Система учета научной деятельности (ASSA)

Вход

Внебюджетные подразделения

Подразделения

Лаборатория по технологии ферментации (т.139)
Лаборатории РНФ

Научные результаты

Сотрудники

Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода:

2003

2004

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

2016

2017

2018

2019

2020

Публикации Монографии Конференции Гранты Научное руководство

Публикации

2020	Single-nucleotide polymorphisms associated with the senescence-accelerated phenotype of OXYS rats: a focus on Alzheimer’s disease-like and age-related-macular-degeneration-like pathologies Vasiliy A. Devyatkin, Olga E. Redina, Nataliya G. Kolosova, Natalia A. Muraleva J ALZHEIMERS DIS, 2020, Volume 73, issue 3
	Genome and karyotype reorganization after whole genome duplication in free-living flatworms of the genus Macrostomum Zadesenets K.S., Jetybayev I.Y., Schärer L., Rubtsov N.B. INT J MOL SCI, 2020, 21(2), 680
2019	Ketamine improves depressive symptoms caused by stress and induces c-Fos expression in the brain resembling some effects of stress N. Dygalo, U. S. Drozd, T. S. Kalinina, E. V. Sukhareva, V.V. Bulygina, G.T. Shishkina, D. A. Lanshakov EUR NEUROPSYCHOPHARM, 2019, Volume 29, Supplement 1, 2019, Page s212
	Acute stress effect on hypothalamus BDNF expression, monoamines levels and adrenal catecholamines in mouse lines differed by 5-HT1A receptor function E. Kondaurova , Y. Antonov , A. Pershina , E. Bazhenova , D. Bazovkina, N. Popova EUR NEUROPSYCHOPHARM, 2019, V.29 (Suppl 1). P. S249-S250
	Вариабельность по экспрессии GFP- гена в моноклональных клеточных линиях Arabidopsis thaliana Т.В. МАРЕНКОВА, Ю.В. СИДОРЧУК, А.В. НОСОВ, А.А. ФОМЕНКОВ, В.В. КУЗНЕЦОВ, С.Р. МУРСАЛИМОВ, А.А. ЗАГОРСКАЯ, Е.А. УВАРОВА, П.А. БЕЛАВИН, Е.В. ДЕЙНЕКО Биотехнология, 2019, Т. 35, № 1, С. 58–67
	Системный подход к моделированию развития листостебельных грибных инфекций пшеницы Николаев С.В., Зубаирова У.С., Сколотнева Е.С., Орлова Е.А., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(1):100-109
	Numerical Algorithm for Morphogen Synthesis Region Identification with Indirect Image-Type Measurement Data Penenko A.V., Zubairova U.S., Mukatova Z., Nikolaev S.V. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2019, Vol. 17, No. 1 1940002
	Межвидовой полиморфизм генов DEP1 и форма колоса у пшениц Вавилова В.Ю., Конопацкая И.Д., Блинов А.Г., Гончаров Н.П. RUSS J GENET+, 2019, том 55, № 7, с. 837–843
	The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development. Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV. BMC PLANT BIOL, 2019
	Homology of Genes Controlling Architectonics of Vegetative and Generative Organs in Barley and Rice and Their Application for Wheat Biodiversity Expansion and Breeding K. V. Ustyantsev, N. P. Goncharov RUSS J GENET+, 2019, V. 55 (5), P. 535-543
	TNFα is responsible for the canonical ofspring number-size trade-off С.О. Масленникова, Л.А. Герлинская, Г.В. Концевая, М.В. Анисимова, С.А. Недоспасов, Н.А. Феофанова, М.П. Мошкин, Ю.М. Мошкин SCI REP-UK, 2019
	Suppression of Alzheimer’s Disease-Like Pathology Progression by Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1: A Transcriptome Profiling Study Stefanova NA, Ershov NI, Kolosova NG. OXID MED CELL LONGEV, 2019, 2019 Jul 15;2019:3984906
	Генетические подходы к изучению функций серотонинергических нейронов у животных У.С. Дрозд, Е.В. Шабурова, Н.Н. Дыгало Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 2019;23(4):448-455
	Subanesthetic dose of ketamine relieves depression-like behavior induced by optogenetic stimulation of the hippocampal pyramidal neurons. N. Dygalo, U.S. Drozd, T.S. Kalinina, E.V. Sukhareva, V.V. Bulygina, G.T. Shishkina, D.A. Lanshakov. EUR NEUROPSYCHOPHARM, 2019, Volume 29, Supplement 6, Page s94
	Mechanisms of Neuronal Death in the Cerebral Cortex during Aging and Development of Alzheimer’s Disease-Like Pathology in Rats Darya V. Telegina,Gleb K. Suvorov,Oyuna S. Kozhevnikova, Nataliya G. Kolosova INT J MOL SCI, 2019, 20(22), 5632
	Inhibition of Opisthorchis felineus glutathione-dependent prostaglandin synthase by resveratrol correlates with attenuation of cholangiocyte neoplasia in a hamster model of opisthorchiasis. Pakharukova MY, Zaparina OG, Kovner AV, Mordvinov VA. INT J PARASITOL, 2019, 2019;49:963-973.
	EXPERIMENTAL MODEL OF OPISTHORCHIASIS FELINEA: MECHANISTIC INSIGHTS INTO THE CHOLANGIOCARCINOGENESIS. Mordvinov V. A., Pakharukova M. Y. T ROY SOC TROP MED H, 2019, Volume: 113 Special Issue: SI Supplement: 1 Pages: S261-S261
	CARCINOGENICITY OF OPISTHORCHIS FELINEUS LIVER FLUKE INFECTION: MECHANISTIC AND OTHER RELEVANT DATA IN EXPERIMENTAL MODEL. Pakharukova MY, Zaparina OG, Kovner AV, Mordvinov VA T ROY SOC TROP MED H, 2019, Volume: 113 Special Issue: SI Supplement: 1 Pages: S259-S260.
	Effect of CC2D1A/Freud-1 and CC2D1B/Freud-2 genes knockdown in the frontal cortex on behavior and 5-HT1A receptor gene Plyusnina A.V., Kondaurova E.M., Ilchibaeva T.V., Naumenko V.S. IBRO Reports, 2019, IBRO Reports Volume 6, Supplement (2019) S.111
