ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Бабенко Владимир Николаевич, к. б. н.

Подразделение: 006. Лаб. молекул. генетики человека
Совместительство: 089. Лаб. моделирования нейропатологий
Должность: старший научный сотрудник
Комната: 3303
Email: bob@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*3303


Публикации

2017 Genomic landscape of CpG rich elements in human genome
Babenko V.N., Chadaeva I.V., Orlov Y.L.
[BMC Evol. Biol]
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population
Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak
[Archaeological and Anthropological Sciences]
Программа анализа геномного распределения хромосомных контактов в ядре клетки, по данным полученным по технологиям ChIA-PET и Hi-C
Кулакова Е.В., Спицина А.М., Богомолов А.Г., Орлова Н.Г., Дергилев А.И., Чадаева И.В., Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л.
[Программные системы: теория и приложения]
2016 Analysis of differential gene expression by RNA-seq data in brain areas of laboratory animals
Babenko V.N., Bragin A.O., Spitsina A.M., Chadaeva I.V., Galieva E.R., Orlova G.V., Medvedeva I.V., Orlov Y.L.
[Journal of Integrative Bioinformatics]
Association of IL28B and IL10 gene polymorphism with predisposition to tick-borne encephalitis in a Russian population
Barkhash A.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romaschenko A.G.
[TICKS TICK-BORNE DIS]
Haplotype analysis of the HFE gene among populations of Northern Eurasia, in patients with metabolic disorders or stomach cancer, and in long-lived people
Mikhailova SV, Babenko VN, Ivanoshchuk DE, Gubina MA, Maksimov VN, Solovjova IG, Voevoda MI.
[BMC GENET]
Heterogeneity of Brain Ribosomal Genes Expression Following Positive Fighting Experience in Male Mice as Revealed by RNA-Seq
Smagin D.A., Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Orlov Y.L., Babenko V.N., Kudryavtseva N.N.
[MOL NEUROBIOL]
The Dynamics of the Composition of mtDNA Haplotypes of the Ancient Population of the Altai Mountains from the Early Bronze Age (3rd Millennium BC) to the Iron Age (2nd-1st Centuries BC)
Gubina MA, Kulikov IV, Babenko VN, Chikisheva TA, Romaschenko AG, Voevoda MI, Molodin VI.
[Genetika]
Transcriptome profiles of gene expression in brain of male mice with repeated experience of aggression as revealed by RNA-Seq
Kudryavtseva N.N., Smagin D.A., Kovalenko I.L., Galyamina A.G., Orlov Y.L., Babenko V.N.
[EUR NEUROPSYCHOPHARM]
[Gene Polymorphism of the c-fms, ITGB3,CCR2, and DBH genes in the populations of old believers of the Tyumen oblast and Russian residents of Novosibirsk].
Gubina MA, Babenko VN, Ivanoshchuk DE, Shuryaeva AK, Latieva OO, Solov'eva IG, Ponomareva MN, Konovalova NA, Maksimov VN, Voevoda MI.
[Mol Biol (Mosk).]
Полиморфизм генов CD209 и TLR3 в популяциях Северной Евразии
Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Воевода М.И., Ромащенко А.Г.
[Генетика]
Эволюция CpG-островов путем тандемных дупликаций
Бабенко В.Н., Орлов Ю.Л., Исакова Ж.И., Антонов Д.А., Воевода М.И.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2015 117 Analysis of SNP containing sites in human genome using text complexity estimates
Nataly S. Safronova, Vladimir N. Babenko, Yuriy L. Orlov
[Journal of Biomolecular Structure and Dynamics]
19 Implication of transposons distribution on chromatin state and genome architecture in human
Vladimir N. Babenko, Vladimir F. Matvienko, Nataly S. Safronova
[Journal of Biomolecular Structure and Dynamics]
Полиморфизм гена TRPM8 в кыргызской популяции:возможная связь с высокогорной адаптацией.
