ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Генаев Михаил Александрович, к. б. н.

Подразделение: 014. Лаб. эволюц. биоинформ. и теор. генетики
Совместительство: 116. Лаб. генетических основ доместикации
Должность: научный сотрудник
Комната: 1317
Email: mag@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*1317


Персональная информация

Дата рождения

14.04.1986

Образование

НГУ ФИТ – 2008



Публикации

2016 Evaluation of the SeedCounter, a Mobile Application for Grain Phenotyping
Komyshev E., Genaev M., Afonnikov D.
[Frontiers in Plant Science]
Methods of high-throughput plant phenotyping for large-scale breeding and genetic experiments
D. A. Afonnikov, M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. G. Komyshev, T. A. Pshenichnikova
[RUSS J GENET+]
Протокол анализа количественных характеристик опушения листа картофеля
А.В. Дорошков, М.А. Генаев, Д.А. Афонников
[Вавиловский журнал генетики и селекции.]
2015 Computer high-throughput approaches to wheat phenotyping: application to leaf pubescence analysis
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A. Simonov A.V.
[The 3rd Intern. Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”, Abstract book]
2013 BioUniWA – СИСТЕМА ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ И КОНВЕЙЕРОВ ДЛЯ УНИФИЦИРОВАННОГО ДОСТУПА К РЕСУРСАМ В ОБЛАСТИ БИОИНФОРМАТИКИ
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
The antioxidant enzymes activity in leaves of inter-varietal substituion lines of wheat (Triticum aestivum L.) with different tolerance to soil water deficit
S.V. Osipova, A.V. Permyakov, M.D. Permyakova, M.A. Genaev, A. Börner
[Acta Physiologia Plantarum]
Компьютерный анализ данных экспрессии генов в клетках мозга, полученных с помощью микрочипов и высокопроизводительного секвенирования
Медведева И.В., Вишневский О.В., Сафронова Н.С., Кожевникова О.С., Генаев М.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Орлов Ю.Л.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2012 BioInfoWF – система автоматической генерации веб-интерфейсов и веб-сервисов для биоинформационных исследований
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes (SAMEM): Analysis of molecular evolution modes at deep inner branches of the phylogenetic tree
Gunbin KV, Suslov VV, Genaev MA, Afonnikov DA.
[In Silico Biology]
Extraction of quantitative characteristics describing wheat leaf pubescence with a novel image processing technique
Mikhail A. Genaev, Alexey V. Doroshkov, Tatyana A. Pshenichnikova, Nikolay A. Kolchanov, Dmitry A. Afonnikov
[PLANTA]
RatDNA: база данных микрочиповых исследований на крысах для генов, ассоциированных с заболеваниями старения
О.С. Кожевникова, М.К. Мартыщенко, М.А. Генаев, Е.E. Корболина, Н.А. Муралева, Н.Г. Колосова, Ю.Л. Орлов
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
WheatPGE: A system for analysis of relationships among the phenotype, genotype, and environment in wheat
M. A. Genaev, A. V. Doroshkov, E. V. Morozova, T. A. Pshenichnikova and D. A. Afonnikov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Информационная поддержка селекционно-генетического эксперимента у пшеницы в системе WheatPGE
Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Морозова Е.В., Симонов А.В., Афонников Д.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы.
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2011 КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМА WheatPGE ДЛЯ АНАЛИЗА ВЗАИМОСВЯЗИ ФЕНОТИП-ГЕНОТИП-ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА У ПШЕНИЦЫ
М.А. Генаев, A.В. Дорошков, Е.В. Морозова, Т.А. Пшеничникова, Д.А. Афонников
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков: анализ эволюции циклинов B
Гунбин К.В., Генаев М.А., Турнаев И.И., Афонников Д.А.
[Вестник ТГУ]
2010 A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits
Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Moscow University Biological Sciences Bulletin]
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков
Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных
Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]

Монографии

2014 Wheat leaf pubescence analysis: methods of computer phenomics
Afonnikov D.A., Genaev M.A., Doroshkov A.V., Komyshev E.G., Pshenichnikova T.A.

2012 Разработка методов, алгоритмов и программ параллельного моделирования в биоинформатике
Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, К.В. Гунбин, М.А. Генаев, Ю.Л. Орлов, Е.В. Игнатьева, О.В. Вишневский, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, Н.А. Колчанов

2010 BioinfoWF – веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики
Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А.


