Система учета научной деятельности (ASSA)

Вход

Внебюджетные подразделения

Подразделения

Лаборатория по технологии ферментации (т. 139)
Лаборатории РНФ

Научные результаты

Сотрудники

Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода:

2003

2004

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

2016

2017

2018

2019

2020

Публикации Монографии Конференции Гранты Научное руководство Патенты

Публикации

2020	Stress early in life leads to cognitive impairments, reduced numbers of CA3 neurons and altered maternal behavior in adult female mice Reshetnikov V.V., Kovner A.V., Lepeshko A.A., Pavlov K.S., Grinkevich L.N., Bondar N.P. GENES BRAIN BEHAV, 2020, Volume 19, Issue 3
	Impact of mothers' experience and early‐life stress on aggression and cognition in adult male mice Vasiliy V. Reshetnikov, Yulia A. Ryabushkina,Natalia P. Bondar DEV PSYCHOBIOL, 2020, Volume 62, Issue 1, Pages 36-49
	Генетический полиморфизм экспериментально воспроизводимых форм артериальной гипертонии Редина О.Е., Девяткин В.А., Ершов Н.И., Маркель А.Л. Генетика, 2020, Т. 56. – № 2. – С. 211-224.
	Genetic polymorphism of experimentally produced forms of arterial hypertension O. E. Redina, V. A. Devyatkin, N. I. Ershov, A. L. Markel RUSS J GENET+, 2020, Vol. 56, No. 2, pp. 213–225.
	Maternal Separation Early in Life Alters the Expression of Genes Npas4 and Nr1d1 in Adult Female Mice: Correlation with Social Behavior Yuliya A. Ryabushkina, Vasiliy V. Reshetnikov, Natalya P. Bondar BEHAV NEUROL, 2020, Volume 2020, Article ID 7830469, 9 pages
	"Single-Nucleotide Polymorphisms (SNPs) Both Associated with Hypertension and Contributing to Accelerated-Senescence Traits in OXYS Rats" Vasiliy A. Devyatkin, Olga E. Redina, Natalia A. Muraleva, Nataliya G. Kolosova INT J MOL SCI, 2020, 21, 3542
	Features of Postnatal Hippocampal Development in a Rat Model of Sporadic Alzheimer’s Disease Ekaterina A. Rudnitskaya, Tatiana A. Kozlova, Alena O. Burnyasheva, Anna E. Tarasova, Tatiana M. Pankova, Marina V. Starostina, Natalia A. Stefanova and Nataliya G. Kolosova Frontiers in Neuroscience, 2020, Volume 14 \| Article 533
	ОСОБЕННОСТИ ГЕНОФОНДА ТУВИНСКОГО ЭТНОСА НА ОСНОВЕ ИЗУЧЕНИЯ АНТИГЕНОВ ГРУПП КРОВИ В СРАВНИТЕЛЬНОМ АСПЕКТЕ Л.Э. Табиханова, Л.П. Осипова, С.С.Ковалёв, У.Н. Кавай-оол, А.Н. Сарыглар, Т.В. Чуркина, М.Р. Хантемирова Якутский медицинский журнал, 2020, №2, с.84-87
	FEATURES OF THE GENE POOL OF THE TUVINIAN ETHNOS BASED ON THE STUDY OF BLOOD GROUP ANTIGENS IN COMPARATIVE PERSPECTIVE L.E. Tabikhanova, L.P. Osipova, S.S. Kovalev, U.N. Kavai-ool, A.N. Sariglar, T.V. Churkina, M.R. Khantemirova Якутский медицинский журнал, 2020, №2, с.84-87
	Dissection of novel candidate genes for grain texture in Russian wheat varieties Kiseleva A.A., Leonova I.N., Pshenichnikova T.A., Salina E.A. PLANT MOL BIOL, 2020
	ВЛИЯНИЕ СТРЕССА НА ЭКСПРЕССИЮ НЕЙРОТРОФИЧЕСКОГО ФАКТОРА МОЗГА (BDNF) И ЕГО ПРЕДШЕСТВЕННИКА proBDNF У МЫШЕЙ, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬЮ СЕРОТОНИНОВЫХ 5-НТ1А РЕЦЕПТОРОВ Е. М. Кондаурова, Т. В. Ильчибаева, Д. В. Базовкина, Н. К. Попова, В. С. Науменко Нейрохимия, 2020, том 37, № 3, с. 201–207
	ЭФФЕКТЫ ОСТРОГО СТРЕССА У МЫШЕЙ, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬЮ 5-НТ1А-РЕЦЕПТОРОВ К ХРОНИЧЕСКОЙ АКТИВАЦИИ С ПОМОЩЬЮ 8-OH-DPAT Е. М. Кондаурова, Е. В. Антонов, Е. Ю. Баженова, Д. В. Базовкина, В. С. Науменко Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2020, том 106, № 9, с. 1069–1084
	Subcellular compartmentalization of the plant antioxidant system: an integrated overview Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Alexey Kolodkin, Alexey Doroshkov PeerJ, 2020
	Genetic variability of spelt factor gene in Triticum and Aegilops species Vavilova V., Konopatskaia I., Blinov A., Kondratenko E.Ya., Kruchinina Y.V., Goncharov N.P. BMC PLANT BIOL, 2020, Vol. 21. (Suppl. 1).
	Cognitive training as a potential activator of hippocampal neurogenesis in the rat model of sporadic Alzheimer’s disease Alena O. Burnyasheva, Tatiana A. Kozlova, Natalia A. Stefanova, Nataliya G. Kolosova, Ekaterina A. Rudnitskaya INT J MOL SCI, 2020, Sep 23;21(19):E6986
2019	Sex differences in the expression of lipid oxidation and glucose uptake genes in muscles of fasted mice Феофанова Н.А., Яковлева Т.В., Макарова Е.Н., Бажан Н.М. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(1):62-66
	FTO haplotyping underlines high obesity risk for European populations Babenko VN, Babenko RO, Gamieldien G, Markel AL BMC MED GENOMICS, 2019, BMC Genetics 2019
	CHARACTERIZATION OF A NOVEL DOMINANT MUTATION FOR THE LIGULELESS TRAIT: Aegilops tauschii liguleless (Lgt) Alina E. Dresvyannikova, Nobuyoshi Watanabe, Alexander F. Muterko, Alexander A. Krasnikov, Nicolay P. Goncharov, Oxana B. Dobrovolskaya BMC PLANT BIOL, 2019
	Вариабельность по экспрессии GFP- гена в моноклональных клеточных линиях Arabidopsis thaliana Т.В. МАРЕНКОВА, Ю.В. СИДОРЧУК, А.В. НОСОВ, А.А. ФОМЕНКОВ, В.В. КУЗНЕЦОВ, С.Р. МУРСАЛИМОВ, А.А. ЗАГОРСКАЯ, Е.А. УВАРОВА, П.А. БЕЛАВИН, Е.В. ДЕЙНЕКО Биотехнология, 2019, Т. 35, № 1, С. 58–67
	Системный подход к моделированию развития листостебельных грибных инфекций пшеницы Николаев С.В., Зубаирова У.С., Сколотнева Е.С., Орлова Е.А., Афонников Д.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(1):100-109
	Numerical Algorithm for Morphogen Synthesis Region Identification with Indirect Image-Type Measurement Data Penenko A.V., Zubairova U.S., Mukatova Z., Nikolaev S.V. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2019, Vol. 17, No. 1 1940002
	Межвидовой полиморфизм генов DEP1 и форма колоса у пшениц Вавилова В.Ю., Конопацкая И.Д., Блинов А.Г., Гончаров Н.П. Генетика, 2019, том 55, № 7, с. 837–843
	The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development. Doroshkov AV, Konstantinov DK, Afonnikov DA, Gunbin KV. BMC PLANT BIOL, 2019
	Homology of Genes Controlling Architectonics of Vegetative and Generative Organs in Barley and Rice and Their Application for Wheat Biodiversity Expansion and Breeding K. V. Ustyantsev, N. P. Goncharov RUSS J GENET+, 2019, V. 55 (5), P. 535-543
	CRISPR/Cas9-mediated gfp gene inactivation in Arabidopsis suspension cells Natalya V. Permyakova, Yury V. Sidorchuk, Tatyana V. Marenkova, Sofya A. Khozeeva, Vitaly V. Kuznetsov, Alla A. Zagorskaya, Sergei M. Rozov, Elena V. Deineko MOL BIOL REP, 2019, 46(6), 5735-5743
	Inhibition of Opisthorchis felineus glutathione-dependent prostaglandin synthase by resveratrol correlates with attenuation of cholangiocyte neoplasia in a hamster model of opisthorchiasis. Pakharukova MY, Zaparina OG, Kovner AV, Mordvinov VA. INT J PARASITOL, 2019, 2019;49:963-973.
	Эффект атипичных антипсихотических препаратов на экспрессию генов нейротрофических факторов в МРТР-индуцированной модели болезни Паркинсона А.С. Цыбко, Т.В. Ильчибаева, Н.В. Хоцкин, А.И. Коветская, В.С. Науменко, Н.К. Попова Нейрохимия, 2019, Т.36, №2, С.155-163
	The Effect of Atypical Antipsychotic Drugs on the Neurotrophic Factors Gene Expression in the MPTP Model of Parkinson’s Disease A.S. Tsybko, T.V. Il’chibaeva, N.V. Khotskin, A.I. Kovetskaya, V.S. Naumenko, N.K. Popova NEUROCHEM J+, 2019, Vol.13 (2). pp.169-175
	Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.) Anton Ermakov, Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Dmitrii Konstantinov, Alexey Doroshkov PeerJ, 2019, PeerJ 7:e7791
	Sex-specific effects of leptin administration to pregnant mice on the placentae and the metabolic phenotypes of offspring. Denisova E.I. Kozhevnikova V.V. Bazhan N.M. Makarova E.N. FEBS Open Bio, 2019, Nov. 8
	Sex Differences in Liver, Adipose Tissue, and Muscle Transcriptional Response to Fasting and Refeeding in Mice Bazhan N, Jakovleva T, Feofanova N, Denisova E, Dubinina A, Sitnikova N, Makarova E. Cells, 2019, 8(12), 1529
	Транскриптомное секвенирование в культурах клеток глиом и анализ данных экспрессии генов Ю.Л.Орлов, С.С.Ковалев, Ю.П.Белоусова, Н.Г.Орлова, Е.Ю.Леберфарб Гены и клетки, 2019, Vol.XIV, №3, р.111
	Sex Dimorphism in the Fgf21 Gene Expression in Liver and Adipose Tissues is Dependent on the Metabolic Condition Bazhan N., JakovlevaT., Balyibina N., Dubinina A., Denisova E., Feofanova N., Makarova E. Online journal of biological sciences, 2019, 19 (1): 28-36