Бабенко ВН., Исакова ЖТ., Талайбекова ЭТ., Асамбаева ДА., Кобзев ВФ., Потапова ТА., Воевода МИ., Алдашев АА.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2014 Genetic Organization of Interphase Chromosome Bands and Interbands in Drosophila melanogaster.
Zhimulev IF, Zykova TY, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES.
[PLoS One]
The roles of the monomer length and nucleotide context of plant tandem repeats in nucleosome positioning
Levitsky VG, Babenko VN, Vershinin AV
[J BIOMOL STRUCT DYN]
Анализ аутосомных микросателлитных ДНК-локусов в геноме кыргызов.
Исакова ЖТ, Бабенко ВН, Асамбаева ДА, Талайбекова ЭТ, Алдашев АА
[Доклады нациаональной академии наук Кыргызской Распублики]
Ассоциация полиморфизмов TRPM8 с липидами крови и антропометрическими показателями в русской популяции.
Potapova TA, Babenko VN, Kobzev VF, Romashchenko AG, Maksimov VN, Voevoda MI.
[B EXP BIOL MED+]
ПОЛНОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ ПУЛИРОВАННЫХ ВЫБОРОК ДНК КОГОРТ ЧЕЛОВЕКА
В.Н. Бабенко, В.Н. Максимов, Е.В. Кулакова, Н.С. Сафронова, М.И. Воевода, Е.И. Рогаев
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2013 Adult Opisthorchis felineus major protein fractions deduced from transcripts: Comparison with liver flukes Opisthorchis viverrini and Clonorchis sinensis.
Pomaznoy M., Tatkov S., Katokhin A., Afonnikov D., Babenko V., Furman D., Brusentsov I., Belavin P., Najakshin A., Guselnikov S., Vasiliev G., Sivkov A., Prokhortchouk E., Skryabin K., Mordvinov V.
[EXP PARASITOL]
Гаплотипическое разнообразие мтДНК и У-хромосомы в популяциях Алтай- Саянского района
Губина МА, Дамба ЛВ, Бабенко ВН, Ромащенко АГ, Воевода МИ
[RUSS J GENET+]
ПОЛИМОРФИЗМ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В ПОПУЛЯЦИЯХ КОРЕННЫХ ЖИТЕЛЕЙ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА
М. А. Губина, Л. А. Гырголькау, В. Н. Бабенко, Л. Д. Дамба, В. Н. Максимов, М. И. Воевода
[RUSS J GENET+]
Эффект суппрессии P-элементов с маркерным геном mini-white в межгенных районах DROSOPHILA MELANOGASTER
Бабенко В.Н., Матвиенко В. ф.
[Цитология]
2012 Drosophila melanogaster Genome: Correlation of Chromatin State with Splicing and Transcription Regulation
Babenko VN, Matvienko VF, Zykov IA
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Nucleosome Organization in Plant DNA Satellite Sequences
Babenko VN, Kutashev KO, Matvienko VF
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Single nucleotide polymorphism in the promoter region of the CD209 gene is associated with human predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis
Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Brinton M.A., Voevoda M.I.
[ANTIVIR RES]
НУКЛЕОСОМНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ В САТЕЛЛИТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ ДНК РАСТЕНИЙ
В.Н. Бабенко К.О. Куташев В.Ф. Матвиенко
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2011 A method for generating selective DNA probes for the analysis of C-negative regions in human chromosomes.
Morozkin ES, Loseva EM, Karamysheva TV, Babenko VN, Laktionov PP, Vlassov VV, Rubtsov NB.
[CYTOGENET GENOME RES]
Identical Functional Organization of Nonpolytene and Polytene Chromosomes in Drosophila melanogaster.
Vatolina TY, Boldyreva LV, Demakova OV, Demakov SA, Kokoza EB, Semeshin VF, Babenko VN, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF.
[PLoS One]
Identification and molecular genetic characterization of the polytene chromosome interbands in Drosophila melanogaster
Vatolina TIu, Demakov SA, Semeshin VF, Makunin IV, Babenko VN, Beliaeva ES, Zhimulev IF.
[RUSS J GENET+]
Linkage and association analyses of glaucoma related traits in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population