Конференции

2016 SEEDCOUNTER APPLICATION AND WHEAT EAR RECOGNIZING ALGORITHM FOR HIGH THROUGHPUT WHEAT PHENOTYPING
E. G. Komyshev, M. A. Genaev, D. A. Afonnikov
[Международный научный симпозиум «Генетика и геномика растений для продовольственной безопасности»]
SyGraph – web system for visualization of synteny alignments and comparison of assembly contigs
M. A. Genaev, D. A. Afonnikov
[BGRS-2006]
Wheatdb2: plant trait database and information system based on Crop Ontology terms
E.G. Komyshev, M.A. Genaev, A.V. Akushkina, D.A. Afonnikov
[10th anniversary International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology»]
Компьютерное фенотипирование растений для селекционно-генетических экспериментов
Генаев М.А.
[международной научно-практической конференции РАЗВИТИЕ НОВЫХ ТЕХНОЛОГИЙ СЕЛЕКЦИИ И СОЗДАНИЕ ОТЕЧЕСТВЕННОГО КОНКУРЕНТОСПОСОБНОГО СЕМЕННОГО ФОНДА КАРТОФЕЛЯ]
2015 SeedCounter – mobile application for grain phenotyping
Комышев Е.Г., Генаев М.А, Афонников Д.А.
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
2014 Генетическое разнообразие опушения листа мягкой пшеницы: описание методом высокопроизводительного фенотипирования
Дорошков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[VI Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров и ассоциированные генетические симпозиумы]
2013 Generation of web services – the unification of access to bioinformatics resources
Комышев Евгений Геннадьевич
[Пятая международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» - 5th International Young Scientists School «Systems Biology and Bioinformatics», SBB’2013]
Компьютерная технология фенотипирования пшеницы.
Афонников Д.А., Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Тарасова И.А., Морозова Е.В. , Симонов А.В.
[Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 19-22 марта 2013]
Разработка системы создания web-сервисов и конвейеров для унифицированного доступа к ресурсам в области биоинформатики
Комышев Евгений Геннадьевич
[мнск 2013 г. новосибирск]
2012 BioinfoWF -- WEB SERVICES AND WEB INTERFACES GENERATOR FOR BIOINFORMATICS ANALYSIS
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич
[Школа молодых ученых "Биоинформатика и системная биология"]
Computer approaches ti wheat high-throughput phenotyping
Afonnikov D., Genaev M., Doroshkov A., Denisyuk V., Morozova E., Simonov A., Pshenichnikova T.
[The 2nd International Conference "Plant Genetics Genomics and Biotechnology"]
PEFF DB: the web-available database of Protein Evolutional and Functional Features
K.V. Gunbin, M.A. Genaev, D.A. Afonnikov
[III Moscow Conference «Molecular Phylogenetics» (MolPhy-3)]
РЕАЛИЗАЦИЯ ПОДСИСТЕМЫ ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ ДЛЯ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫХ МОДУЛЕЙ СИСТЕМЫ BioInfoWF
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович
[мнск 2012 г. новосибирск]
2011 Analysis of leaf hairiness morphology wheat: computational approaches using image processing technique.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
BioinfoWF — workflow management system for bioinformatics analysis.
Genaev M.A., Afonnikov D.A., Gunbin K.V.
[Третья школа молодых ученых «Биоинформатика и системная биология»]
Hight througput phenotyping approach to analysis of the leaf hairiness in wheat.
D.A. Afonnikov, A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova.
[The International Conference “Wheat Genetics Resources and Genomics”.]
2010 Analysis of leaf hairiness in wheat Triticum aestivum L. using the high throughput phenotyping approach.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A. Pshenichnikova, D.A. Afonnikov
[The International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
BioinfoWF - веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики
Генаев М.А., Гунбин К.В., Афонников Д.А.
[Электронные библиотеки: перспективные методы и технологии, электронные коллекции. RCDL’2010]
BioinfoWF – веб-сервесы и пакет конвейерной обработки для решения задач биоинформатики
Genaev M.A.
[The Young Scientists School "Bioinformatics and system biology"]
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein families: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms
Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles]
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes of protein-coding genes: relation of molecular evolution with the phenotypical features of organisms
Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Genaev M.A., Kolchanov N.A.
[2nd Moscow International Сonference "Molecular phylogenetics" (MolPhy-2)]
Method and Software Tools for Gene Networks Evolution Research
Timonov V.S., Gunbin K.V., Turnaev I.I., Genaev M.A., Kolchanov N.A.
[14-th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles]
Using a computer-base image processing technique in genetic analysis of leaf hairiness in wheat Trticum aestivum L.
A.V. Doroshkov, M.A. Genaev, T.A.Pshenichnikova, D.A. Afonnikov.
[The 7th International Conference on Bioinformatics of Genome regulation and Structure.]
WheatDB - база данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
WheatPGE - компьютерная система анализа взаимосвязи признаков фенотипа генотипа и окружающей среды у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Электронные библиотеки:перспективные методы и технологии, электронные коллекции. XII Всероссийская научная конференция RCDL'2010. Казань]
WheatPGE : a system for analysis of phenotypic, genotypic and environmental relationships in wheat
Genaev M.A.
[XVI Biotechnology Summer School, Gdansk, Poland, 11 - 17 July 2010]
WheatPGE — система анализа взаимосвязей фенотип-генотип-окружающая среда у пшеницы
Генаев М.А., Дорoшков А.В., Афонников Д.А.
[Молодежный научный форум "ЛОМОНОСОВ - 2010" г. Москва]
Анализ морфологии опушения листа у пшеницы: компьютерный подход с использованием анализа изображений
Афонников Д.А. Дорошков А.В., Генаев М.А.
[Российско-Французского семинар "Геномика, биоинформатика и моделирование в науках о жизни", 18-21 июня 2010]
Визуализация схем скрещивания пшеницы в рамках разработки системы WheatDB
Генев М.А. Дорошков А.В.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
Исследование опушения листа пшеницы Triticum aestivum L. с помошью высокоэффективных методов фенотипирования
Дорoшков А.В., Генаев М.А., Афонников Д.А., Пшеничникова Т.А.
[XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.]
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков
Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии"]
Методы компьютерного анализа в исследовании опушения листа пшеницы TRITICUM AESTIVUM L.
Дорошков А.В., Генаев М.А., Пшеничникова Т.А., Афонников Д.А.
[VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Молодеж и современные информационные технологии" г. Томск]
2008 Создание графовой базы данных и реализация основных типов запросов к ней
Генаев М.А.
[XLVI Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-46) г.Новосибирск 26 – 30 апреля 2008 г.]
2007 Визуализатор вырожденных олигонуклеотидных мотивов
Генаев М.А.
[XLV международная научная студенческая конференция: Студент и научно-технический прогресс, Новосибирск 10-12 апреля 2007г.]

