ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Цуканов Антон Витальевич

Подразделение: 137. Сектор биоинформ. и информац. технологий в генетике
Совместительство: 162. Лаб.молекул.механ.гормон.регуляции у растений
175. Лаб.анализа регуляторных модулей генов растений
Должность: младший научный сотрудник
Комната: 1301
Email: tsukanov@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*1301





Публикации

2021 Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2
А.В. Цуканов , В.Г. Левицкий, Т.И. Меркулова
[Vavilov journal of genetics and breeding]
2018 Компьютерная база данных для анализа дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с агрессивным поведением, на моделях лабораторных животных
Анатолий Олегович Брагин, Кирилл Александрович Табанюхов, Ирина Витальевна Чадаева, Антон Витальевич Цуканов, Роман Олегович Бабенко, Ирина Вадимовна Медведева, Антон Геннадьевич Богомолов, Владимир Николаевич Бабенко, Юрий Львович Орлов
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
Компьютерные средства анализа регуляции экспрессии генов и альтернативного сплайсинга
Дергилев А.И., Табанюхов К.А., Цуканов А.В., Брагин А.О., Орлов Ю.Л.
[Гены и клетки]
Компьютерный анализ альтернативного сплайсинга генов в культурах клеток глиом по данным RNA-seq
С. С. Ковалев, Е. Ю. Леберфарб, Н. В. Губанова, А. О. Брагин, А. Г. Галиева,А. В. Цуканов, В. Н. Бабенко, Ю. Л. Орлов
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
Программы статистической обработки, кластеризации и визуализации распределения сайтов связывания транскрипционных факторов в геноме
Цуканов А.В., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Орлов Ю.Л
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
Реконструкция геномного распределения кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов, связанных с поддержанием плюрипотентности.
Цуканов А.В., Дергилев А.И., Богомолов А.Г., Орлов Ю.Л.
[Гены и клетки]
2017 Компьютерные методы анализа хромосомных контактов в ядре клетки по данным технологий секвенирования
Орлов Ю.Л., Тьерри О., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Кулакова Е.В., Галиева Э.Р., Брагин А.О., Ли Г.
[Биомедицинская химия]
Компьютерный анализ кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов в эмбриональных стволовых клетках
Дергилев А.И., Цуканов А.В., Орлов Ю.Л.
[Гены и клетки]

Конференции

2020 Analysis of short- and long-range interactions within potential binding sites notably extends the fraction of verified peaks in ChIP-seq data
Цуканов Антон Витальевич, Левицкий Виктор Георгиевич, Меркулова Татьяна Ивановна
[BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology“]
2019 Statistical analysis, clusterization and visualization of genome distribution of transcription factor binding sites
Dergilev A.I., Tsukanov A.V., Luzin A.N., Babenko R.O., Orlov Y.L.
[Systems Biology and Bioinformatics (SBB-2019) The Eleventh International Young Scientists School.]
Компьютерные средства анализа кластеров регуляторных районов экспрессии генов
Орлов Ю.Л., Дергилев А.И., Цуканов А.В., Лузин А.Н., Орлова Н.Г.
[VI Съезд биофизиков России]
2018 Analysis of genome size, CG content and characteristics of microorganisms’environment habitats
V.V. Suslov, A.V. Tsukanov, Y.L. Orlov
[BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\SYSTEMS BIOLOGY (BGRS\SB-2018)]
Bioinformatics tools for 3D chromosome contacts analysis
Thierry O., Galieva A.G., Tsukanov A.V., Orlov Y.L.
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
Cell-free RNA studies in cancer based on T oligo-primed polymerase chain reaction (TOP-PCR) technology
K.-P.Chiu, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, Y.L. Orlov
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
Computer analysis of alternative splicing events by RNA-seq data in brain cells
V.N. Babenko, N.V. Gubanova, A.V. Tsukanov, S.S. Kovalev, A.O. Bragin,G.V. Vasiliev, Yu.L. Orlov
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
Computer studies of miRNA in abiotic stress response in plants
Dobrovolskaya O.B., Spitsina A.M., Galieva A.G., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G., Orlov Y.L., Chen M.
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
Extended clusters of transcription factor binding sites in embryonic stem cells
Tsukanov A.V., Dergilev A.I., Orlov Y.L.
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
Statistical approaches for analysis of mapping quality for single-cell sequencing data
Abnizova I.I., te Boekhorst R., Beka N., Naumenko F.M., Tsukanov A.V., Orlov Y.L.
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
2017 Компьютерный анализ кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов в эмбриональных стволовых клетках
Дергилев А.И., Цуканов А.В., Орлов Ю.Л.
[III Национальный Конгресс по Регенеративной Медицине]

Гранты

2021 Поиск, декомпозиция и верификация регуляторных модулей, обеспечивающих формирование пространственно-временных паттернов экспрессии генов растений
Левицкий Виктор Георгиевич, Миронова Виктория Владимировна, Лавреха Виктория Вадимовна, Сизенцова Яна Геннадьевна, Коврижных Василина Владимировна, Долгих Владислав Андреевич, Омельянчук Надежда Анатольевна, Цуканов Антон Витальевич, Вибе Даниил Станиславович, Коростелева Анастасия Леонидовна

2020 Регуляция EIN3/EIL1-зависимого транскрипционного ответа на этилен у растений: системный анализ полногеномных данных
Землянская Е.В., Левицкий В.Г., Долгих В.А., Убогоева Е.В., Пуховая Е.М., Багаутдинова З.З., Цуканов А.В., Омельянчук Н.А.


Патенты

2021 Программный комплекс для поиска мотивов в данных полногеномного картирования сайтов связывания транскрипционных факторов ChIP-seq (SiteGA)
Левицкий В.Г., Цуканов А.В.

2018 База данных «Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов человека при вторичной глиобластоме (ДАСГГ)» / «Differential Alternative Splicing of Human Genes in secondary Glioblastome (DASGG)»
Брагин А.О., Губанова Н.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Леберфарб Е.Ю., Орлов Ю.Л.

Программа поиска кластеров сайтов ChIP-seq в геноме «КланЧиПикс» / Program for ChIP-seq cluster search in genome «ClanChIPeaks»
Цуканов А.В., Орлов Ю.Л.

© 2010-2021 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.