	Компьютерные методы для анализа технологий секвенирования в анализе хромосомных контактов в клетке Орлов Ю.Л., Ковалев С.С., Дергилев А.И., Бабенко Р.О., Галиева Э.Р., Леберфарб Е.Ю. Гены и клетки, 2019, Том XIV №4-1, 2019. C. 171.
2018	CpG islands’ clustering uncovers early development genes in the human genome Babenko V.N. , Bogomolov A.G., Babenko R.O., Galieva E.R., Orlov Y.L. COMPUT SCI INF SYST, 2018, V 15 N2
	Effects of early-life stress on social and anxiety-like behaviors in adult mice: sex-specific effects Bondar N., Lepeshko A., Reshetnikov V. BEHAV NEUROL, 2018, Volume 2018 (2018), 13 pages
	Consequences of early life stress on genomic landscape of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice Nikita I. Ershov, Natalya P. Bondar, Arina A. Lepeshko, Vasiliy V. Reshetnikov, Julia A. Ryabushkina, Tatiana I. Merkulova BMC GENOMICS, 2018, 19(Suppl 3):93
	Analysis of the Basic Characteristics of Osteogenic and Chondrogenic Cell Lines Important for Tissue Engineering Implants Astakhova N.M., Korel’ A.V., Shchelkunova E.I., Orishchenko K.E., Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Kirilova I.A. B EXP BIOL MED+, 2018, 5 March 2018, Pages 1-8
	The impact of early-life stress on the expression of HPA-associated genes in the adult murine brain V.V. Reshetnikov, A.A. Studenikina, J.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova, N.P. Bondar BEHAVIOUR, 2018, Volume 155, Issue 2-3, pages 181 – 203
	Генетические механизмы формирования времени колошения мягкой пшеницы А. А. Киселёва, Е. А. Салина RUSS J GENET+, 2018, Т. 54, № 4, с. 381–396
	Genetic Regulation of Common Wheat Heading Time A.A. Kiseleva, E.A. Salina RUSS J GENET+, 2018, Vol. 54, No. 4, pp. 375–388
	The long-term effects of early postnatal stress on cognitive abilities and expression of genes of the glutamatergic system in mice V. V. Reshetnikov, A. A. Lepeshko, Yu. A. Ryabushkina, A. A. Studenikina, T. I. Merkulova, N. P. Bondar NEUROCHEM J+, 2018, 12(2): 142-151
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на когнитивные способности и экспрессию генов глутаматергической системы у мышей В В Решетников, А А Лепешко, Ю А Рябушкина, А А Студеникина, Т И Меркулова, Н П Бондарь Нейрохимия, 2018, 35(2): 140-150
	Genetically defined fear-induced aggression: Focus on BDNF and its receptors. Ilchibaeva TV, Tsybko AS, Kozhemyakina RV, Kondaurova EM, Popova NK, Naumenko VS BEHAV BRAIN RES, 2018, Volume 343, Pages 102-110
	Анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным транскриптомного секвенирования. Ковалев С.С., Губанова Н.В., Леберфарб Е.Ю., Брагин А.О., Орлов Ю.Л. Гены и клетки, 2018, Приложение, No 1, стр.71-72
	Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, Том 16, № 3, С.22-36
	ВЛИЯНИЕ НОКАУТА ГЕНА ФАКТОРА НЕКРОЗА ОПУХОЛИ НА ПОВЕДЕНИЕ И ДОФАМИНОВУЮ СИСТЕМУ МОЗГА У МЫШЕЙ Д. В. Базовкина, Д. В. Фурсенко, А. В. Першина, Н. В. Хоцкин, Е. Ю. Баженова, А. В. Куликов Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2018, Том 104 № 7 с. 745—756.
	Компьютерная база данных для анализа дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с агрессивным поведением, на моделях лабораторных животных Анатолий Олегович Брагин, Кирилл Александрович Табанюхов, Ирина Витальевна Чадаева, Антон Витальевич Цуканов, Роман Олегович Бабенко, Ирина Вадимовна Медведева, Антон Геннадьевич Богомолов, Владимир Николаевич Бабенко, Юрий Львович Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, 2018. - Том 16, Выпуск № 3. - С. 7-21. - DOI 10.25205/1818-7900-2018-16-3-7-21. - ISSN 1818-7900
	Гендер-специфическое влияние мутации Аy у мышей на метаболический фенотип потомства, рост плодов и экспрессию генов в плацентах Макарова Е.Н., Денисова Е.И., Кожевникова В.В., Кулешова А.Е Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 22(4):406-414
	Инактивация гена GFP при помощи системы CRISPR/Cas9 в культуре суспензионных клеток Arabidopsis Thaliana Н.В. Пермякова, Ю.В. Сидорчук, Т.В. Маренкова, С.А. Хозеева, А.А. Загорская, Е.В. Дейнеко Гены и клетки, 2018, Приложение, №2, с. 84-85
	Исследование агрегативности суспензионной клеточной культуры Arabidopsis thaliana с нокаутом гена GAUT1 Ю.В. Сидорчук, А.С. Щелокова, Н.В. Пермякова, Е.В. Дейнеко Гены и клетки, 2018, Приложение, №2, с. 47
	Interpreting chromosomal rearrangements in the context of 3-dimentional genome organization: a practical guide for medical genetics V.S. Fishman, P.A. Salnikov, N.R. Battulin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2018
	Соцветие злаков: особенности строения, развития и генетической регуляции морфогенеза Добровольская О.Б., Дресвянникова А.Е. Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 2018;22(7):766-775
2017	Genes WHEAT FRIZZY PANICLE and SHAM RAMIFICATION 2 independently regulate differentiation of floral meristems in wheat Oxana B. Dobrovolskaya, Yumiko Amagai, Karina I. Popova, Alina E. Dresvyannikova, Petr Martinek, Alexander A. Krasnikov, Nobuyoshi Watanabe BMC PLANT BIOL, 2017, 17(Suppl 2):252
	Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Программные системы: теория и приложения, 2017, 8:1(32), 219–242
	Эффекты непродолжительного воздействия лития на экспрессию антиапоптозного белка Bcl-xL в коре и гиппокампе в ответ на острый стресс Дыгало Н.Н., Баннова А.В., Сухарева Е.В., Шишкина Г.Т., Айриянц К.А., Калинина Т.С. Биохимия, 2017, 2017, том 82, вып. 3, с. 487 – 493.
	Effects of short-term exposure to lithium on antiapoptotic Bcl-xL protein expression in cortex and hippocampus of rats after acute stress Dygalo N.N., Bannova A.V., Sukhareva E.V., Shishkina G.T., Ayriyants K.A., Kalinina T.S. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 345-350. / Original Russian Text © N. N. Dygalo, A. V. Bannova, E. V. Sukhareva, G. T. Shishkina, K. A. Ayriyants, T. S. Kalinina1,2, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 487-493.
	Оптогенетическая активация нейрона повышает в нем уровень антиапоптозного белка Bcl-xL Ланшаков Д.А., Дрозд У.С., Дыгало Н.Н. Биохимия, 2017, Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 481 – 486
	Optogenetic stimulation increases level of antiapoptotic protein Bcl-xL in neurons Lanshakov DA, Drozd US, Dygalo NN BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 340-344. Original Russian Text © D. A. Lanshakov, U. S. Drozd, N. N. Dygalo, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 481-486.
	Role of glial cell line-derived neurotrophic factor in the pathogenesis and treatment of mood disorders A.S. Tsybko, T.V. Ilchibaeva, N.K. Popova REV NEUROSCIENCE, 2017
	Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекс ExpGene А. М. Спицина, А. О. Брагин, А. И. Дергилев, И. В. Чадаева, Н. Н. Твердохлеб, Э. Р. Галиева, Л. Э. Табиханова, Ю. Л. Орлов Програмные системы: теория и приложения, 2017, 8:2(33), 45–68.
	Ранние этапы развития соцветия пшеницы: Изучение генетического контроля и физиологии. Добровольская О.Б. Бадаева Е.Д. Попова К.И. Красников А.А. Мартинек П. Acta Naturae, 2017, том 9 стр.59
	СУСПЕНЗИОННЫЕ КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК РАСТЕНИЙ КАК ПЛАТФОРМА ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНЫХ БЕЛКОВ Загорская А.А., Дейнеко Е.В. Физиология растений, 2017, том 64, № 6, с. 403–417
	Experimental opisthorchiasis: Study of blood cell composition, hematopoiesis, and startle reflex in laboratory animals D. F. Avgustinovich a, *, I. A. Orlovskaya b , L. B. Toporkova b , G. B. Vishnivetskaya a , A. V. Katokhin a , M. N. Lvova a , E. V. Kashina a , N. P. Bondar a , N. A. Feofanova a, b , and V. A. Mordvinov a, c Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, 7(1):82-92 · January 2017
	Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene Anastasiya Y. Glagoleva, Nikolay A. Shmakov, Olesya Y. Shoeva, Gennady V. Vasiliev, Natalia V. Shatskaya, Andreas Börner, Dmitry A. Afonnikov, Elena K. Khlestkina BMC PLANT BIOL, 2017, 17(Suppl 1):182, DOI 10.1186/s12870-017-1124-1
	Generation of megabase-scale deletions, inversions and duplications involving the Contactin-6 gene in mice by CRISPR/Cas9 technology Korablev AN,Serova IA, Serov OL BMC GENET, 2017, v.18. (Suppl 1): 112
