ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Лихошвай Виталий Александрович, д. б. н.

Подразделение: 013. Лаб. молекулярно-генетич. систем
Должность: ведущий научный сотрудник
Комната: 3102
Email: likho@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*3102


Персональная информация

Рабочий адрес

Г.  Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия

Дата рождения

29.06.1954

Образование

высшее, НГУ – 1976 – специалист (математика и прикладная математика)

кбн - 1985 (молекулярная биология)

дбн - 2008 (математическая биология, биоинформатика) 

Награды

 

Область научных интересов

математика, биоинформатика, биология,  эволюция

Область рабочих интересов

математическое моделирование динамических систем, математическая биология гена, математическая теория эволюции

Хобби

 

Контакты в социальных сетях, блогах и т.д.

 



Публикации

2017 Chaos and hyperchaos in simple gene network with negative feedback and time delays.
Khlebodarova T.M., Kogai V.V., Fadeev S.I., Likhoshvai V.A.
[J. Bioinf. Comput. Biol.]
Dynamic landscape of the local translation at activated synapses.
Khlebodarova T.M., Kogai V.V., Trifonova E.A., Likhoshvai V.A.
[MOL PSYCHIATRY]
MAMMOTH: A NEW DATABASE FOR CURATED MATHEMATICAL MODELS OF BIOMOLECULAR SYSTEMS
Fedor Kazantsev, Ilya Akberdin, Sergey Lashin, Natalia Ree, Vladimir Timonov, Alexander Ratushny, Tamara Khlebodarova, Vitaly Likhoshvai
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Multiple Scenarios of Transition to Chaos in the Alternative Splicing Model
Kogai V.V., Likhoshvai V.A., Fadeev S.I., Khlebodarova T.M.
[INT J BIFURCAT CHAOS]
Phenotypic variability of bacterial cell cycle: mathematical model.
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[Математическая биология и биоинформатика]
О связи свойств одномерных отображений управляющих функций с хаосом в уравнениях специального вида с запаздывающим аргументом.
Лихошвай В.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
Стазис и периодичность в эволюции глобальной экосистемы: минимальная логистическая модель
Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
2016 Chaos and Hyperchaos in a Model Of Ribosome Autocatalytic Synthesis
Лихошвай В.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[SCI REP-UK]
On numerical study of periodic solutions of a delay equation in biological models.
Fadeev S.I., Kogai V.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[Journal of Applied and Industrial Mathematics]
On the control mechanisms of the nitrite level in Escherichia coli cells: the mathematical model.
Khlebodarova T.M., Ree N.A., Likhoshvai V.A.
[BMC MICROBIOL]
О численном исследовании периодических решений уравнения с запаздывающим аргументом в биологических моделях.
Фадеев С.И., Когай В.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Сибирский журнал индустриальной математики]
Фенотипическая множественность клеточного цикла бактерий: математическая модель
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
2015 Alternative splicing can lead to chaos
Likhoshvai V.A., Kogai V.V., Fadeev S.I., Khlebodarova T.M.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
On the distribution of auxin concentrations in root horizontal layer cells.
Novoselova E.S., Mironova V.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Механизмы регуляции экспрессии гена dps Escherichia coli в условиях стресса: реконструкция по кинетическим данным
Хлебодарова Т.М., Степанова Т.Ю., Ощепков Д.Ю., Тикунова Н.В., Бабкин И.В., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при культивировании их в условиях стационарного роста.
Ри Н.А., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
О типах законов роста бактерий
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
Сложная динамика в системах альтернативного сплайсинга мРНК: математическая модель
Когай В.В., Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И., Лихошвай В.А.
[Вычислительные технологии]
Суперкомпьютерные технологии в решении задач биоинформатики
