trifonova E.A., Likhoshvai V.A.
[MOL PSYCHIATRY]
MAMMOTH: A NEW DATABASE FOR CURATED MATHEMATICAL MODELS OF BIOMOLECULAR SYSTEMS
Fedor Kazantsev, Ilya Akberdin, Sergey Lashin, Natalia Ree, Vladimir Timonov, Alexander Ratushny, Tamara Khlebodarova, Vitaly Likhoshvai
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Molecular Mechanisms of Autism as a Form of Synaptic Dysfunction
E. A. Trifonova, T. M. Khlebodarova, N. E. Gruntenko
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Multiple Scenarios of Transition to Chaos in the Alternative Splicing Model
Kogai V.V., Likhoshvai V.A., Fadeev S.I., Khlebodarova T.M.
[INT J BIFURCAT CHAOS]
Phenotypic variability of bacterial cell cycle: mathematical model.
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[Математическая биология и биоинформатика]
О связи свойств одномерных отображений управляющих функций с хаосом в уравнениях специального вида с запаздывающим аргументом.
Лихошвай В.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
Стазис и периодичность в эволюции глобальной экосистемы: минимальная логистическая модель
Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
2016 Chaos and Hyperchaos in a Model Of Ribosome Autocatalytic Synthesis
Лихошвай В.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[SCI REP-UK]
On numerical study of periodic solutions of a delay equation in biological models.
Fadeev S.I., Kogai V.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[J Appl Indust Math.]
On the control mechanisms of the nitrite level in Escherichia coli cells: the mathematical model.
Khlebodarova T.M., Ree N.A., Likhoshvai V.A.
[BMC Microbiol.]
Аутизм как проявление нарушения молекулярных механизмов регуляции развития и функций синапсов
Е.А. Трифонова, Т.М. Хлебодарова, Н.Е. Грунтенко
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
О численном исследовании периодических решений уравнения с запаздывающим аргументом в биологических моделях.
Фадеев С.И., Когай В.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Сиб. Журн. Индустр. Матем.]
Фенотипическая множественность клеточного цикла бактерий: математическая модель
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
2015 Alternative splicing can lead to chaos
Likhoshvai V.A., Kogai V.V., Fadeev S.I., Khlebodarova T.M.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Effect of flanking sequences on the accuracy of the recognition of transcription factor binding sites.
Khlebodarova T. M., Oshchepkov D. Yu., Levitsky V. G., Podkolodnaya O. A., Ignatieva E. V., Ananko E. A., Stepanenko I. L., Kolchanov N. A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
On the distribution of auxin concentrations in root horizontal layer cells.
Novoselova E.S., Mironova V.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Механизмы регуляции экспрессии гена dps Escherichia coli в условиях стресса: реконструкция по кинетическим данным
Хлебодарова Т.М., Степанова Т.Ю., Ощепков Д.Ю., Тикунова Н.В., Бабкин И.В., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в условиях стационарного роста.
Ри Н.А., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
О типах законов роста бактерий
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
Сложная динамика в системах альтернативного сплайсинга мРНК: математическая модель
Когай В.В., Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И., Лихошвай В.А.
[Вычислительные технологии]
2014 Mathematical model of the Tat-Rev regulation of HIV-1 replication in an activated cell predicts the existence of oscillatory dynamics in the synthesis of viral components
Vitaly A Likhoshvai, Tamara M Khlebodarova, Sergei I Bazhan, Irina A Gainova, Valery A Chereshnev, Gennady A Bocharov
[BMC GENOMICS]
Mathematical modeling of bacterial cell cycle: The problem of coordinating genome replication with cell growth.
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
New evidence of an old problem: the coupling of genome replication to cell growth in bacteria
Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[RUSS J GENET+]
Влияние фланкирующих последовательностей на точность распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов.
Хлебодарова Т.М., Ощепков Д.Ю., Левицкий В.Г., Подколодная О.А., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Колчанов Н. А.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
О распределениях концентраций ауксина в клетках горизонтального слоя корня
Новоселова Е.С., Миронова В.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2013 On the chaos in gene networks
VITALY A. LIKHOSHVAI, STANISLAV I. FADEEV,VLADISLAV V. KOGAI, TAMARA M. KHLEBODAROVA
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Reconstruction of the Mechanisms that Regulate the Expression of the Escherihia coli yfiA Gene under Stress Conditions.
T. M. Khlebodarova, D. Yu. Oshchepkov, N. V. Tikunova, I. V. Babkin, A. D. Gruzdev, and V. A. Likhoshvai
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
«Электронная клетка»: проблемы и перспективы.
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В., Тимонов В.С., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
Моделирование утилизации нитрита клетками Escherichia coli: анализ потоков
Хлебодарова Т.М., Когай В.В., Акбердин И.Р., Ри Н.А., Фадеев С.И., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
Реконструкция механизмов регуляции экспрессии гена yfiA Escherichia coli в условиях стресса.
Хлебодарова Т.М., Ощепков Д.Ю., Тикунова Н.В., Бабкин И.В., Груздев А.Д., Лихошвай В.А.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Согласование темпов роста объема клетки и репликации ДНК: математическая модель.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
2012 Бистабильность системы утилизации нитрита Escherichia coli: анализ математической модели.
Ри Н. А., Хлебодарова Т. М., Когай В. В., Фадеев С. И., Лихошвай В. А.
[Сибирский журнал индустриальной математики (СИБЖИМ)]
2011 Извлечение знаний из текстов научных публикаций и создание баз знаний в области нанобиотехнологии
В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов
[Российские нанотехнологии]
2010 Metabolic Engineering in Silico
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ree M.T., Kolchanov N.A.
[APPL BIOCHEM MICRO+]
Микрофлюидные системы в биологии и конструирование геносенсоров
Пельтек С.Е., Горячковская Т.Н., Рубцов Н.Б., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А., Попик В.М., Пиндюрин В.Ф., Гольденберг Б.Г., Щеглов М.А., Кулипанов Г.Н.
[Нанотехнологии Экология Производство]
2009 Корреляции оперонной структуры с длинной генома у 14 видов микоплазм
Лашин С.А., Матушкин Ю.Г., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа
Бажан С. И., Кашеварова Н. А., Хлебодарова Т. М., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А.
[BIOFIZIKA+]
Экспрессия гена dps Escherichia coli в присутствии токсических агентов: анализ и математическое моделирование
Лихошвай В.А., Степанова Т.Ю., Задорожный А.В., Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М.
[Информационный вестник ВОГИС]
2008 TRRD: Technology for extraction, storage, and use of knowledge about the structural-functional organization of the transcriptional regulatory regions in the eukaryotic genes
N.A. Kolchanov, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, T.M. Khlebodarova, I.L. Stepanenko, T.I. Merkulova, V.M. Merkulov, N.L. Podkolodnyy, A.G. Romashchenko
[INTELL DATA ANAL]
Микрофлюидные системы в биологии и конструирование геносенсоров