	Effect of chronic fluoxetine administration on brain mRNA levels of 5-HT1A receptor gene and its repressors CC2D1A/Freud-1 and CC2D1B/Freud-2 in mouse lines differed by 5-HT1A receptor sensitivity Elena Kondaurova, Alexander Rodnyy, Vladimir Naumenko IBRO Reports, 2019, IBRO Reports Volume 6, Supplement, 2019, Pages S222-S223
	On the behavior and 5-HT1A receptor functioning in the brain of BTBR mice – The animal model of autism Vladimir Naumenko∗, Alexander Rodnyy, Nikita Khotskin, Yegor Antonov, Elena Kondaurova, Elizabeth Kulikova IBRO Reports, 2019, IBRO Reports Volume 6, Supplement, September 2019, Page S225
	The effects of aging on behavior and brain-derived neurotrophic factor in the hippocampus in mice Vitalii Moskaliuk,∗, Elizabeth Kulikova, Vladimir Naumenko, Elena Kondaurova, Darya Bazovkina IBRO Reports, 2019, IBRO Reports Volume 6, Supplement, 2019, Page S118
	Phylostratigraphic Analysis Shows the Earliest Origination of the Abiotic Stress Associated Genes in A. thaliana Zakhar S. Mustafin, Vladimir I. Zamyatin, Dmitrii K. Konstantinov, Aleksej V. Doroshkov, Sergey A. Lashin, Dmitry A. Afonnikov Genes, 2019, Genes 2019, 10(12), 963
	Эффект атипичных антипсихотических препаратов на экспрессию генов нейротрофических факторов в МРТР-индуцированной модели болезни Паркинсона А.С. Цыбко, Т.В. Ильчибаева, Н.В. Хоцкин, А.И. Коветская, В.С. Науменко, Н.К. Попова Нейрохимия, 2019, Т.36, №2, С.155-163
	The Effect of Atypical Antipsychotic Drugs on the Neurotrophic Factors Gene Expression in the MPTP Model of Parkinson’s Disease A.S. Tsybko, T.V. Il’chibaeva, N.V. Khotskin, A.I. Kovetskaya, V.S. Naumenko, N.K. Popova NEUROCHEM J+, 2019, Vol.13 (2). pp.169-175
	Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.) Anton Ermakov, Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Dmitrii Konstantinov, Alexey Doroshkov PeerJ, 2019, PeerJ 7:e7791
	Early-life stress increases susceptibility to social defeat stress in adults and causes long-lasting transcriptional and epigenetic alterations: Evidence from RNA-seq and H3K4me3-based chromatin immunoprecipitation with sequencing Vasiliy Reshetnikov, Nikita Ershov, Polina Kisaretova, Natalia Bondar IBRO Reports, 2019, Volume 6, Pages S65-S66
	Sex Differences in Liver, Adipose Tissue, and Muscle Transcriptional Response to Fasting and Refeeding in Mice Bazhan N, Jakovleva T, Feofanova N, Denisova E, Dubinina A, Sitnikova N, Makarova E. Cells, 2019, 8(12), 1529
	Diversity of mariner-like elements in Orthoptera K. Ustyantsev, M. Biryukov, I. Sukhikh, N.V. Shatskaya, V. Fet, A. Blinov, I. Konopatskaia Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1059-1066
	Examining causal effects of body mass index on back pain: a Mendelian randomization study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov Tsepilov, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Yurii Aulchenko, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2019
	Aberrant Expression of Collagen Gene Family in the Brain Regions of Male Mice with Behavioral Psychopathologies Induced by Chronic Agonistic Interactions Smagin DA, Galyamina AG, Kovalenko IL, Babenko VN, Kudryavtseva NN Biomed Res Int, 2019, 2019:7276389
	Генетические подходы к изучению функций серотонинергических нейронов у животных Дрозд У. С., Шабурова Е. В., Дыгало Н. Н. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019
	Генетические подходы к изучению функций серотонинергических нейронов у животных Дрозд У. С., Шабурова Е. В., Дыгало Н. Н. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019
2018	Effects of early-life stress on social and anxiety-like behaviors in adult mice: sex-specific effects Bondar N., Lepeshko A., Reshetnikov V. BEHAV NEUROL, 2018, Volume 2018 (2018), 13 pages
	Consequences of early life stress on genomic landscape of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice Nikita I. Ershov, Natalya P. Bondar, Arina A. Lepeshko, Vasiliy V. Reshetnikov, Julia A. Ryabushkina, Tatiana I. Merkulova BMC GENOMICS, 2018, 19(Suppl 3):93
	Analysis of the Basic Characteristics of Osteogenic and Chondrogenic Cell Lines Important for Tissue Engineering Implants Astakhova N.M., Korel’ A.V., Shchelkunova E.I., Orishchenko K.E., Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Kirilova I.A. B EXP BIOL MED+, 2018, 5 March 2018, Pages 1-8
	The impact of early-life stress on the expression of HPA-associated genes in the adult murine brain V.V. Reshetnikov, A.A. Studenikina, J.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova, N.P. Bondar BEHAVIOUR, 2018, Volume 155, Issue 2-3, pages 181 – 203
	The long-term effects of early postnatal stress on cognitive abilities and expression of genes of the glutamatergic system in mice V. V. Reshetnikov, A. A. Lepeshko, Yu. A. Ryabushkina, A. A. Studenikina, T. I. Merkulova, N. P. Bondar NEUROCHEM J+, 2018, 12(2): 142-151
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на когнитивные способности и экспрессию генов глутаматергической системы у мышей В В Решетников, А А Лепешко, Ю А Рябушкина, А А Студеникина, Т И Меркулова, Н П Бондарь Нейрохимия, 2018, 35(2): 140-150