Глинский Б.М., Кучин Н.В., Черных И.Г., Орлов Ю.Л., Подколодный Н.Л., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.
[Программные системы: теория и приложения]
2014 A New Stochastic Model for Subgenomic Hepatitis C Virus Replication Considers Drug Resistant Mutants
Nikita V. Ivanisenko, Elena L. Mishchenko, Ilya R. Akberdin, Pavel S. Demenkov, Vitaly A. Likhoshvai, Konstantin N. Kozlov, Dmitry I. Todorov, Vitaly V. Gursky, Maria G. Samsonova, Alexander M. Samsonov, Diana Clausznitzer, Lars Kaderali, Nikolay A. Kolchanov, Vladimir A. Ivanisenko
[PLoS One]
Gene Expression and Secondary mRNA Structures in Different Mycoplasma Species
В.С. Соколов, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Mathematical model of the Tat-Rev regulation of HIV-1 replication in an activated cell predicts the existence of oscillatory dynamics in the synthesis of viral components
Vitaly A Likhoshvai, Tamara M Khlebodarova, Sergei I Bazhan, Irina A Gainova, Valery A Chereshnev, Gennady A Bocharov
[BMC GENOMICS]
Mathematical modeling of bacterial cell cycle: The problem of coordinating genome replication with cell growth.
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
New evidence of an old problem: the coupling of genome replication to cell growth in bacteria
Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[RUSS J GENET+]
О распределениях концентраций ауксина в клетках горизонтального слоя корня
Новоселова Е.С., Миронова В.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2013 How multiple auxin responsive elements may interact in plant promoters: a reverse problem solution
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Savina M.S., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
MATHEMATICAL MODELING OF AUXIN TRANSPORT IN PROTOXYLEM AND PROTOPHLOEM OF ARABIDOPSIS THALIANA ROOT TIPS
Novoselova ES, Mironova VV, Omelyanchuk NA, Kazantsev FV, Likhoshvai VA
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
On the chaos in gene networks
VITALY A. LIKHOSHVAI, STANISLAV I. FADEEV,VLADISLAV V. KOGAI, TAMARA M. KHLEBODAROVA
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Pathogenesis and Treatment of HIV Infection: The Cellular, the Immune System and the Neuroendocrine Systems Perspective
V. A. Chereshnev, G. Bocharov, S. Bazhan, B. Bachmetyev, I. Gainova, V. Likhoshvai, J. M. Argilaguet, J. P. Martinez, J. A. Rump, B. Mothe, C. Brander, A. Meyerhans
[INT REV IMMUNOL]
PЕПЛИКАЦИЯ CУБГЕНОМНОГО PЕПЛИКОНА ВИPУCА ГЕПАТИТА C В ПPИCУТCТВИИ ИНГИБИТОPОВ NS3-ПPОТЕАЗЫ: CТОXАCТИЧЕCКАЯ МОДЕЛЬ
Н.В. Иваниcенко, Е.Л. Мищенко, И.P. Акбеpдин, П.C. Деменков, В.А. Лиxошвай, К.Н. Козлов, Д.И. Тодоpов, М.Г. Cамcонова, А.М. Cамcонов, Н.А. Колчанов, В.А. Иваниcенко
[МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА]
Reconstruction of the Mechanisms that Regulate the Expression of the Escherihia coli yfiA Gene under Stress Conditions.
T. M. Khlebodarova, D. Yu. Oshchepkov, N. V. Tikunova, I. V. Babkin, A. D. Gruzdev, and V. A. Likhoshvai
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Translation efficiency in yeasts correlates with nucleosome formation in promoters
Matushkin YG, Levitsky VG, Orlov YL, Likhoshvai VA, Kolchanov NA.
[J BIOMOL STRUCT DYN]
«Электронная клетка»: проблемы и перспективы.
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В., Тимонов В.С., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
Генные сети
Н.А. Колчанов, Е.В. Игнатьева, О.А. Подколодная, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Исследование математической модели перераспределения вещества в кольцевом ансамбле клеток
С. И. Фадеев, В. В. Когай, В. В. Миронова, Н. А. Омельянчук, В. А. Лихошвай
[Сибирский журнал вычислительной математики]
Моделирование утилизации нитрита клетками Escherichia coli: анализ потоков
Хлебодарова Т.М., Когай В.В., Акбердин И.Р., Ри Н.А., Фадеев С.И., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
О сдвиге регуляторного сигнала в моделях матричного синтеза.
Лихошвай В.А., Фадеев С.И.
[Сибирский журнал индустриальной математики]