С.Е. Пельтек, Т.Н. Горячковская, В.М. Попик, В.Ф. Пиндюрин, В.С. Елисеев, Б.Г. Гольденберг, М.А. Щеглов, Н.В. Тикунова, Т.М. Хлебодарова, Н.Б. Рубцов, Г.Н. Кулипанов, Н.А. Колчанов
[Российские нанотехнологии]
2007 Application of bioinformatics resources for genosensor design
Khlebodarova T.M., Tikunova N.V., Kachko A.V., Stepanenko I.L., Podkolodny N.L., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Mathematical model for suppression of subgenomic hepatitis C virus RNA replication in cell culture
Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Sournina N. Yu., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Компьютерно-экспериментальный подход к дизайну полифункционального геносенсора, полученного на основе промотора гена yfiA Escherichia coli
Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Крачко А.В., Степаненко И.Л., Колчанов Н.А.
[Доклады Академии Наук]
2006 Математическая модель репликации РНК репликона вируса гепатита С в клеточной культуре. Моделирование действия потенциальных лекарственных препаратов
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.,Иванисенко В.А.
[BIOFIZIKA+]
Статистический анализ последовательностей ДНК, содержащих сайты формирования нуклеосом
Орлов Ю.Л., Левицкий В.Г., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А
[BIOFIZIKA+]
2004 SITECON: a tool for detecting conservative conformational and physicochemical properties in transcription factor binding site alignments and for site recognition.
Oshchepkov D.Y., Vityaev E.E., Grigorovich D.A., Ignatieva E.V., Khlebodarova T.M.
[NUCLEIC ACIDS RES]
2001 О некоторых закономерностях генетического контроля стресс-реакции Drosophila
Раушенбах И.Ю., Грунтенко Н.Е., Васенкова И.А., Хлебодарова Т.М., Суханова М.Ж., Корочкин Л.И.
[Генетика]
Стресс-реактивность системы дофамина у имаго Drosophila virilis контролируется геном, сцепленным с хромосомой 6
Суханова М.Ж., Васенкова И.А., Гренбэк Л.Г., Грунтенко Н.Е., Хлебодарова Т.М., Раушенбах И.Ю.
[Цитология и генетика]
2000 Stress-reactivity of a Drosophila melanogaster strain with impaired juvenile hormone action
Gruntenko N.E., Khlebodarova T.M., Vasenkova I.A., Sukhanova M.Jh., Wilson T.G., Rauschenbach I.Yu.
[J. Insect Physiol]
Реакция теплового шока нарушена у неспособной к нейрогормональной стресс-реакции линии Drosophila virilis
Васенкова И.А., Хлебодарова Т.М., Суханова М.Ж., Грунтенко Н.Е., Гренбэк Л.Г., Раушенбах И.Ю.
[Цитология и генетика]
1999 Prolonged negative selection of Drosophila melanogaster for a character of adaptive significance disturbs stress reactivity
Gruntenko N.Е., Khlebodarova Т.М., Sukhanova М.Jh., Vasenkova I.А., Kaidanov L.Z., Rauschenbach I.Yu.
[Insect Biochem. Mol. Biol]
Гены, регулирующие активность щелочной фосфатазы и тирозиндекарбоксилазы у Drosophila virilis сцеплены с хромосомой 6
Суханова М.Ж., Васенкова И.А., Гренбэк Л.Г., Грунтенко Н.Е., Хлебодарова Т.М., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
1998 Ген, контролирующий ответ системы деградации ЮГ у имаго Drosophila virilis на стрессирующее воздействие, сцеплен с хромосомой 6
Хлебодарова Т.М., Гренбэк Л.Г., Грунтенко Н.Е., Суханова М.Ж., Анкилова И.А., Шумная Л.В., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Нарушение синтеза белков теплового шока не препятствует нормальному развитию стресс-реакции у Drosophila melanogaster
Грунтенко Н.Е. Хлебодарова Т.М. Суханова М.Ж. Васенкова И.А. Раушенбах И.Ю.
[Доклады РАН]
Нарушения в стресс-реакции Drosophila коррелируют с изменениями в хит-шок ответе
Хлебодарова Т.М., Анкилова И.А., Грунтенко Н.Е., Суханова М.Ж., Раушенбах И.Ю.
[Доклады РАН]
Селекция по половому поведению изменяет метаболизм ювенильного гормона у Drosophila melanogaster
Грунтенко Н.Е., Хлебодарова Т.М., Анкилова И.А., Суханова М.Ж., Кайданов Л.З., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Система деградации ювенильного гормона не играет роли в репродуктивной функции самцов Drosophila melanogaster
Грунтенко Н.Е. Хлебодарова Т.М. Анкилова И.А. Суханова М.Ж. Кайданов Л.З. Раушенбах И.Ю.
[Доклады РАН]
Щелочная фосфатаза у линий Drosophila melanogaster, различающихся по половой активности самцов, и их F1-гибридов
Суханова М.Ж. Анкилова И.А. Грунтенко Н.Е. Хлебодарова Т.М. Кайданов Л.З. Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
1997 N-ацетилирование биогенных аминов у Drosophila virilis
Суханова М.Ж., Хлебодарова Т.М., Гренбэк Л.Г., Грунтенко Н.Е., Шумная Л.В., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Role of dopa decarboxylase and N-acetyltransferase in regulation of dopamine content in Drosophila virilis under normal and heat stress conditions.
Rauschenbach IY, Sukhanova MZ, Shumnaya LV, Gruntenko N.E., Grenback L.G., Khlebodarova T.M., Сhentsova NA,
[INSECT BIOCHEM MOLEC]
Tyrosine decarboxylase and dopa decarboxylase in Drosophila virilis under heat stress
Sukhanova MJh, Shumnaya LV, Grenback LG, Gruntenko NE, Khlebodarova TM, Rauschenbach IYu.
[BIOCHEM GENET]
Генетический анализ различий активности дофадекарбоксилазы в двух линиях Drosophila virilis, отличающихся по содержанию дофамина
Шумная Л.В., Суханова М.Ж., Грунтенко Н.Е., Гренбек Л.Г., Хлебодарова Т.М., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Генетический контроль активности ДФФ-чувствительной эстеразы ювенильного гормона у D.virilis.
Гренбэк Л.Г., Хлебодарова Т.М., Суханова М.Ж., Шумная Л.В., Грунтенко Н.Е., Анкилова А.А., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Генетический контроль активности тирозиндекарбоксилазы Drosophila virilis
Суханова М.Ж., Шумная Л.В., Гренбэк Л.Г., Грунтенко Н.Е., Хлебодарова Т.М., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Генетический контроль ответа системы метаболизма ЮГ Drosophila virilis на стрессирующие воздействия
Гренбэк Л. Г., Хлебодарова Т. М., Грунтенко Н. Е., Суханова М. Ж., Шумная Л. В., Раушенбах И. Ю.
[Генетика]
1996 A comparative analysis of juvenile hormone metabolysing enzymes in two species of Drosophila during development.
Khlebodarova, T.M., Gruntenko, N.E., Grenback, L.G., Sukhanova, M.Z., Mazurov, M.M., Tomas, B.A., Hammock, B.D., Rauschenbach, I.Y.
[INSECT BIOCHEM MOLEC]
Alkaline phosphatase in Drosophila under heat stress
Sukhanova, М.Jh., Grenback, L.G., Gruntenko, N.Е., Khlebodarova, Т.М., Rauschenbach, I.Yu.
[Journal of Insect Physiology]
The role of the degradation system of the juvenile hormone in the reproduction of Drosophila under stress
Rauschenbach I.Yu., Gruntenko N.E., Khlebodarova T.M., Mazurov M.M., Grenback L.G., Sukhanova M.Jh., Shumnaja L.V., Zakharov I.K., Hammock B.D.
[J.Insect Physiol]
Генетический анализ различий в активности щелочной фосфатазы у двух линий Drosophila virilis, различающихся реакцией на тепловой стресс
Суханова М.Ж., Гренбэк Л.Г., Грунтенко Н.Е., Хлебодарова Т.М., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Генетический контроль метаболизма ювенильного гормона у Drosophila melanogaster
Грунтенко Н.Е., Хлебодарова Т.М., Гренбэк Л.Г., Суханова М.Ж., Захаров И.К., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Роль метаболизма ювенильного гормона в адаптации популяций Drosophila к стрессирующим условиям среды
Грунтенко Н.Е., Хлебодарова Т.М., Мазуров М.М., Гренбэк Л.Г., Суханова М.Ж., Шумная Л.В., Захаров И.К., Хэммок Б.Д., Раушенбах И.Ю.
[Генетика]
Ферменты метаболизма ювенильного гормона в онтогенезе Drosophila virilis
Хлебодарова Т.М. Гренбэк Л.Г. Грунтенко Н.Е. Суханова М.Ж., Раушенбах И.Ю.
[Онтогенез]