	Genetically defined fear-induced aggression: Focus on BDNF and its receptors. Ilchibaeva TV, Tsybko AS, Kozhemyakina RV, Kondaurova EM, Popova NK, Naumenko VS BEHAV BRAIN RES, 2018, Volume 343, Pages 102-110
	ВЛИЯНИЕ НОКАУТА ГЕНА ФАКТОРА НЕКРОЗА ОПУХОЛИ НА ПОВЕДЕНИЕ И ДОФАМИНОВУЮ СИСТЕМУ МОЗГА У МЫШЕЙ Д. В. Базовкина, Д. В. Фурсенко, А. В. Першина, Н. В. Хоцкин, Е. Ю. Баженова, А. В. Куликов Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2018, Том 104 № 7 с. 745—756.
	Sex-specific changes of gene expression in response to obesity are associated with different FGF21 expression in obese male and female mice Elena Makarova, Denisova E, Dubinina A, Feofanova N, Yakovleva T, Bazhan N Journal of Obesity & Weight Loss Therapy, 2018, 2018, Volume 8, Proceedings of 20th Global Obesity Meeting, P 21
	Инактивация гена GFP при помощи системы CRISPR/Cas9 в культуре суспензионных клеток Arabidopsis Thaliana Н.В. Пермякова, Ю.В. Сидорчук, Т.В. Маренкова, С.А. Хозеева, А.А. Загорская, Е.В. Дейнеко Гены и клетки, 2018, Приложение, №2, с. 84-85
	Исследование агрегативности суспензионной клеточной культуры Arabidopsis thaliana с нокаутом гена GAUT1 Ю.В. Сидорчук, А.С. Щелокова, Н.В. Пермякова, Е.В. Дейнеко Гены и клетки, 2018, Приложение, №2, с. 47
	Stress early in life leads to cognitive impairments, reduced numbers of CA3 neurons and altered maternal behavior in adult female mice Reshetnikov V.V., Kovner A.V., Lepeshko A.A., Pavlov K.S., Grinkevich L.N., Bondar N.P. GENES BRAIN BEHAV, 2018, e12541
	Соцветие злаков: особенности строения, развития и генетической регуляции морфогенеза Добровольская О.Б., Дресвянникова А.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 2018;22(7):766-775
	Unexpected phenotypic effects of a transgene integration causing a knockout of the endogenous Contactin-5 gene in mice Smirnov A.V., Kontsevaya G.V., Feofanova N.A., Anisimova M.V., Serova I.A., Gerlinskaya L.A., Battulin N.R., Moshkin M.P., Serov O.L. TRANSGENIC RES, 2018, 27(1):1-13
2017	Genes WHEAT FRIZZY PANICLE and SHAM RAMIFICATION 2 independently regulate differentiation of floral meristems in wheat Oxana B. Dobrovolskaya, Yumiko Amagai, Karina I. Popova, Alina E. Dresvyannikova, Petr Martinek, Alexander A. Krasnikov, Nobuyoshi Watanabe BMC PLANT BIOL, 2017, 17(Suppl 2):252
	Оптогенетическая активация нейрона повышает в нем уровень антиапоптозного белка Bcl-xL Ланшаков Д.А., Дрозд У.С., Дыгало Н.Н. Биохимия, 2017, Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 481 – 486
	Optogenetic stimulation increases level of antiapoptotic protein Bcl-xL in neurons Lanshakov DA, Drozd US, Dygalo NN BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 340-344. Original Russian Text © D. A. Lanshakov, U. S. Drozd, N. N. Dygalo, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 481-486.
	Role of glial cell line-derived neurotrophic factor in the pathogenesis and treatment of mood disorders A.S. Tsybko, T.V. Ilchibaeva, N.K. Popova REV NEUROSCIENCE, 2017
	Ранние этапы развития соцветия пшеницы: Изучение генетического контроля и физиологии. Добровольская О.Б. Бадаева Е.Д. Попова К.И. Красников А.А. Мартинек П. Acta Naturae, 2017, том 9 стр.59
	СУСПЕНЗИОННЫЕ КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК РАСТЕНИЙ КАК ПЛАТФОРМА ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНЫХ БЕЛКОВ Загорская А.А., Дейнеко Е.В. Физиология растений, 2017, том 64, № 6, с. 403–417
	Experimental opisthorchiasis: Study of blood cell composition, hematopoiesis, and startle reflex in laboratory animals D. F. Avgustinovich a, *, I. A. Orlovskaya b , L. B. Toporkova b , G. B. Vishnivetskaya a , A. V. Katokhin a , M. N. Lvova a , E. V. Kashina a , N. P. Bondar a , N. A. Feofanova a, b , and V. A. Mordvinov a, c Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, 7(1):82-92 · January 2017
	Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene Anastasiya Y. Glagoleva, Nikolay A. Shmakov, Olesya Y. Shoeva, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Elena K. Khlestkina BMC PLANT BIOL, 2017, 17(Suppl 1):182, DOI 10.1186/s12870-017-1124-1
	Unexpected phenotypic effects of a transgene integration causing a knockout of the endogenous Contactin-5 gene in mice Smirnov AV, Kontsevaya GV, Feofanova NA, Anisimova MV, Serova IA, Gerlinskaya LA, Battulin NR, Moshkin MP, Serov OL TRANSGENIC RES, 2017
	Создание кандидатной вакцины против клещевого энцефалита на основе гибридного рекомбинантного flagG-protE-белка Белавин П.А., Кунык Д.А., Протопопова Е.В., Локтев И.Б., Дейнеко Е.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(8):986-992. DOI 10.18699/VJ17.323
	The factors affecting the evolution of the anthocyanin biosynthesis pathway genes in monocot and dicot plant species Shoeva O.Yu., Glagoleva A.Yu., Khlestkina E.K. BMC PLANT BIOL, 2017, 17(Suppl 2):256, https://doi.org/10.1186/s12870-017-1190-4
	DEP1 gene in wheat species with normal, compactoid and compact spikes V. Vavilova, I. Konopatskaia, A. E. Kuznetsova, A. Blinov, N. P. Goncharov BMC GENET, 2017, 18(Suppl 1): 106
	Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko BMC PLANT BIOL, 2017, BMC Plant Biology 2017, 17 (Suppl 2):251
	Suspension-Cultured Plant Cells as a Platform for Obtaining Recombinant Proteins Загорская А.А., Дейнеко Е.В. RUSS J PLANT PHYSL+, 2017, Vol. 64, No. 6, pp. 795–807
	Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016	Механизмы регуляции передачи этиленового сигнала у растений Землянская Е.В., Омельянчук Н.А., Ермаков А.А., Миронова В.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, Принята в печать. DOI: 10.18699/VJ15.105
	Экспериментальный описторхоз: исследование состава форменных элементов крови, гемопоэза и стартл-рефлекса у лабораторных животных Д.Ф. Августинович, И.А. Орловская, Л.Б. Топоркова, Г.Б. Вишнивецкая, А.В. Катохин, М.Н. Львова, Е.В. Кашина, Н.П. Бондарь, Н.А. Феофанова, В.А. Мордвинов Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016. 20 (2):155-164
	Mechanical Behavior of Cells within a Cell-Based Model of Wheat Leaf Growth Zubairova U, Nikolaev S, Penenko A, Podkolodnyy N, Golushko S, Afonnikov D, Kolchanov N Frontiers in Plant Science, 2016, 7:1878
	Эффективное получение химерных мышей с использованием новой линии эмбриональных стволовых клеток Концевая Г.В., Феофанова Н.А., Мензоров А.Г., Пристяжнюк И.Е., Смирнов А.В., Баттулин Н.Р., Герлинская Л.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):925-929. DOI 10.18699/VJ16.213
	Морфофизиологические эффекты инсерционного мутагенеза гена контактин 5 (Cntn5) у трансгенных мышей А. В. Смирнов, Н. А. Феофанова, Г. В. Концевая, М. В. Анисимова, И. И. Ковригин, И. А. Серова, М. П. Мошкин, Л. А. Герлинская, Н. Р. Баттулин Vavilov journal of genetics and breeding, 2016
	Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
2010	Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А. Сибирский журнал индустриальной математики, 2010, том 13, № 4 (44) С. 70-82
	Распространение и филогенетические взаимоотношения Tc1-Mariner ДНК транспозонов в отряде Lepidoptera И.Д.Сормачева, А.С.Новиков, А.Г.Блинов Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 430-432.
	Cross-hybridization of repetitive sequences from the pericentric heterochromatic region of Chorthippus apricarius (L.) with the chromosomes of grasshoppers from the Gomphocerini tribe Jetybayev I.E., Karamysheva T.V., Bugrov A.G., Rubtsov N.B. EUROA Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 433–436 + III
	Supernumerary chromosomes as markers of population structure evolution in the grasshopper Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Dzubenko V.V., Bugrov A.G., Jetybayev I.E., Rubtsov N.B. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 437–440 + IV
	Кросс-гибридизация повторенных последовательностей ДНК прицентромерного гетерохроматина Chorthippus apricarius (L.) с хромосомами саранчовых трибы Gomphocerini. Джетыбаев И. Е., Карамышева Т.В., Бугров А.Г., Рубцов Н.Б Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 433-436
	Добавочные хромосомы как маркёры формирования популяционной структуры плавучей кобылки Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Дзюбенко В.В., Бугров А.Г., Джетыбаев И.Е., Рубцов Н.Б. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 437-440
2008	Математическое моделирование морфогенеза растений Г.Г. Лазарева, В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, И.В. Шваб, В.А. Вшивков, Д.Н. Горпинченко, С.В. Николаев, Н.А.Колчанов. Журнал вычислительной математики и математической физики, 2008, Т.11. №2., c.151-166
2007	Модельное изучение роли CLV1, CLV2, CLV3 И WUS в регуляции структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В., Пененко A. В., Лавреха В. В., Мелснесс Э. Д., Колчанов Н. А. RUSS J DEV BIOL+, 2007, 38 №6, 457-462
2006	Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани Николаев С.В., Колчанов Н.А., Фадеев С.И., Когай В.В., Мйолснесс Э. Вычислительные технологии, 2006, Том 11, № 2, с. 67 - 81
	Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: I. База данных AGNS Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Шамов И.С.,Поплавский А.С., Подколодный Н.Л., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Мелснесс Э.Д., Мейеровитц Е.M., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, выпуск N7, т. 51
	A Systems Approach to Morphogenesis in Arabidopsis thaliana: II. Modeling of the Regulation of Shoot Apical Meristem Structure S. V. Nikolaev, S. I. Fadeev, A. V. Penenko, V. V. Lavrekha, V. V. Mironova, E. D. Mjolsness, N. A. Omel’yanchuk, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, №7, V. 51
2005	Актуальные проблемы компьютерной протеомики Иванисенко В.А., Афонников Д.А., Николаев С.В., Пинтус С.С., Крестьянова М.А., Пальянов А.Ю, Титов И.И. Информационный вестник ВОГИС, 2005, т.9, с.162-178
	Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2005, Т.9, N2, май 2005, 232-261
2003	Data Mining Techniques in Bioinformatics Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V. Pattern Recognition and Image Analysis, 2003, N. 4, V. 13, P. 550-555

