Система учета научной деятельности (ASSA)

Вход

Внебюджетные подразделения

ИЦиГ

Подразделения

Лаборатория по технологии ферментации (т. 139)
Лаборатории РНФ

Научные результаты

Сотрудники

Выберите слайдером нужный промежуток, и список ниже будет содержать записи только нужного периода:

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

2016

2017

2018

2019

2020

2021

Публикации Монографии Конференции Гранты

Публикации

2020	Pleiotropic ZIP8 A391T implicates abnormal manganese homeostasis in complex human disease Sunuwar, Laxmi Frkatovic, Azra Sharapov, Sodbo Wang, Qinchuan Neu, Heather Wu, Xinqun Haritunians, Talin Wan, Fengyi Michel, Sarah L. J. Wu, Shaoguang McGovern, Dermot Lauc, Gordan Donowitz, Mark Sears, Cynthia L. Melia, Joanna M.P. JCI Insight, 2020
	Creation of the viral vectors for the inhibition of the serotonergic neurons using light sensitive proton pump U. S. Drozd, D. A. Lanshakov Интегративная физиология, 2020, vol. 1, no. 2
	Candidate genes for age at menarche are associated with endometriosis Irina Ponomarenko, Evgeny Reshetnikov, Alexey Polonikov, Irina Verzilina, Inna Sorokina, Elizaveta E Elgaeva, Yakov A Tsepilov, Anna Yermachenko, Volodymyr Dvornyk, Mikhail Churnosov REPROD BIOMED ONLINE, 2020
	Glycosylation of immunoglobulin G is regulated by a large network of genes pleiotropic with inflammatory diseases Klarić, Lucija Tsepilov, Yakov A. Stanton, Chloe M. Mangino, Massimo Sikka, Timo Tõnis Esko, Tõnu Pakhomov, Eugene Salo, Perttu Deelen, Joris McGurnaghan, Stuart J. Keser, Toma Vučković, Frano Ugrina, Ivo Krištić, Jasminka Gudelj, Ivan Štambuk, Jerko Plomp, Rosina Pučić-Baković, Maja Pavić, Tamara Vilaj, Marija Trbojević-Akmačić, Irena Drake, Camilla Dobrinić, Paula Mlinarec, Jelena Jelušić, Barbara Richmond, Anne Timofeeva, Maria Grishchenko, Alexander K. Dmitrieva, Julia Bermingham, Mairead L. Sharapov, Sodbo Zh. Farrington, Susan M. Theodoratou, Evropi Uh, Hae-Won Beekman, Marian Slagboom, Eline P. Louis, Edouard Georges, Michel Wuhrer, Manfred Colhoun, Helen M. Dunlop, Malcolm G. Perola, Markus Fischer, Krista Polasek, Ozren Campbell, Harry Rudan, Igor Wilson, James F. Zoldoš, Vlatka Vitart, Veronique Spector, Tim Aulchenko, Yurii S. Lauc, Gordan Hayward, Caroline Sci Advances, 2020
	Absence of EGFR C797S Mutation in Tyrosine Kinase Inhibitor-Naïve Non–Small Cell Lung Cancer Tissues Igor P. Oscorbin, Alexandra S. Shadrina, Vadim V. Kozlov, Vladimir E. Voitsitsky, Maxim L. Filipenko PATHOL ONCOL RES, 2020, 26(2):1229-1234
	Genome and karyotype reorganization after whole genome duplication in free-living flatworms of the genus Macrostomum Zadesenets K.S., Jetybayev I.Y., Schärer L., Rubtsov N.B. INT J MOL SCI, 2020, 21(2), 680
	"Single-Nucleotide Polymorphisms (SNPs) Both Associated with Hypertension and Contributing to Accelerated-Senescence Traits in OXYS Rats" Vasiliy A. Devyatkin, Olga E. Redina, Natalia A. Muraleva, Nataliya G. Kolosova INT J MOL SCI, 2020, 21, 3542
	Features of Postnatal Hippocampal Development in a Rat Model of Sporadic Alzheimer’s Disease Ekaterina A. Rudnitskaya, Tatiana A. Kozlova, Alena O. Burnyasheva, Anna E. Tarasova, Tatiana M. Pankova, Marina V. Starostina, Natalia A. Stefanova and Nataliya G. Kolosova Frontiers in Neuroscience, 2020, Volume 14 \| Article 533
	ВЛИЯНИЕ СТРЕССА НА ЭКСПРЕССИЮ НЕЙРОТРОФИЧЕСКОГО ФАКТОРА МОЗГА (BDNF) И ЕГО ПРЕДШЕСТВЕННИКА proBDNF У МЫШЕЙ, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬЮ СЕРОТОНИНОВЫХ 5-НТ1А РЕЦЕПТОРОВ Е. М. Кондаурова, Т. В. Ильчибаева, Д. В. Базовкина, Н. К. Попова, В. С. Науменко Нейрохимия, 2020, том 37, № 3, с. 201–207
	ЭФФЕКТЫ ОСТРОГО СТРЕССА У МЫШЕЙ, РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬЮ 5-НТ1А-РЕЦЕПТОРОВ К ХРОНИЧЕСКОЙ АКТИВАЦИИ С ПОМОЩЬЮ 8-OH-DPAT Е. М. Кондаурова, Е. В. Антонов, Е. Ю. Баженова, Д. В. Базовкина, В. С. Науменко Российский физиологический журнал имени И.М. Сеченова, 2020, том 106, № 9, с. 1069–1084
	Subcellular compartmentalization of the plant antioxidant system: an integrated overview Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Alexey Kolodkin, Alexey Doroshkov PeerJ, 2020
	Cognitive training as a potential activator of hippocampal neurogenesis in the rat model of sporadic Alzheimer’s disease Alena O. Burnyasheva, Tatiana A. Kozlova, Natalia A. Stefanova, Nataliya G. Kolosova, Ekaterina A. Rudnitskaya INT J MOL SCI, 2020, Sep 23;21(19):E6986
	ИССЛЕДОВАНИЕ ПЛАСТИЧНОСТИ СЕРОТОНИНОВОЙ СИСТЕМЫ МОЗГА С ПОМОЩЬЮ РЕКОМБИНАНТНЫХ ЛИНИЙ МЫШЕЙ, НЕСУЩИХ 1473G-АЛЛЕЛЬ ГЕНА ТРИПТОФАНГИДРОКСИЛАЗЫ-2 И РАЗЛИЧАЮЩИХСЯ ДИСТАЛЬНЫМ ФРАГМЕНТОМ ХРОМОСОМЫ 13, СОДЕРЖАЩИМ ГЕН, КОДИРУЮЩИЙ 5-HT1A РЕЦЕПТОР А. Я. Родный, И. И. Белокопытова, Е. В. Антонов, В. С. Науменко, Е. М. Кондаурова Нейрохимия, 2020, том 37, № 4, с. 338–349
	Disruptive natural selection by male reproductive potential prevents underexpression of protein-coding genes on the human Y chromosome as a self-domestication syndrome. Ponomarenko M., Kleshchev M., Ponomarenko P., Chadaeva I., Sharypova E., Rasskazov D., Kolmykov S., Drachkova I., Vasiliev G., Gutorova N., Ignatieva E., Savinkova L., Bogomolov A., Osadchuk L., Osadchuk A., Oshchepkov D. BMC GENET, 2020, V. 21, Suppl. 1. P. 89
	Genetic Background Underlying 5-HT1A Receptor Functioning Affects the Response to Fluoxetine Elena M. Kondaurova, Alexander Ya. Rodnyy, Tatiana V. Ilchibaeva, Anton S. Tsybko, Dmitry V. Eremin, Yegor V. Antonov, Nina K. Popova and Vladimir S. Naumenko INT J MOL SCI, 2020, Int. J. Mol. Sci. 2020, 21(22), 8784
	Pharmacological effects of fibroblast growth factor 21 are sex-specific in mice with the lethal yellow (Ay) mutation MakarovaE.N., Yakovleva T.V., Balyibina N.Yu., Baranov K.O., Denisova E.I., Dubinina A.D., Feofanova N.A., Bazhan N.M. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(2):200-208
	Positive fighting experience, addiction-like state, and relapse: Retrospective analysis of experimental studies Kudryavtseva N.N AGGRESSION AND VIOLENT BEHAVIOR, 2020, 52: 101403
	Dopamine response gene pathways in dorsal striatum MSNs from a gene expression viewpoint: cAMP‑mediated gene networks Babenko V.N., Galyamina A.G., Rogozin I.B., Smagin D. A., Kudryavtseva N.N. BMC NEUROSCI, 2020, 21:12; Q3