Монографии

2017 On the potential for multiscale oscillatory behavior in HIV
Ratushny A.V., De Leenheer P., Bazhan S.I., Bocharov G.A., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.

2010 Компьютерный генетический конструктор для моделирования молекулярно-генетических процессов в бактериальной клетке: анализ циклической генной сети Изд-во СО РАН, Новосибирск. 2010, Глава 6.5, С. 392-404.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.

Компьютерный генетический конструктор: математическое моделирование генетических и метаболических подсистем E. coli
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Ратушный А.В., Лашин С.А., Турнаев И.И., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Колчанов Н.А.

Роль микроорганизмов в функционировании живых систем: фундаментальные проблемы и биоинженерные приложения
И. С. Андреева, А. В. Брянская, С. М. Жмодик, В. А. Лихошвай, Б. Б. Намсараев, Д. Ю. Рогозин, О. П. Таран, С. Е. Ткачев, Е. А. Ананько, K. Aсано, Д. А. Афонников, Т. Г. Банзаракцаева, Д. Д. Бархутова, Ж. Батаа, В. В. Бахвалова, С. И. Беликов, В. М. Белолипецкий, П. В. Белолипецкий, Т. К. Белянин, А. А. Богуш, Е. В. Болдырева, Е. Н. Болдарева, A. В. Брушков, Л. И. Бурцева, С. П. Бурюхаев, В. В. Власов, С. Н. Генова, Н. А. Гольцова, В. М. Горленко, К. В. Гунбин, Э. В. Данилова, А. Г. Дегерменджи, М. А. Дымова, Е. К. Емельянова, В. И. Жираковский, А. В. Задорожный, С. С. Ибрагимова, Л. И. Иванов, Г. В. Калмыкова, Т. П. Камынина, А. В. Качко, И. В. Козлова, Л. П. Козырева, Ю. П. Колмогоров, Н. А. Колчанов, В. Н. Компаниченко, Е. В. Лаврентьева, Е. В. Лазарева, С. А. Лашин, С. Г. Ливанов, Н. Н. Ливанова, Ю. Г. Матушкин, И. B. Морозов, О. В. Морозова, З. Б. Намсараев, С. Ф. Орешкова, Д. Ю. Ощепков, В. В. Панов, В. Н. Пармон, С. Е. Пельтек, Н. И. Печуркина, О. А. Подколодная, В. А. Пономарчук, И. Г. Прокопкин, В. Г. Пугачев, Н. М. Пуховская, Л. И. Пучкова, В. А. Рар, А. В. Ратушный, В. Е. Репин, А. С. Розанов, Е. И. Рябчикова, Ю. В. Сабитова, И. В. Саранина, Д. В. Семенова, В. А. Симонов, О. Г. Смирнова, К. Н. Сорокина, Т. Ю. Степанова, О. В. Стронин, В. В. Суслов, M. Taнака, О. С. Таранов, Н. В. Тикунова, И. И. Турнаев, Т. Торок, О. Д. Тотменина, М. Ю. Трусова, M. Утсуми, М. Л. Филипенко, Н. В. Фоменко, M. Фукуда, М. А. Хаснатинов, Т. М. Хлебодарова, Д. Д. Цыренова

