ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Шмаков Николай Александрович

Подразделение: 137. Сектор биоинформ. и информац. технологий в генетике
Совместительство: 157. Отделение "Курчатовский геномный центр ИЦиГ СО РАН"
190. Лаб.генет.дегенерации межпозвонковых дисков.
180. Лаб.молекул.генетики полифенол.метаболизма растений
Должность: младший научный сотрудник
Комната: 1301
Email: shmakov@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*1301


Scopus: 56708648900
Индекс WOS: AAO-2336-2020



Публикации

2023 Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia
Dmitry I. Karetnikov, Gennady V. Vasiliev, Stepan V. Toshchakov, Nikolay A. Shmakov, Mikhail A. Genaev, Mikhail A. Nesterov, Salmaz M. Ibragimova, Daniil A. Rybakov, Tatjana A. Gavrilenko, Elena A. Salina, Maxim V. Patrushev, Alex V. Kochetov and Dmitry A. Afonnikov
[INT J MOL SCI]
Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato
Alex V. Kochetov, Nikolay Shmakov, Dmitry A. Afonnikov, Gennady V. Vasiliev, Natalja V. Shatskaya, Anastasiya A. Egorova, Nina V. Mironenko, Nina M. Lashina, Alexander V. Khiutti and Olga S. Afanasenko
[Agronomy]
WAX INDUCER 1 Regulates β-Diketone Biosynthesis by Mediating Expression of the Cer-cqu Gene Cluster in Barley
Gerasimova, S.V.; Kolosovskaya, E.V.; Vikhorev, A.V.; Korotkova, A.M.; Hertig, C.W.; Genaev, M.A.; Domrachev, D.V.; Morozov, S.V.; Chernyak, E.I.; Shmakov, N.A.; Vasiliev, G.V.; Kochetov, A.V.; Kumlehn, J.; Khlestkina, E.K.
[INT J MOL SCI]
2022 Features of activity of the phenylpropanoid biosynthesis pathway in melanin-accumulating barley grains
Anastasiia Y. Glagoleva, Alexander V. Vikhorev, Nikolay A. Shmakov, Sergey V. Morozov, Elena I. Chernyak, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Elena K. Khlestkina, Olesya Y. Shoeva
[Frontiers in Plant Science]
QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color Characteristics Estimated by Digital Image Processing
Mian Abdur Rehman Arif, Evgenii G. Komyshev, Mikhail A. Genaev, Vasily S. Koval, Nikolay A. Shmakov, Andreas Börner and Dmitry A. Afonnikov
[Plants]
2021 NLR Genes Related Transcript Sets in Potato Cultivars Bearing Genetic Material of Wild Mexican Solanum Species
Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Antonova O.Y., Shatskaya N.V., Glagoleva A.Y., Ibragimova S.M., Khiutti A., Afanasenko O.S., Gavrilenko T.A.
[Agronomy]
Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы
Афонников, Д. А., Синицына, О. И., Голубева, Т. С., Шмаков, Н. А., Кочетов, А. В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
Улучшение качества сборки de novo транскриптомов ячменя на основе гибридного подхода для линий с изменениями окраски колоса и стебля
Шмаков Николай Александрович
[Vavilov journal of genetics and breeding]
2020 The mechanism of potato resistance to Globodera rostochiensis: comparison of root transcriptomes of resistant and susceptible Solanum phureja genotypes
Alex V. Kochetov, Anastasiya A. Egorova, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko and Tatjana A. Gavrilenko
[BMC PLANT BIOL]
2017 Achievements and Prospects of Applying High-Throughput Sequencing Techniques to Potato Genetics and Breeding
Bykova I.V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Kochetov A.V., Khlestkina E.K.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis
Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko
[BMC PLANT BIOL]
Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene
Anastasiya Y. Glagoleva, Nikolay A. Shmakov, Olesya Y. Shoeva, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Elena K. Khlestkina
[BMC PLANT BIOL]
RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION
Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[Acta Naturae]
Достижения и перспективы использования методов высокопроизводительного секвенирования в генетике и селекции картофеля
Быкова И.В., Шмаков Н.А., Афонников Д.А., Кочетов А.В., Хлесткина Е.К.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
2016 Identification of nuclear genes controlling chlorophyll synthesis in barley by RNA-seq
Shmakov N.A., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Doroshkov A.V., Gordeeva E.I., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[BMC PLANT BIOL]
2014 Эффективность использования генов bmy2, waxy и внутренних транскрибируемых спейсеров генов рибосомных рнк в качестве маркеров для изучения генетического разнообразия видов рода Elymus.
Шмаков Н.А., Афонников Д.А., Белавин П.А., Агафонов А.В.
[Vavilov journal of genetics and breeding]