	Unexpected phenotypic effects of a transgene integration causing a knockout of the endogenous Contactin-5 gene in mice Smirnov AV, Kontsevaya GV, Feofanova NA, Anisimova MV, Serova IA, Gerlinskaya LA, Battulin NR, Moshkin MP, Serov OL TRANSGENIC RES, 2017
	Создание кандидатной вакцины против клещевого энцефалита на основе гибридного рекомбинантного flagG-protE-белка Белавин П.А., Кунык Д.А., Протопопова Е.В., Локтев И.Б., Дейнеко Е.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(8):986-992. DOI 10.18699/VJ17.323
	Генерирование мегабазных делеций, дупликаций и инверсий, включающих ген Cntn6, у мышей: экспериментальные модели нейро-психических нарушений человека, вызванных масштабными хромосомными перестройками Кораблев АН, Серова ИА, Серов ОЛ Гены и клетки, 2017, Т. XII, № 3, С.123
	Манипуляции с ранними эмбрионами мыши для создания генетически модифицированных животных А.Н. Кораблев, И.А. Серова, Б.В. Скрябин Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(7):758-763, DOI 10.18699/VJ17.291
	The factors affecting the evolution of the anthocyanin biosynthesis pathway genes in monocot and dicot plant species Shoeva O.Yu., Glagoleva A.Yu., Khlestkina E.K. BMC PLANT BIOL, 2017, 17(Suppl 2):256, https://doi.org/10.1186/s12870-017-1190-4
	DEP1 gene in wheat species with normal, compactoid and compact spikes V. Vavilova, I. Konopatskaia, A. E. Kuznetsova, A. Blinov, N. P. Goncharov BMC GENET, 2017, 18(Suppl 1): 106
	Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis Alex V. Kochetov, Anastasiya Y. Glagoleva, Kseniya V. Strygina, Elena K. Khlestkina, Sophia V. Gerasimova, Salmaz M. Ibragimova, Natalja V. Shatskaya, Gennady V. Vasilyev, Dmitry A. Afonnikov, Nikolay A. Shmakov, Olga Y. Antonova, Tatyana A. Gavrilenko, Natalia V. Alpatyeva, Alexander Khiutti, Olga S. Afanasenko BMC PLANT BIOL, 2017, BMC Plant Biology 2017, 17 (Suppl 2):251
	Suspension-Cultured Plant Cells as a Platform for Obtaining Recombinant Proteins Загорская А.А., Дейнеко Е.В. RUSS J PLANT PHYSL+, 2017, Vol. 64, No. 6, pp. 795–807
	Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016	Механизмы регуляции передачи этиленового сигнала у растений Землянская Е.В., Омельянчук Н.А., Ермаков А.А., Миронова В.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, Принята в печать. DOI: 10.18699/VJ15.105
	Экспериментальный описторхоз: исследование состава форменных элементов крови, гемопоэза и стартл-рефлекса у лабораторных животных Д.Ф. Августинович, И.А. Орловская, Л.Б. Топоркова, Г.Б. Вишнивецкая, А.В. Катохин, М.Н. Львова, Е.В. Кашина, Н.П. Бондарь, Н.А. Феофанова, В.А. Мордвинов Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016. 20 (2):155-164
	Компьютерный анализ совместной локализации сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq Дергилев А.И., Спицина А.М., Чадаева И.В., Свичкарев А.В., Науменко Ф.М., Кулакова Е.В., Витяев Е.Е., Чен М., Орлов Ю.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6):770-778. DOI 10.18699/VJ16.194
	Analysis of differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals Babenko V.N., Bragin A.O., Spitsina A.M., Chadaeva I.V., Galieva E.R., Orlova G.V., Medvedeva I.V., Orlov Y.L. J INTEGR BIOINFORM, 2016, 13(4):292. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-292
	Практическое руководство по редактированию геномов системой CRISPR/Cas9 Мензоров А.Г., Лукьянчикова В.А., Кораблев А.Н., Серова И.А., Фишман В.С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):930-944. DOI 10.18699/VJ16.214
	Эффективное получение химерных мышей с использованием новой линии эмбриональных стволовых клеток Концевая Г.В., Феофанова Н.А., Мензоров А.Г., Пристяжнюк И.Е., Смирнов А.В., Баттулин Н.Р., Герлинская Л.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):925-929. DOI 10.18699/VJ16.213
	Структурное моделирование мод связывания НАД+ с ПАРП-1 Иванисенко Н.В., Жечев Д.А., Иванисенко В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016
	Морфофизиологические эффекты инсерционного мутагенеза гена контактин 5 (Cntn5) у трансгенных мышей А. В. Смирнов, Н. А. Феофанова, Г. В. Концевая, М. В. Анисимова, И. И. Ковригин, И. А. Серова, М. П. Мошкин, Л. А. Герлинская, Н. Р. Баттулин Vavilov journal of genetics and breeding, 2016
	Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
2015	Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК Спицина А.М., Орлов Ю.Л., Подколодная Н.Н., Свичкарев А.В., Дергилев А.И., Чен М., Кучин Н. В., Черных И. Г., Глинский Б. М. Программные системы: теория и приложения, 2015, 6:1(23), c. 157–174
	Программы анализа геномных данных секвенирования, полученных на основе технологий ChIP-seq, ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е. В., Спицина А. М., Орлова Н. Г., Дергилев А. И., Свичкарев А. В., Сафронова Н. С., Черных И. Г., Орлов Ю. Л. Программные системы: теория и приложения, 2015, 2(25), c. 129–148
2010	Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А. Сибирский журнал индустриальной математики, 2010, том 13, № 4 (44) С. 70-82
	Распространение и филогенетические взаимоотношения Tc1-Mariner ДНК транспозонов в отряде Lepidoptera И.Д.Сормачева, А.С.Новиков, А.Г.Блинов Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 430-432.
	Cross-hybridization of repetitive sequences from the pericentric heterochromatic region of Chorthippus apricarius (L.) with the chromosomes of grasshoppers from the Gomphocerini tribe Jetybayev I.E., Karamysheva T.V., Bugrov A.G., Rubtsov N.B. EUROA Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 433–436 + III
	Supernumerary chromosomes as markers of population structure evolution in the grasshopper Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Dzubenko V.V., Bugrov A.G., Jetybayev I.E., Rubtsov N.B. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 437–440 + IV
	Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
	Кросс-гибридизация повторенных последовательностей ДНК прицентромерного гетерохроматина Chorthippus apricarius (L.) с хромосомами саранчовых трибы Gomphocerini. Джетыбаев И. Е., Карамышева Т.В., Бугров А.Г., Рубцов Н.Б Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 433-436
	Добавочные хромосомы как маркёры формирования популяционной структуры плавучей кобылки Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Дзюбенко В.В., Бугров А.Г., Джетыбаев И.Е., Рубцов Н.Б. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 437-440
2008	Математическое моделирование морфогенеза растений Г.Г. Лазарева, В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, И.В. Шваб, В.А. Вшивков, Д.Н. Горпинченко, С.В. Николаев, Н.А.Колчанов. Журнал вычислительной математики и математической физики, 2008, Т.11. №2., c.151-166
2007	Модельное изучение роли CLV1, CLV2, CLV3 И WUS в регуляции структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В., Пененко A. В., Лавреха В. В., Мелснесс Э. Д., Колчанов Н. А. RUSS J DEV BIOL+, 2007, 38 №6, 457-462
2006	Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани Николаев С.В., Колчанов Н.А., Фадеев С.И., Когай В.В., Мйолснесс Э. Вычислительные технологии, 2006, Том 11, № 2, с. 67 - 81
	Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: I. База данных AGNS Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Шамов И.С.,Поплавский А.С., Подколодный Н.Л., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Мелснесс Э.Д., Мейеровитц Е.M., Колчанов Н.А. BIOPHYSICS, 2006, выпуск N7, т. 51
	A Systems Approach to Morphogenesis in Arabidopsis thaliana: II. Modeling of the Regulation of Shoot Apical Meristem Structure S. V. Nikolaev, S. I. Fadeev, A. V. Penenko, V. V. Lavrekha, V. V. Mironova, E. D. Mjolsness, N. A. Omel’yanchuk, N. A. Kolchanov BIOPHYSICS, 2006, №7, V. 51
2005	Актуальные проблемы компьютерной протеомики Иванисенко В.А., Афонников Д.А., Николаев С.В., Пинтус С.С., Крестьянова М.А., Пальянов А.Ю, Титов И.И. Информационный вестник ВОГИС, 2005, т.9, с.162-178
	Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А. Информационный вестник ВОГИС, 2005, Т.9, N2, май 2005, 232-261
2003	Data Mining Techniques in Bioinformatics Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V. Pattern Recognition and Image Analysis, 2003, N. 4, V. 13, P. 550-555