Экспериментально-компьютерное конструирование и анализ бактериальных геносенсоров для детекции токсичности окружающей среды
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Лихошвай В.А., Качко А.В., Степанова Т.Ю., Ощепков Д.Ю., Задорожный А.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.

2008 Cистемная компьютерная биология. Ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А., Изд-во СО РАН, Новосибирск
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Качко А.В., Степаненко И.Л., Колчанов Н.А.

Методы моделирования динамики молекулярно-генетических систем
Лихошвай В.А., Ратушный А.В., Бажан. С.И., Ощепкова Е.А., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.

Регуляторные последовательности ДНК: описание в базах данных.
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Меркулова Т.И., Меркулов В.М., Мищенко Е.Л., Ибрагимова С.С., Смирнова О.Г., Подколодный Н.Л., Ромащенко А.Г., Ощепков Д.Ю., Мигинский Д.С.

2006 ARTSITE DATABASE: COMPARISON OF IN VITRO SELECTED AND NATURAL BINDING SITES OF EUKARYOTIC TRANSCRIPTION FACTORS
Khlebodarova, O. Podkolodnaya, D. Oshchepkov, D. Miginsky, E. Ananko, E. Ignatieva

TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS DATABASE (TRRD): A SOURCE OF EXPERIMENTALLY CONFIRMED DATA ON TRANSCRIPTION REGULATORY REGIONS OF EUKARYOTIC GENES
N. Kolchanov, E. Ignatieva, O. Podkolodnaya, E. Ananko, I. Stepanenko, T. Merkulova, T. Khlebodarova, V. Merkulov, N. Podkolodny, D. Grigorovich, A. Poplavsky, A. Romashchenko