	Differentially Expressed Genes of the Slc6a Family as Markers of Altered Brain Neurotransmitter System Function in Pathological States in Mice Babenko V. N., Smagin D. A., Kovalenko I. L., Galyamina A. G., Kudryavtseva N. N. Neuroscience Behavioral Physiology, 2020, 50(2): 199-209
	Comparative Expression Analysis of Stress-Inducible Candidate Genes in Response to Cold and Drought in Tea Plant Lidiia S. Samarina, Alexandr V. Bobrovskikh, Alexey V. Doroshkov,Lyudmila S. Malyukova, Alexandra O. Matskiv, Ruslan S. Rakhmangulov, Natalia G. Koninskaya, Valentina I. Malyarovskaya, Wei Tong, Enhua Xia, Karina A. Manakhova, Alexey V. Ryndin, Yuriy L. Orlov Frontiers in Genetics, 2020, 11, 1613
	Replication of fifteen loci involved in human plasma protein N-glycosylation in 4,802 samples from four cohorts Sharapov SZ, Shadrina AS, Tsepilov YA, Elgaeva EE, Tiys ES, Feoktistova SG, Zaytseva OO, Vuckovic F, Cuadrat R, Jäger S, Wittenbecher C, Karssen LC, Timofeeva M, Tillin T, Trbojević-Akmačić I, Štambuk T, Rudman N, Krištić J, Šimunović J, Momčilović A, Vilaj M, Jurić J, Slana A, Gudelj I, Klarić T, Puljak L, Skelin A, Kadić AJ, Van Zundert J, Chaturvedi N, Campbell H, Dunlop M, Farrington SM, Doherty M, Dagostino C, Gieger C, Allegri M, Williams F, Schulze MB, Lauc G, Aulchenko YS. GLYCOBIOLOGY, 2020, cwaa053
	Analysis of genetically independent phenotypes identifies shared genetic factors associated with chronic musculoskeletal pain conditions Tsepilov Y. A., Freidin M. B., Shadrina A. S., Sharapov S. Z., Elgaeva E. E., van Zundert J., Karssen L. С., Suri P., Williams F. M. K., Aulchenko Y. S. Commun. biolog., 2020, 3, Article number: 329
	The GWAS-MAP platform for aggregation of results of genome-wide association studies and the GWAS-MAP\|homo database of 70 billion genetic associations of human traits Shashkova T.I., Gorev D.D., Pakhomov E.D., Shadrina A.S., Sharapov S.Z., Tsepilov Y.A., Karssen L.C., Aulchenko Y.S. Vavilov journal of genetics and breeding, 2020, 24(8):876-884
	Prioritization of causal genes for coronary artery disease based on cumulative evidence from experimental and in silico studies Shadrina A. S., Shashkova T. I., Torgasheva A. A., Sharapov S. Z., Klarić L., Pakhomov E. D., Alexeev D. G., Wilson J. F., Tsepilov Y. A., Joshi P. K., Aulchenko Y. S. SCI REP-UK, 2020, 10, Article number: 10486
	Погребальный памятник афанасьевской культуры Бертек-33 на плато Укок (Горный Алтай): результаты палеогенетического исследования Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Черданцев С.В., Пилипенко И.В., Журавлев А.А., Пристяжнюк М.С., Молодин В.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2020, Т. 48, № 4
	К вопросу о генетическом составе сарматского населения Нижнего Поволжья (данные палеогенетики) Пилипенко А. С., Черданцев С. В., Трапезов Р. О., Томилин М. А., Балабанова М. А., Пристяжнюк М. С., Журавлев А. А. Вестник ВГУ. Серия 4., 2020, Т. 25, № 4, С. 17–50
	The Influence of Stress on the Expression of Brain-Derived Neurotrophic Factor (BDNF) and Its Precursor proBDNF in Mice with Different Sensitivity of Serotonin 5-HT1A Receptors E. M. Kondaurovaa, T. V. Il’chibaeva, D. V. Bazovkinaa, N. K. Popova, and V. S. Naumenko NEUROCHEM J+, 2020, Vol. 14, No. 3, pp. 262–267
	Expression Patterns of Serotonin Receptors 1А and 7 in the Brain of Rats with Genetically Determined Fear-Induced Aggressive Behavior or the Lack of Aggression T. V. Ilchibaevaa, A. S. Tsybko, E. M. Kondaurova, A. I. Kovetskaya, R. V. Kozhemyakina, and V. S. Naumenko NEUROCHEM J+, 2020, Vol. 14, No. 2, pp. 180–186.
	Analyzing a putative enhancer of optic disc morphology Babenko V, Babenko R, Orlov Yu BMC GENET, 2020, 21(Suppl 1):73
	Analysis of the Metaphase Chromosome Karyotypes in Imaginal Discs of Aedes communis, Ae. punctor, Ae. intrudens, and Ae. rossicus (Diptera: Culicidae) Mosquitoes Alekseeva S. S., Andreeva Y. V., Wasserlauf I. E., Sibataev A. K., Stegniy V. N. Insects, 2020, V. 11, №63
	Chromosome and Genome Divergence between the Cryptic Eurasian Malaria Vector-Species Anopheles messeae and Anopheles daciae Naumenko A. N., Karagodin D. A., Yurchenko A. A., Moskaev A. V., Martin O. I., Baricheva E. M., Sharakhov I. V., Gordeev M. I., Sharakhova M. V. Genes, 2020, V.11, №2
	Genomic differentiation and intercontinental population structure of mosquito vectors Culex pipiens pipiens and Culex pipiens molestus Yurchenko A. A., Masri R. A., Khrabrova N. V., Sibataev A. K., Fritz M. L., Sharakhova M. V. SCI REP-UK, 2020, V. 10
	Фауна и экология кровососущих комаров (diptera: culicidae) государственного природного заповедника "нургуш" кировской области Панюкова Е.В., Целищева Л.Г., Пестов С.В., Колесникова А.А., Бакка С.В., Шарахова М.В Цитология, 2020, Т. 54, № 4. С. 322-240
	Structural Variation of the X Chromosome Heterochromatin in the Anopheles gambiae Complex Sharma A., Kinney N. A., Timoshevskiy V. A., Sharakhova M. V., Sharakhov I. V. Genes, 2020, V. 11, №3
	GTRD: An integrated view of transcription regulation Semyon Kolmykov, Ivan Yevshin, Mikhail Kulyashov, Ruslan Sharipov, Yury Kondrakhin, Vsevolod J Makeev, Ivan V Kulakovskiy, Alexander Kel, Fedor Kolpakov NUCLEIC ACIDS RES, 2020, Volume 49, Issue D1, 8 January 2021, Pages D104–D111
	Analysis of NGS data on the transcriptional regulation Kolmykov S.K., Evshin I.S., Kolpakov F.A. CEUR workshop proceedings, 2020, Vol.2569. - P.19-22
	Description, Characteristic And Algorithm For Creation Of A Dictionary Of Cell Types And Tissues In The Gtrd Database Kulyashov M.A., Kolmykov S.K., Evshin I.S., Kolpakov F.A. CEUR workshop proceedings, 2020, Vol.2569. - P.13-18.
	Metagenomics dataset used to characterize microbiome in water and sediments of the lake Solenoe (Novosibirsk region, Russia) Alla V Bryanskaya, Aleksandra A Shipova, Alexei S Rozanov, Oxana A Volkova, Elena V Lazareva, Yulia E Uvarova, Tatyana N Goryachkovskaya, Sergey E Peltek Data in Brief, 2020
