ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Богомолов Антон Геннадьевич, к. б. н.

Подразделение: 062. Лаб. морф. и функции клет. структур
Должность: научный сотрудник
Комната: 1307
Email: mantis_anton@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-55*1307


Scopus: 55513172900
РИНЦ: 864939
Индекс WOS: AAD-7887-2020



Персональная информация

orcid: 0000-0003-4359-6089

SPIN-код: 3430-4045

Рабочий адрес

Россия, г.  Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10

 

Образование

НГУ – 2009 – инженер (специальность “Программное обеспечение вычислительной техники и автоматизированных систем”)

ИЦиГ СО РАН – 2019 – кандидат биологических наук (математическая биология, биоинформатика



Публикации

2024 AtSNP_TATAdb: Candidate molecular markers of plant advantages related to single nucleotide polymorphisms within proximal promoters of Arabidopsis thaliana L.
Bogomolov A, Zolotareva K, Filonov S, Chadaeva I, Rasskazov D, Sharypova E, Podkolodnyy N, Ponomarenko P, Savinkova L, Tverdokhleb N, Khandaev B, Kondratyuk E, Podkolodnaya O, Zemlyanskaya E, Kolchanov NA, Ponomarenko M.
[INT J MOL SCI]
2023 Candidate SNP markers significantly altering the affinity of TATA-binding protein for the promoters of human hub genes for atherogenesis, atherosclerosis and atheroprotection.
Bogomolov A, Filonov S, Chadaeva I, Rasskazov D, Khandaev B, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Ivanisenko VA, Demenkov P, Podkolodnyy N, Kondratyuk E, Ponomarenko P, Podkolodnaya O, Mustafin Z, Savinkova L, Kolchanov N, Tverdokhleb N, Ponomarenko M.
[INT J MOL SCI]
Differentially expressed genes and molecular susceptibility to human age-related diseases
Shikhevich S, Chadaeva I, Khandaev B, Kozhemyakina R, Zolotareva K, Kazachek A, Oshchepkov D, Bogomolov A, Klimova NV, Ivanisenko VA, Demenkov P, Mustafin Z, Markel A, Savinkova L, Kolchanov NA, Kozlov V, Ponomarenko M
[INT J MOL SCI]
Human_SNP_TATAdb – база данных о SNP, статистически достоверно изменяющих сродство ТАТА-связывающего белка к промоторам генов человека: полногеномный анализ и варианты использования.
Филонов С.В., Подколодный Н.Л., Подколодная О.А., Твердохлеб Н.Н., Пономаренко П.М., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Пономаренко М.П.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
База знаний RatDEGdb по дифференциально экспрессирующимся генам крысы как модельного объекта биомедицинских исследований
Чадаева И.В., Филонов С.В., Золотарева К.А., Хандаев Б.М., Ершов Н.И., Подколодный Н.Л., Кожемякина Р.В., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Кондратюк Е.Ю., Климова Н.В., Шихевич С.Г., Рязанова М.А., Федосеева Л.А., Редина О.Е., Кожевникова О.С., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г., Маркель А.Л., Пономаренко М.П., Ощепков Д.Ю.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
2022 CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana
Lavrekha VV, Levitsky VG, Tsukanov AV, Bogomolov AG, Grigorovich DA, Omelyanchuk N, Ubogoeva EV, Zemlyanskaya EV, Mironova V
[Frontiers in Plant Science]
Plant_SNP_TATA_Z-tester: a Web service that unequivocally estimates the impact of proximal promoter mutations on plant gene expression
Rasskazov D, Chadaeva I, Sharypova E, Zolotareva K, Khandaev B, Ponomarenko P, Podkolodnyy N, Tverdokhleb N, Vishnevsky O, Bogomolov A, Podkolodnaya O, Savinkova L, Zemlyanskaya E, Golubyatnikov V, Kolchanov N, Ponomarenko M.
[INT J MOL SCI]
Stress reactivity, susceptibility to hypertension, and differential expression of genes in hypertensive compared to normotensive patients
Oshchepkov D, Chadaeva I, Kozhemyakina R, Zolotareva K, Khandaev B, Sharypova E, Ponomarenko P, Bogomolov A, Klimova NV, Shikhevich S, Redina O, Kolosova NG, Nazarenko M, Kolchanov NA, Markel A, Ponomarenko M.
[INT J MOL SCI]
Биоинформатический поиск соответствия дифференциально экспрессируемых генов домашних и диких животных с ортологичными генами, изменяющими репродуктивный потенциал человека.
Пономаренко М.П., Чадаева И.В., Пономаренко П.М., Богомолов А.Г., Ощепков Д.Ю., Шарыпова Е.Б., Суслов В.В., Осадчук А.В., Осадчук Л.В., Матушкин Ю.Г.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
Промоторы генов, кодирующих β-амилазу, альбумин и глобулин пищевых растений в сравнении с непищевыми, характеризуются более низкой аффинностью к ТАТА-связывающему белку: in silico анализ.
Вишневский О.В., Чадаева И.В., Шарыпова Е.Б., Хандаев Б.М., Золотарева К.А., Казачек А.В., Пономаренко П.М., Подколодный Н.Л., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Подколодная О.А., Савинкова Л.К., Землянская Е.В., Пономаренко М.П.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