Axenovich T, Zorkoltseva I, Belonogova N, van Koolwijk L, Borodin P, Kirichenko A, Babenko V, Ramdas W, Amin N, Despriet D, Vingerling J, Lemij H, Oostra BA, Klaver C, Aulchenko Y, van Duijn C.
[J MED GENET]
Protein composition of interband regions in polytene and cell line chromosomes of Drosophila melanogaster.
Demakov SA, Vatolina TY, Babenko VN, Semeshin VF, Belyaeva ES, Zhimulev IF.
[BMC GENOMICS]
Геном Drosophila melanogaster: cвязь состояния хроматина с регуляцией сплайсинга и транскрипции
Бабенко ВН, Матвиенко ВФ, Зыков ИА
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Полиморфизм гена HFE у населения Северной Азии
Михайлова С.В., Ромащенко А.Г., Бабенко В.Н., Губина М.А., Соболева Д.Е., Кобзев В.Ф., Воевода М.И
[Вестник РАМН]
2010 Does drive toward canonic exonic splicing sites exist in mammals
Babenko V, Ward W, Ruvinsky A
[J MOL EVOL]
Gene density profile reveals the marking of late replicated domains in the Drosophila melanogaster genome
Belyakin SN, Babenko VN, Maksimov DA, Shloma VV, Kvon EZ, Belyaeva ES, Zhimulev IF.
[Chromosome Research]
Paucity and preferential suppression of transgenes in late replication domains of the D. melanogaster genome
Babenko V.N., Makunin I.V., Brusentsova I.V., Belyaeva E.S., Maksimov D.A., Belyakin S.N., Maroy P., Vasil’eva L.A., Zhimulev I.F.
[BMC GENOMICS]
The ethnospecific distribution of the HFE haplotypes for IVS2(+4)t/c, IVS(-44)t/c, and IVS5(-47)g/a in populations of Russia and possible effects of these single-nucleotide polymorphisms in splicing
Mikhailova S.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romashchenko A.G.
[GENET TEST]
Variability in the 2'-5'-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease
Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A.
[J INFECT DIS]
Интеркалярный хроматин в геноме Drosophila
Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Андреева ИС, Андреенкова АВ, Бабенко ВН, Белякин СН, Болдырева ЛС, Брусенцова ИС, Демаков СН, Зыков ИА, Кокоза ЕП, Колесникова ТН, Максимов ДН, Макунин ИВ, Пиндюрин АВ, Семешин ВФ, Хорошко ВА
[RUSS J GENET+]
Ландшафт альтернативного сплайсинга в геноме Drosophila melanogaster
Бабенко В.Н., Айтназаров Р.Б., Гончаров Ф.В., Жимулев И.Ф.
[RUSS J GENET+]
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека, связанный с предрасположенностью к тяжелым формам клещевого энцефалита, в популяциях Северной Евразии
Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И.
[Molecular Biology]
2009 Характеристика молекулярно-генетической организации интеркалярного гетерохроматина в районе 10А-В D. melanogaster
Бабенко ВН, Похолкова ГС, Кокоза ЕВ, Андреенкова НС, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
2008 Оценка потенциальной функциональной значимости полиморфизмов IVS2(+4) t/c, IVS4(-44) t/c и IVS5(-47) a/g гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом человека
Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Воевода М.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г.
[Математическая биология и биоинформатика]
Полиморфизм холодового рецептора TPRM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока
Потапова ТА, Юдин НС, Бабенко ВН, Пилипенко ИВ, Кобзев ВФ, Гырголькау ЛА, Воевода МИ
[Информационный вестник ВОГИС]
2007 Long-term trends in evolution of indels in protein sequences
Wolf Y, Madej T, Babenko V, Shoemaker B, Panchenko AR.
[BMC EVOL BIOL]
2006 Signs of positive selection of somatic mutations in human cancers detected by EST sequence analysis
Babenko VN, Basu MK, Kondrashov FA, Rogozin IB, Koonin EV.
[BMC CANCER]
2005 Analysis of evolution of exon-intron structure of eukaryotic genes
Rogozin IB, Sverdlov AV, Babenko VN, Koonin EV