Гранты

2016 Разработка компьютерных методов высокопроизводительного фенотипирования злаков на основе анализа изображений и их интеграция с информационной системой поддержки селекционно-генетических исследований
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович

Вариабельность VRN1 генов и эволюция признака яровость-озимость у тетраплоидных пшениц и эгилопсов
Вавилова Валерия Юрьевна, Генаев Михаил Александрович, Конопацкая Ирина Дмитриевна, Трапезникова Мария Сергеевна

2014 Компьютерно-экспериментальный анализ молекулярных механизмов регуляции экспрессии генов в клетках опухолей головного мозга
Васильев Геннадий Владимирович Вишневский Олег Владимирович Генаев Михаил Александрович Губанова Наталья Владимировна Климова Наталья Викторовна Кожевникова Оюна Суранзановна Медведева Ирина Вадимовна Орлов Юрий Львович Попик Ольга Васильевна Сафронова Наталья Сергеевна

2013 Разработка программного комплекса для анализа влияния SNP на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний
Колчанов Николай Александрович, Подколодный Николай Леонтьевич, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Брызгалов Леонид Олегович, Рассказов Дмитрий Александрович, Васькин Юрий Юрьевич, Данилова Юлия

2012 Интегрированная биоинформационная платформа анализа данных экспрессии генов в тканях мозга
Орлов Юрий Львович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Медведева Ирина Вадимовна, Кожевникова Оюна Суранзановна, Васильев Геннадий Владимирович, Медведев Кирилл Евгеньевич, Орлов Алексей Валерьевич, Подколодный Николай Леонтьевич, Пономаренко Михаил Павлович, Рубцова Надежда Владимировна, Вишневский Олег Владимирович, Ершов Никита Игоревич, Климова Наталья Викторовна, Суслов Валентин Владимирович, Генаев Михаил Александрович, Корболина Елена Евгеньевна, Пономаренко Петр Михайлович, Семенычев Александр Владимирович, Овчинников Владимир Юрьевич, Сафронова Наталья Сергеевна, Шмаков Николай Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Левицкий Виктор Георгиевич

Междисциплинарный интеграционный проект «Математические модели, числен-ные методы и параллельные алго-ритмы для решения больших задач СО РАН и их реализация на мно-гопроцессорных СуперЭВМ»
Подколодный Николай Леонтьевич Колчанов Николай Александрович Фомин Эдуард Станиславович Алемасов Николай Александрович Казанцев Федор Владимирович Афонников Дмитрий Аркадьевич Гунбин Константин Владимирович Генаев Михаил Александрович Вишневский Олег Владимирович