2021 A bioinformatics model of human diseases on the basis of differentially expressed genes (of domestic versus wild animals) that are orthologs of human genes associated with reproductive-potential changes.
Vasiliev G, Chadaeva I, Rasskazov D, Ponomarenko P, Sharypova E, Drachkova I, Bogomolov A, Savinkova L, Ponomarenko M, Kolchanov N, Osadchuk A, Oshchepkov D, Osadchuk L.
[INT J MOL SCI]
A catalogue of human genes associated with pathozoospermia and functional characteristics of these genes
Ignatieva E.V., Osadchuk A.V., Kleshchev M.A., Bogomolov A.G., Osadchuk L.V.
[Frontiers in Genetics]
Domestication explains two-thirds of differential-gene-expression variance between domestic and wild animals; the remaining one-third reflects intraspecific and interspecific variation
Chadaeva I, Ponomarenko P, Kozhemyakina R, Suslov V, Bogomolov A, Klimova N, Shikhevich S, Savinkova L, Oshchepkov D, Kolchanov N, Markel A, Ponomarenko M.
[Animals]
2020 Disruptive natural selection by male reproductive potential prevents underexpression of protein-coding genes on the human Y chromosome as a self-domestication syndrome.
Ponomarenko M., Kleshchev M., Ponomarenko P., Chadaeva I., Sharypova E., Rasskazov D., Kolmykov S., Drachkova I., Vasiliev G., Gutorova N., Ignatieva E., Savinkova L., Bogomolov A., Osadchuk L., Osadchuk A., Oshchepkov D.
[BMC GENET]
Reproductive potential of the male (RPM): the computer database of phenotypic and molecular genetic data for Russian men with impaired and normal fertility
A Bogomolov, A Osadchuk, L Osadchuk
[J INTEGR BIOINFORM]
2018 CpG islands’ clustering uncovers early development genes in the human genome
Babenko V.N. , Bogomolov A.G., Babenko R.O., Galieva E.R., Orlov Y.L.
[COMPUT SCI INF SYST]
Компьютерная база данных для анализа дифференциально экспрессирующихся генов, связанных с агрессивным поведением, на моделях лабораторных животных
Анатолий Олегович Брагин, Кирилл Александрович Табанюхов, Ирина Витальевна Чадаева, Антон Витальевич Цуканов, Роман Олегович Бабенко, Ирина Вадимовна Медведева, Антон Геннадьевич Богомолов, Владимир Николаевич Бабенко, Юрий Львович Орлов
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
Реконструкция геномного распределения кластеров сайтов связывания транскрипционных факторов, связанных с поддержанием плюрипотентности.
Цуканов А.В., Дергилев А.И., Богомолов А.Г., Орлов Ю.Л.
[Гены и клетки]
2017 Development of software and modification of Q-FISH protocol for estimation of individual telomeres length in immunopathology
M.Sh. Barkovskaya A.G. Bogomolov N.Yu. Knauer N.B. Rubtsov V.A. Kozlov
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Origin and Evolution of the Neo-Sex Chromosomes in Pamphagidae Grasshoppers through Chromosome Fusion and Following Heteromorphization
Jetybayev IY, Bugrov AG, Buleu OG, Bogomolov AG, Rubtsov NB
[Genes]
Spatial organization of fibroblast and spermatocyte nuclei with different B-chromosome content in Korean field mouse, Apodemus peninsulae (Rodentia, Muridae)
Tatyana V. Karamysheva, Anna A. Torgasheva, Yaroslav R. Yefremov, Anton G. Bogomolov, Thomas Liehr, Pavel M. Borodin, Nikolay B. Rubtsov
[GENOME]
THU0019 Features of telomere length distribution on individual chromosomes in rheumatoid arthritis.
M Barkovskaya, A Bogomolov, N Knauer, E Blinova, A Sizikov, N Rubtsov, V Kozlov.
[ANN RHEUM DIS]
Анализ необычной морфологии хромосомы 21 хориона при неразвивающейся беременности
Карамышева Т.В., Гайнер Т.А., Каримова О.Г., Богомолов А. Г., Рубцов Н.Б.
[Медицинская генетика]
Комплексная диагностика хромосомной патологии - деривата хромосомы 4 и малой сверхчисленной маркерной хромосомы
Гайнер Т.А., Карамышева Т.В., Каримова О.Г., Корень О.Л., Шлома В.В., Шорина А.Р., Богомолов А.Г., Рубцов Н.Б.
[Медицинская генетика]
Компьютерные методы анализа хромосомных контактов в ядре клетки по данным технологий секвенирования
Орлов Ю.Л., Тьерри О., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Кулакова Е.В., Галиева Э.Р., Брагин А.О., Ли Г.
[Биомедицинская химия]
Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C
Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л.
[Программные системы: теория и приложения]
2014 Флуоресцентная гибридизация in situ ДНК-проб, полученных из индивидуальных хромосом и хромосомных районов.
Богомолов А.Г. Карамышева Т.В. Рубцов Н.Б.
[Molecular Biology]
2012 Визуализация хромосомоспецифичных последовательностей ДНК при проведении FISH микродиссекционных ДНК-проб с метафазными хромосомами.
А.Г. Богомолов, К.С. Задесенец, Т.В. Карамышева, Н.Л. Подколодный, Н.Б. Рубцов
[Vavilov journal of genetics and breeding]