Конференции

2023 Analysis of the genome structure and its variations in potato cultivars grown in Russia
Karetnikov D.I., Vasiliev G.V., Toshchakov S.V., Shmakov N.A., Genaev M.A., Nesterov M.A., Ibragimova S.M., Rybakov D.A., Gavrilenko T.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Afonnikov D.A.
[7th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen 2023)]
2022 Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight
Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T.
[13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
Plant immunity genes of Solanum tuberosum L. cultivars associated with resistance to potato late blight
Shmakov N., Kochetov A., Afonnikov D., Vasiliev G., Antonova O., Shatskaya N., Glagoleva A., Ibragimova S., Khiutti A., Afanasenko O., Gavrilenko T.
[13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
Large scale analysis of the crop transcriptomic data: analysis of out of the reference transcripts
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Shmakov N.A., Mustafin Z.S., Mukhin A.M., Lashin S.A.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022)]
RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF PANGENOME OF SIBERIAN CULTIVARS OF POTATO SOLANUM TUBEROSUM
Toschakov S.V., Gavrilenko T.A., Afonnikov D.A., Salina E.A., Patrushev M.V., Kochetov A.V., Karetnikov D.I., Genaev M.A., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Ibragimova S.M., Vasiliev G.V.
[III Всероссийская конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике» (HSG-2022)]
2021 Pan-transcriptomic analysis of Solanum tuberosum NLR genes regulating resistance to Phytophthora infestans
Shmakov N.A., Kochetov A.V., Afonnikov D.A., Vasiliev G.V.
[PlantGen2021]
Study of melanin and anthocyanin biosynthesis regulation in barley grain by transcriptomic analysis of near-isogenic lines with different pigment composition
Vikhorev A.V., Glagoleva A.Yu., Shmakov N.A., Kukoeva T.V., Khlestkina E.K., Shoeva O.Yu.
[PLANT GENETICS, GENOMICS, BIOINFORMATICS, AND BIOTECHNOLOGY (PLANTGEN2021)]
2020 Exploring interaction between metabolic pathways involved in pigmentation of barley spike
Anastasiia Yu. Glagoleva, Nikolay A. Shmakov, Aleksandr V. Vikhorev, Sergei R. Mursalimov, Natalia V. Gracheva, Tatjana V. Kukoeva, Olesya Yu. Shoeva, Elena K. Khlestkina
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020): The Twelfth International Multiconference]
Identification of an AP2/ERF Transcription Factor Controlling the Synthesis of Barley Epicuticular Wax
Ekaterina Kolosovskaya, Sophia Gerasimova, Anna Korotkova, Christian Hertig, Sergey Morozov, Elena Chernyak, Dmitriy Domrachev, Vikhorev Alexander, Nikolay Shmakov, Alexey Kochetov, Jochen Kumlehn, Elena Khlestkina
[12-ая Международная мультиконференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии / Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology, BGRS/SB-2020]
Study of the root transcriptome of bread wheat using high-throughput RNA sequencing (RNA-SEQ)
Vikhorev A., Shmakov N., Glagoleva A., Khlestkina E., Shoeva O.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020): The Twelfth International Multiconference]
ИССЛЕДОВАНИЕ ВЗАИМОСВЯЗИ СИНТЕЗА МЕЛАНИНА И ДРУГИХ ПИГМЕНТОВ В КОЛОСЕ ЯЧМЕНЯ
Глаголева А.Ю., Шмаков Н.А., Мурсалимов С.Р., Грачева Н.В., Кукоева Т.В., Шоева О.Ю., Хлесткина Е.К.
[24-я Международная Пущинская школа- конференция молодых ученых]
Изучение генетической регуляции накопления кутику-лярного воска ячменя при помощи анализа данных RNA-seq
Вихорев А., Шмаков Н., Колосовская Е., Короткова А., Герасимова С., Хлесткина Е.
[12-я Международная школа молодых ученых «Системная Биология и Биоинформатика» / 12th International young scientists school «System Biology and Bioinformatics», SBB-2020]
2019 Current achievements in study of black-spiked barley
Anastasiia Yu. Glagoleva, Sergey R. Mursalimov, Natalya V. Gracheva, Nickolay A. Shmakov, Natalya M. Levanova, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Olesya Yu. Shoeva, Elena K. Khlestkina
[5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding]
Novel genomic marker for the Alm locus in barley identified based on transcriptome analysis
N.A. Shmakov, A.Yu. Glagoleva, G.V. Vasiliev, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina
[PlantGen2019]
Study of genetic basis of the melanin biosynthesis in barley grain
Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Mursalimov S.R., Khlestkina E.K., Shoeva O.Yu.
[The Fifth International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2019)]