Реконструкция механизмов регуляции экспрессии гена yfiA Escherichia coli в условиях стресса.
Хлебодарова Т.М., Ощепков Д.Ю., Тикунова Н.В., Бабкин И.В., Груздев А.Д., Лихошвай В.А.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Согласование темпов роста объема клетки и репликации ДНК: математическая модель.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика]
Экспрессия генов и вторичные структуры в мРНК в разных видах Mycoplasma
В.С. Соколов, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Эффективность элонгации генов дрожжей кореллирует с плотностью нуклеосомной упаковки в 5’-нетранслируемом районе.
Матушкин Ю.Г., Левицкий В.Г., Соколов В.С., Лихошвай В.А., Орлов Ю.Л.
[Математическая биология и биоинформатика]
2012 Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
Бистабильность системы утилизации нитрита Escherichia coli: анализ математической модели.
Ри Н. А., Хлебодарова Т. М., Когай В. В., Фадеев С. И., Лихошвай В. А.
[Сибирский журнал индустриальной математики]
Новые возможности системы MGSmodeller
Казанцев Ф.В., Акбердин И.Р., Подколодный Н.Л., Лихошвай В.А.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
ПОДАВЛЕНИЕ РЕПЛИКАЦИИ СУБГЕНОМНОГО РНК РЕПЛИКОНА ВИРУСА ГЕПАТИТА С ИНГИБИТОРОМ NS3 ПРОТЕАЗЫ SCH 503034 В HUH-7 КЛЕТКАХ: СТОХАСТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ
Е.Л. Мищенко, Н.В. Иванисенко, И.Р. Акбердин, П.С. Деменков, В.А. Лихошвай, Н.А. Колчанов, В.А. Иванисенко
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2010 A plausible mechanism for auxin patterning along the developing root
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Yosiphon G, Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Mjolsness E., Likhoshvai V.A.
[BMC SYST BIOL]
Metabolic Engineering in Silico
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ree M.T., Kolchanov N.A.
[APPL BIOCHEM MICRO+]
New computer technologies for construction and numerical analysis of mathematical models molecular genetic systems
I.R. Akberdin, S.I. Fadeev, Gainova I.A., F.V. Kazantsev, V.K. Korolev, V.A. Likhoshvai, A.E. Medvedev
[Progress in Analysis and its Applications]
On properties of solutions to equations of multistage substance synthesis.
Demidenko G.V., Likhoshvai V.A., Melnik I.A.
[ANAL APPL]
Studying the mathematical models for the matrix synthesis of non-regular polymers of DNA, RNA and proteins
Fadeev S.I., Likhoshvai V.A., Shtokalo D.N., Korolev V.K.
[Сибирские электронные математические известия]
О некоторых нелинейных динамических системах, моделирующих несимметричные генные сети.
Ю.А.Гайдов, В.П. Голубятников, В.А. Лихошвай
[Вестник НГУ]
О применении метода отображения по параметру для численного исследования биологических моделей// Сибирские электронные математические известия(СЭМИ) (Siberian Electronic Mathematical Reports, http://semr.math.nsc.ru, 2010, Т.7, с. 394-412
Лихошвай В.А., Фадеев С.И.
[Сибирские электронные математические известия]
О существовании и устойчивости циклов в пятимерных моделях генных сетей.
В.П. Голубятников, И.В. Голубятников, В.А. Лихошвай.
[Сибирский журнал вычислительной математики]
2009 Study of a Mathematical Model for the Autoregulation of Hes7 Protein Synthesis.
adeev S. I., Omel’yanchuk N. A., Likhoshvai V.A.
[Journal of Applied and Industrial Mathematics]
Компьютерная система интеграции модулей для автоматической генерации и численного анализа математических моделей молекулярно-генетических систем
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Гайнова И.А., Королев В.К., Медведев А.Е.
[Сибирские электронные математические известия]
Математическая модель внутриклеточного размножения вируса гриппа
Бажан С. И., Кашеварова Н. А., Хлебодарова Т. М., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А.
[BIOFIZIKA+]
Математическое моделирование метаболизма ауксина в клетке меристемы побега растения
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А
[Информационный вестник ВОГИС]
Моделирование регуляции ауксином инициации латеральных органов у Arabidopsis thaliana