[BRIEF BIOINFORM]
Conservation versus parallel gains in intron evolution
Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV
[NUCLEIC ACIDS RES]
2004 Comparative analysis of complete genomes reveals gene loss, acquisition and acceleration of evolutionary rates in Metazoa, suggests a prevalence of evolution via gene acquisition and indicates that the evolutionary rates in animals tend to be conserved.
Babenko VN, Krylov DM
[NUCLEIC ACIDS RES]
Preferential loss and gain of introns in 3' portions of genes suggests a reverse-transcription mechanism of intron insertion
Sverdlov AV, Babenko VN, Rogozin IB, Koonin EV
[GENE]
Prevalence of intron gain over intron loss in the evolution of paralogous gene families
Babenko VN, Rogozin IB, Mekhedov SL, Koonin EV
[NUCLEIC ACIDS RES]
Reconstruction of ancestral protosplice sites
Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV
[CURR BIOL]
2003 Computational analysis of mutation spectra
Rogozin IB, Babenko VN, Milanesi L, Pavlov YI
[BRIEF BIOINFORM]
Evidence of splice signal migration from exon to intron during intron evolution
Sverdlov AV, Rogozin IB, Babenko VN, Koonin EV
[CURR BIOL]
2001 The contribution of exon-skipping events on chromosome 22 to protein coding diversity.
Hide WA, Babenko VN, van Heusden PA, Seoighe C, Kelso JF
[GENOME RES]
1999 GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот
Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон
[BIOFIZIKA+]
Integrated databases and computer systems for studying eukaryotic gene expression.
Kolchanov N.A., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Ananko E.A., Kolpakov F.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Goryachkovskaya T.N., Stepanenko I.L., Merkulova T.I., Babenko V.N., Ponomarenko J.V., Kochetov A.V., Podkolodny N.L., Vorobyev D.G., Lavrushev S.V., Grigorovich D.A., Kondrakhin Yu.V., Milanesi L., Wingender E., Solovyev V.V., Overton G.C.
[BIOINFORMATICS]
Investigating extended regulatory regions of genomic DNA sequences
Babenko VN, Kosarev PS, Vishnevsky OV, Levitsky VG, Basin VV, Frolov AS
[BIOINFORMATICS]
Recognition of NFATp/AP-1 composite elements within genes induced upon the activation of immune cells.
Kel A, Kel-Margoulis O, Babenko V, Wingender E.
[J MOL BIOL]
Use of a rank correlation coefficient for comparing mutational spectra
Babenko VN, Rogozin IB
[BIOFIZIKA+]
1998 A genetic algorithm for designing gene family-specific oligonucleotide sets used for hybridization: the G protein-coupled receptor protein superfamily
Kel A, Ptitsyn A, Babenko V, Meier-Ewert S, Lehrach H.
[BIOINFORMATICS]
Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features.
Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA.
[FEBS LETT]
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome.
N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer
[Proc. Int. Conf. Intell. Syst. Mol. Biol. (ISMB)]
1996 Олигонуклеотидные словари изофункциональных семейств генов, кодирующих белок
Колчанов Н.А., Бабенко В.Н., Вишневский О.В., Кель А.Э.
[Доклады Академии Наук]
1995 Identification of cDNA sequences by specific oligonucleotide sets. Computer tool and application.
Kolchanov NA, Vishnevsky OV, Kel AE, Shindyalov IN
[Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol]
Распределение транскриптов Bsp-повторов Canidae в почке песца: структурное сходство Bsp-повторов с SINEs
Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Ромащенко А.Г., Беляева Т.А., Мелиди Н.Н., Лавриненко В.А., Гувакова Т.В., Иванова Л.Н.
[Доклады Академии наук СССР]
1991 Comparison of asymptotic tests of the Hardy-Weinberg distribution.
Ginzburg E.Kh, Axenovich TI, Babenko VN
[Annals of Human Genetics]