Конференции

2017 Расстройства аутистического спектра как проявление нарушений функций синапсов.
Трифонова Е.А., Хлебодарова Т.М., Когай В.В., Лихошвай В.А.
[Всероссийская научно-практическая конференции с международным участием "Современные проблемы клинической психологии и психологии личности"]
Эмпирический критерий существования хаоса в уравнениях с запаздывающим аргументом
Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Математика в современном мире. Международная конференция, посвященная 60-летию Института математики им. С. Л. Соболева.]
Сложная динамика локальной трансляции в синапсе: математическая модель
Е.А. Трифонова, Т.М. Хлебодарова, В.В. Когай, В.А. Лихошвай
[Международная конференция, посвященная столетию со дня рождения академика АН СССР Д.К.Беляева «Беляевские чтения»]
Эмпирический критерий существования хаоса в уравнениях с запаздывающим аргументом
Лихошвай В.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[Марчуковские научные чтения]
Membrane potential as a new factor, modulating periplasmic nitrite reductase activty.
Ree N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[The Ninth International Yong Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics”]
Стазис, периодичность и прерывистость в эволюции глобальных экосистем: математическая модель.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[III Международная конференция «Современные проблемы биологической эволюции», посвященной 130-летию со дня рождения Н.И. Вавилова и 110-летию со дня основания Государственного Дарвиновского музея]
2016 Минимальная логистическая модель эволюции глобальной экосистемы
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[VI Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика"]
Фенотипическая множественность клеточного цикла – следствие универсальных свойств сопряженной системы транскрипции-трансляции
Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[VI Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика"]
Biomolecular systems models semi-automatic reconstruction based on structural and quantitative information
F.V. Kazantsev, I.R. Akberdin, S.A. Lashin, Natalia Ree, Vladimir Timonov, A.V. Ratushny, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai
[BGRS/SB’16, Novosibirsk]
Chaos and hyperchaos in the alternative splicing model.
Kogai V.V., Likhoshvai V.A., Fadeev S.I., Khlebodarova T.M.
[The 2nd International Conference «Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology».]
Role of membrane potential in nitrite utilization by Escherichia coli cells under low substrate concentration: the mathematical model.
Ree N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[The Tenth IC on Bioinformatics of Genome Regulation\Systems Biology.]
Математическая биология гена: генные сети и хаос.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И., Когай В.В.
[8-я международная молодежная научная школа-конференция «Теория и численные методы решения обратных и некорректных задач».]
2015 Явление хаоса в математической модели альтернативного сплайсинга мРНК
Когай В.В., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[«Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики», посвященной 90-летню со дня рождения академика Г.И. Марчука.]
2014 Complex dynamics in systems of alternative mRNA splicing: a mathematical model.
Kogai V.V., Fadeev S.E., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology]
KINET 1.0 - a new web database on kinetics data and parameters for E.coli metabolic pathways
Ermak T.V., Akberdin I.R., Timonov V.S., Mischenko E.L., Oshchepkova E.A., Perfilyeva O.A., Smirnova O.G., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
Kinetic modeling of pyrimidine biosynthesis is a first step to in silico bacterial cell
Akberdin I.R., Ermak T.V., Kazantsev F.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
TAT-REV regulation of HIV-1 replication: Mathematical model predicts the existence of oscillatory dynamics.
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Bazhan S.I., Gainova I.A., Chereshnev V.A., Bocharov G.A.
[9-th IC on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology,]
Кинетическое моделирование метаболических путей в бактериальной клетке
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Шестой съезд ВОГиС]
Математическое моделирование Tat-Rev регуляции репликации HIV-1
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Бажан С.И., Гайнова И.А., Черешнев В.А., Бочаров Г.А.
[V МК “Математическая биология и биоинформатика” (ICMBB'2014)]
О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при микромолярных концентрациях субстрата в хемостате.
Ри Н.А., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика (ICMBB’2014)]
О типе закона роста бактериальной клетки
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика” (ICMBB’2014)]
Реконструкция механизмов регуляции экспрессии гена dps Escherichia coli при стрессе по кинетическим данным.
Хлебодарова Т.М., Степанова Т.Ю., Ощепков Д.Ю., Бабкин И.В., Тикунова Н.В., Лихошвай В.А.
[V МК “Математическая биология и биоинформатика” (ICMBB’2014)]
2013 Математические модели метаболических процессов в бактериальной клетке
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Методы создания, исследования и идентификации математических моделей]
Mathematical modeling of gene network dynamics in E. coli
I. Akberdin, F. Kazantsev, T. Ermak, V. Timonov, T. M. Khlebodarova, V. A. Likhoshvai
[38-ой Конгресс FEBS]
KiNET – a new web database on kinetics data and parameters for E.coli
Ермак Т., Акбердин И.Р., Тимонов В.С., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Пятая международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» - 5th International Young Scientists School «Systems Biology and Bioinformatics», SBB’2013]
MGSmodelsDB – a new database on mathematical models of biomolecular systems
F.V. Kazantsev, I.R. Akberdin, V.V. Timonov, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai
[BREW 2013: Bioinformatics Research and Education Workshop]
2012 Компьютерное моделирование динамики функционирования молекулярно-генетических систем E.coli
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В, Ри Н.А., Тимонов В.А., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Четвертая международная конференция «Математическая биология и биоинформатика»]
Modeling and analysis of dynamics of the gene networks: automatic generation and storage in a new database
Akberdin I.R., Kazantsev F.V., Ree N.A., Timonov V.S., Oshchepkova E.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Likhoshvai V.A.
[Международный симпозиум "Syspatho-Системная биология и медицина"]
ABOUT SHIFT FUNCTION OF IRREGULAR POLYMERS SYNTHESIS IN MODELS OF THE MATRIX SYNTHESIS.
V.A. Likhoshvai, S.I. Fadeev, T.M. Khlebodarova
[The Eighth IC on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology]
KINET – A NEW WEB DATABASE ON KINETICS DATA AND PARAMETERS FOR E. COLI
Ermak T., Timonov V.S., Akberdin I.R., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
MODELING AND ANALYSIS OF DYNAMICS OF THE RIBOPYRIMIDINES DE NOVO BIOSYNTHESIS IN E. COLI
Khlebodarova T.M., Akberdin I.R., Fadeev S.I., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
Multiple solutions under modeling of the nitrate utilization system in Escherichia coli.
Ri N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[The Eighth IC on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology]
Математическое моделирование клеточного цикла прокариот: согласование темпов роста объема клетки и репликации ДНК
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[IV Международная конференция “Математическая биология и биоинформатика”,]
Математическое моделирование метаболизма нитрита при культивировании клеток Escherichia coli в проточном хемостате.
Ри Н.А., Хлебодарова Т.М., Когай В.В., Фадеев С.И., Лихошвай В.А.
[IV Международная конференция “Математическая биология и биоинформатика”]
2011 Новая база математических моделей элементарных подсистем клетки Escherichia coli
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ри М.Т., Ри Н.А., Насонов В.В., Тимонов В.С., Лашин С.А., Ощепкова Е.А., Ратушный А.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»]
Automatic generation of mathematical models of molecular-genetic systems
Akberdin I., Kazantsev F., Ree M., Ree N., Timonov V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2011)]
MGSMODELSDB – Новая база математических моделей элементарных подсистем клетки Escherichia coli
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ри М.Т., Ри Н.А., Тимонов В.С., Ощепкова Е.А., Ратушный А.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[VI Московский международный конгресс. «Биотехнология: состояние и перспективы развития»]
Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияние мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Пономаренко М.П., Игнатьева Е.В., Левицкий В.Г., Савинкова Л.К., Захаренко Л.П., Пинтус С.С., Суслов В.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
[Программа фундаментальных исследований Президиума РАН. № 11. “Биологическое разнообразие”. Подпрограмма “Генофонды и генетическое разнообразие”. Сборник материалов. – Москва: ИОГен. 2011. С. 100-104.]
Математическое моделирование биосинтеза нуклеотидов de novo у Escherichia coli
Ри М.Т., Захарцев М.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»]
Моделирование метаболизма пуринов и пиримидинов de novo в клетке E. coli
Лихошвай В.А., Ри М.Т., Когай В.В, Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И.