Studying of the molecular-genetic control of polyphenolic pigmentation in wheat and barley as a basis for breeding antioxidant-rich cereals
Shoeva O.Yu., Gordeeva E.I., Kukoeva T.V., Strygina K.V., Vikhorev A.V., Glagoleva A.Yu., Shmakov N.A., Levanova N.M., Mursalimov S.R., Yudina R.S., Börner А., Khlestkina E.K.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы]
Transcriptomic analysis of barley partial albinism
Nickolay Shmakov, Anastasiya Glagoleva, Gennadiy Vasiliev, Dmitry Afonnikov, Elena Khlestkina
[5th Conference on Cereal Biotechnology and Breeding]
Выявление генов-кандидатов локуса Blp, контролирующего формирование признака чёрной окраски колоса ячменя (Hordeum vulgare l.)
Глаголева А.Ю., Шмаков Н.А., Мурсалимов С.Р., Хлесткина Е.К., Шоева О.Ю.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы]
ИССЛЕДОВАНИЕ ТРАНСКРИПТОМА ПОЧТИ ИЗОГЕННОЙ ЛИНИИ ЯЧМЕНЯ С ЧАСТИЧНЫМ АЛЬБИНИЗМОМ
Шмаков Н.А., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А., Хлёсткина Е.К.
[БИОТЕХНОЛОГИЯ: СОСТОЯНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ]
ИССЛЕДОВАНИЕ ЧАСТИЧНОГО АЛЬБИНИЗМА ЯЧМЕНЯ С ПОЗИЦИИ ТРАНСКРИПТОМИКИ
Шмаков Н. А., Глаголева А.Ю., Афонников Д.А., Хлёсткина Е.К.
[VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)]
2018 Genetic control of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in potato plants Solanum phureja
A.A.Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov
["PLANT FUNCTIONING UNDER ENVIRONMENTAL STRESS" SEPTEMBER 12 - 15, 2018, CRACOW, POLAND.]
Genetic mechanisms of resistance to golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis in Solanum phureja
A.A. Egorova, N.A. Shmakov, S.V. Gerasimova, G.V. Vasilyev, N.V. Shatskaya, K.V. Strygina, D.A. Afonnikov, A.V. Kochetov
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” – BGRS\SB-2018]
Identification of genes, associated with black pigmentation of seeds in cereals, based on transcriptomic analysis.
A.Yu. Glagoleva, N.A. Shmakov, O.Yu. Shoeva, G.V. Vasiliev, N.V. Shatskaya, A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina
[The Tenth International Young Scientists School (SBB-2018)]
Investigating genetic control of pigmentation in mutant barley lines with RNA-seq. BGRS, 2018
N.Shmakov, A.Glagoleva, A.Doroshkov, G.Vasiliev, N.Shatskaya, D.Afonnikov, E.Khlestkina
[BGRS\SB-2018 The 11th International Conference Systems Biology and Biomedicine, SBioMed-2018 Symposium]
Анализ транскриптов, специфичных для линии картофеля, устойчивой к золотистой картофельной нематоде, из данных RNA-seq
Н.А. Шмаков, А.Ю. Глаголева, К.В. Стрыгина, А.В. Егорова, Д.А. Афонников, А.В. Кочетов
[Теоретические основы и прикладные исследования в селекции и семеноводстве картофеля]
2017 GENETICS AND OMICS APPROACHES TO BETTER UNDERSTANDING REGULATION OF METABOLI C PATHWAYS UNDERLYING PIGMENTATION IN WHEAT AND BARLEY
O.Y. Shoeva, E.I. Gordeeva, N.A. Shmakov, K.V. Strygina, A.Y. Glagoleva, T.V. Kukoeva , N.V. Shatskaya , G.V. Vasiljev , A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina*
[4-ая международная научная конференция "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений" (PlantGen2017)]
IDENTIFICATION OF GENES CONTROLLING BLACK PIGMENTATION IN CEREALS
Glagoleva A.Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N. V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Shoeva O. Y., Börner A., Khlestkina E.K.
[4th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)]
RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION
Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K.
[II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике" (HSG-2017)]
ЗНАЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ ПРЯМОЙ И ОБРАТНОЙ ГЕНЕТИКИ РАСТЕНИЙ
Хлесткина Е.К.*, Афонников Д.А., Бернер А., Быкова И.В., Васильев Г.В., Герасимова С.В., Глаголева А.Ю., Гордеева Е.И., Григорьев Ю.Н., Короткова А.М., Пшеничникова Т.А., Стрыгина К.В., Шацкая Н.В., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Юдина Р.С.
[III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)]
ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ЧЕРНОЙ ОКРАСКОЙ КОЛОСА У ЗЛАКОВ, НА ОСНОВЕ ТРАНСКРИПТОМНОГО АНАЛИЗА
Глаголева А.Ю., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Бернер А., Афонников Д.А., Хлесткина Е.К.
[IV Вавиловская международная конференция «Идеи Н. И. Вавилова в современном мире»]
2015 THE STRUCTURAL ORGANIZATION OF THE REGIONS SPANNING 5S rRNA GENES LOCATED ON 5BS CHROMOSOME OF TRITICUM AESTIVUM L.
Sergeeva E.M., Koltunova M., Nesterov M.A., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Salina E.A.
[The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”]