	The effect of hippocampal knockdown of 5-HT1A receptor silencer Freud-1 on the behavior and the serotonin system in mice T. Ilchibaeva, D. Eremin, A. Plyusnina, E. Antonov, V. Naumenko, E. Kondaurova EUR NEUROPSYCHOPHARM, 2020, Volume 40, Supplement 1, November 2020, Pages S42-S43
	Analyzing a putative enhancer of optic disc morphology Babenko V Babenko O Orlov Yu BMC GENET, 2020, 21:1; SI; Q3
2019	Sex differences in the expression of lipid oxidation and glucose uptake genes in muscles of fasted mice Феофанова Н.А., Яковлева Т.В., Макарова Е.Н., Бажан Н.М. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(1):62-66
	FTO haplotyping underlines high obesity risk for European populations Babenko VN, Babenko RO, Gamieldien G, Markel AL BMC MED GENOMICS, 2019, BMC Genetics 2019
	Ketamine improves depressive symptoms caused by stress and induces c-Fos expression in the brain resembling some effects of stress N. Dygalo, U. S. Drozd, T. S. Kalinina, E. V. Sukhareva, V.V. Bulygina, G.T. Shishkina, D. A. Lanshakov EUR NEUROPSYCHOPHARM, 2019, Volume 29, Supplement 1, 2019, Page s212
	Suppression of Alzheimer’s Disease-Like Pathology Progression by Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1: A Transcriptome Profiling Study Stefanova NA, Ershov NI, Kolosova NG. OXID MED CELL LONGEV, 2019, 2019 Jul 15;2019:3984906
	Subanesthetic dose of ketamine relieves depression-like behavior induced by optogenetic stimulation of the hippocampal pyramidal neurons. N. Dygalo, U.S. Drozd, T.S. Kalinina, E.V. Sukhareva, V.V. Bulygina, G.T. Shishkina, D.A. Lanshakov. EUR NEUROPSYCHOPHARM, 2019, Volume 29, Supplement 6, Page s94
	Mechanisms of Neuronal Death in the Cerebral Cortex during Aging and Development of Alzheimer’s Disease-Like Pathology in Rats Darya V. Telegina,Gleb K. Suvorov,Oyuna S. Kozhevnikova, Nataliya G. Kolosova INT J MOL SCI, 2019, 20(22), 5632
	Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.) Anton Ermakov, Aleksandr Bobrovskikh, Ulyana Zubairova, Dmitrii Konstantinov, Alexey Doroshkov PeerJ, 2019, PeerJ 7:e7791
	Sex Differences in Liver, Adipose Tissue, and Muscle Transcriptional Response to Fasting and Refeeding in Mice Bazhan N, Jakovleva T, Feofanova N, Denisova E, Dubinina A, Sitnikova N, Makarova E. Cells, 2019, 8(12), 1529
	Examining causal effects of body mass index on back pain: a Mendelian randomization study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov Tsepilov, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Yurii Aulchenko, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2019
	Генетические подходы к изучению функций серотонинергических нейронов у животных Дрозд У. С., Шабурова Е. В., Дыгало Н. Н. Vavilov journal of genetics and breeding, 2019
	Sex Dimorphism in the Fgf21 Gene Expression in Liver and Adipose Tissues is Dependent on the Metabolic Condition Bazhan N., JakovlevaT., Balyibina N., Dubinina A., Denisova E., Feofanova N., Makarova E. Online journal of biological sciences, 2019, 19 (1): 28-36
	Компьютерные методы для анализа технологий секвенирования в анализе хромосомных контактов в клетке Орлов Ю.Л., Ковалев С.С., Дергилев А.И., Бабенко Р.О., Галиева Э.Р., Леберфарб Е.Ю. Гены и клетки, 2019, Том XIV №4-1, 2019. C. 171.
2018	CpG islands’ clustering uncovers early development genes in the human genome Babenko V.N. , Bogomolov A.G., Babenko R.O., Galieva E.R., Orlov Y.L. COMPUT SCI INF SYST, 2018, V 15 N2
	Генетические механизмы формирования времени колошения мягкой пшеницы А. А. Киселёва, Е. А. Салина RUSS J GENET+, 2018, Т. 54, № 4, с. 381–396
	Genetic Regulation of Common Wheat Heading Time A.A. Kiseleva, E.A. Salina RUSS J GENET+, 2018, Vol. 54, No. 4, pp. 375–388
	Анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным транскриптомного секвенирования. Ковалев С.С., Губанова Н.В., Леберфарб Е.Ю., Брагин А.О., Орлов Ю.Л. Гены и клетки, 2018, Приложение, No 1, стр.71-72
	Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, Том 16, № 3, С.22-36
	Компьютерная база данных для анализа дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с агрессивным поведением, на моделях лабораторных животных Анатолий Олегович Брагин, Кирилл Александрович Табанюхов, Ирина Витальевна Чадаева, Антон Витальевич Цуканов, Роман Олегович Бабенко, Ирина Вадимовна Медведева, Антон Геннадьевич Богомолов, Владимир Николаевич Бабенко, Юрий Львович Орлов Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии, 2018, 2018. - Том 16, Выпуск № 3. - С. 7-21. - DOI 10.25205/1818-7900-2018-16-3-7-21. - ISSN 1818-7900
	Гендер-специфическое влияние мутации Аy у мышей на метаболический фенотип потомства, рост плодов и экспрессию генов в плацентах Макарова Е.Н., Денисова Е.И., Кожевникова В.В., Кулешова А.Е Vavilov journal of genetics and breeding, 2018, 22(4):406-414
	Interpreting chromosomal rearrangements in the context of 3-dimentional genome organization: a practical guide for medical genetics V.S. Fishman, P.A. Salnikov, N.R. Battulin BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2018
2017	Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Программные системы: теория и приложения, 2017, 8:1(32), 219–242
	Эффекты непродолжительного воздействия лития на экспрессию антиапоптозного белка Bcl-xL в коре и гиппокампе в ответ на острый стресс Дыгало Н.Н., Баннова А.В., Сухарева Е.В., Шишкина Г.Т., Айриянц К.А., Калинина Т.С. Биохимия, 2017, 2017, том 82, вып. 3, с. 487 – 493.
	Effects of short-term exposure to lithium on antiapoptotic Bcl-xL protein expression in cortex and hippocampus of rats after acute stress Dygalo N.N., Bannova A.V., Sukhareva E.V., Shishkina G.T., Ayriyants K.A., Kalinina T.S. BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 345-350. / Original Russian Text © N. N. Dygalo, A. V. Bannova, E. V. Sukhareva, G. T. Shishkina, K. A. Ayriyants, T. S. Kalinina1,2, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 487-493.
	Оптогенетическая активация нейрона повышает в нем уровень антиапоптозного белка Bcl-xL Ланшаков Д.А., Дрозд У.С., Дыгало Н.Н. Биохимия, 2017, Биохимия, 2017, том 82, вып. 3, с. 481 – 486