Монографии

2022 A Catalog of Human Genes Associated With Pathozoospermia and Functional Characteristics of These Genes.
Ignatieva E.V., Osadchuk A.V., Kleshchev M.A., Bogomolov A.G., Osadchuk L.V.

2016 Анализ экспрессии генов и расположения сайтов связывания транскрипционных факторов в геноме по данным высокопроизводительного секвенирования / Монография. отв. ред. Ю.Л. Орлов; - Н. Изд-во «Академиздат», 2016, 136 с.
Ю.Л. Орлов, В.Н. Бабенко, А.Г. Богомолов, Э.Р. Галиева, И.В. Чадаева


Конференции

2023 CisCross web server: a gene set enrichment analysis to predict the upstream regulators in Arabidopsis thaliana
Lavrekha V.V., Levitsky V., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G., Omelyanchuk N., Zemlyanskaya E.V., Mironova V.
[Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology (PlantGen 2023)]
2022 Domestication explains 2/3 of differential gene expression variance between domestic and wild animals; the remaining 1/3 reflects intraspecific and interspecific variation
Irina Chadaeva, Petr Ponomarenko, Rimma Kozhemyakina, Valentin Suslov, Anton Bogomolov, Natalya Klimova, Svetlana Shikhevich, Ludmila Savinkova, Dmitry Oshchepkov, Nikolay A. Kolchanov, Arcady Markel, Mikhail Ponomarenko
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022) : The Thirteenth International Multiconference]
CisCross web service: a gene set enrichment analysis to predict the upstream regulators for Arabidopsis thaliana
Lavrekha V.V., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G. , Omelyanchuk N., Zemlyanskaya E.V., Levitsky V.G., Mironova V.V.
[BGRS/SB-2022: 13th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
2020 Computer methods for visualization chromosome-specific DNA sequences in FISH images
Bogomolov AG, Karamysheva TV, Rubtsov NB
[BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”]
2019 Computer method for image enhancement in FISH diagnostics
A.G. Bogomolov, T.V. Karamysheva, N.B. Rubtsov
[BGRS\SB-2018]
2018 Alternative splicing in transcriptomes of glioma cell cultures
N.V. Gubanova, A.O. Bragin, A.G. Bogomolov, S.S. Kovalev, Y.L. Orlov
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
Computer studies of miRNA in abiotic stress response in plants
Dobrovolskaya O.B., Spitsina A.M., Galieva A.G., Tsukanov A.V., Bogomolov A.G., Orlov Y.L., Chen M.
[Integrative Bioinformatics and Systems Biology (WIBSB-2018): First Sino-Russian Workshop]
2017 Software for visualization and analysis of chromosome-specific dna sequences for fish diagnostics
Bogomolov A.G., Spitsina A.M., Podkolodnyy N.L., Rubtsov N.B.
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Дмитрия Константиновича Беляева]
2016 Interspersed repetitive sequences distribution in human chromosomes analyzed by in situ hybridization and in silico analysis
A.G. Bogomolov, T.V. Karamysheva, N.B. Rubtsov
[BGRS/SB’16, Novosibirsk]
Sex chromosome evolution in Pamphagidae grasshoppers