[VI Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», часть II, Москва, март 21-25, 2011, стр. 385-386]
2010 The mathematical modeling of nitrite metabolism regulation in Escherichia coli cell during nitrate respiration under anaerobic conditions.
Ree N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[International conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB’10)]
Control of Escherichia coli dps gene expression in response to toxic action of cadmium.
Stepanova T.Y., Likhoshvai V.A., Babkin I.V., Khlebodarova T.M.
[International conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology. (BGRS/SB’10)]
E.coli proteom expression under terahertz irradiation
Peltek S.E., Mesheryakova I.A., Goryachkovskaya T.N., Demidova E.V., Demidov E.A., Khlebodarova T.M., Oschepkov D.Yu., Kolchanov N.A., Popik V.M., Scheglov M.A., Vinokurov N.A., Kulipanov G.N., Nikolaev E.N.
[Terahertz radiation: generation and application]
Mathematical modeling of nucleotide biosynthesis in Escherichia coli.
Ree M.T., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[International conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB’10)]
Similarities and differences in the structures of artificial and natural transcription factor binding sites: impact of flanking sequences to recognition performance.
Oshepkov D.Y., Levitsky V.G., Khlebodarova T.M.
[International conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB’10)]
The nanobiotechnology database
V.A. Ivanisenko, N.L. Podkolodnyy, P.S. Demenkov, T.V. Ivanisenko, N.N. Podkolodnaya, T.M. Khlebodarova, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, E.A. Ananko, and N.A. Kolchanov
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'2010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
2009 A novel promoter of the Escherichia coli yfiA gene and pathways of its regulation under oxidative stress conditions
T.M. Khlebodarova, A.V. Zadorozhny, V.A. Likhoshvai, N.V. Tikunova, D.Yu. Oschepkov, N.A. Kolchanov.
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 09)]
Experimental study of predicted regulation pathways of E.coli/pYFI-GFP genosensor under oxidative stress
A.V. Zadorozhny, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai, D.Yu. Oschepkov, N.V. Tikunova.
[German-Russian Forum Biotechnology GRFB'09]
Prediction of the regulation pathways of the Еscherichia coli dps gene expression under stress conditions.
T.Yu. Stepanova, D.Yu. Oshchepkov, V.A. Likhoshvai, A.V. Zadorozhny, N.V. Tikunova, T.M. Khlebodarova.
[German-Russian Forum Biotechnology GRFB'09]
Нанобиотехнология: извлечение знаний методами text-mining
Иванисенко В.А., Деменков П. С., Подколодный Н.Л., Яркова Е. Э., Иванисенко Т. В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.
[Пятый московский международный конгресс “Биотехнология: состояние и перспективы развития”]
Реконструкция механизмов регуляции экспрессии гена dps Еscherichia coli в присутствии ионов кадмия.
Т.Ю. Степанова, В.А. Лихошвай, А.В. Задорожный, Н.В. Тикунова, Д.Ю. Ощепков, Т.М. Хлебодарова.
[Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Ч. Дарвина и Пятый съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров]
2008 Analysis of the evolutionary specificities of the yfiA and yhbh E.Coli genes and their regulatory regions.
Baryshev P.S., Oshchepkov D.Y., Khlebodarova T.M., Afonnikov D.A.
[Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
Approval method for transcription termination sites prediction in firmicutes
S.A. Lashin, Yu.G. Matushkin, T.M, Khlebodarova, V.A. Likhoshvai.
[Sixth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure (BGRS)]
Genetic constructor: a computer resource for molecular-genetic systems modeling
V.A. Likhoshvai, N.V. Tikunova, A.V. Kachko, T.M. Khlebodarova.
[Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
Mathematical modeling of genetic regulation of pyrimidine biosynthesis in Escherichia coli
M.T. Ri, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai.
[Sixth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure]
Nanobiotechnology and its application to biomedicine: text-mining knowledge extraction and integration
Ivavisenko V.A. Demenkov P.S., Yarkova E.E., Ivavisenko N.V., Ivavisenko T.V. Sournina N.Yu., Podkolodny N.L., Khlebodarova T.M., Ibragimova S.S., Smirnova O.G.
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
Prediction of the regulatory mechanisms of Escherichia coli yfiA gene expression
T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai, D.Y. Oshchepkov, A.V. Kachko, N.V. Tikunova.
[Sixth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure (BGRS)]
Информационные ресурсы для дизайна новых геносенсоров. разработка полифункциональных геносенсоров на основе промоторов генов yfiA и dps Escherichia coli
Т. М. Хлебодарова, А.В. Качко, Н.В. Тикунова, В.А. Лихошвай, Т.Ю.Степанова, Д.Ю. Ощепков, И.Л. Степаненко, Ю.Г. Матушкин
[IV съезд Российского Общества биохимиков и молекулярных биологов, 10-15 мая, Новосибирск, 2008]
2007 Deducing the mechanisms underlying expression regulation of a polyfunctional genosensor based on the promoter of Escherichia coli gene yfiA.
T.M. Khlebodarova, A.V. Kachko, D.Yu. Oshchepkov, N.V. Tikunova, V.A. Likhoshvai.
[«Basic sciences - medicine»]
Применение терагерцового излучения для анализа биологических объектов
Горячковская Т.Н., Козлов А.С., Колчанов Н.А., Малышкин С.Б., Пельтек С.Е., Петров А.К., Попик В.М., Тарабан М.Б., Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Щеглов М.А.
[Всероссийский семинар по радиофизике миллиметровых и субмиллиметровых волн]
2006 A mathematical model for the Influenza virus life cycle.
Akberdin I.R., Kashevarova (Ree) N.A., Khlebodarova T.M., Bazhan S.I., Likhoshvai V.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
A minimum mathematical model for suppression HCV RNA replication in cell culture
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Иванисенко В.А.
[The 2d All-Russian Conference "Infocommunication and Computing Technologies and Systems", Ulan-Ude]
A minimum mathematical model for suppression HCV RNA replication in cell culture.
Bezmaternikh K.D., Mishenko E.L., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ivanisenko V.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
BiotechPro: a database for microbiologically synthesized products of biotechnological value.
Ibragimova S.S., Smirnova O.G., Grigorovich D.A., Khlebodarova T.M.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Database GenSensor as informational source for design of biosensors. Experimental development of biosensor based on yfiA gene
Khlebodarova T.M., Kachko A.V., Stepanenko I.L., Tikunova N.V.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Gene network reconstruction and mathematical modeling of E. coli respiration: regulation of F0F1-ATP synthase by metal ions.
Khlebodarova T.M., Lashin S.A., Apasieva N.V.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Hepatitis C virus: application of gene networks technology to searching for perspective pharmacological targets
Ivanisenko VA, Mischenko EL, Bezmaternikh KD, Ratushny AV, Likhoshvai VA,Titov II, Korotkov RO, Khlebodarova TM, Kolchanov NA.
[3rd International conference "Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine" July 12-16, 2006, Novosibirsk, Russia]
In silico cell II. Information sources for modeling Escherichia coli metabolic pathways.
Khlebodarova T.M., Ananko E.A., Nedosekina (Oschepkova) E.A. Podkolodnaya O.A., Poplavsky A.S., Smirnova O.G., Ibragimova S.M., Mishenko E.L., Stepanenko I.L., Ignatieva E.V., Proskura A.L., Nishio Imaizumi, Usuda Matsui, Podkolodny N.L.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Mathematical model for suppression of hepatitis C virus RNA replicon replication in cell culture
Bezmaternikh K.D., Mishchenko E.L., Ratushny A.V., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ivanisenko V.A.
[The VII All-Russian young scientists conference on mathematical modeling and informatics technology (with foreign participants), Krasnoyarsk]
Mathematical modeling of regulation of cyoABCDE operon expression in Escherichia coli.
Ratushny A.V., Khlebodarova T.M.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Nano/microfluid bio-analytical systems
Pel'tek S.E., Pindyurin V.F., Popik V.M., Scheglov M.A., Goldenberg B.G., Eliseev V.S., Petrova E.V., Tikunova N.V., Rubtsov N.B., Goraychkovskaya T.N., Khlebodarova T.M., Govorun V.M., Kulipanov G.N., Kolchanov N.A.
[The XVI Intern. Synchrotron Radiation Conference (SR-2006), July 10-14, 2006, BINP, Novosibirsk, Russia]
System computer biology in Institute of Cytology of SB RAS
Yu. Matushkin, E. Ananko, D. Afonnikov, V. Golomolzin, V. Ivanisenko, E. Ignat’eva, A. Katokhin, V.Likhoshvai, D. Miginskii, N. Omelyanchuk, S. Peltek, T. Khlebodarova, N. Kolchanov
[Saint-Petersburg International Workshop on NanoBiotechnologies]
TRRD: a database on experimentally identified transcription regulatory regions and transcription factor binding sites.
Kolchanov N.A., Podkolodnaya O.A., Ananko E.A., Ignatieva E.V., Stepanenko I.L., Khlebodarova T.M., Merkulov V.M., Merkulova T.I., Podkolodny N.L., Romashchenko A.G.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Молекурно-генетические механизмы регуляции дыхания клетки E.coli: реконструкция генной сети и математическое моделирование
Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[The 2d All-Russian Conference "Infocommunication and Computing Technologies and Systems", Ulan-Ude]