Монографии

2016 Анализ экспрессии генов и расположения сайтов связывания транскрипционных факторов в геноме по данным высокопроизводительного секвенирования / Монография. отв. ред. Ю.Л. Орлов; - Н. Изд-во «Академиздат», 2016, 136 с.
Ю.Л. Орлов, В.Н. Бабенко, А.Г. Богомолов, Э.Р. Галиева, И.В. Чадаева

Дифференциально экспрессирующиеся гены в мозге мышей линии C57BL/6J, ассоциируемые с агонистистическими взаимодействиями.
Н.Н. Кудрявцева, Д.Ф. Смагин, И. Л. Коваленко Ф.Г. Галямина, В. Н. Бабенко

2013 Degrees of Freedom.
Ponomarenko M, Babenko V, Kochetov A, Kolchanov N

2006 Dollo parsimony and the reconstruction of genome evolution
Igor B. Rogozin · Yuri I. Wolf · Vladimir N. Babenko · Eugene V. Koonin


Конференции

2017 ALTERNATIVE SPLICING, ISOFORMS AND ROLE OF GRIN1 GENE EXPRESSION IN BEHAVIOR OF RATS SELECTED BY AGGRESSIVE BEHAVIOR
Babenko V.N., Bragin A.O., Chadaeva I.V.
[БЕЛЯЕВСКИЕ ЧТЕНИЯ, Международная конференция, посвященная 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева]
2016 Differential alternative splicing in brain tissues of rats selected by aggressive behavior
Babenko V.N., Bragin A.O., Chadaeva I.V., Orlov Y.L.
[BGRS 2016]
Analysis of Differential Gene Expression by RNA-seq Data in Brain Areas of Laboratory Animals
Yuriy Orlov, Anastasia Spitsina,Irin a Medvedeva,Anatoly Bragin, Vladimir Babenko
[Integrated Bioinformatics symposium]
Analysis of aggressive behavior by whole RNA sequencing in brain compartments
V.N. Babenko, A.O. Bragin, I.V. Medvedeva, I.V. Chadaeva, A.I. Dergilev, A.M. Spitsyna, N.N. Kudriavtseva, A.L. Markel, Y.L. Orlov
[Нейроинформатика 2016]
Clustering of CpG rich elements in gene dense region
Babenko V. N., Chadaeva I., Orlov Y. L.
[Belgrade Bioinformatics Conference]
Computer Analysis of RNA-seq Data of Laboratory Rats with Aggressive Behavior
Anatoly O. Bragin*, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel
[SocBin Bioinformatics 2016]
Gene ontology analysis and network reconstruction for genes related to aging diseases and behavior
I.V. Chadaeva, O.V. Saik, V.N. Babenko
[BGRS 2016]
Human genetic predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced disease: possible involvement of polymorphism in chemokine and interleukin genes
Barkhash A.V., Babenko V.N., Voevoda M.I., Romaschenko A.G.
[International Scientific Conference “Viruses 2016 - At the Forefront of Virus-Host Interactions”]
Possible role of human interleukin and chemokine genes in the control of tick-borne encephalitis virus infection
Barkhash A., Babenko V, Romaschenko A.
[EMBO Symposium “Innate Immunity in Host-Pathogen Interactions”]
RNA-SEQ DATA ANALYSIS OF RATS WITH AGGRESSIVE BEHAVIOR IN THREE BRAIN AREAS
A.O. Bragin, A.L. Markel, V.N. Babenko, I.V. Chadaeva, E.S. Tiys, Y.L. Orlov
[BGRS-2016]
Альтернативный сплайсинг и дифференциальная экспрессия генов в тканях головного мозга крыс, селектированных по агрессивности
Бабенко В.Н., Брагин А.О., Чадаева И.В., Орлов Ю.Л.
[III Международной научной конференции «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы»]
2015 Analysis of gene location relative to chromosome loops and topological chromosome domains by ChIA-PET and Hi-C
Orlov Y.L., Kulakova E.V., Spitsina A.M., Svichkarev A.V., Babenko V.N., Li G.
[3D Genome Workshop]
CTCF binding sites and gene expression analysis in genome scale by sequencing data
Kulakova E.V., Spitsina A.M., Safronova N.S., Svichkarev A.V., Dergilev A.I., Ponomarenko M.P., Babenko V.N., Hong P., Li G., Orlov Y.L.
[7th International Young Scientists School “Systems biology and bioinformatics” SBB-2015]
Chromosome 19 enigma pursue: what's currently unraveled.
Babenko VN
[Chromosoma 2015]
Computer Tools for Gene Expression Data Processing and Correlation Analysis
Babenko V.N., Orlov Y. L., Spitsyina A. M. Podkolodnaya N.
[Computational systems biology and bioinformatics (CSBio 2015)]
Gene Expression Analysis in Brain Areas of Laboratory Rats with Aggressive Behavior by RNA-seq Data
Anatoly O. Bragin, Vladimir N. Babenko, Anastasia M. Spitsina, Ekaterina V. Kulakova, Irina V. Medvedeva, Irina V. Chadaeva, Yuriy L. Orlov, Arcady L. Markel