	Optogenetic stimulation increases level of antiapoptotic protein Bcl-xL in neurons Lanshakov DA, Drozd US, Dygalo NN BIOCHEMISTRY-MOSCOW+, 2017, Biochemistry (Moscow), 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 340-344. Original Russian Text © D. A. Lanshakov, U. S. Drozd, N. N. Dygalo, 2017, published in Biokhimiya, 2017, Vol. 82, No. 3, pp. 481-486.
	Компьютерные средства анализа транскриптомных данных: программный комплекс ExpGene А. М. Спицина, А. О. Брагин, А. И. Дергилев, И. В. Чадаева, Н. Н. Твердохлеб, Э. Р. Галиева, Л. Э. Табиханова, Ю. Л. Орлов Програмные системы: теория и приложения, 2017, 8:2(33), 45–68.
	Моделирование болезни Хантингтона на клетках линии HEK293 Шарипова Д.В., Маланханова Т.Б., Малахова А.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(7):856-861
	Experimental opisthorchiasis: Study of blood cell composition, hematopoiesis, and startle reflex in laboratory animals D. F. Avgustinovich a, *, I. A. Orlovskaya b , L. B. Toporkova b , G. B. Vishnivetskaya a , A. V. Katokhin a , M. N. Lvova a , E. V. Kashina a , N. P. Bondar a , N. A. Feofanova a, b , and V. A. Mordvinov a, c Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2017, 7(1):82-92 · January 2017
	Generation of megabase-scale deletions, inversions and duplications involving the Contactin-6 gene in mice by CRISPR/Cas9 technology Korablev AN,Serova IA, Serov OL BMC GENET, 2017, v.18. (Suppl 1): 112
	Unexpected phenotypic effects of a transgene integration causing a knockout of the endogenous Contactin-5 gene in mice Smirnov AV, Kontsevaya GV, Feofanova NA, Anisimova MV, Serova IA, Gerlinskaya LA, Battulin NR, Moshkin MP, Serov OL TRANSGENIC RES, 2017
	Генерирование мегабазных делеций, дупликаций и инверсий, включающих ген Cntn6, у мышей: экспериментальные модели нейро-психических нарушений человека, вызванных масштабными хромосомными перестройками Кораблев АН, Серова ИА, Серов ОЛ Гены и клетки, 2017, Т. XII, № 3, С.123
	Манипуляции с ранними эмбрионами мыши для создания генетически модифицированных животных А.Н. Кораблев, И.А. Серова, Б.В. Скрябин Vavilov journal of genetics and breeding, 2017, 21(7):758-763, DOI 10.18699/VJ17.291
	Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016	Экспериментальный описторхоз: исследование состава форменных элементов крови, гемопоэза и стартл-рефлекса у лабораторных животных Д.Ф. Августинович, И.А. Орловская, Л.Б. Топоркова, Г.Б. Вишнивецкая, А.В. Катохин, М.Н. Львова, Е.В. Кашина, Н.П. Бондарь, Н.А. Феофанова, В.А. Мордвинов Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016. 20 (2):155-164
	Компьютерный анализ совместной локализации сайтов связывания транскрипционных факторов по данным ChIP-seq Дергилев А.И., Спицина А.М., Чадаева И.В., Свичкарев А.В., Науменко Ф.М., Кулакова Е.В., Витяев Е.Е., Чен М., Орлов Ю.Л. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 20(6):770-778. DOI 10.18699/VJ16.194
	Analysis of differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals Babenko V.N., Bragin A.O., Spitsina A.M., Chadaeva I.V., Galieva E.R., Orlova G.V., Medvedeva I.V., Orlov Y.L. J INTEGR BIOINFORM, 2016, 13(4):292. doi:10.2390/biecoll-jib-2016-292
	Практическое руководство по редактированию геномов системой CRISPR/Cas9 Мензоров А.Г., Лукьянчикова В.А., Кораблев А.Н., Серова И.А., Фишман В.С. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):930-944. DOI 10.18699/VJ16.214
	Эффективное получение химерных мышей с использованием новой линии эмбриональных стволовых клеток Концевая Г.В., Феофанова Н.А., Мензоров А.Г., Пристяжнюк И.Е., Смирнов А.В., Баттулин Н.Р., Герлинская Л.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):925-929. DOI 10.18699/VJ16.213
	Структурное моделирование мод связывания НАД+ с ПАРП-1 Иванисенко Н.В., Жечев Д.А., Иванисенко В.А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2016
	Морфофизиологические эффекты инсерционного мутагенеза гена контактин 5 (Cntn5) у трансгенных мышей А. В. Смирнов, Н. А. Феофанова, Г. В. Концевая, М. В. Анисимова, И. И. Ковригин, И. А. Серова, М. П. Мошкин, Л. А. Герлинская, Н. Р. Баттулин Vavilov journal of genetics and breeding, 2016
2015	Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК Спицина А.М., Орлов Ю.Л., Подколодная Н.Н., Свичкарев А.В., Дергилев А.И., Чен М., Кучин Н. В., Черных И. Г., Глинский Б. М. Программные системы: теория и приложения, 2015, 6:1(23), c. 157–174
	Программы анализа геномных данных секвенирования, полученных на основе технологий ChIP-seq, ChIA-PET и Hi-C Кулакова Е. В., Спицина А. М., Орлова Н. Г., Дергилев А. И., Свичкарев А. В., Сафронова Н. С., Черных И. Г., Орлов Ю. Л. Программные системы: теория и приложения, 2015, 2(25), c. 129–148
2014	БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЕ И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ПОДХОДЫ К ИЗУЧЕНИЮ РОЛИ микроРНК В ВИДОСПЕЦИФИЧНОЙ ИНДУКЦИИ ЦИТОХРОМА Р4502В Гуляева Л. Ф., Чанышев М. Д., Колмыков С. К., Колесников Н. Н. Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2014
2010	Cross-hybridization of repetitive sequences from the pericentric heterochromatic region of Chorthippus apricarius (L.) with the chromosomes of grasshoppers from the Gomphocerini tribe Jetybayev I.E., Karamysheva T.V., Bugrov A.G., Rubtsov N.B. EUROA Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 433–436 + III
	Supernumerary chromosomes as markers of population structure evolution in the grasshopper Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Dzubenko V.V., Bugrov A.G., Jetybayev I.E., Rubtsov N.B. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, 9(3): 437–440 + IV
	Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R J INTEGR BIOINFORM, 2010, 7(1):148. doi: 10.2390/biecoll-jib-2010-148
	Кросс-гибридизация повторенных последовательностей ДНК прицентромерного гетерохроматина Chorthippus apricarius (L.) с хромосомами саранчовых трибы Gomphocerini. Джетыбаев И. Е., Карамышева Т.В., Бугров А.Г., Рубцов Н.Б Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 433-436
	Добавочные хромосомы как маркёры формирования популяционной структуры плавучей кобылки Eyprepocnemis plorans Charpantier, 1825 (Orthoptera, Acrididae) Дзюбенко В.В., Бугров А.Г., Джетыбаев И.Е., Рубцов Н.Б. Евразиатский энтомологический журнал, 2010, Т. 9, №3 стр. 437-440