Гранты

2020 Разработка и анализ точных генетических моделей для исследования взаимодействия путей биосинтеза пигментов фенольной природы в зерновке ячменя
Глаголева Анастасия Юрьевна, Шмаков Николай Александрович, Вихорев Александр Викторович, Новокрещёнов Леонид Александрович

2016 Дуплицированные гены в аллополиплоидном геноме пшеницы - вклад в формирование тканеспецифичных регуляторных механизмов
Глаголева Анастасия Юрьевна, Гордеева Елена Ивановна, Иванисенко Никита Владимирович, Короткова Анна Михайловна, Кукоева Татьяна Владимировна, Стрыгина Ксения Владимировна, Хлесткина Елена Константиновна, Шмаков Николай Александрович

2015 Молекулярно-генетические механизмы формирования окраски овощных и злаковых культур
Хлесткина Елена Константиновна, Кильчевский Александр Владимирович, Бабак Ольга Геннадьевна, Шоева Олеся Юрьевна, Некрашевич Наталья Александровна, Гордеева Елена Ивановна, Юдина Римма Сергеевна, Никитинская Татьяна Владимировна, Яцевич Констанция Константиновна, Кукоева Татьяна Владимировна, Шмаков Николай Александрович, Глаголева Анастасия Юрьевна

2013 Регуляторные гены биосинтеза флавоноидов злаков и их роль в увеличении продолжительности жизни семян и устойчивости растений к неблагоприятным факторам окружающей среды
Хлесткина Елена Константиновна, Шоева Олеся Юрьевна, Петраш Надежда Владимировна, Шмаков Николай Александрович

© 2010-2024 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.