[CSBio’2015]
Integrative analysis of antisense transcripts in plants
Orlov Y.L., Dobrovolskaya O., Babenko V.N., Safronova N.S., Chen M.
[The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology” PlantGen 2015]
Statistical analysis of chromosome contacts by ChIA-PET and Hi-C technologies
Orlov Y.L., Kulakova E., Spitsina A., Babenko V.
[Future of Biomedicine 2015 Conference]
Tale of the transposons on chromatin landscape
Babenko V. N., Matvienko V. F.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, 2015 Moscow]
2014 TRANSPOSONS VS GENES: SURVIVAL STRATEGIES
Matvienko V.F. Babenko V.N.
[BGRS\SB-2014]
2012 “Where ends meet”: gene orientation paradigm genome wide.
Бабенко В.Н.
[Хромосома 2012, Новосибирск, 2-7 сентября]
2011 Nucleosome organization in plant satellites
Babenko VN, Matvienko VF, Vershinin AS, Levitsky AG
[Wheat Genetic Resources and Genomics]
Nucleosome phasing grid in plant satellites
Бабенко ВН
[Современные методы математики, инофрматики и биоинформатики, посвященная 100-лектию со дня рождения члена - корреспондента АН СССР Алексея Андреевича Ляпунова]
SNP polymorphism of cold and mentol receptor 1 (CMR1, TRPM8) in native and caucasian populations of North Asia
Voevoda M., Potapova T., Babenko V., Pilipenko I., Yudin N., Kulikov I., Romaschenko A.
[Human Genome Meeting]
Single nucleotide polymorphism rs2287886 in the promoter region of the CD209 gene is associated with human predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis
Barkhash A., Perelygin A., Babenko V., Brinton M., Voevoda M.
[3rd EMBO Conference on Host Genetic Control of Infectious Diseases]
Исследование регуляции сплайсинга в нервных тканях
Бабенко ВН, Матвиенко ВФ
[Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика]
2010 2'-5'-oligoadenylate synthetase genes polymorphism, associated with predisposition to severe forms of tick-borne encephalitis, in human North Eurasian populations
Barkhash A.V., Babenko V.N., Kobzev V.F., Romaschenko A.G., Voevoda M.I.
[10th International Conference on Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics of Infectious Diseases (MEEGID X)]
Polymorphism in the 2-5-oligoadenylate synthetase gene cluster is associated with human resistance/susceptibility to tick-borne encephalitis virus induced disease
Barkhash A.V., Perelygin A.A., Babenko V.N., Myasnikova N.G., Pilipenko P.I., Romaschenko A.G., Voevoda M.I., Brinton M.A.
[Ninth International Symposium on Positive-Strand RNA Viruses]
Полиморфизм генов 2'-5'-олигоаденилатсинтетаз (OAS) человека в популяциях Северной Евразии
Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г., Воевода М.И.
[IV Международная Школа молодых ученых по молекулярной генетике «Геномика и биология клетки».]
2009 Alnterniative landscape of D. melanogaster
Бабенко В.Н.
[Chromoosoma 2009, Novosibirsk]
Gene density in the late replicated domains of Drosophila
Belyakin S. N., Babenko V.N., Maximov D.A., Shloma V.V., Kvon E.Z., Belyaeva E.S., Zhimulev I.F.
[Chromoosoma 2009, Novosibirsk]
Investigating Branch point consensus of human
Babenko V. N. Goncharov F.P. Romaschenko AG, Zhimulev IF
[MCCMB 2009, Moscow]
2008 Intron landscape of human genome
Maximov DA, Babenko VN
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
Оценка потенциальной функциональной значимости полиморфизмов IVS2 (+4) t/c, IVS4 (-47) t/c, and IVS5 (-44) a/g гена HFE, ассоциированного с наследственным гемохроматозом человека
Михайлова С.В., Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Воевода М.И., Кобзев В.Ф., Ромащенко А.Г.
[II-ая Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика" г. Пущино Московской области 7-13 сентября 2008 г.]
2001 Reconstructing ORFs for the EST and mRNA Assemblies in the AllGenes Gene Index Project
Vladimir Babenko, Brian Brunk, Jonathan Crabtree, Li Li, Christian Stoeckert
[The third Georgia Tech - Emory International Conference on Bioinformatics]
2000 Alu subfamilies in the expressed sequences
Babenko VN, Hide W
[Genome Sequencing and Biology]