Монографии

2010

Visualization and Analysis of Biological Networks combining Text Mining and Data Warehouse Approaches
Björn Sommer, Evgeny S. Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian J. Janowski, Timofey V. Ivanisenko, Anatoly O. Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel S. Demenkov, Alexey V. Kochetov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov and Ralf Hofestädt

Конференции

2021	A feedback loop enrchment analysis in gene network of bronchial asthma and pulmonary tuberculosis interaction Evgeny S. Tiys, Pavel S. Demenkov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
2020	Loci and genes involved in chronic musculoskeletal pain identified via analysis of genetically independent pain phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Novel loci associated with plasma immunoglobulin G N-glycosylation identified by a multivariate analysis Alexandra S. Shadrina, Alexander S. Zlobin, Olga O. Zaytseva, Gordan Lauc, Lucija Klaric, Sodbo Z. Sharapov, Yurii S. Aulchenko, Yakov A. Tsepilov BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Association between total plasma N-glycan levels and chronic back pain: a prospective study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov A. Tsepilov, Irena Trbojevic Akmacic, Andrea Skelin, Concetta Dagostino, Massimo Allegri, Jan Van Zundert, Dragan Primorac, Gordan Lauc, Frances M. K. Williams, Maxim B. Freidin BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Генетические факторы риска развития варикозной болезни нижних конечностей: результаты первого крупномасштабного исследования in silico Шадрина А.С., Шарапов С.Ж., Шашкова Т.И., Цепилов Я.А. Онлайн конференция Ассоциации флебологов России «Актуальные вопросы флебологии»
	Loci and Genes Involved in Chronic Musculoskeletal Pain Identified via Analysis of Genetically Orthogonal Pain Phenotypes Y Tsepilov, M Freidin, A Shadrina, E Elgaeva, S Sharapov, J van Zunder, L Karssen, P Suri, F Williams, Y Aulchenko European Mathematical Genetics Meeting
	Whole-exome sequencing association studies on impaired spermatogenesis in different ethnic groups in Russia. Kolmykov S.K. Vasiliev G.V. Ponomarenko M.P. Kleshev M.A. Osadchuk A.V. Osadchuk L.V. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/ Systems Biology The 12th International Multiconference
	Эффект нокаута гена Cc2d1a, кодирующего транскрипционный фактор Freud-1, в гиппокампе на нейротрофическую систему А. Я. Родный, Д. В. Ерёмин, Т. В. Ильчибаева, В. С. Науменко, Е. М. Кондаурова OpenBIO2020
	Pharmacological effects of recombinant FGF21 in ovariectomized mice C57Bl/6J. Kazantseva A., Kriklivaya N., Yakovleva T., Bazhan N., Makarova E. Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2020)
	ВЛИЯНИЕ РЕКОМБИНАНТНОГО FGF21 НА ПОКАЗАТЕЛИ УГЛЕВОДНО-ЖИРОВОГО ОБМЕНА У ОВАРИЭКТОМИРОВАННЫХ САМОК МЫШЕЙ Казанцева А.Ю., Яковлева Т.В., Бажан Н.М., Крикливая Н.П., Макарова Е.Н. СОВЕЩАНИЕ ПО ЭВОЛЮЦИОННОЙ ФИЗИОЛОГИИ имени академика Л.А. Орбели
	ВЛИЯНИЕ ЭСТРАДИОЛА НА ФАРМАКОЛОГИЧЕСКИЕ ЭФФЕКТЫ FGF21 У МЫШЕЙ Мамонтова К.Ю., Яковлева Т.В., Казанцева А.Ю., Макарова Е.Н., Бажан Н.М. СОВЕЩАНИЕ ПО ЭВОЛЮЦИОННОЙ ФИЗИОЛОГИИ имени академика Л.А. Орбели
	METHYLATION AND EXPRESSION PROFILES IN APOE VICINITY POINT TO SPECIFIC NEIGHBORING INTERACTION OF APOE AND TOMM40 GENES: IMPLICATION FOR THE ALZHEIMER DISEASE. Babenko V., Babenko R.,Rogaev E. BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, Symposium “Cognitive Science and Genomics” (CSGB- 2020)
	A new method for combining of genetically correlated traits by maximizing of their shared heritability Svishcheva G, Tiys E, Feoktisova S, Elgaeva E, Sharapov S, Tsepilov Y 48th European Mathematical Genetics Meeting (EMGM)
	Results of genome-wide association study of plasma proteome N-glycosylation in 10,000 samples Sodbo Sharapov, Yurii Aulchenko, Tim Spector, Sofya Feoktistova, Yakov A. Tsepilov, Elizaveta E. Elgaeva, Lucija Klaric, Eugene Tiys, Frano Vuckovic, Harry Campbell, Karsten Suhre, Matthias Schulze, Malcolm Dunlop, Frances Williams, Gordan Lauc BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	Генетические механизмы ответа растений на световой стресс: реконструкция генных сетей и эволюционная перспектива Бобровских А. В., Ермаков А. А., Зубаирова У. С., Константинов Д. К., Левина А.Б., Колодкин А.Н., Хейдари С., Дорошков А.В. Генофонд и селекция растений 2020
	Реконструкция регуляторных генных сетей ответа на солевой стресс Arabidopsis thaliana и Zea mays Бобровских А. В., Ермаков А. А., Зубаирова У. С., Константинов Д. К., Левина А.Б., Дорошков А.В. Генофонд и селекция растений 2020
	Выявление контекстных сигналов в промоторах генов, регулирующих ответ на световой стресс у Arabidopsis thaliana А. В. Бобровских, А. Б. Левина, Д. К. Константинов, А. А. Ермаков , У. С. Зубаирова, А. В. Дорошков Марчуковские научные чтения - 2020
	Выявление контекстных сигналов цис-регуляторных элементов транскрипционного ответа на солевой стресс у Arabidopsis thaliana А. В. Бобровских , Д. К. Константинов , А. А. Ермаков , У. С. Зубаирова , А. В. Дорошков Марчуковские научные чтения - 2020
	Hippocampal overexpression of the cerebral dopamine neurotrophic factor (CDNF) impaired fear memory formation in rats Tatiana Ilchibaeva, Elizaveta Zolotenkova, Dmitry Eremin, Anton Tsybko BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”
	The effect of hippocampal knockdown of 5-HT1A receptor silencer Freud-1 on the behavior and the serotonin system in mice T. Ilchibaeva, D. Eremin, A. Plyusnina, E. Antonov, V. Naumenko, E. Kondaurova ECNP 2020 Virtual
	AAV-mediated overexpression of CDNF in the hippocampus affected the behavior of mice with genetically-defined depressive-like behavior A.S. Tsybko, T.V. Ilchibaeva, N.V. Khotskin, D.V. Eremin, V.S. Naumenko 33st ECNP Congress
2019	С чем связана устойчивость к развитию ожирения у самок мышей ? Гончар А.Д., Макарова Е.Н. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
	Сreation of the viral vectors for the inhibition of the serotonergic neurons using light sensitive proton pump Drozd, U. S., Lanshakov, D. A Summer School on Stress: From Hans Selye’s original concept to recent advances
	Subanesthetic dose of ketamine relieves depression-like behavior induced by optogenetic stimulation of the hippocampal pyramidal neurons N. Dygalo, U.S. Drozd, T.S. Kalinina, E.V. Sukhareva, V.V. Bulygina, G.T. Shishkina, D.A. Lanshakov 32nd ECNP Congress – Copenhagen, 2019, 7-10 September 2019, P.111.
	Genome-wide association study of genetic principal components of four chronic musculoskeletal human pain types Yakov A. Tsepilov, Maxim B. Freidin, Sodbo Zh. Sharapov, Aleksandra S. Shadrina, Elizaveta E. Elgaeva, Melody Palmer, Lennart C. Karssen, Pradeep Suri, Frances M. K. Williams 9th Moscow Conference on Computational Molecular Biology МССМВ'19 2019, Москва
	Исследование главных генетических компонент четырех хронических скелетно-мышечных болей человека Е. Е. Елгаева Международная научная студенческая конференция (МНСК-2019)
	Prediction and verification of auxin-ethylene crosstalk gene networks Ubogoeva E., Levitsky V., Zemlyanskaya E. The Fifth International Scientific Conference "Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics, and Biotechnology" (PlantGen2019)
	3D genome modeling by Hi-C and ChIA-PET data Orlov Y. L., Dergilev A. I., Kovalev S. S., Babenko R. O., Li G. Марчуковские научные чтения - 2019
	Computer tools for spatial chromosome contacts analysis by ChIA-PET and HI-C data. Dergilev A.I., Luzin A.N., Kovalev S.S., Babenko R.O., Orlov Y.L. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.
	Statistical analysis, clusterization and visualization of genome distribution of transcription factor binding sites Dergilev A.I., Tsukanov A.V., Luzin A.N., Babenko R.O., Orlov Y.L. Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.
	ВЛИЯНИЕ ОПТОГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОДАВЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ СЕРОТОНИНЕРГИЧЕСКИХ НЕЙРОНОВ ДОРЗАЛЬНОГО ЯДРА ШВА НА АНТИДЕПРЕССАНТНОЕ ДЕЙСТВИЕ КЕТАМИНА У КРЫС Шабурова Е.В., Дрозд У.С. ИНИЦИАТИВА В НАУКЕ КАК НОВАЯ СТРАТЕГИЯ РАЗВИТИЯ СИСТЕМЫ ЗНАНИЙ
	MODELING OF ANTIOXIDANT SYSTEM OF A PLANT CELL IN CONTROL AND STRESS CONDITIONS Aleksandr V. Bobrovskikh, Alexey N. Kolodkin and Alexey V. Doroshkov DSABNS2019