Монографии

2020	Тканеспецифичные факторы phox2a/2b, обеспечивающие специфичную экспрессию вирусных векторов Дрозд У. С.
2008	Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование. Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.
	Процессы морфогенеза и подходы к их моделированию Николаев С.В., Гунбин К.В., Омельянчук Н.А., Суслов В.В., Омельянчук Л.В., Колчанов Н.А.

Конференции

2020	Сreation of the viral vectors for the inhibition of the serotonergic neurons using light sensitive proton pump. Drozd, U. S., Lanshakov, D. A Summer School on Stress: From Hans Selye’s original concept to recent advances
2019	Genome reorganization after whole genome duplication in evolution of free-living flatworms of the genus Macrostomum Zadesenets K.S., Ershov N.I., Jetybayev I.E., Berezikov N.B., Scharer L., Rubtsov N.B. International Conference on Polyploidy
	ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Identification and characterization of a barley gene controlling cuticle wax formation Gerasimova S., Kolosovskaya E., Hertig C., Hiekel S., Korotkova A., Doroshkov A., Kukoeva T., Domrachev D., Kochetov A., Kumlehn J., Khlestkina E. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	The effect of various dominant VRN alleles and their combinations on the duration of development phases and productivity in common wheat lines Chumanova E.V., Efremova T.T., Kruchinina Y.V PlantGen2019
	ИЗУЧЕНИЕ ЛИНИЙ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ ПО ОЗИМОМУ СОРТУ БЕЗОСТАЯ 1 С КОМБИНАЦИЕЙ ДОМИНАНТНЫХ АЛЛЕЛЕЙ ЛОКУСОВ VRN-1 Чуманова Е.В., Ефремова Т.Т., Кручинина Ю.В. VII Съезд ВОГиС
	Stress early in life alters the murine cortical transcriptome in age-dependent manner N.P. Bondar, N.I. Ershov, A.S. Shulyupova, P.E. Kisaretova, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova 48th Meeting of the European Brain and Behaviour Society
	Morris water maze performance correlates with gene expression in the hippocampus: A transcriptome analysis Кисаретова Полина Эдуардовна, Шулюпова Анастасия Сергеевна, Иванчихина Анна Михайловна, Климова Наталья Викторовна, Ершов Никита Игоревич, Решетников Василий Владимирович, Меркулова Татьяна Ивановна, Бондарь Наталья Петровна The 10th IBRO World Congress of Neuroscience
	Различия в проявлении пространственной памяти у мышей: роль экспрессии генов в гиппокампе Кисаретова Полина Эдуардовна, Шулюпова Анастасия Сергеевна, Иванчихина Анна Михайловна, Климова Наталья Викторовна, Ершов Никита Игоревич, Решетников Василий Владимирович, Меркулова Татьяна Ивановна, Бондарь Наталья Петровна XVIII Конференции-школы с международным участием «Актуальные проблемы биологии развития»
	С чем связана устойчивость к развитию ожирения у самок мышей ? Гончар А.Д., Макарова Е.Н. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	АНТИДИАБЕТИЧЕСКИЙ ФАКТОР FGF21 ПО-РАЗНОМУ ВЛИЯЕТ НА ПОТРЕБЛЕНИЕ ПИЩИ И УГЛЕВОДНО-ЖИРОВОЙ ОБМЕН У САМЦОВ И САМОК МЫШЕЙ С ГЕНЕТИЧЕСКИМ МЕЛАНОКОРТИНОВЫМ ОЖИРЕНИЕМ Макарова Е.Н., Балыбина Н.Ю., Дубинина А.Д, Денисова Е.И., Яковлева Т.В., Бажан Н.М. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Subanesthetic dose of ketamine relieves depression-like behavior induced by optogenetic stimulation of the hippocampal pyramidal neurons N. Dygalo, U.S. Drozd, T.S. Kalinina, E.V. Sukhareva, V.V. Bulygina, G.T. Shishkina, D.A. Lanshakov 32nd ECNP Congress – Copenhagen, 2019, 7-10 September 2019, P.111.
	Genome-wide association study of genetic principal components of four chronic musculoskeletal human pain types Yakov A. Tsepilov, Maxim B. Freidin, Sodbo Zh. Sharapov, Aleksandra S. Shadrina, Elizaveta E. Elgaeva, Melody Palmer, Lennart C. Karssen, Pradeep Suri, Frances M. K. Williams Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)
	Исследование главных генетических компонент четырех хронических скелетно-мышечных болей человека Е. Е. Елгаева Международная научная студенческая конференция (МНСК-2019)
2018	Влияние раннего постнатального стресса на транскриптом гиппокампа головного мозга 15-дневных мышей Лепешко А. А., Рябушкина Ю. А., Решетников В. В., Бондарь Н. П. Зимняя молодежная школа ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии
	Длительное отделение от матерей в ранний период жизни приводит к когнитивным и поведенческим нарушениям у взрослых самок мышей: ключевая роль гиппокампа Решетников В.В., Ковнер А.В., Рябушкина Ю.А., Лепешко А.А., Бондарь Н.П. ГИППОКАМП И ПАМЯТЬ: НОРМА И ПАТОЛОГИЯ
	Особенности изменений транскриптома гиппокампа головного мозга 15-ти дневных мышей, подвергавшихся раннему постнатальному стрессу Лепешко А.А., Рябушкина Ю.A., Решетников В.В., Бондарь Н.П. ГИППОКАМП И ПАМЯТЬ: НОРМА И ПАТОЛОГИЯ
	Previous mother’s experience and early life stress: impact on aggression and cognition in adult mice V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, N.P. Bondar The 11th International Conference BGRS\SB-2018
	Impact of early life stress on susceptibility to chronic social stress in adult mice A. Lepeshko, V. Reshetnikov, N. Bondar The 11th International Conference BGRS\SB-2018
	Consequences of early life stress in mice: transcriptional and epigenetic hallmarks in frontal cortex and hippocampus N.P. Bondar, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova The 11th International Conference BGRS\SB-2018. Simposium Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB-2018
	Leptin administration in midpregnancy reduces fetal and early postnatal growth rate and abolishes obesity-associated hyperglycemia in mouse offspring Makarova E., Denisova E., Kozhevnikova V. 20th Global Obesity Meeting
	Sex-specific changes of gene expression in response to obesity are associated with different FGF21 expression in obese male and female mice Makarova E., Denisova E., Dubinina A., Feofanova N., Yakovleva T., Bazhan N. 20th Global Obesity Meeting
	Sex-specific effect of leptin on gene expression in placentas and fetal tissues in mice E. Denisova, E. Makarova BGRS-2018
	Fasting increases FGF21 expression in liver and changes gene expressions in metabolic organs in a sex-specific manner in mice Nadezhda Bazhan, Yakovleva T, Denisova E, Dubinina N, Feofanova N, Chepeleva E and Makarova E 20th Global Obesity Meeting
	Studying the impact of sex on the molecular mechanisms of liver adaptation to fasting in mice N. Bazhan, N. Sitnikova , T. Iakovleva, A. Dubinina, E. Makarova BGRS 2018
	Sex differences in the effect of high-fat diet on mouse white adipose tissue Bazhan N, Yakovleva T, Dubinina A, Makarova E. 21 World Obesity Conference
	DEP1 gene in wheat species with different spike phenotype I. Konopatskaia, V. Vavilova, A. Kuznetsova, A. Blinov Plant Biology Europe 2018
	Влияние стресса матери на проявление последствий раннего постнатального стресса у взрослых самцов мышей Батлук У.И., Решетников В.В, Рябушкина Ю.А., Бондарь Н.П. Фундаментальные аспекты компенсаторно-приспособительных процессов
	Hepatoprotective effect of various antioxidants in the pathogenesis of opisthorchiasis Zaparinа O., Kovner A., Rakhmetova A., Pakharukova M., Mordvinov V. System Biology and bioinformatics (SBB-2018) The Tenth International Young Scientists School