I.E. Jetybayev, A.G. Bugrov, O.G. Buleu, A.G. Bogomolov, N.B. Rubtsov
[BGRS\SB-2016, SBioMed-2016 and Structure\ Systems Biology — BGRS\SB-2016 Symposium Systems Biology and Biomedicine (SBioMed-2016)]
The software for estimation of telomere length on individual chromosome arms in immunopathology
G. Bogomolov, M.S. Barkovskaya, N.B. Rubtsov, V.A. Kozlov
[BGRS/SB’16, Novosibirsk]
2015 Компьютерный анализ микроскопических изображений, полученных в результате FISH гибридизации без супрессии повторенных последовательностей
Богомолов Антон Геннадьевич
[Ежегодная школа по конфокальной микроскопии и клеточным технологиям 2015]
Разработка программного обемпечения для оценки длины теломер индивидуальных хромосомчеловека методом Q-FISH
Барковская М.Ш., Богомолов А.Г., Рубцов Н.Б., Козлов А.В.
[Международная научная конференция Научного парка СПбГУ "Трансляционная биомедицина: современные методы междисциплинарных исследований в аспекте внедрения в практическую медицину"]
2014 Fluorescence in situ hybridization with microdissected DNA probes on chromo`somes of species with large genome size without suppression of repetitive DNA sequences.
A.G. Bogomolov, I.E. Jetybayev, N.L. Podkolodnyy, N.B. Rubtsov
[The 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB’14)]
2013 Analysis of images obtained by FISH with chromosome‐derived DNA probes without suppression of repetitive DNA hybridization
A.G. Bogomolov, T.V. Karamysheva, N.L. Podkolodnyy, N.B. Rubtsov
[19th International Chromosome Conference]
Toad grasshoppers (Pamphagidae, Orthoptera) as a new model of sex chromosome evolution.
Jetybayev I.E., Bugrov A.G., Bogomolov A.G, RubtsovN.B.
[19th International Chromosome Conference]
2012 Fluorescence in situ hybridization with chromosome-derived DNA probes on Opisthorchis felineus and Metorchis xanthosomus chromosomes without suppression of repetitive DNA sequences.
A.G. Bogomolov, K.S. Zadesenets, T.V. Karamysheva, N.L. Podkolodnyy, N.B. Rubtsov
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
Fluorescence in situ hybridization with chromosome-derived DNA probes on Opisthorchis felineus and Metorchis xanthosomus chromosomes without suppression of repetitive DNA sequences.
A.G. Bogomolov, K.S. Zadesenets, T.V. Karamysheva, N.L. Podkolodnyy, N.B. Rubtsov
[IV международная Школа молодых ученых "Биоинформатика и системная биология"]
2011 Разработка программного обеспечения микроскопического анализа биологических объектов.
Богомолов А.Г., Подколодный Н.Л., Рубцов Н.Б.
[Третья школа молодых ученых “Биоинформатика и системная биология”]
2010 Computer support system development for biological objects research in microscopy
A.G. Bogomolov, N.L. Podkolodnyy, N.B. Rubtsov
[BGRS/SB’10, Novosibirsk]
2009 Анализ изображений биологических объектов
Богомолов А.Г.
[XLVII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-47) г.Новосибирск, 11 – 15 апреля 2009 г.]