Гранты

2015 Гранты выдающимся ученым за рубежом
Бабенко В. Н. Рогаев Е. И.

Mongolian population
16 человек

Компьютерное исследование геномов эукариот
20 человек

Анализ генетических полиморфизмов адаптации к окружающей среде и диабета II типа у монгольских бурят
Бабенко Владимир Николаевич, Вишневский Олег Владимирович, Медведева Ирина Вадимовна, Орлов Юрий Львович, Посух Ольга Леонидовна, Сафронова Наталья Сергеевна, Китайские партнеры - Проф. Минг Чен, Проф. Хайхуа Бай

2014 Экспериментальные генетические модели агрессивного и толерантного поведения: исследование молекулярно-генетических механизмов с использованием технологий секвенирования следующего поколения (RNA-Seq)
17 человек

Поиск общих генетических факторов, связанных с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым различными флавивирусами
Ромащенко А.Г., Бархаш А.В., Бабенко В.Н., Михайлова С.В., Иванощук Д.Е.

2011 Изучение связи полиморфизма генов неспецифического иммунного ответа с предрасположенностью человека к заболеваниям, вызываемым флавивирусами
Ромащенко А.Г., Бабенко В.Н., Бархаш А.В., Кобзев В.Ф., Михайлова С.В., Иванощук Д.Е.


Научное руководство

2016 Разработка пакета визуализации структурных характеристик генетического текста
Орлов Юрий Львович Бабенко Владимир Николаевич
[Спицина Анастасия Михайловна]

Учебные курсы

2013 Экзон-интронная структур генов эукариот: сплайсинг как эволюционный фактор.
Бабенко В.Н.

2011 Экзон-интронная структур генов эукариот

Диссертации

1992 Ислледование статистических критериев для проверки распределения Харди-Вайнберга [Кандидат]
© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.