	Роль активных форм кислорода в системе взаимоотношений «паразит-хозяин» при описторхозе Запарина О.Г., Kовнер A.В., Рахметова A.Ш., Пахарукова M.Ю., Mордвинов В.A. // СОВРЕМЕННАЯ ПАРАЗИТОЛОГИЯ — ОСНОВНЫЕ ТРЕНДЫ И ВЫЗОВЫ Материалы VI Съезда Паразитологического общества: Международная конференция:
	Acute stress effect on hypothalamus BDNF expression, monoamines levels and adrenal catecholamines in mouse lines differed by 5-HT1A receptor function Kondaurova E.M., Antonov Y.V., Pershina A.V., Bazhenova E.Y., Bazovkina D.V., Popova N.K 31 st ECNP congress
	Genetic regulation of wheat plant development and architecture. Dobrovolskaya O.B., Dresvyannikova A.E., Popova K.I., Ponomarenko M.P., Orlov Yu.L., Krasnikov A.A., Martinek P. The 11th Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/System Biology: BGRS/SB'2018
	Molecular evolution analysis of genetic network components related to plant trichome development A.V. Doroshkov, D.K. Konstantinov, K. V. Gunbin, D. A. Afonnikov BGRS/SB 2018
	Transcriptional and epigenetic consequences of early life stress on murine frontal cortex N.P. Bondar, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, A.S. Shulyupova, T.I. Merkulova Latest Advances in Development & Function of Neuronal Circuits, Cold Spring Harbor Asia conference
	Early and late transcriptional responses to the low concentration of salicylic acid in Arabidopsis thaliana L. root E. Elgaeva, E. Zemlyanskaya, D. Novikova, V. Mironova Systems Biology And Bioinformatics (SBB-2018) \| The Tenth International Young Scientists School
	Ранний и поздний транскрипционный ответ на низкие концентрации салициловой кислоты в корне Arabidopsis thaliana L. Е. Е. Елгаева Международная научная студенческая конференция
2017	ГЕНДЕР-СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ВЛИЯНИЕ ЛЕПТИНА ВО ВРЕМЯ БЕРЕМЕННОСТИ НА РАЗВИТИЕ ОЖИРЕНИЯ В ПОТОМСТВЕ И ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ В ПЛАЦЕНТАХ И МОЗГЕ ПЛОДОВ У МЫШЕЙ Макарова Е.Н., Кожевникова В.В., Денисова Е.И. 23 Съезд Физиологического общества им. И. П. Павлова
	Different evolutionary patterns of the universal flavonoid biosynthesis pathway genes in monocot and dicot plant species O.Yu. Shoeva, A.Yu. Glagoleva, E.K. Khlestkina БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	Long-lasting consequences of early life stress in mice: changes in gene expression and H3K4me3 profile. Bondar N.P. , Reshetnikov V.V., Studenikina A.A., Ryabushkina Yu.A., Lepeshko A.A., Ershov N.I., Merkulova T.I. 2017 Annual Meeting, Genes, Brain and Behavior
	Early life stress promotes the changes in whole-genome distribution of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice. Bondar N.P., Ershov N.I., Lepeshko A.A., Reshetnikov V.V., Ryabushkina Yu.A., Merkulova T.I. БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	The impact of early life stress on distribution of H3K4Me3 histone modification in murine prefrontal cortex: the role in gene expression. V.V. Reshetnikov, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, Yu.A. Ryabushkina, A.A. Studenikina, N.P. Bondar, T.I. Merkulova 24th Multidisciplinary international neuroscience and biological psychiatry "stress and behavior" conference
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на экспрессию генов глюкокортикоидной и глутаматной систем в головном мозге мышей В.В. Решетников, А.А. Студеникина, Ю.А. Рябушкина, Т.И. Меркулова, Н.П. Бондарь БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на экспрессию генов глюкокортикоидной и глутаматной систем в гипоталамусе у самцов мышей Студеникина А. А., Решетников В. В 55-я Международная научная студенческая конференция МНСК-2017
	Анализ транскрипционной регуляции промотора гена орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana A.A. Егорова, В.В. Горелова, С.В. Герасимова БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	Characterization of a chlorophyll mutant, tigrina, in rye. Dobrovolskaya O.B., Morozova K., Popova K.I., Dresvyannikova A. E., Boerner A., Roeder M., Kiseleva E.V., Voylokov A.V. 4th Internetional conference "Plant genetics, genomics, bioinformatics and biotechnology
	Study on genetic control of early inflorescence development in bread wheat (T. aestivum) that determines inflorescence architecture and yield Dobrovolskaya O.B., Popova K.I., Orlov Yu.L., Krasnikov A.A., Martinek P. 4th International conference "Plant genetics, genomics, bioinformatics and biotechnology May 29- June 02, 2017
	ЗНАЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ ПРЯМОЙ И ОБРАТНОЙ ГЕНЕТИКИ РАСТЕНИЙ Хлесткина Е.К.*, Афонников Д.А., Бернер А., Быкова И.В., Васильев Г.В., Герасимова С.В., Глаголева А.Ю., Гордеева Е.И., Григорьев Ю.Н., Короткова А.М., Пшеничникова Т.А., Стрыгина К.В., Шацкая Н.В., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Юдина Р.С. III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)
	GENETICS AND OMICS APPROACHES TO BETTER UNDERSTANDING REGULATION OF METABOLI C PATHWAYS UNDERLYING PIGMENTATION IN WHEAT AND BARLEY O.Y. Shoeva, E.I. Gordeeva, N.A. Shmakov, K.V. Strygina, A.Y. Glagoleva, T.V. Kukoeva , N.V. Shatskaya , G.V. Vasiljev , A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina* 4-ая международная научная конференция "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений" (PlantGen2017)
	Получение химерных мышей путем инъекции эмбриональных стволовых клеток в бластоцисту на базе Центра генетических ресурсов лабораторных животных ИЦиГ СО РАН Концевая Г.В., Феофанова Н.А., Мензоров А.Г., Пристяжнюк И.Е., Смирнов А.В., Баттулин Н.Р., Герлинская Л.А. 6-ая научно-практическая конференция Rus-LASA
	ANTHOCYANINS IN WHEAT: PLANT PROTECTION AND HEALTH BENEFIT E. Gordeeva*, O. Shoeva, R. Yudina, N. Usenko, Y. Otmakhova, T. Amstislavskaya, K. Pavlov., E. Khlestkina 4-ая международная научная конференция "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений" (PlantGen2017)
	Глутаматергическая регуляция индуцированных стрессом поведенческих реакций. Дыгало Н.Н., Булыгина В.В., Калинина Т.С., Сухарева Е.В., Дрозд У.С., Шишкина Г.Т., Ланшаков Д.А. «СТРЕСС: ФИЗИОЛОГИЧЕСКИЕ ЭФФЕКТЫ, ПАТОЛОГИЧЕСКИЕ ПОСЛЕДСТВИЯ И СПОСОБЫ ИХ ПРЕДОТВРАЩЕНИЯ» (Посвящается памяти профессора А.А. Филаретова). 10–13 октября 2017 г. Санкт-Петербург.
	IDENTIFICATION OF GENES CONTROLLING BLACK PIGMENTATION IN CEREALS Glagoleva A.Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N. V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Shoeva O. Y., Börner A., Khlestkina E.K. 4th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)
	RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике" (HSG-2017)
	ORGANIZATION AND EVOLUTION CHALCONE SYNTHASE GENE FAMILY IN BREAD WHEAT AND RELATIVE SPECIES A.Glagoleva, E.Khlestkina 9th YOUNG SCIENTISTS SCHOOL «Systems Biology and Bioinformatics», SBB-2017
	ORGANIZATION AND EVOLUTION CHALCONE SYNTHASE GENE FAMILY IN BREAD WHEAT AND RELATIVE SPECIES A. Glagoleva, E. Khlestkina БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ЧЕРНОЙ ОКРАСКОЙ КОЛОСА У ЗЛАКОВ, НА ОСНОВЕ ТРАНСКРИПТОМНОГО АНАЛИЗА Глаголева А.Ю., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Бернер А., Афонников Д.А., Хлесткина Е.К. IV Вавиловская международная конференция «Идеи Н. И. Вавилова в современном мире»