Гранты

2022 Популяционное исследование мужского репродуктивного потенциала: оценка возможностей полно-экзомного секвенирования и идентификация новых генов, ассоциированных с ослабленным сперматогенезом
Осадчук Людмила Владимировна Осадчук Александр Владимирович Клещев Максим Александрович Васильев Геннадий Владимирович Богомолов Антон Геннадьевич Онопченко Маргарита Андреевна Колмыков Семён Константинович Прасолова Мария Анатольевна

2019 Популяционное исследование мужского репродуктивного потенциала: оценка возможностей полно-экзомного секвенирования и идентификация новых генов, ассоциированных с ослабленным сперматогенезом
Осадчук Людмила Владимировна, Осадчук Александр Владимирович, Пономаренко Михаил Павлович, Васильев Геннадий Владимирович, Игнатьева Елена Васильевна, Клещев Максим Александрович, Богомолов Антон Геннадьевич, Чадаева Ирина Витальевна, Колмыков Семен Константинович, Даниленко Анна Дмитриевна

2018 Изучение клинического значения сверхчисленных маркерных хромосом человека с помощью молекулярно-цитогенетических методов анализа
Карамышева Татьяна Витальевна, Богомолов Антон Геннадьевич, Кузнецов Сергей Борисович, Елисафенко Евгений Анатольевич, Орищенко Константин Евгеньевич, Закирова Эльвира Гамиловна

2016 Разработка новых методов визуализации и анализа хромосомоспецифичных последовательностей ДНК для FISH-диагностики
Богомолов А.Г., Кулакова Е.В., Спицина А.М., Черный В.С.

2014 Физическое картирование и структурно-функциональная организация хромосом планарии Macrostomum lignano (Platyhelminthes, Turbellaria) как модельного объекта для изучения механизмов регенерации и старения
Задесенец Кира Сергеевна Сормачева Ирина Дмитриевна Джетыбаев Ильяс Еркинович Богомолов Антон Геннадьевич

2013 The development of the method for image analysis of FISH performed with microdisstcted DNA-probes without suppression of repetitive DNA hybridization
Богомолов А.Г., Джетыбаев И.Е.


Патенты

2023 «База данных дифференциально экспрессирующихся генов крыс как модельных объектов заболеваний человека (RatDEGdb) /A database of differentially expressed genes in rats as model objects for human diseases (RatDEGdb)»
Чадаева И.В., Ершов Н.И., Подколодный Н.Л., Кожемякина Р.В., Рассказов Д.А., Богомолов А.Г., Кондратюк Е.Ю., Шихевич С.Г., Рязанова М.А., Федосеева Л.А., Редина О.Е., Кожевникова О.С., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г., Маркель А.Л., Пономаренко М.П., Ощепков Д.Ю.

2020 Базы данных: «Репродуктивный потенциал мужского населения России (РПМ) / Database of Reproductive potential of Russian men (RPM)»
Богомолов А.Г., Осадчук А.В., Осадчук Л.В.

2018 Визуализация хромосомоспецифичных последовательностей ДНК при проведении FISH / Visualization chromosome-specific signals in FISH-images (VisualCS)
Богомолов А.Г., Подколодный Н.Л., Рубцов Н.Б.

База данных «Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов человека при вторичной глиобластоме (ДАСГГ)» / «Differential Alternative Splicing of Human Genes in secondary Glioblastome (DASGG)»
Брагин А.О., Губанова Н.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Цуканов А.В., Леберфарб Е.Ю., Орлов Ю.Л.

База данных «Дифференциальный альтернативный сплайсинг генов крыс, селектированных по агрессивному поведению (ГК-АСАП)» / «Differential alternative splicing of rat genes selected for aggressive behavior (RG-ASAB)»
Брагин А.О., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Богомолов А.Г., Кожемякина Р.В., Маркель А.Л., Орлов Ю.Л

2016 Оценка длины теломерных районов хромосом (МеТеЛен)/Measurement of telomere length on chromosomes (MeTeLen)
Богомолов А.Г. Барковская М.Ш. Рубцов Н.Б.


Диссертации

2019 Разработка метода визуализации хромосомоспецифичных последовательностей ДНК при проведении FISH [Кандидат]
© 2010-2024 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.