Монографии

2010	Visualization and Analysis of Biological Networks combining Text Mining and Data Warehouse Approaches Björn Sommer, Evgeny S. Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian J. Janowski, Timofey V. Ivanisenko, Anatoly O. Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel S. Demenkov, Alexey V. Kochetov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov and Ralf Hofestädt
2008	Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование. Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.
	Процессы морфогенеза и подходы к их моделированию Николаев С.В., Гунбин К.В., Омельянчук Н.А., Суслов В.В., Омельянчук Л.В., Колчанов Н.А.

Конференции

2020	QTL analysis complemented by the transcriptome sequencing to identify candidate genes associated with wheat heading time Antonina A. Kiseleva, Alexandr F. Muterko, Elena A. Salina 8th Plant Genomics and Gene Editing Congress: Europe
	Detection and investigation of genes with circadian expression pattern in common wheat Antonina Kiseleva, Maria Bragina, Elena Salina 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” (BGRS/SB-2020)
	Altered expression of genes Npas4 and Nr1d1 in adult female mice with history of early-life stress Yuliya Ryabushkina Vasiliy Reshetnikov Natalya Bondar BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
2019	Изменение агрегативности суспензионной культуры Arabidopsis thaliana с нарушением экспрессии гена GAUT1 Сидорчук Ю.В., Щелокова А.С., Пермякова Н.В., Дейнеко Е.В. IX Съезд общества физиологов растений России «Физиология растений – основа создания растений будущего»
	High-throughput genotyping and transcriptome analysis reveals candidate genes associated with wheat heading time Kiseleva A.A., Muterko A.F., Salina E.A. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
	Development of spring wheat lines with a reduced period from germination to heading using the marker-assisted selection Stasyuk A.I., Kiseleva A.A., Salina E.A. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
	Application of biotechnological approaches in genetic and pre-breeding studies of bread wheat Leonova I.N., Kiseleva A.A., Skolotneva E.S., Salina E.A. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
	Identification of grain and flour quality determinants in common wheat using GWAS Kiseleva A.A., Leonova I.N., Pshenichnikova T.A., Likhenko I.E., Ageeva E.V., Stepochkina N.I., Salina E.A. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
	Новые аспекты регуляции гена Ppd-B1 мягкой пшеницы и его взаимодействий Киселёва А.А., Салина Е.А. VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы
	ALTERING PLANT DOMESTICATION TRAITS VIA SITE-DIRECTED GENOME MODIFICATION Gerasimova S.V., Ivanova K.A., Hertig C., Korotkova A.M., Hiekel S., Kolosovskaya E., Koloshina K.A., Genaev M.A., Komyshev E.G., Egorova A.A., Domrachev D.V., Rogozina E.V., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Identification and characterization of a barley gene controlling cuticle wax formation Gerasimova S., Kolosovskaya E., Hertig C., Hiekel S., Korotkova A., Doroshkov A., Kukoeva T., Domrachev D., Kochetov A., Kumlehn J., Khlestkina E. Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology (PlantGen2019): the fifth international scientific conference
	The study of the localization, structure and expression of the genes regulating the development of the ligular region of the tribe Triticeae Dresvyannikova A.E., Muterko A.F., Krasnikov A.A., Goncharov N.P., Watanabe N., Dobrovolskaya O.B. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
	Изучение локализации, первичной структуры и особенностей экспрессии генов, регулирующих развитие лигульного района у представителей трибы Triticeae Дресвянникова А.Е., Ватанабе Н., Мутерко А.Ф., Красников А.А., Гончаров Н.П., Добровольская О.Б. Международный конгресс "VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПБГУ, и ассоциированные симпозиумы"
	Stress early in life alters the murine cortical transcriptome in age-dependent manner N.P. Bondar, N.I. Ershov, A.S. Shulyupova, P.E. Kisaretova, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova 48th Meeting of the European Brain and Behaviour Society
	Search for single-nucleotide polymorphisms associated with accelerated senescence in OXYS rats Devyatkin V., Redina O, Muraleva N., Kolosova N. 11th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics” – SBB-2019
	Влияние материнского лептина на экспрессию генов в печени и мозге плодов разного пола у мышей Денисова Е.И., Макарова Е.Н. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	ВЛИЯНИЕ ФАКТОРА РОСТА ФИБРОБЛАСТОВ 21 НА УГЛЕВОДНЫЙ ОБМЕН И ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ ПЕЧЕНИ У МЫШЕЙ С ОЖИРЕНИЕМ ЗАВИСИТ ОТ ПОЛА Бажан Н.М., Яковлева Т.В., Денисова Е.И., Дубинина А.Д., Макарова Е.Н. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	АНТИДИАБЕТИЧЕСКИЙ ФАКТОР FGF21 ПО-РАЗНОМУ ВЛИЯЕТ НА ПОТРЕБЛЕНИЕ ПИЩИ И УГЛЕВОДНО-ЖИРОВОЙ ОБМЕН У САМЦОВ И САМОК МЫШЕЙ С ГЕНЕТИЧЕСКИМ МЕЛАНОКОРТИНОВЫМ ОЖИРЕНИЕМ Макарова Е.Н., Балыбина Н.Ю., Дубинина А.Д, Денисова Е.И., Яковлева Т.В., Бажан Н.М. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Antidiabetic FGF21 action depended on sex and exerted only in male mice with diet induced obesity Bazhan, N.; Yakovleva, T.; Denisova, E.; Dubinina, A.; Makarova, E. 26th European Congress on Obesity - 2019ECO
	Central and peripheral effects of FGF21 are sex-specific in mice with melanocortin obesity Makarova, E.; Yakovleva, T.; Denisova, E.; Dubinina, A.; Bazhan, N. 26th European Congress on Obesity - 2019ECO
	ГЕНЕТИЧЕСКАЯ РЕГУЛЯЦИЯ АРХИТЕКТУРЫ СОЦВЕТИЯ ПШЕНИЦЫ Добровольская О.Б., Дресвянникова А.Е., Володина Е.А., Красников А.А., Ю.Л. Орлов, Н. Ватанабэ, П. Мартинек VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы.
	COMPUTER TOOLS FOR BRAIN TRANSCRIPTIONAL PROFILING IN RATS MODELS Chadaeva I.V., Bragin A.O., Kovalev S.S., Galieva A.G., Markel A.L., Orlov Y.L. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Developmental pathways regulating wheat inflorescence architecture Dobrovolskaya O.B., Dresvyannikova A.E., Volodina E.A., Krasnikov A.A., Orlov Yu., Watanabe N., Martinek P. 5th International Scientific Conference “Plant genetics, genomics, bioinformatics, and biotechnology” (PlantGen2019)
	Влияние блокады рецепторов вазопрессина на натрийуретическую функцию почек при стресс-индуцируемой гипертензии (крысы линии НИСАГ) Дубинина А.Д., Иванова Л.Н. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)
	Prediction and verification of auxin-ethylene crosstalk gene networks Ubogoeva E., Levitsky V., Zemlyanskaya E. The Fifth International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2019)
	Анализ генотипа и фенотипа линий ячменя, мутантных по генам транскрипционных факторов типа AP2/ERF Е. В. Колосовская 57-я Международная научная студенческая конференция
	ANALYSIS OF BARLEY MUTANT POPULATIONS OBTAINED BY SIMULTANEOUS MUTAGENESIS AT FOUR GENOMIC LOCI Kolosovskaya E.V., Gerasimova S.V., Hertig С., Korotkova A.M., Kukoeva T.V., Hiekel S., Kochetov A.V., Kumlehn J., Khlestkina E.K. VII International Congress of Vavilov society of geneticists and breeders and associate symposiums
	Нокаутирование генов XYLT, FUCT в суспензионной клеточной линии Arabidopsis thaliana, методом CRISPR/CAS9 Пермякова Н.В., Хозеева С.А., Дейнеко Е.В. IX Съезд общества физиологов растений России «Физиология растений – основа создания растений будущего»
	Исследование мультифакторных заболеваний на примере предрасположенности к алкоголизму: молекулярная генетика и биофизика Осипова Л.П., Хантемирова М.Р., Галиева Э.Р., Личман Д.В., Бабенко Р.О., Ковалев С.С., Табиханова Л.Э., Орлов Ю.Л. VI Съезд биофизиков России
	Анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq Ковалев С.С., Леберфарб Е.Ю., Орлова Н.Г., Брагин А.О., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. VI Съезд биофизиков России
	Исследование молекулярных основ глиобластомы с помощью электронных ресурсов и баз данных Ковалев С.С., Белоусова Ю.П., Галиева Е.Р., Леберфарб Е.Ю., Орлов Ю.Л. Международная научно-практическая конференция «Биоразнообразие и сохранение генофонда флоры, фауны и народонаселения центрально-азиатского региона» 11-15 сентября 2019. г.Кызыл.
	Цифровая медицина как современное направление фундаментальных онкологических исследований в России Ковалев С.С., Белоусова Ю.П., Хантемирова М.Р., Орлов Ю.Л. IV Межрегиональный фестиваль «Молодой профессионал Сибири» 17-18 сентября. 2019. г.Кызыл.
	Суперкомпьютерные вычисления для задач электронного здравоохранения Ю.Л.Орлов, С.С.Ковалев, А.И.Шадеркин, Н.Г.Орлова, Э.Н.Фартушный, Г.С.Лебедев. Национальный Суперкомпьютерный Форум (НСКФ-2019), г. Переславль-Залесский, ИПС имени А.К. Айламазяна РАН, 26 – 29 ноября 2019 г.
	Вычислительные методы для транскриптомного профилирования и анализа данных высокопроизводительного секвенирования Ковалев С.С., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Белоусова Ю.П., Хантемирова М.Р., Орлов Ю.Л. Национальный Суперкомпьютерный Форум (НСКФ-2019), г. Переславль-Залесский, ИПС имени А.К. Айламазяна РАН, 26 – 29 ноября 2019 г.
	3D genome modeling by Hi-C and ChIA-PET data Orlov Y. L., Dergilev A. I., Kovalev S. S., Babenko R. O., Li G. Марчуковские научные чтения - 2019
	Проблемы суперкомпьютерного моделирования в биоинформатике Орлов Ю.Л., Жилицкий В.Е., Ковалев С.С., Галиева А.Г., Лузин А.Н., Подколодный Н.Л. Марчуковские научные чтения - 2019
	Computer tools for spatial chromosome contacts analysis by ChIA-PET and HI-C data. Dergilev A.I., Luzin A.N., Kovalev S.S., Babenko R.O., Orlov Y.L. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.