Гранты

2016 Математические проблемы биологии гена
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И., Когай В.В.

2013 Математическая биология гена
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Новоселова Е.С., Перфильева О.А., Фадеев С.И., Когай В.В.

2012 ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО-РАЗНОСТНЫЕ И ИНТЕГРОДИФФЕРЕНЦИАЛЬНЫЕ УРАВНЕНИЯ. ПРИЛОЖЕНИЯ К ЗАДАЧАМ ЕСТЕСТВОЗНАНИЯ
общее кол-во = 72 человека

2011 Изучение молекулярных механизмов быстрых негеномных эффектов альдостерона в собирательных трубках почки крысы в постнатальном онтогенезе
Логвиненко Нинель Степановна, Гербек Юрий Эмильевич, Хлебодарова Тамара Михайловна, Тинников Александр Анатольевич, Кабилова Наталья Олеговна

2010 Симметрия и хаос в генных сетях
Лихошвай Виталий Александрович руководитель Акбердин Илья Ринатович исполнитель Казанцев Федор Владимирович исполнитель Когай Владислав Владимирович исполнитель Фадеев Станислав Иванович исполнитель Хлебодарова Тамара Михайловна исполнитель Новоселова Екатерина Сергеевна исполнитель Ри Наталья Александровна

2009 Разработка Веб-ориентированной экспертной системы, предназначенной для распознавания взаимосвязанных белков, выявленных с применением постгеномных методов
Колчанов Н.А., Подколодный Н.Л., Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Медведева И.В., Тийс Е.С., Брагин А.О., Игнатьева Е.В., Ананько Е.В., Подколодная Н.Н., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М.

Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Акбердин Илья Ринатович, Гунбин Константин Владимирович, Захаренко Л.П., Иванисенко Владимир Александрович, Игнатьева Елена Васильевна, Казанцев Федор Владимирович, Левицкий Виктор Георгиевич, Лихошвай Виталий Александрович, Омельянчук Надежда Анатольевна, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Пинтус Сергей Сергеевич, Пономаренко Михаил Павлович, Пономаренко Петр Михайлович, Ри Максим Тексенович, Савинкова Людмила Кузминична, Суслов Валентин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Хлебодарова Тамара Михайловна

Методы исследования дифференциально-разностных уравнений и приложения к задачам биологии и химии
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Омельянчук Н.А., Акбердин И.Р., Безматерных К.Д., Миронова В.В., Ри М.Т., Казанцев Ф.В., Новоселова Е.С. и др.

ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
76 человек

2008 Создание баз данных в области нанобиотехнологии как элементов информационной составляющей инфраструктуры наноиндустрии
В.А. Иванисенко, Н.Л. Подколодный, П.С. Деменков, Т.В. Иванисенко, О.А. Подколодная, Е.В. Игнатьева, Т.М. Хлебодарова, Н.Н. Подколодная, Е.А. Ананько, С.С. Гончаров, Н.А. Колчанов

Исследование молекулярных механизмов быстрой негеномной регуляции альдостероном эпителиального натриевого канала в дистальном сегменте нефрона крысы
Логвиненко Нинель Степановна,Тинников Александр Анатольевич, Кабилова Наталья Олеговна, Хлебодарова Тамара Михайловна

Компьютерная реконструкция потенциальных регуляторных районов E.coli и механизмов их функционирования. Экспериментальное подтверждение разработанных моделей
Лихошвай Виталий Александрович, Бабкин Игорь Викторович, Качко Алла Васильевна, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Ри Наталья Александровна, Степаненко Ирина Лембитовна, Степанова Татьяна Юрьевна, Тикунова Нина Викторовна

2007 Конструирование геносенсоров и оценка их чувствительности к токсическим воздействиям
Колчанов Н.А., Хлебодарова Т.М., Афонников Д.А., Кучумова Л.Я., Качко А.В., Тикунова Н.В.