Междисциплинарный интеграционный проект «Методы параллельной обработки данных и моделирование на распределенных вычислительных системах»
Подколодный Николай Леонтьевич, Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Казанцев Федор Владимирович, Рассказов Дмитрий Александрович

2011 Проведение проблемно- ориентированных поисковых исследований в области ДНК-чипов в рамках технологической платформы «Медицина будущего»
Орлов Юрий Львович Колосова Наталия Гориславовна Корболина Елена Евгеньевна Кожевникова Оюна Суранзановна Татьков Сергей Иванович Муралёва Наталья Александровна Генаев Михаил Александрович

Проектирование и разработка RESTful-веб-сервисов для создания распределенной инфраструктуры, ориентированной на решения задач реконструкции и анализа генных сетей
Н.А. Колчанов, Н.Л. Подколодный, В.С. Тимонов, И.Р. Акбердин, Е.А. Ананько, М.А. Генаев, Е.В. Игнатьева, Ф.В. Казанцев, Н.Н. Подколодная, О.А. Подколодная, Д.А. Рассказов, А.В. Семенычев

2009 Структура и свойства молекулярных органических кристаллов в условиях высоких давлений и низких температур
Колчанов Николай Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Гунбин Константин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Суслов Валентин Владимирович, Медведев Кирилл Евгеньевич, Генаев Михаил Александрович


Научное руководство

2012 Подсистема генерации web-сервисов для вычислительных модулей системы BioInfoWF [Комышев Евгений Геннадьевич]
Программное средство для определения скелета растрового изображения с применением волнового алгоритма. [Русакова Наталья]
2010 Создание системы визуализации статистических данных для фенотипических признаков растений [Радошкевич Даниил Александрович]
Создание системы статистической обработки данных для анализа фенотипических признаков растений [Котов Иван Анатольевич]

Патенты

2016 Система визуализации синтенных блоков и сравнения геномных сборок (СиГраф)
Генаев М.А., Афонников Д.А.

Мобильное и настольное приложение для массового фенотипирования зерен пшеницы (СиидКаунтер)/Mobile and desktop application for mass phenotyping seeds of wheat (SeedCounter)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич

2014 Программа для автоматической оценки эффективности элонгации трансляции генов различных организмов (EloE) / Software tool for automatical estimation of genes elongation translation efficiency in various organisms (EloE)
В. С. Соколов, Б. С. Зураев, М. А. Генаев

2013 Система автоматической генерации веб-интерфейсов для конвейеров и вычислительных модулей для поддержки исследований в области биоинформатики (BioInfoWF)
Генаев Михаил Александрович, Гунбин Константин Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич

Система генерации веб-сервисов и конвейеров для унифицированного доступа к ресурсам в области биоинформатики (BioUniWA)
Комышев Евгений Геннадьевич, Генаев Михаил Александрович, Афонников Дмитрий Аркадьевич

2012 База данных генов крысы, ассоциированных с заболеваниями старения для исследований на микрочипах (РатДНК ДБ)/ Database of rat genes associated with senescence deceases for microarray research (RatDNA DB)
Орлов Юрий Львович, Мартыщенко Мария Кирилловна, Генаев Михаил Александрович, Кожевникова Оюна Суранзановна

База данных эволюционных и функциональных характеристик белков (ПЕФФ ДБ)/ Database of Protein Evolutional and Functional Features (PEFF DB)
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Генаев М.А.

Программа автоматического определения количественных характеристик опушения листа (ОЛДетект2) / Software tool for automatically determination of the quantitative characteristics of leaf hairiness in plants (LHDetect2)
Генаев Михаил Александрович, Дорошков Алексей Владимирович, Афонников Дмитрий Аркадьевич, Пшеничникова Татьяна Алексеевна

2010 База данных для анализа взаимосвязей генотип-фенотип-окружающая среда у пшеницы (ВитПГЕ).
Генаев М.А., Дорошков А.В., Афонников Д.А.

2007 База данных: Транскрипционный Фактор-Ген Млекопитающих взаимодействия (ТФГМВ)/ Transcription Factor- Mammalian Gene Interactions (TFMGI)
Колчанов Н.А., Подколодная О.А., Подколодный Н.Л., Хлебодарова Т.М., Ананько Е.А., Степаненко И.Л., Игнатьева Е.В., Генаев М.А.


Диссертации

2013 РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ АВТОМАТИЧЕСКОГО ОПРЕДЕЛЕНИЯ КОЛИЧЕСТВЕННЫХ ХАРАКТЕРИСТИК ОПУШЕНИЯ ЛИСТА [Кандидат]
© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.