	Statistical analysis, clusterization and visualization of genome distribution of transcription factor binding sites Dergilev A.I., Tsukanov A.V., Luzin A.N., Babenko R.O., Orlov Y.L. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.
	Database on alternative gene splicing in glioma cell cultures Kovalev S.S., Gubanova N.V., Lieberfarb E.Y., Galieva A.G., Orlov Y.L. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.
	Разработка компьютерной базы данных альтернативного сплайсинга в глиомах Орлов Ю.Л., Ковалев С.С., Бабенко В.Н., Леберфарб Е.Ю. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
2018	Исследование агрегативности суспензионной клеточной культуры Arabidopsis thaliana с нокаутом гена GAUT1 Ю.В. Сидорчук, А.С. Щёлокова, Н.В. Пермякова, Е.В. Дейнеко Международный конгресс “CRISPR-2018”
	Влияние раннего постнатального стресса на транскриптом гиппокампа головного мозга 15-дневных мышей Лепешко А. А., Рябушкина Ю. А., Решетников В. В., Бондарь Н. П. Зимняя молодежная школа ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии
	Localization and Study of Interactions of B-Genome Genes Inducing Flowering of Common Wheat Antonina A. Kiseleva, Elena A. Salina Plant and Animal Genome Conference, PAG Asia 2018
	Длительное отделение от матерей в ранний период жизни приводит к когнитивным и поведенческим нарушениям у взрослых самок мышей: ключевая роль гиппокампа Решетников В.В., Ковнер А.В., Рябушкина Ю.А., Лепешко А.А., Бондарь Н.П. ГИППОКАМП И ПАМЯТЬ: НОРМА И ПАТОЛОГИЯ
	Особенности изменений транскриптома гиппокампа головного мозга 15-ти дневных мышей, подвергавшихся раннему постнатальному стрессу Лепешко А.А., Рябушкина Ю.A., Решетников В.В., Бондарь Н.П. ГИППОКАМП И ПАМЯТЬ: НОРМА И ПАТОЛОГИЯ
	Previous mother’s experience and early life stress: impact on aggression and cognition in adult mice V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, N.P. Bondar The 11th International Conference BGRS\SB-2018
	Impact of early life stress on susceptibility to chronic social stress in adult mice A. Lepeshko, V. Reshetnikov, N. Bondar The 11th International Conference BGRS\SB-2018
	Consequences of early life stress in mice: transcriptional and epigenetic hallmarks in frontal cortex and hippocampus N.P. Bondar, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, T.I. Merkulova The 11th International Conference BGRS\SB-2018. Simposium Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB-2018
	Brain regions transriptome analysis in mouse chronic stress model Babenko VN, Babenko RO, Kudryavtseva NN Belgrade Bioinformatics Conference
	Transposable Elements mediated CTCF binding sites: their nuclear compartments localization in human genome Babenko VN, Babenko RO Chromosome 2018
	Получение кардиомиоцитов из пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток для моделирования наследственных сердечно-сосудистых заболеваний Дементьева Е.В., Медведев С.П., Коваленко В.Р., Югова К.А., Вяткин Ю.В., Кретов Е.И., Слотвицкий М.М., Штокало Д.Н., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Всероссийская научно-практическая конференция «Новые вызовы и новые решения в кардиологии»
	Моделирование наследственных аритмических заболеваний человека с использованием пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Дементьева Е.В., Медведев С.П., Коваленко В.Р., Югова К.А., Вяткин Ю.В., Кретов Е.И., Слотвицкий М.М., Штокало Д.Н., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Национальный медицинский инновационный форум
	Исследование влияния мутаций в генах, ассоциированных с наследственной гипертрофической кардиомиопатией, с помощью пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Дементьева Е.В., Медведев С.П., Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Кретов Е.И., Слотвицкий М.М., Штокало Д.Н., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Международный конгресс “CRISPR-2018”
	Leptin administration in midpregnancy reduces fetal and early postnatal growth rate and abolishes obesity-associated hyperglycemia in mouse offspring Makarova E., Denisova E., Kozhevnikova V. 20th Global Obesity Meeting
	Sex-specific changes of gene expression in response to obesity are associated with different FGF21 expression in obese male and female mice Makarova E., Denisova E., Dubinina A., Feofanova N., Yakovleva T., Bazhan N. 20th Global Obesity Meeting
	Sex-specific effect of leptin on gene expression in placentas and fetal tissues in mice E. Denisova, E. Makarova BGRS-2018
	Fasting increases FGF21 expression in liver and changes gene expressions in metabolic organs in a sex-specific manner in mice Nadezhda Bazhan, Yakovleva T, Denisova E, Dubinina N, Feofanova N, Chepeleva E and Makarova E 20th Global Obesity Meeting
	Studying the impact of sex on the molecular mechanisms of liver adaptation to fasting in mice N. Bazhan, N. Sitnikova , T. Iakovleva, A. Dubinina, E. Makarova BGRS 2018
	Sex differences in the effect of high-fat diet on mouse white adipose tissue Bazhan N, Yakovleva T, Dubinina A, Makarova E. 21 World Obesity Conference
	Search of single-nucleotide polymorphisms associated with accelerated senescence in OXYS rats V. Devyatkin, N. Muraleva, O. Redina 11th International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology»
	DEP1 gene in wheat species with different spike phenotype I. Konopatskaia, V. Vavilova, A. Kuznetsova, A. Blinov Plant Biology Europe 2018
	Computer analysis of alternative splicing events by RNA-seq data in brain cells V.N. Babenko, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, A.O. Bragin,G.V. Vasiliev, Yu.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
	Cell-free RNA studies in cancer based on T oligo-primed polymerase chain reaction (TOP-PCR) technology K.-P.Chiu, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, Y.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
	Alternative splicing in transcriptomes of glioma cell cultures N.V. Gubanova, A.O. Bragin, A.G. Bogomolov, S.S. Kovalev, Y.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
	Влияние стресса матери на проявление последствий раннего постнатального стресса у взрослых самцов мышей Батлук У.И., Решетников В.В, Рябушкина Ю.А., Бондарь Н.П. Фундаментальные аспекты компенсаторно-приспособительных процессов
	Hepatoprotective effect of various antioxidants in the pathogenesis of opisthorchiasis Zaparinа O., Kovner A., Rakhmetova A., Pakharukova M., Mordvinov V. System Biology and bioinformatics (SBB-2018) The Tenth International Young Scientists School
	Роль активных форм кислорода в системе взаимоотношений «паразит-хозяин» при описторхозе Запарина О.Г., Kовнер A.В., Рахметова A.Ш., Пахарукова M.Ю., Mордвинов В.A. // СОВРЕМЕННАЯ ПАРАЗИТОЛОГИЯ — ОСНОВНЫЕ ТРЕНДЫ И ВЫЗОВЫ Материалы VI Съезда Паразитологического общества: Международная конференция:
	Genetic regulation of wheat plant development and architecture. Dobrovolskaya O.B., Dresvyannikova A.E., Popova K.I., Ponomarenko M.P., Orlov Yu.L., Krasnikov A.A., Martinek P. The 11th Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/System Biology: BGRS/SB'2018
	Molecular evolution analysis of genetic network components related to plant trichome development A.V. Doroshkov, D.K. Konstantinov, K. V. Gunbin, D. A. Afonnikov BGRS/SB 2018
	Computer studies of miRNA in abiotic stress response in plants Dobrovolskaya O.B., Spitsina A.M., Galieva A.G., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G., Orlov Y.L., Chen M. Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
	Transcriptional and epigenetic consequences of early life stress on murine frontal cortex N.P. Bondar, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, V.V. Reshetnikov, Yu.A. Ryabushkina, A.S. Shulyupova, T.I. Merkulova Latest Advances in Development & Function of Neuronal Circuits, Cold Spring Harbor Asia conference
2017	Использование системы CRISPR/Cas9 для изучения клеточной модели спинальной мышечной атрофии Валетдинова К.Р., Овечкина В.С., Григорьева Е.В., Маретина М.А., Киселев А.В., Баранов В.С., Медведев С.П., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Создание клеточной платформы для изучения молекулярно-генетических механизмов патогенеза болезни Паркинсона. III Национальный конгресс по регенеративной медицине Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Медведев С.П. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Моделирование наследственных сердечно-сосудистых заболеваний с помощью индуцированных плюрипотентных стволовых клеток: успехи, проблемы и перспективы Дементьева Е.В., Медведев С.П., Елисафенко Е.А., Вяткин Ю.В., Штокало Д.Н., Байрамова С.А., Кретов Е.И., Покушалов Е.А., Караськов А.М., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	ГЕНДЕР-СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ВЛИЯНИЕ ЛЕПТИНА ВО ВРЕМЯ БЕРЕМЕННОСТИ НА РАЗВИТИЕ ОЖИРЕНИЯ В ПОТОМСТВЕ И ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ В ПЛАЦЕНТАХ И МОЗГЕ ПЛОДОВ У МЫШЕЙ Макарова Е.Н., Кожевникова В.В., Денисова Е.И. 23 Съезд Физиологического общества им. И. П. Павлова
	Создание клеточной платформы для исследования молекулярно-генетических механизмов патогенеза болезни Паркинсона Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Медведев С.П., Закиян С.М. IV Национальный конгресс по болезни Паркинсона и расстройствам движений (с международным участием)
	Different evolutionary patterns of the universal flavonoid biosynthesis pathway genes in monocot and dicot plant species O.Yu. Shoeva, A.Yu. Glagoleva, E.K. Khlestkina БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	Long-lasting consequences of early life stress in mice: changes in gene expression and H3K4me3 profile. Bondar N.P. , Reshetnikov V.V., Studenikina A.A., Ryabushkina Yu.A., Lepeshko A.A., Ershov N.I., Merkulova T.I. 2017 Annual Meeting, Genes, Brain and Behavior