Разработка универсальных геносенсоров для детекции общей токсичности, мутагенности и техногенных стрессов
Д.А.Афонников В.А.Лихошвай О.В. Ефремова Т.М.Хлебодарова И.Л.Степаненко Ю.Г.Матушкин Н.В.Тикунова И.В. Бабкин А.В. Качко Л.Я. Кучумова

2006 РОЛЬ МИКРООРГАНИЗМОВ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И БИОИНЖЕНЕРНЫЕ ПРИЛОЖЕНИЯ
113 исполнителей из 10 Институтов СО РАН

2005 Исследование механизмов регуляции альдостероном внутриклеточного натрия в дистальном сегменте нефрона в постнатальном онтогенезе
Логвиненко Нинель Степановна, Хлебодарова Тамара Михайловна, Кабилова Наталья Олеговна, Тинников Александр Анатольевич

2000 Экспериментальный поиск ключевого звена стресс-реакции (модель Drosophila)
Грунтенко Наталия Евгеньевна, Хлебодарова Тамара Михайловна, Ченцова Надежда Алексеевна, Васенкова Ирина Александровна, Адоньева Наталья Васильевнаовна, Карпова Евгения Константиновна, Андреенкова (Бурдина) Елена Владимировна, Шубина Тамара Николаевна, Носатова Ирина Борисовна

1997 Закономерности экспрессии генных систем, контролирующих стресс-реакцию (модель Drosophila)
Раушенбах Инга Юрьевна, Хлебодарова Тамара Михайловна, Грунтенко Наталия Евгеньевна, Шумная Людмила Владимировна, Гренбэк Лариса Георгиевна, Ченцова Надежда Алексеевна, Суханова Мадина Жантасовна, Шубина Тамара Николаевна, Васенкова Ирина Александровна


Научное руководство

2008 Исследование механизмов регуляции геносенсора на основе промотора гена dps Escherichia coli [Степанова Татьяна Юрьевна]
2007 Реконструкция и моделирование генной сети онтогенеза вируса гриппа типа А [Кашеварова Наталья Александровна]
2000 Анализ взаимосвязи клеточного и нейроэндокринного ответов на стресс у Drosophila
Хлебодарова Т.М., Раушенбах И.Ю.
[Васенкова Ирина Александровна]
1996 Роль системы деградации ювенильного гормона в стресс-реакции имаго и адаптации популяций Drosophila к неблагоприятным условиям среды
Хлебодарова Т.М., Раушенбах И.Ю.
[Грунтенко Наталия Евгеньевна]

Патенты

2013 Программа для доступа и отображения кинетических данных биохимических реакций (Веб-КиНЕТ)
Лихошвай В.А., Акбердин И.Р., Ермак Т.В., Тимонов В.С., Хлебодарова Т.М.

2012 База данных "Элементарные подсистемы: метаболизм E.coli" (ЭлСи: E.coli)/ Database "Elementary subsystems: E.coli metabolism" (ElSy: E.coli)
Лихошвай В.А., Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ри М.Т., Ри Н.А., Хлебодарова Т.М., Лашин С.А., Ощепкова Е.А., Ратушный А.В.

2010 Рекомбинантная плазмидная ДНК pYfi-gfp, кодирующая продукцию флюоресцентного белка GFPaav и штамм бактерий Escherichia coli JM109-pYfi продуцирующий флюоресцентный белок GFPaav в присутствии токсических агентов
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Качко А.В., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.

База данных нанобиоматериалов (НАНОБИОБАЗА)/Nanobiomaterial database (NANOBIOBASE)
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.

База данных нанобиотехнологий (НАНОБИОТЕХБАЗЕ)/Nanobiotechnology database (NANOBIOTECHBASE)
Иванисенко В.А., Деменков П.С., Иванисенко Т.В., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Колчанов Н.А.

2009 База данных: Матрицы функциональных сайтов связывания транскрипционных факторов про- и эукариот (RealSite)
Хлебодарова Т.М., Степаненко И.Л., Игнатьева Е.В., Ананько Е.А., Подколодная О.А.

Штамм бактерий Escherichia coli для тестирования присутствия в среде фенола и перекиси водорода.
Качко А.В., Тикунова Н.В., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.

2007 База данных: Сайты связывания транскрипционных факторов (ТФСАЙТ)/ Transcription factor sites database (TFSITE).
Степаненко И.Л., Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Хлебодарова Т.М., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.

База данных: Транскрипционный Фактор-Ген Млекопитающих взаимодействия (ТФГМВ)/ Transcription Factor- Mammalian Gene Interactions (TFMGI)
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Игнатьева Е.В., Генаев М.А.

База данных: Экспрессия эукариотических генов (ЭуГенЭксп) / Eukaryotic Gene Expression Database (EuGenExp)
Ананько Е.А., Игнатьева Е.В., Подколодная О.А., Степаненко И.Л., Хлебодарова Т.М., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.

База данных: Геносенсорные конструкции (ConSensor)
Хлебодарова Т.М., Подколодный Н.Л.

База данных: Биотехнологически значимые продукты (BiotechPro)
Ибрагимова С.М., Смирнова О.Г., Григорович Д.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.

2006 База данных: Регуляторные районы генов прокариот (ProkaTEX)
Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Подколодная О.А., Поплавский А.С., Наумочкин А.Н., Смирнова О.Г., Степаненко И.Л., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.

База кинетических данных (KiNET)
Недосекина Е.А., Хлебодарова Т.М., Поплавский А.С., Смирнова О.Г., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Ибрагимова С.М., Мищенко Е.Л., Игнатьева Е.В., Подколодный Н.Л., Колчанов Н.А.

База данных: Гены-сенсоры (GenSensor)
Хлебодарова Т.М., Степаненко И.Л., Подколодный Н.Л.

База данных: Матрицы сайтов связывания транскрипционных факторов (ArtSite)
Хлебодарова Т.М.

База данных: Районы позиционирования нуклеосом (NPRD).
Левицкий В.Г., Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Фурман Д.П., Катохин А.В., Смирнова О.Г., Хлебодарова Т.М.

© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.