	Изучение структуры и динамики антиоксидантной системы растений методами системной биологии Бобровских А. В., Дорошков А. В. МНСК-2019, г. Новосибирск
2018	НОКАУТ КЛЮЧЕВЫХ ГЕНОВ БИОСИНТЕЗА НИКОТИНА N. TABACUM МЕТОДОМ РНК-НАПРАВЛЕННОГО МУТАГЕНЕЗА Спасельникова А.В., Егорова А.А., Домрачев Д.В., Кочетов А.В., Герасимова С.В. XVIII научная конференция молодых ученых "Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и ветеринарии"
	Localization and Study of Interactions of B-Genome Genes Inducing Flowering of Common Wheat Antonina A. Kiseleva, Elena A. Salina Plant and Animal Genome Conference, PAG Asia 2018
	Brain regions transriptome analysis in mouse chronic stress model Babenko VN, Babenko RO, Kudryavtseva NN Belgrade Bioinformatics Conference
	Transposable Elements mediated CTCF binding sites: their nuclear compartments localization in human genome Babenko VN, Babenko RO Chromosome 2018
	Получение кардиомиоцитов из пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток для моделирования наследственных сердечно-сосудистых заболеваний Дементьева Е.В., Медведев С.П., Коваленко В.Р., Югова К.А., Вяткин Ю.В., Кретов Е.И., Слотвицкий М.М., Штокало Д.Н., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Всероссийская научно-практическая конференция «Новые вызовы и новые решения в кардиологии»
	Моделирование наследственных аритмических заболеваний человека с использованием пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Дементьева Е.В., Медведев С.П., Коваленко В.Р., Югова К.А., Вяткин Ю.В., Кретов Е.И., Слотвицкий М.М., Штокало Д.Н., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Национальный медицинский инновационный форум
	Исследование влияния мутаций в генах, ассоциированных с наследственной гипертрофической кардиомиопатией, с помощью пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток Дементьева Е.В., Медведев С.П., Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Кретов Е.И., Слотвицкий М.М., Штокало Д.Н., Покушалов Е.А., Закиян С.М. Международный конгресс “CRISPR-2018”
	Leptin administration in midpregnancy reduces fetal and early postnatal growth rate and abolishes obesity-associated hyperglycemia in mouse offspring Makarova E., Denisova E., Kozhevnikova V. 20th Global Obesity Meeting
	Sex-specific changes of gene expression in response to obesity are associated with different FGF21 expression in obese male and female mice Makarova E., Denisova E., Dubinina A., Feofanova N., Yakovleva T., Bazhan N. 20th Global Obesity Meeting
	Sex-specific effect of leptin on gene expression in placentas and fetal tissues in mice E. Denisova, E. Makarova BGRS-2018
	Fasting increases FGF21 expression in liver and changes gene expressions in metabolic organs in a sex-specific manner in mice Nadezhda Bazhan, Yakovleva T, Denisova E, Dubinina N, Feofanova N, Chepeleva E and Makarova E 20th Global Obesity Meeting
	Studying the impact of sex on the molecular mechanisms of liver adaptation to fasting in mice N. Bazhan, N. Sitnikova , T. Iakovleva, A. Dubinina, E. Makarova BGRS 2018
	Sex differences in the effect of high-fat diet on mouse white adipose tissue Bazhan N, Yakovleva T, Dubinina A, Makarova E. 21 World Obesity Conference
	Search of single-nucleotide polymorphisms associated with accelerated senescence in OXYS rats V. Devyatkin, N. Muraleva, O. Redina 11th International Multiconference «Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology»
	Computer analysis of alternative splicing events by RNA-seq data in brain cells V.N. Babenko, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, A.O. Bragin,G.V. Vasiliev, Yu.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
	Cell-free RNA studies in cancer based on T oligo-primed polymerase chain reaction (TOP-PCR) technology K.-P.Chiu, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, Y.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
	Alternative splicing in transcriptomes of glioma cell cultures N.V. Gubanova, A.O. Bragin, A.G. Bogomolov, S.S. Kovalev, Y.L. Orlov Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
	Computer studies of miRNA in abiotic stress response in plants Dobrovolskaya O.B., Spitsina A.M., Galieva A.G., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G., Orlov Y.L., Chen M. Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop
2017	Использование системы CRISPR/Cas9 для изучения клеточной модели спинальной мышечной атрофии Валетдинова К.Р., Овечкина В.С., Григорьева Е.В., Маретина М.А., Киселев А.В., Баранов В.С., Медведев С.П., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Создание клеточной платформы для изучения молекулярно-генетических механизмов патогенеза болезни Паркинсона. III Национальный конгресс по регенеративной медицине Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Медведев С.П. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	Моделирование наследственных сердечно-сосудистых заболеваний с помощью индуцированных плюрипотентных стволовых клеток: успехи, проблемы и перспективы Дементьева Е.В., Медведев С.П., Елисафенко Е.А., Вяткин Ю.В., Штокало Д.Н., Байрамова С.А., Кретов Е.И., Покушалов Е.А., Караськов А.М., Закиян С.М. III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	ГЕНДЕР-СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ВЛИЯНИЕ ЛЕПТИНА ВО ВРЕМЯ БЕРЕМЕННОСТИ НА РАЗВИТИЕ ОЖИРЕНИЯ В ПОТОМСТВЕ И ЭКСПРЕССИЮ ГЕНОВ В ПЛАЦЕНТАХ И МОЗГЕ ПЛОДОВ У МЫШЕЙ Макарова Е.Н., Кожевникова В.В., Денисова Е.И. 23 Съезд Физиологического общества им. И. П. Павлова
	Создание клеточной платформы для исследования молекулярно-генетических механизмов патогенеза болезни Паркинсона Коваленко В.Р., Вяткин Ю.В., Медведев С.П., Закиян С.М. IV Национальный конгресс по болезни Паркинсона и расстройствам движений (с международным участием)
	Анализ связи функциональных изменений миокарда при старении с изменением экспрессии альфаB-кристаллинов и их фосфорилирования Муралёва Н.А., Девяткин В.А. XXIII Съезд Физиологического общества им. И.П. Павлова.
	Поиск полиморфизмов, потенциально ассоциированных с дисфункцией митохондрий у преждевременно стареющих крыс OXYS В.А. Девяткин, Н.А. Муралёва, Н.Г. Колосова Беляевские чтения : Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева
	Анализ транскрипционной регуляции промотора гена орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana A.A. Егорова, В.В. Горелова, С.В. Герасимова БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева
	Analysis of microRNA expression in rat pluripotent stem cells using genome-wide sequencing technologies Sherstyuk V.V., Medvedev S.P., Elisaphenko E.A., Vaskova E.A., Ri M.T., Vyatkin Y.V., Saik O.V., Shtokalo D.N., Pokushalov E.A., Zakian S.M. 15th Annual Meeting of the International Society for Stem Cell Research
	Получение химерных мышей путем инъекции эмбриональных стволовых клеток в бластоцисту на базе Центра генетических ресурсов лабораторных животных ИЦиГ СО РАН Концевая Г.В., Феофанова Н.А., Мензоров А.Г., Пристяжнюк И.Е., Смирнов А.В., Баттулин Н.Р., Герлинская Л.А. 6-ая научно-практическая конференция Rus-LASA
	Глутаматергическая регуляция индуцированных стрессом поведенческих реакций. Дыгало Н.Н., Булыгина В.В., Калинина Т.С., Сухарева Е.В., Дрозд У.С., Шишкина Г.Т., Ланшаков Д.А. «СТРЕСС: ФИЗИОЛОГИЧЕСКИЕ ЭФФЕКТЫ, ПАТОЛОГИЧЕСКИЕ ПОСЛЕДСТВИЯ И СПОСОБЫ ИХ ПРЕДОТВРАЩЕНИЯ» (Посвящается памяти профессора А.А. Филаретова). 10–13 октября 2017 г. Санкт-Петербург.
	Анализ альтернативного сплайсинга в глиомах с помощью секвенирования транскриптом Брагин А.О., Губанова Н.В., Ковалев С.С., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л. Вторая Международная научно-практическая конференция «NGS в медицинской генетике 2017»
	Генерирование мегабазных делеций, дупликаций и инверсий, включающих ген CNTN6, у мышей: экспериментальные модели нейро-психических нарушений человека, вызванных масштабными хромосомными перестройками Серов ОЛ, Кораблев АН, Серова ИА III-й Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине
	ЭКСПРЕССИЯ АНТИ-АПОПТОЗНОГО БЕЛКА BCL-XL В ГЛУТАМАТЕРГИЧЕСКИХ НЕЙРОНАХ ГИППОКАМПА ПРИ ИХ ОПТОГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТИМУЛЯЦИИ Дрозд У.С. ПЕРСПЕКТИВЫ РАЗВИТИЯ ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ НАУК
	ОПТОГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТИМУЛЯЦИЯ ГЛУТАМАТЕРГИЧЕСКИХ НЕЙРОНОВ ГИППОКАМПА УСИЛИВАЕТ ПРОЯВЛЕНИЕ ДЕПРЕССИВНО-ПОДОБНОГО ПОВЕДЕНИЯ У КРЫС Дрозд У.С. МНСК-2017: БИОЛОГИЯ
2016	Computer Analysis of RNA-seq Data of Laboratory Rats with Aggressive Behavior Anatoly O. Bragin*, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel SocBin Bioinformatics 2016
	Создание панели изогенных линий клеток, моделирующих болезнь Хантингтона in vitro Шарипова Д.В., Маланханова Т.Б. Международная научная студенческая конференция, НГУ, Новосибирск
	Search for regulatory context signals in genomic DNA E.E.Vityaev, A.I.Dergilev, I.V.Chadaeva, Y.Y.Vaskin, A.M.Spitsina, E.V.Kulakova, O.V.Vishnevsky, Y.L.Orlov XVIII Международная научно-техническая конференция Нейроинформатика 2016
	Analysis of aggressive behavior by whole RNA sequencing in brain compartments V.N. Babenko, A.O. Bragin, I.V. Medvedeva, I.V. Chadaeva, A.I. Dergilev, A.M. Spitsyna, N.N. Kudriavtseva, A.L. Markel, Y.L. Orlov Нейроинформатика 2016
2015	CTCF binding sites and gene expression analysis in genome scale by sequencing data Kulakova E.V., Spitsina A.M., Safronova N.S., Svichkarev A.V., Dergilev A.I., Ponomarenko M.P., Babenko V.N., Hong P., Li G., Orlov Y.L. 7th International Young Scientists School “Systems biology and bioinformatics” SBB-2015
	Analysis of gene location relative to chromosome loops and topological chromosome domains by ChIA-PET and Hi-C Orlov Y.L., Kulakova E.V., Spitsina A.M., Svichkarev A.V., Babenko V.N., Li G. 3D Genome Workshop
	Differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals with aggressive and tolerant behaviors Anatoly O. Bragin, Natalia N. Kudryavtseva, Arcady L. Markel, Yuriy L. Orlov, Ekaterina V. Kulakova, Anastasia M. Spitsina MCCMB-15
	Statistical analysis of chromosome contacts by ChIA-PET and Hi-C technologies Orlov Y.L., Kulakova E., Spitsina A., Babenko V. Future of Biomedicine 2015 Conference
	Computer Tools for Gene Expression Data Processing and Correlation Analysis Babenko V.N., Orlov Y. L., Spitsyina A. M. Podkolodnaya N. Computational systems biology and bioinformatics (CSBio 2015)
	Gene Expression Analysis in Brain Areas of Laboratory Rats with Aggressive Behavior by RNA-seq Data Anatoly O. Bragin, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel CSBio’2015
2014	Implications of hostile environment and social instability in adolescent mice Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Smagin D.A., Michurina T.V., Enikolopov G., Kudryavtseva N.N. BGRS\SB-2014
	Repeated positive fighting experience in male mice: the tool for the study of movement disorders Kudryavtseva N.N., Smagin D.A., Kovalenko I.L.,Vishnivetskaya G.B., Galyamina A.G, Enikolopov G BGRS\SB-2014
	Activation of hippocampal cell proliferation and decrease of c-fos expression in the amygdala under positive fighting experience in male mice Smagin D.A., Kudryavtseva N.N., Enikolopov G.N. BGRS\SB-2014
	Behavioral and neurobiological changes under repeated experience of aggression in male mice Smagin D.A., Enikolopov G.N., Kudryavtseva N.N. X International congress NEUROSCIENCE FOR MEDICINE AND PSYCHOLOGY
	Интеграция геномных и транскриптомных данных о хромосомных контактах в геноме человека, полученных по методу ChIA-PET // Сборник трудов IV международной научно-практической конференции «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» Постгеном-2014, 29 октября – 1 ноября 2014, г.Казань. Издательство Казанского (Приволжского) Федерального Университета (ISBN 987-5-00019-293-1) S05-24, С.150. Орлов Ю.Л., Кулакова Е.В, Спицина А.М., Дергилев А.И., Свичкарев А.В., Афонников Д.А., Чен М., Ли Г., Руан Й., Колчанов Н.А. Постгеном-2014 «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине»
2011	Эффекты гипоксии и глюкокортикоидов на двигательную активность и экспрессию белков апоптоза в головном мозге неонатальных крысят. Вечкапова С.О. XLIХ международная студенческая конференция
	Развитие неонатальных крыс и экспрессия белков апоптоза в их мозге после воздействия дексаметазоном и гипоксией. Меньшанов ПН, Вечкапова ОС, Калинина ТС, Дыгало НН. VII Съезд Казахского физиологического общества
	Behavioral and neurodevelopmental effects of ACTH and glucocorticoids in neonatal rats. Dygalo N.N, Kalinina T.S., Shemenkova T.V., Vechkapova S.O., Menshanov P.N., Bulygina V.V. 24th ECNP Congress (European College of Neuropsychopharmacology)
	VISUALIZATION AND ANALYSIS OF A CARDIO VASCULAR DISEASE-RELATED BIOLOGICAL NETWORK COMBINING TEXT MINING AND DATA WAREHOUSE APPROACHES Ralf Hofestädt, Björn Sommer, Evgeny Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian Janowski, Timofey Ivanisenko, Anatoly Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel Demenkov, Alexey Kochetov, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011
	Автоматическая реконструкция ассоциативных генных сетей на примере анализа протеома мочи Тийс Е.С., Деменков П.С., Доброхотов И.В., Валеева О.А., Пастушкова Л.Х., Николаев Е.Н., Ларина И.М., Колчанов Н.А., Иванисенко В.А. Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика, г. Новосибирск, 14-17 ноября 2011 г.
	Comparison of molecular composition of pericentric heterochromatin of two grasshopper species from Gomphocerini tribe (Acrididae; Orthoptera) Jetybayev I.E., Bugrov A.G., Belavin P.A., Tatkov S.I., Shvalov A.N. Rubtsov N.B 18th International Chromosome Conference
2010	Возможности и ограничения молекулярно-цитогенетических методов в исследовании хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Дзюбенко В. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. V Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных (KARYO V) с 16 по 20 августа 2010 г. г. Новосибирск
	Флуоресцентная гибридизация in situ оригинальных микродиссекционных ДНК-проб с А- и В-хромосомами плавучей кобылки Eyprepocnemis plorans Charp. (Orthoptera, Acrididae) Дзюбенко В. В., Бугров А. Г., Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Рубцов Н. Б. V Международная конференция по кариосистематике беспозвоночных животных (KARYO V) с 16 по 20 августа 2010 г. г. Новосибирск
	Молекулярные маркеры в сравнительной цитогенетике саранчовых подсемейства Gemphocerinae (Acrididae, Orthoptera) Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Молекулярные маркеры в сравнительной цитогенетике саранчовых подсемейства Gomphocerinae (Acrididae, Orthoptera) Джетыбаев И. Е., Карамышева Т. В., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	Гибридизация in situ и LA-PCR — новый метод получения микродиссекционных ДНК-проб хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Лосева Е. М., Морозкин Е. С., Лактионов П. П., Бугров А. Г., Рубцов Н. Б. Тезисы V Международной конференции по кариосистематике беспозвоночных животных. Новосибирск 2010
	A computer analysis of functional relationships between genes associated with multifactorial diseases: pre-eclampsia as an example E. Tiys, P. Demenkov, E. Vashukova, A. Glotov, V. Ivanisenko 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
	Гибридизация in situ и LA-PCR – новый метод получениея микродиссекционных ДНК-проб хромосом саранчовых Джетыбаев И. Е., Лосева Е.М., Морозкин Е.С., Лактионов П.П., Бугров А.Г., Рубцов Н.Б KARYO V
2009	Компьютерный анализ распределения структурных аналогов активных сайтов в пространственных структурах ферментов Тийс Е. Новосибирск, апрель 2009 г.: Тез. докл. Материалы XLVII международной научной студенческой конференции "Студент и научно-технический прогресс": Биология.
	Comparative analysis of localization of rDNA clusters an telomeric repeats (TTAGG)n in C-positive and C-negative chromosome regions of Gomphocerinae grasshoppers (Acrididae; Orthoptera) Jetybayev I., Bugrov A., Karamysheva T., Rubtsov N 17th International Chromosome Conference
2008	Компьютерный анализ распределения структурных аналогов активных сайтов в пространственных структурах ферментов Тийс Е.С. XLVI международная научная студенческая конференция «Студент и научно-технический прогресс»: Биология
	Distribution of active site structural analogs in enzyme 3D-structures: computer analysis E.S.Teeys, V.A. Ivanisenko Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure
2007	Структурные аналоги функциональных центров белков в пространственных структурах ферментов Тийс Е.С. XLV международная научная студенческая конференция «Студент и научно- технический прогресс»: Биология.