	Early life stress promotes the changes in whole-genome distribution of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice. Bondar N.P., Ershov N.I., Lepeshko A.A., Reshetnikov V.V., Ryabushkina Yu.A., Merkulova T.I. БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	The impact of early life stress on distribution of H3K4Me3 histone modification in murine prefrontal cortex: the role in gene expression. V.V. Reshetnikov, A.A. Lepeshko, N.I. Ershov, Yu.A. Ryabushkina, A.A. Studenikina, N.P. Bondar, T.I. Merkulova 24th Multidisciplinary international neuroscience and biological psychiatry "stress and behavior" conference
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на экспрессию генов глюкокортикоидной и глутаматной систем в головном мозге мышей В.В. Решетников, А.А. Студеникина, Ю.А. Рябушкина, Т.И. Меркулова, Н.П. Бондарь БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Отсроченные эффекты раннего постнатального стресса на экспрессию генов глюкокортикоидной и глутаматной систем в гипоталамусе у самцов мышей Студеникина А. А., Решетников В. В 55-я Международная научная студенческая конференция МНСК-2017
	Анализ связи функциональных изменений миокарда при старении с изменением экспрессии альфаB-кристаллинов и их фосфорилирования Муралёва Н.А., Девяткин В.А. XXIII Съезд Физиологического общества им. И.П. Павлова.
	Поиск полиморфизмов, потенциально ассоциированных с дисфункцией митохондрий у преждевременно стареющих крыс OXYS В.А. Девяткин, Н.А. Муралёва, Н.Г. Колосова Беляевские чтения : Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Анализ транскрипционной регуляции промотора гена орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana A.A. Егорова, В.В. Горелова, С.В. Герасимова БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	Analysis of microRNA expression in rat pluripotent stem cells using genome-wide sequencing technologies Sherstyuk V.V., Medvedev S.P., Elisaphenko E.A., Vaskova E.A., Ri M.T., Vyatkin Y.V., Saik O.V., Shtokalo D.N., Pokushalov E.A., Zakian S.M. 15th Annual Meeting of the International Society for Stem Cell Research
	Characterization of a chlorophyll mutant, tigrina, in rye. Dobrovolskaya O.B., Morozova K., Popova K.I., Dresvyannikova A. E., Boerner A., Roeder M., Kiseleva E.V., Voylokov A.V. 4th Internetional conference "Plant genetics, genomics, bioinformatics and biotechnology
	Study on genetic control of early inflorescence development in bread wheat (T. aestivum) that determines inflorescence architecture and yield Dobrovolskaya O.B., Popova K.I., Orlov Yu.L., Krasnikov A.A., Martinek P. 4th International conference "Plant genetics, genomics, bioinformatics and biotechnology May 29- June 02, 2017
	ЗНАЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ КОЛЛЕКЦИЙ ДЛЯ РЕШЕНИЯ ЗАДАЧ ПРЯМОЙ И ОБРАТНОЙ ГЕНЕТИКИ РАСТЕНИЙ Хлесткина Е.К.*, Афонников Д.А., Бернер А., Быкова И.В., Васильев Г.В., Герасимова С.В., Глаголева А.Ю., Гордеева Е.И., Григорьев Ю.Н., Короткова А.М., Пшеничникова Т.А., Стрыгина К.В., Шацкая Н.В., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Юдина Р.С. III МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ГЕНОФОНД И СЕЛЕКЦИЯ РАСТЕНИЙ», ПОСВЯЩЕННАЯ 130-ЛЕТИЮ Н.И. ВАВИЛОВА (28.03. – 30.03.2017)
	GENETICS AND OMICS APPROACHES TO BETTER UNDERSTANDING REGULATION OF METABOLI C PATHWAYS UNDERLYING PIGMENTATION IN WHEAT AND BARLEY O.Y. Shoeva, E.I. Gordeeva, N.A. Shmakov, K.V. Strygina, A.Y. Glagoleva, T.V. Kukoeva , N.V. Shatskaya , G.V. Vasiljev , A. Börner, D.A. Afonnikov, E.K. Khlestkina* 4-ая международная научная конференция "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений" (PlantGen2017)
	Получение химерных мышей путем инъекции эмбриональных стволовых клеток в бластоцисту на базе Центра генетических ресурсов лабораторных животных ИЦиГ СО РАН Концевая Г.В., Феофанова Н.А., Мензоров А.Г., Пристяжнюк И.Е., Смирнов А.В., Баттулин Н.Р., Герлинская Л.А. 6-ая научно-практическая конференция Rus-LASA
	ANTHOCYANINS IN WHEAT: PLANT PROTECTION AND HEALTH BENEFIT E. Gordeeva*, O. Shoeva, R. Yudina, N. Usenko, Y. Otmakhova, T. Amstislavskaya, K. Pavlov., E. Khlestkina 4-ая международная научная конференция "Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений" (PlantGen2017)
	Глутаматергическая регуляция индуцированных стрессом поведенческих реакций. Дыгало Н.Н., Булыгина В.В., Калинина Т.С., Сухарева Е.В., Дрозд У.С., Шишкина Г.Т., Ланшаков Д.А. «СТРЕСС: ФИЗИОЛОГИЧЕСКИЕ ЭФФЕКТЫ, ПАТОЛОГИЧЕСКИЕ ПОСЛЕДСТВИЯ И СПОСОБЫ ИХ ПРЕДОТВРАЩЕНИЯ» (Посвящается памяти профессора А.А. Филаретова). 10–13 октября 2017 г. Санкт-Петербург.
	IDENTIFICATION OF GENES CONTROLLING BLACK PIGMENTATION IN CEREALS Glagoleva A.Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N. V., Shmakov N.A., Afonnikov D.A., Shoeva O. Y., Börner A., Khlestkina E.K. 4th International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology" (PlantGen2017)
	RNAseq-BASED DECIFERING OF MOLECULAR MECHANISMS UNDERLYING TRAIT FORMATION: NON-ALTERNATIVE WAY IN CASE OF IMPEDED METABOLITE IDENTIFICATION Glagoleva A.Y., Shmakov N.A., Shoeva O. Y., Vasiliev G.V., Shatskaya N.V., Börner A., Afonnikov D.A., Khlestkina E.K. II Всероссийская конференция с международным участием "Высокопроизводительное секвенирование в геномике" (HSG-2017)
	ORGANIZATION AND EVOLUTION CHALCONE SYNTHASE GENE FAMILY IN BREAD WHEAT AND RELATIVE SPECIES A.Glagoleva, E.Khlestkina 9th YOUNG SCIENTISTS SCHOOL «Systems Biology and Bioinformatics», SBB-2017
	ORGANIZATION AND EVOLUTION CHALCONE SYNTHASE GENE FAMILY IN BREAD WHEAT AND RELATIVE SPECIES A. Glagoleva, E. Khlestkina БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	ИДЕНТИФИКАЦИЯ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С ЧЕРНОЙ ОКРАСКОЙ КОЛОСА У ЗЛАКОВ, НА ОСНОВЕ ТРАНСКРИПТОМНОГО АНАЛИЗА Глаголева А.Ю., Шмаков Н.А., Шоева О.Ю., Васильев Г.В., Шацкая Н.В., Бернер А., Афонников Д.А., Хлесткина Е.К. IV Вавиловская международная конференция «Идеи Н. И. Вавилова в современном мире»
	Анализ альтернативного сплайсинга в глиомах с помощью секвенирования транскриптом Брагин А.О., Губанова Н.В., Ковалев С.С., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Вторая Международная научно-практическая конференция «NGS в медицинской генетике 2017»
	Генерирование мегабазных делеций, дупликаций и инверсий, включающих ген CNTN6, у мышей: экспериментальные модели нейро-психических нарушений человека, вызванных масштабными хромосомными перестройками Серов ОЛ, Кораблев АН, Серова ИА III-й Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Влияние стрессирующих факторов в раннем онтогенезе на эпигенетическую регуляцию экспрессии генов во фронтальной коре головного мозга взрослых мышей Лепешко А. А., Рябушкина Ю. А. МНСК
	ОПТОГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТИМУЛЯЦИЯ ГЛУТАМАТЕРГИЧЕСКИХ НЕЙРОНОВ ГИППОКАМПА УСИЛИВАЕТ ПРОЯВЛЕНИЕ ДЕПРЕССИВНО-ПОДОБНОГО ПОВЕДЕНИЯ У КРЫС Дрозд У.С. МНСК-2017: БИОЛОГИЯ
2016	Computer Analysis of RNA-seq Data of Laboratory Rats with Aggressive Behavior Anatoly O. Bragin*, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel SocBin Bioinformatics 2016
	Search for regulatory context signals in genomic DNA E.E.Vityaev, A.I.Dergilev, I.V.Chadaeva, Y.Y.Vaskin, A.M.Spitsina, E.V.Kulakova, O.V.Vishnevsky, Y.L.Orlov XVIII Международная научно-техническая конференция Нейроинформатика 2016
	Analysis of aggressive behavior by whole RNA sequencing in brain compartments V.N. Babenko, A.O. Bragin, I.V. Medvedeva, I.V. Chadaeva, A.I. Dergilev, A.M. Spitsyna, N.N. Kudriavtseva, A.L. Markel, Y.L. Orlov Нейроинформатика 2016
	Purple-grained barley: marker-assisted devlopment of NILs and genetic dissection Kukoeva T., Gordeeva E., Glagoleva A., Shoeva O., Börner A., Khlestkina E The 1st International Workshop “Plant Genetics and Genomics for Food Security”
	Влияние раннего постнатального стресса на профиль распределения метки активного хроматина H3K4me3 Решетников В.В.,Лепешко А.А., Ершов Н.И., Студеникина А.А., Бондарь Н.П. VII Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология живых существ»
2015	CTCF binding sites and gene expression analysis in genome scale by sequencing data Kulakova E.V., Spitsina A.M., Safronova N.S., Svichkarev A.V., Dergilev A.I., Ponomarenko M.P., Babenko V.N., Hong P., Li G., Orlov Y.L. 7th International Young Scientists School “Systems biology and bioinformatics” SBB-2015
	Analysis of gene location relative to chromosome loops and topological chromosome domains by ChIA-PET and Hi-C Orlov Y.L., Kulakova E.V., Spitsina A.M., Svichkarev A.V., Babenko V.N., Li G. 3D Genome Workshop
	Differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals with aggressive and tolerant behaviors Anatoly O. Bragin, Natalia N. Kudryavtseva, Arcady L. Markel, Yuriy L. Orlov, Ekaterina V. Kulakova, Anastasia M. Spitsina MCCMB-15
	Statistical analysis of chromosome contacts by ChIA-PET and Hi-C technologies Orlov Y.L., Kulakova E., Spitsina A., Babenko V. Future of Biomedicine 2015 Conference
	Computer Tools for Gene Expression Data Processing and Correlation Analysis Babenko V.N., Orlov Y. L., Spitsyina A. M. Podkolodnaya N. Computational systems biology and bioinformatics (CSBio 2015)
	Gene Expression Analysis in Brain Areas of Laboratory Rats with Aggressive Behavior by RNA-seq Data Anatoly O. Bragin, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel CSBio’2015
2014	Implications of hostile environment and social instability in adolescent mice Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Smagin D.A., Michurina T.V., Enikolopov G., Kudryavtseva N.N. BGRS\SB-2014
	Repeated positive fighting experience in male mice: the tool for the study of movement disorders Kudryavtseva N.N., Smagin D.A., Kovalenko I.L.,Vishnivetskaya G.B., Galyamina A.G, Enikolopov G BGRS\SB-2014