	Влияние стрессирующих факторов в раннем онтогенезе на эпигенетическую регуляцию экспрессии генов во фронтальной коре головного мозга взрослых мышей Лепешко А. А., Рябушкина Ю. А. МНСК
2016	Purple-grained barley: marker-assisted devlopment of NILs and genetic dissection Kukoeva T., Gordeeva E., Glagoleva A., Shoeva O., Börner A., Khlestkina E The 1st International Workshop “Plant Genetics and Genomics for Food Security”
	Влияние раннего постнатального стресса на профиль распределения метки активного хроматина H3K4me3 Решетников В.В.,Лепешко А.А., Ершов Н.И., Студеникина А.А., Бондарь Н.П. VII Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология живых существ»
	Виталитетная структура популяций растений в лесных фитоценозах Елгаева Е. Е. Международная научная студенческая конференция
2011	Comparison of molecular composition of pericentric heterochromatin of two grasshopper species from Gomphocerini tribe (Acrididae; Orthoptera) Jetybayev I.E., Bugrov A.G., Belavin P.A., Tatkov S.I., Shvalov A.N. Rubtsov N.B 18th International Chromosome Conference
2010	A Model of Shoot Apocal Meristem Compartmentalization Based on CLV/WUS Interplay Nikolaev SV, Zubairova US, Mjolsness ED, Shapiro BE, Smal PA, Kolchanov NA 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	On model phenomenology of vascular cambium activity U. Zubairova, S. Nikolaev 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	The cell growth and division can destroy stem cell niche in a reaction-diffusion model S. Nikolaev, U. Zubairova, S. Fadeev, E. Mjolsness, N. Kolchanov 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	Genetic and molecular characteri-zation of three agronomical importance genes (Vrn1, Vrn2, Q) in wheats Golovnina K., Sormacheva I., Blinov A., Kondratenko E., Goncharov N.P 8th Intern. Wheat Conf. June 1-4, 2010. SPb, 2010
	Модель типа реакция-диффузия механизма регуляции пространственной структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В. , Зубаирова У.С., Мьолснесс Э., Смаль П.А., Шапиро Б., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
	Нестабильность структуры клеточного ансамбля в модифицированной модели трехцветного флага в результате роста и деления клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мьолснесс Э., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
	A reaction-diffusion model of shoot apical meristem compartmentalization based on CLV/WUS interplay Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Mjolsness E., Smal P.A., Shapiro B., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
	Modified French Flag model: instability of the structure under cell growth and division Zubairova U.S., Nikolaev S.V., Fadeev S.I., Mjolsness E., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
	Возможности и ограничения молекулярно-цитогенетических методов в исследовании хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Дзюбенко В. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. V Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных (KARYO V) с 16 по 20 августа 2010 г. г. Новосибирск
	Флуоресцентная гибридизация in situ оригинальных микродиссекционных ДНК-проб с А- и В-хромосомами плавучей кобылки Eyprepocnemis plorans Charp. (Orthoptera, Acrididae) Дзюбенко В. В., Бугров А. Г., Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Рубцов Н. Б. V Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных (KARYO V) с 16 по 20 августа 2010 г. г. Новосибирск
	Возмущения за счет деления клеток в пространственно‐распределенной модели регуляции структуры ниши стволовых клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мелснесс Э., Колчанов Н.А. Международная конференция "Стохастические модели в биологии и предельные алгебры", 2—7 августа 2010 Омск Россия
	Моделирование динамических систем с динамической структурой на примере камбиальных клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В. Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых учёных "Молодёжь и современные информационные технологии", 3-5 марта 2010 года
	Молекулярные маркеры в сравнительной цитогенетике саранчовых подсемейства Gemphocerinae (Acrididae, Orthoptera) Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Молекулярные маркеры в сравнительной цитогенетике саранчовых подсемейства Gomphocerinae (Acrididae, Orthoptera) Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Гибридизация in situ и LA-PCR — новый метод получения микродиссекционных ДНК-проб хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Лосева Е. М., Морозкин Е. С., Лактионов П. П., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Эволюционные взаимоотношения ДНК транспозонов суперсемейства тc1-mariner у представителей отряда lepidoptera И.Д.Сормачева ХLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" 10 - 14 апреля 2010 года, Новосибирск.
	Гибридизация in situ и LA-PCR – новый метод получениея микродиссекционных ДНК-проб хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Лосева Е.М., Морозкин Е.С., Лактионов П.П., Бугров А.Г., Рубцов Н.Б KARYO V
2009	Comparative analysis of localization of rDNA clusters an telomeric repeats (TTAGG)n in C-positive and C-negative chromosome regions of Gomphocerinae grasshoppers (Acrididae; Orthoptera) Jetybayev I., Bugrov A., Karamysheva T., Rubtsov N 17th International Chromosome Conference
2008	Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development Lavreha V.V., Penenko A.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A. The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)
	A MODEL STUDY OF THE ROLE OF PROTEINS CLV1, CLV2, CLV3, AND WUS IN REGULATION OF THE STRUCTURE OF THE SHOOT APICAL MERISTEM Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A. The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)
	Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development V.V. Lavreha, A.V.Penenko, S.V. Nikolaev, N.A. Kolchanov The European conference on Computational Biology (ECCB'08)
2007	Применение формализма dL-систем для изучения модели регуляции размеров возобновительной зоны в растущей ткани Зубаирова У.С., Николаев С.В. VIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Новосибирск, 27-29 ноября 2007
	Computer system for analysis and modeling 2D plant tissue Lavreha V.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A., Penenko A.V. 3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia
	Modeling of the Shoot Apical Meristem Structure Regulation Based on CLV1, CLV2, CLV3 and WUS Interactions Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A. The Eighth International Conference On Systems Biology (ICSB-2007)
2006	A system for simulation of 2D plant tissue growth and development Nikolaev S.V., Penenko A.V., Belavskaya V.V., Mjolsness E., N.A. Kolchanov N.A. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
	Identification and structure-functional analysis of the specificity determining residues of the alpha subunits of the proteosomal complex. Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Novosibirsk, Russia, 2006, v.1, p. 235-239. Baryshev P.B., Afonnikov D.A., Nikolaev S.V. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure

Гранты

2020	Системное изучение механизмов морфогенеза растений на основе данных секвенирования транскриптомов одиночных клеток РФФИ, номер гранта 20-04-01112 А
	Анализ взаимодействия коры и гиппокампа при проявлении депрессивно-подобного состояния и его коррекции методами постгеномной нейробиологии РНФ
2019	Системное изучение взаимной регуляции ростовых процессов и водного режима злаков РНФ, номер гранта 19-74-10037
	Создание клеточных моделей болезни Хантингтона для изучения молекулярных механизмов развития патологии РНФ, номер гранта 16-15-10128П
	Гены - регуляторы гликозилирования белков человека Российский научный фонд, номер гранта 19-15-00115
2018	Новый подход к созданию безопасных растительных систем экспрессии чужеродных белков: снижение природной токсичности табака методом геномного редактирования РФФИ, номер гранта 18-416-543004 р_мол_а
	Разработка платформы для доместикации картофеля de novo РФФИ, номер гранта 18-316-00068 мол_а
	Разработка метода и онлайн ресурса для биоинформатического анализа фолд-специфической экспрессии генов РФФИ, номер гранта 18-34-00871
	Исследование механизмов генетической регуляции процессов развития растений на примере соцветия пшеницы РФФИ, номер гранта 18-04-00483
2017	Исследование дофаминовой системы мозга у крыс генетически-предрасположенных к высокому уровню защитно-оборонительной агрессии, вызванной страхом. РФФИ, номер гранта 17-04-00183
	Изучение генетических и эпигенетических механизмов программирующего действия материнского лептина в зависимости от пола потомства у мышей РФФИ, номер гранта 17-04-01357 А
	Изучение половых особенностей регуляторного влияния фактора роста фибробластов 21 (FGF21) на углеводно-жировой обмен РНФ, номер гранта 17-15-01036
2016	Выяснение эпигенетических механизмов отсроченного влияния раннего постнатального стресса на формирование когнитивных расстройств у взрослых особей РНФ, номер гранта 16-15-10131
	Поиск целевых генов и оптимизация подходов по модификации геномов для получения новых форм злаков с заранее заданными свойствами РНФ, номер гранта 16-14-00086
	Дуплицированные гены в аллополиплоидном геноме пшеницы - вклад в формирование тканеспецифичных регуляторных механизмов РФФИ, номер гранта 16-04-00912
2015	«Развитие коллекции генетических линий мышей и инструментального обеспечения их высокотехнологического фенотипирования для изучения на животных с целевыми мутациями вклада отдельных генов в эффективность репродукции, скорость старения, нейробиологические процессы и нейропатологии, разработка на этой основе инновационных средств коррекции генетически детерминированных нарушений» Минобрнауки России, номер гранта 14.621.21.0010
	МОЗГ КАК ОРГАН МИШЕНЬ ДЛЯ НАНОРАЗМЕРНЫХ ТВЕРДЫХ АЭРОЗОЛЕЙ. Нейробиологические и нейротоксические эффекты кристаллических и аморфных наночастиц при интраназальном введении. РНФ, номер гранта 14-14-00221
	«Технологическое и коллекционное развитие "Центра генетических ресурсов лабораторных животных" (ЦГР), сформированного на базе SPF-вивария ИЦиГ СО РАН» Минобрнауки России, номер гранта 14.619.21.0005
2014	Картирование и изучение структурно-функциональной организации генных локусов дикорастущей пшеницы Triticum dicoccoides. Российский научный фонд, номер гранта 14-14-00161
2013	Структурно-функциональная организация генов защитного ответа в чужеродно-замещенных линиях пшеницы РФФИ, номер гранта 12-04-33027
2012	Молекулярно-генетическое исследование гена Q, контролирующего основные признаки пшениц, связанные с доместикацией РФФИ, номер гранта 12-04-01099-а
2011	Формирование билатеральной симметрии в зародышах двудольных растений РФФИ, номер гранта 11-04-91397-НИСИ_а
2010	Вертикальная эволюция и горизонтальный перенос ДНК транспозонов и non-LTR ретротранспозонов в отряде Lepidoptera (Insects) Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта П1044
2009	Роль транскрипционных факторов в возникновении яровости у пшениц в процессе доместикации РФФИ, номер гранта 09-04-01382
2008	Компьютерное моделирование и анализ механизма гомеостаза структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме Arabidopsis thaliana РФФИ, номер гранта 08-04-01214-а
2005	Теоретическое исследование особенностей эволюции белков, обусловленных координированными заменами аминокислотных остатков РФФИ, номер гранта 05-04-49141
	Компьютерный анализ структурной организации и эволюции функциональных сайтов глобулярных белков РФФИ, номер гранта 05-04-49283

Научное руководство

2010	Система для моделирования морфогенеза двумерных растительных тканей СМАЛЬ Павел Александрович 2010-06-15
2008	Одномерная модель регуляции структуры возобновительной зоны в биологической ткани с учетом роста и деления клеток Зубаирова Ульяна Станиславовна 2008-06-10
	Идентификация параметров в модели регуляции компартментной структуры апикальной меристемы растения СМАЛЬ Павел Александрович 2008-06-10
2006	L-системы и моделирование в биологии развития растений Еременко Денис Сергеевич 2006-06-12
	Применение формализма dL-систем для моделирования в биологии развития (на примере водоросли Anabaena Catenula) Зубаирова Ульяна Станиславовна 2006-06-12