Гранты

2020	Регуляция EIN3/EIL1-зависимого транскрипционного ответа на этилен у растений: системный анализ полногеномных данных Российский научный фонд, номер гранта 20-14-00140
	Влияние активности глутаматергических нейронов на экспрессию BDNF в миндалине и проявления тревожности в ювенильном и взрослом периодах онтогенеза РФФИ, номер гранта 20-015-00129 А
	Разработка теоретических и прикладных основ использования больших данных для картирования генов РФФИ, номер гранта 20-04-00464 А
	Системное изучение механизмов морфогенеза растений на основе данных секвенирования транскриптомов одиночных клеток РФФИ, номер гранта 20-04-01112 А
	Анализ взаимодействия коры и гиппокампа при проявлении депрессивно-подобного состояния и его коррекции методами постгеномной нейробиологии РНФ
	Исследование роли усечённой формы тропомиозинового тирозинкиназного рецептора (TrkB-T) в регуляции нормального и патологического поведения: связь с серотониновой (5-HT) системой мозга. РФФИ
	Изучение половых особенностей регуляторного влияния фактора роста фибробластов 21 (FGF21) на углеводно-жировой обмен РНФ, номер гранта 17-15-01036-П
2019	Системное изучение взаимной регуляции ростовых процессов и водного режима злаков РНФ, номер гранта 19-74-10037
	Гены - регуляторы гликозилирования белков человека Российский научный фонд, номер гранта 19-15-00115
	Популяционная геномика и эволюционная история комаров-переносчиков заболеваний человека в России РНФ, номер гранта 19-14-00130
2018	Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования, РФФИ, номер гранта №18-29-13021
	Исследование роли пространственной организации генома в регуляции активности генов на примере локуса Pdgfra/Kit/Kdr, с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9 РФФИ, номер гранта 18-29-07022 мк
	Анализ роли кортиколиберинергической системы в негативных эффектах неонатальной терапии глюкокортикоидами на формирующийся головной мозг и анализ их предотвращения воздействиями на эту систему РФФИ, номер гранта 18-44-543013
	Новый подход к созданию безопасных растительных систем экспрессии чужеродных белков: снижение природной токсичности табака методом геномного редактирования РФФИ, номер гранта 18-416-543004 р_мол_а
	Исследование влияния мутаций в генах, ассоциированных с наследственной гипертрофической кардиомиопатией, на развитие данного заболевания с помощью пациент-специфичных индуцированных плюрипотентных стволовых клеток РНФ, номер гранта 18-75-10039
	Создание вирусных векторов для управления активностью серотонинергических нейронов с помощью фоточувствительных белков РФФИ, номер гранта 18-315-00114 мол_а
	Разработка платформы для доместикации картофеля de novo РФФИ, номер гранта 18-316-00068 мол_а
	Программирование поведения посредством редактирования эпигенома норадренергических нейронов голубого пятна ствола мозга в ранний постнатальный период РФФИ, номер гранта 18-315-20028 мол_а_вед
	Разработка метода и онлайн ресурса для биоинформатического анализа фолд-специфической экспрессии генов РФФИ, номер гранта 18-34-00871
	Оценка вклада изменений с возрастом фосфорилирования альфаВ-кристаллина в нарушения протеостаза при болезни Альцгеймера РФФИ, номер гранта 18-015-00336
2017	Направленная модификация генома для исследования роли пространственной архитектуры ядра в развитии патологий РНФ, номер гранта 17-74- 10143
	Изучение генетических и эпигенетических механизмов программирующего действия материнского лептина в зависимости от пола потомства у мышей РФФИ, номер гранта 17-04-01357 А
	Изучение половых особенностей регуляторного влияния фактора роста фибробластов 21 (FGF21) на углеводно-жировой обмен РНФ, номер гранта 17-15-01036
2016	Создание клеточных моделей болезни Хантингтона для изучения молекулярных механизмов развития патологии РНФ, номер гранта 16-15-10128
	Экзомный анализ предрасположенности человека к тяжелым формам клещевого энцефалита Российский научный фонд, номер гранта 16-15-00127
	Популяционная структура и следы адаптации к холодному климату в геномах российских пород крупного рогатого скота и овец Российский научный фонд
	Разработка новых методов визуализации и анализа хромосомоспецифичных последовательностей ДНК для FISH-диагностики РФФИ, номер гранта 16-34-00498
2015	«Развитие коллекции генетических линий мышей и инструментального обеспечения их высокотехнологического фенотипирования для изучения на животных с целевыми мутациями вклада отдельных генов в эффективность репродукции, скорость старения, нейробиологические процессы и нейропатологии, разработка на этой основе инновационных средств коррекции генетически детерминированных нарушений» Минобрнауки России, номер гранта 14.621.21.0010
	Молекулярно-генетические механизмы формирования окраски овощных и злаковых культур СО РАН, номер гранта 22
	МОЗГ КАК ОРГАН МИШЕНЬ ДЛЯ НАНОРАЗМЕРНЫХ ТВЕРДЫХ АЭРОЗОЛЕЙ. Нейробиологические и нейротоксические эффекты кристаллических и аморфных наночастиц при интраназальном введении. РНФ, номер гранта 14-14-00221
	«Технологическое и коллекционное развитие "Центра генетических ресурсов лабораторных животных" (ЦГР), сформированного на базе SPF-вивария ИЦиГ СО РАН» Минобрнауки России, номер гранта 14.619.21.0005
2014	Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq) РНФ, номер гранта РНФ № 14-14-00269
	Картирование и изучение структурно-функциональной организации генных локусов дикорастущей пшеницы Triticum dicoccoides. Российский научный фонд, номер гранта 14-14-00161
2011	Исследование эффектов кортикотропина на экспрессию нейроэндокринных регуляторов активности мужской половой системы в раннем постнатальном онтогенезе РФФИ, номер гранта 11-04-00375-а
2010	Разработка алгоритмов для биоинформационного анализа комплексных метаболических и молекулярно-генетических сетей Министерство образования и науки, номер гранта 14.740.11.0001
2009	Разработка Веб-ориентированной экспертной системы, предназначенной для распознавания взаимосвязанных белков, выявленных с применением постгеномных методов Федеральное агенство по науке и инновациям, номер гранта 02.514.11.4123
2008	Анализ функции люлиберина (GnRH-1) в регуляции физиологического апоптоза клеток формирующегося мозга РФФИ, номер гранта 08-04- 00292-а