	Activation of hippocampal cell proliferation and decrease of c-fos expression in the amygdala under positive fighting experience in male mice Smagin D.A., Kudryavtseva N.N., Enikolopov G.N. BGRS\SB-2014
	Behavioral and neurobiological changes under repeated experience of aggression in male mice Smagin D.A., Enikolopov G.N., Kudryavtseva N.N. X International congress NEUROSCIENCE FOR MEDICINE AND PSYCHOLOGY
	Интеграция геномных и транскриптомных данных о хромосомных контактах в геноме человека, полученных по методу ChIA-PET // Сборник трудов IV международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» Постгеном-2014, 29 октября – 1 ноября 2014, г.Казань. Издательство Казанского (Приволжского) Федерального Университета (ISBN 987-5-00019-293-1) S05-24, С.150. Орлов Ю.Л., Кулакова Е.В, Спицина А.М., Дергилев А.И., Свичкарев А.В., Афонников Д.А., Чен М., Ли Г., Руан Й., Колчанов Н.А. Постгеном-2014 «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»
2011	Эффекты гипоксии и глюкокортикоидов на двигательную активность и экспрессию белков апоптоза в головном мозге неонатальных крысят. Вечкапова С.О. XLIХ международная студенческая конференция
	Развитие неонатальных крыс и экспрессия белков апоптоза в их мозге после воздействия дексаметазоном и гипоксией. Меньшанов ПН, Вечкапова ОС, Калинина ТС, Дыгало НН. VII Съезд Казахского физиологического общества
	Behavioral and neurodevelopmental effects of ACTH and glucocorticoids in neonatal rats. Dygalo N.N, Kalinina T.S., Shemenkova T.V., Vechkapova S.O., Menshanov P.N., Bulygina V.V. 24th ECNP Congress (European College of Neuropsychopharmacology)
	VISUALIZATION AND ANALYSIS OF A CARDIO VASCULAR DISEASE-RELATED BIOLOGICAL NETWORK COMBINING TEXT MINING AND DATA WAREHOUSE APPROACHES Ralf Hofestädt, Björn Sommer, Evgeny Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian Janowski, Timofey Ivanisenko, Anatoly Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel Demenkov, Alexey Kochetov, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011
	Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей на примере анализа протеома мочи Тийс Е.С., Деменков П.С., Доброхотов И.В., Валеева О.А., Пастушкова Л.Х., Николаев Е.Н., Ларина И.М., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика, г. Новосибирск, 14-17 ноября 2011 г.
	Comparison of molecular composition of pericentric heterochromatin of two grasshopper species from Gomphocerini tribe (Acrididae; Orthoptera) Jetybayev I.E., Bugrov A.G., Belavin P.A., Tatkov S.I., Shvalov A.N. Rubtsov N.B 18th International Chromosome Conference
2010	A Model of Shoot Apocal Meristem Compartmentalization Based on CLV/WUS Interplay Nikolaev SV, Zubairova US, Mjolsness ED, Shapiro BE, Smal PA, Kolchanov NA 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	On model phenomenology of vascular cambium activity U. Zubairova, S. Nikolaev 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	The cell growth and division can destroy stem cell niche in a reaction-diffusion model S. Nikolaev, U. Zubairova, S. Fadeev, E. Mjolsness, N. Kolchanov 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	Genetic and molecular characteri-zation of three agronomical importance genes (Vrn1, Vrn2, Q) in wheats Golovnina K., Sormacheva I., Blinov A., Kondratenko E., Goncharov N.P 8th Intern. Wheat Conf. June 1-4, 2010. SPb, 2010
	Модель типа реакция-диффузия механизма регуляции пространственной структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В. , Зубаирова У.С., Мьолснесс Э., Смаль П.А., Шапиро Б., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
	Нестабильность структуры клеточного ансамбля в модифицированной модели трехцветного флага в результате роста и деления клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мьолснесс Э., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
	A reaction-diffusion model of shoot apical meristem compartmentalization based on CLV/WUS interplay Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Mjolsness E., Smal P.A., Shapiro B., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
	Modified French Flag model: instability of the structure under cell growth and division Zubairova U.S., Nikolaev S.V., Fadeev S.I., Mjolsness E., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
	Возможности и ограничения молекулярно-цитогенетических методов в исследовании хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Дзюбенко В. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. V Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных (KARYO V) с 16 по 20 августа 2010 г. г. Новосибирск
	Флуоресцентная гибридизация in situ оригинальных микродиссекционных ДНК-проб с А- и В-хромосомами плавучей кобылки Eyprepocnemis plorans Charp. (Orthoptera, Acrididae) Дзюбенко В. В., Бугров А. Г., Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Рубцов Н. Б. V Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных (KARYO V) с 16 по 20 августа 2010 г. г. Новосибирск
	Возмущения за счет деления клеток в пространственно‐распределенной модели регуляции структуры ниши стволовых клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мелснесс Э., Колчанов Н.А. Международная конференция "Стохастические модели в биологии и предельные алгебры", 2—7 августа 2010 Омск Россия
	Моделирование динамических систем с динамической структурой на примере камбиальных клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В. Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых учёных "Молодёжь и современные информационные технологии", 3-5 марта 2010 года
	Молекулярные маркеры в сравнительной цитогенетике саранчовых подсемейства Gemphocerinae (Acrididae, Orthoptera) Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Молекулярные маркеры в сравнительной цитогенетике саранчовых подсемейства Gomphocerinae (Acrididae, Orthoptera) Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Гибридизация in situ и LA-PCR — новый метод получения микродиссекционных ДНК-проб хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Лосева Е. М., Морозкин Е. С., Лактионов П. П., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Эволюционные взаимоотношения ДНК транспозонов суперсемейства тc1-mariner у представителей отряда lepidoptera И.Д.Сормачева ХLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" 10 - 14 апреля 2010 года, Новосибирск.
	A computer analysis of functional relationships between genes associated with multifactorial diseases: pre-eclampsia as an example E. Tiys, P. Demenkov, E. Vashukova, A. Glotov, V. Ivanisenko 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	Гибридизация in situ и LA-PCR – новый метод получениея микродиссекционных ДНК-проб хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Лосева Е.М., Морозкин Е.С., Лактионов П.П., Бугров А.Г., Рубцов Н.Б KARYO V
2009	Компьютерный анализ распределения структурных аналогов активных сайтов в пространственных структурах ферментов Тийс Е. Новосибирск, апрель 2009 г.: Тез. докл. Материалы XLVII международной научной студенческой конференции "Студент и научно-технический прогресс": Биология.
	Comparative analysis of localization of rDNA clusters an telomeric repeats (TTAGG)n in C-positive and C-negative chromosome regions of Gomphocerinae grasshoppers (Acrididae; Orthoptera) Jetybayev I., Bugrov A., Karamysheva T., Rubtsov N 17th International Chromosome Conference
2008	Компьютерный анализ распределения структурных аналогов активных сайтов в пространственных структурах ферментов Тийс Е.С. XLVI международная научная студенческая конференция «Студент и научно-технический прогресс»: Биология
	Distribution of active site structural analogs in enzyme 3D-structures: computer analysis E.S.Teeys, V.A. Ivanisenko Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
	Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development Lavreha V.V., Penenko A.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A. The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)
	A MODEL STUDY OF THE ROLE OF PROTEINS CLV1, CLV2, CLV3, AND WUS IN REGULATION OF THE STRUCTURE OF THE SHOOT APICAL MERISTEM Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A. The Sixth International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008)
	Computer system for modelling and analysis of plant tissue growth and development V.V. Lavreha, A.V.Penenko, S.V. Nikolaev, N.A. Kolchanov The European conference on Computational Biology (ECCB'08)
2007	Применение формализма dL-систем для изучения модели регуляции размеров возобновительной зоны в растущей ткани Зубаирова У.С., Николаев С.В. VIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Новосибирск, 27-29 ноября 2007
	Структурные аналоги функциональных центров белков в пространственных структурах ферментов Тийс Е.С. XLV международная научная студенческая конференция «Студент и научно- технический прогресс»: Биология.
	Computer system for analysis and modeling 2D plant tissue Lavreha V.V., Nikolaev S.V., Kolchanov N.A., Penenko A.V. 3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia
	Modeling of the Shoot Apical Meristem Structure Regulation Based on CLV1, CLV2, CLV3 and WUS Interactions Nikolaev S.V., Penenko A.V., Lavreha V.V., Smal P.A., Mjolsness E.D., Kolchanov N.A. The Eighth International Conference On Systems Biology (ICSB-2007)
2006	A system for simulation of 2D plant tissue growth and development Nikolaev S.V., Penenko A.V., Belavskaya V.V., Mjolsness E., N.A. Kolchanov N.A. 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)
	Identification and structure-functional analysis of the specificity determining residues of the alpha subunits of the proteosomal complex. Proceedings of the Fifth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Novosibirsk, Russia, 2006, v.1, p. 235-239. Baryshev P.B., Afonnikov D.A., Nikolaev S.V. International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure

Гранты

2020	Системное изучение механизмов морфогенеза растений на основе данных секвенирования транскриптомов одиночных клеток РФФИ, номер гранта 20-04-01112 А
	Изучение функциональной роли генов с циркадным паттерном экспрессии у мягкой пшеницы РФФИ, номер гранта 20-316-80003 мол_эв_а
	Генетические основы инициации колошения мягкой пшеницы и её созревания в условиях длинного дня РФФИ, номер гранта 20-016-00059 А
2019	Системное изучение взаимной регуляции ростовых процессов и водного режима злаков РНФ, номер гранта 19-74-10037
	Задержка созревания мозга в ранний постнатальный период как предпосылка развития болезни Альцгеймера РНФ, номер гранта 19-15-00044
2018	Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования, РФФИ, номер гранта №18-29-13021
	Исследование роли пространственной организации генома в регуляции активности генов на примере локуса Pdgfra/Kit/Kdr, с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9 РФФИ, номер гранта 18-29-07022 мк
	Анализ роли кортиколиберинергической системы в негативных эффектах неонатальной терапии глюкокортикоидами на формирующийся головной мозг и анализ их предотвращения воздействиями на эту систему РФФИ, номер гранта 18-44-543013
	Новый подход к созданию безопасных растительных систем экспрессии чужеродных белков: снижение природной токсичности табака методом геномного редактирования РФФИ, номер гранта 18-416-543004 р_мол_а
	Исследование влияния мутаций в генах, ассоциированных с наследственной гипертрофической кардиомиопатией, на развитие данного заболевания с помощью пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток РНФ, номер гранта 18-75-10039
	Создание вирусных векторов для управления активностью серотонинергических нейронов с помощью фоточувствительных белков РФФИ, номер гранта 18-315-00114 мол_а
	Разработка платформы для доместикации картофеля de novo РФФИ, номер гранта 18-316-00068 мол_а
	Программирование поведения посредством редактирования эпигенома норадренергических нейронов голубого пятна ствола мозга в ранний постнатальный период РФФИ, номер гранта 18-315-20028 мол_а_вед
	Разработка метода и онлайн ресурса для биоинформатического анализа фолд-специфической экспрессии генов РФФИ, номер гранта 18-34-00871
	Исследование механизмов генетической регуляции процессов развития растений на примере соцветия пшеницы РФФИ, номер гранта 18-04-00483
	Оценка вклада изменений с возрастом фосфорилирования альфаВ-кристаллина в нарушения протеостаза при болезни Альцгеймера РФФИ, номер гранта 18-015-00336
2017	Направленная модификация генома для исследования роли пространственной архитектуры ядра в развитии патологий РНФ, номер гранта 17-74- 10143
	Исследование дофаминовой системы мозга у крыс генетически-предрасположенных к высокому уровню защитно-оборонительной агрессии, вызванной страхом. РФФИ, номер гранта 17-04-00183
	Изучение генетических и эпигенетических механизмов программирующего действия материнского лептина в зависимости от пола потомства у мышей РФФИ, номер гранта 17-04-01357 А
	Изучение половых особенностей регуляторного влияния фактора роста фибробластов 21 (FGF21) на углеводно-жировой обмен РНФ, номер гранта 17-15-01036
2016	Выяснение эпигенетических механизмов отсроченного влияния раннего постнатального стресса на формирование когнитивных расстройств у взрослых особей РНФ, номер гранта 16-15-10131
	Экзомный анализ предрасположенности человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Российский научный фонд, номер гранта 16-15-00127
	Популяционная структура и следы адаптации к холодному климату в геномах российских пород крупного рогатого скота и овец Российский научный фонд
	Разработка новых методов визуализации и анализа хромосомоспецифичных последовательностей ДНК для FISH-диагностики РФФИ, номер гранта 16-34-00498
	Поиск целевых генов и оптимизация подходов по модификации геномов для получения новых форм злаков с заранее заданными свойствами РНФ, номер гранта 16-14-00086
	Дуплицированные гены в аллополиплоидном геноме пшеницы - вклад в формирование тканеспецифичных регуляторных механизмов РФФИ, номер гранта 16-04-00912
2015	«Развитие коллекции генетических линий мышей и инструментального обеспечения их высокотехнологического фенотипирования для изучения на животных с целевыми мутациями вклада отдельных генов в эффективность репродукции, скорость старения, нейробиологические процессы и нейропатологии, разработка на этой основе инновационных средств коррекции генетически детерминированных нарушений» Минобрнауки России, номер гранта 14.621.21.0010
	Молекулярно-генетические механизмы формирования окраски овощных и злаковых культур СО РАН, номер гранта 22
	МОЗГ КАК ОРГАН МИШЕНЬ ДЛЯ НАНОРАЗМЕРНЫХ ТВЕРДЫХ АЭРОЗОЛЕЙ. Нейробиологические и нейротоксические эффекты кристаллических и аморфных наночастиц при интраназальном введении. РНФ, номер гранта 14-14-00221
	«Технологическое и коллекционное развитие "Центра генетических ресурсов лабораторных животных" (ЦГР), сформированного на базе SPF-вивария ИЦиГ СО РАН» Минобрнауки России, номер гранта 14.619.21.0005
2014	Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq) РНФ, номер гранта РНФ № 14-14-00269
	Картирование и изучение структурно-функциональной организации генных локусов дикорастущей пшеницы Triticum dicoccoides. Российский научный фонд, номер гранта 14-14-00161
2013	Структурно-функциональная организация генов защитного ответа в чужеродно-замещенных линиях пшеницы РФФИ, номер гранта 12-04-33027
2012	Молекулярно-генетическое исследование гена Q, контролирующего основные признаки пшениц, связанные с доместикацией РФФИ, номер гранта 12-04-01099-а
2011	Формирование билатеральной симметрии в зародышах двудольных растений РФФИ, номер гранта 11-04-91397-НИСИ_а
	Исследование эффектов кортикотропина на экспрессию нейроэндокринных регуляторов активности мужской половой системы в раннем постнатальном онтогенезе РФФИ, номер гранта 11-04-00375-а
2010	Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей Министерство образования и науки, номер гранта 14.740.11.0001
	Вертикальная эволюция и горизонтальный перенос ДНК транспозонов и non-LTR ретротранспозонов в отряде Lepidoptera (Insects) Министерство образования и науки Российской Федерации, номер гранта П1044
2009	Разработка Веб-ориентированной экспертной системы, предназначенной для распознавания взаимосвязанных белков, выявленных с применением постгеномных методов Федеральное агенство по науке и инновациям, номер гранта 02.514.11.4123
	Роль транскрипционных факторов в возникновении яровости у пшениц в процессе доместикации РФФИ, номер гранта 09-04-01382
2008	Компьютерное моделирование и анализ механизма гомеостаза структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме Arabidopsis thaliana РФФИ, номер гранта 08-04-01214-а
	Анализ функции люлиберина (GnRH-1) в регуляции физиологического апоптоза клеток формирующегося мозга РФФИ, номер гранта 08-04- 00292-а
2005	Теоретическое исследование особенностей эволюции белков, обусловленных координированными заменами аминокислотных остатков РФФИ, номер гранта 05-04-49141
	Компьютерный анализ структурной организации и эволюции функциональных сайтов глобулярных белков РФФИ, номер гранта 05-04-49283

Научное руководство

2020	Изучение аллелей инициирующего колошение гена VRN-B3 на материале линий мягкой пшеницы отечественной селекции Бережная Алина Александровна 2020-06-16
2010	Система для моделирования морфогенеза двумерных растительных тканей СМАЛЬ Павел Александрович 2010-06-15
2008	Одномерная модель регуляции структуры возобновительной зоны в биологической ткани с учетом роста и деления клеток Зубаирова Ульяна Станиславовна 2008-06-10
	Идентификация параметров в модели регуляции компартментной структуры апикальной меристемы растения СМАЛЬ Павел Александрович 2008-06-10
2006	L-системы и моделирование в биологии развития растений Еременко Денис Сергеевич 2006-06-12
	Применение формализма dL-систем для моделирования в биологии развития (на примере водоросли Anabaena Catenula) Зубаирова Ульяна Станиславовна 2006-06-12

Патенты

2020	Способ отбора растений яровой мягкой пшеницы с укороченным сроком колошения Салина Елена Артемовна, Стасюк Анатолий Иванович, Киселёва Антонина Андреевна Номер патента 2710729