В.А. Лихошвай, Н.А. Омельянчук, В.В. Миронова, Ф.В. Казанцев, И.Р. Акбердин, В.К. Королев, С.И. Фадеев, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
О связи между решениями дифференциальных уравнений с запаздывающим аргументом и бесконечномерных систем дифференциальных уравнений
Г. В. Демиденко, В. А. Лихошвай, А. В. Мудров
[Дифференциальные уравнения]
Система автоматизированной генерации математических моделей генных сетей
Казанцев Ф.В., Акбердин И.Р., Безматерных К.Д., Лихошвай В.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
2008 Исследование математической модели авторегуляции синтеза белка Hes7
Фадеев С.И., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А
[Сибирский журнал индустриальной математики]
Исследование математической модели авторегуляции синтеза белка Hes7.
Фадеев С.И., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Сибирский журнал индустриальной математики]
О математическом моделировании паттерна распределения ауксина в корне растений
Фадеев С.И., Когай В.В., Омельянчук Н.А. , Лихошвай В.А
[Сибирские электронные математические известия]
О математическом моделировании паттерна распределения ауксина в корне растений
Фадеев С.И., Когай В.В., Омельянчук Н.А. , Лихошвай В.А.
[Сибирские электронные математические известия]
2007 Study of a Model of Linear Biomolecular Synthesis with Reversible Processes.
S.I. Fadeev, V.A. Likhoshvai, D.N. Shtokalo
[Journal of Applied and Industrial Mathematics]
A mathematical model for the adenylosuccinate synthetase reaction involved in purine biosynthesis
Evgeniya A Oshchepkova-Nedosekina, Vitalii A Likhoshvai
[THEOR BIOL MED MODEL]
Correlation of codon biases and potential secondary structures with mRNA translation efficiancy in unicellular organisms
Vladimirov NV, Likhoshvai VA, Matushkin YG
[Molecular Biology]
Generalized Hill function method for modeling molecular processes
Vitaly Likhoshvai and Alexander Ratushny
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Mathematical model for suppression of subgenomic hepatitis C virus RNA replication in cell culture
Mishchenko E.L., Bezmaternykh K.D., Likhoshvai V.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Sournina N. Yu., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Study of a Model of Linear Biomolecular Synthesis with Reversible Processes
S.I. Fadeev, V.A. Likhoshvai and D.N. Shtokalo
[Journal of Applied and Industrial Mathematics]
А cellular automaton to model the development of primary shoot meristems of Arabidopsis Thaliana
Ilya Akberdin, Evgeniy Ozonov, Victoria Mironova, Nadezda Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai, Dmytry Gorpinchenko, Nikolay Kolchanov
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Математическая модель паттерна распределения ауксина в корне растения
Лихошвай В. А., Омельянчук Н. А., Миронова В. В., Фадеев С. И., Мелснесс Э. М., Колчанов Н. А.
[RUSS J DEV BIOL+]
2006 A model of Arabidopsis thaliana morphogenesis in cellular automaton terms
I. R. Akberdin, E. A. Ozonov, V.V. Mironova, D. N. Gorpinchenko,N. A. Omelyanchuk, V. A. Likhoshvai, N. A. Kolchanov
[BIOFIZIKA+]
Математическая модель репликации РНК репликона вируса гепатита С в клеточной культуре. Моделирование действия потенциальных лекарственных препаратов
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.,Иванисенко В.А.
[BIOFIZIKA+]
Математическое моделирование внутриклеточного мембранного транспорта:рецептор-опосредованный эндоцитоз и деградация липопротеинов низкой плотности
А.В. Ратушный, В.А. Лихошвай
[BIOFIZIKA+]
Моделирование морфогенеза Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата
Акбердин И. Р., Озонов Е. А., Миронова В. В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н. А., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А.
[BIOFIZIKA+]
Об одном классе систем дифференциальных уравнений с запаздывающим аргументом
Г.В. Демиденко, В.А. Лихошвай, Т.В. Котова, Ю.Е. Хропова
[SIBERIAN MATH J+]
2005 GeneNet in 2005.
E.A. Ananko, N.L. Podkolodny, I.L. Stepanenko, O.A. Podkolodnaya, D.A. Rasskazov, D.S. Miginsky, V.A. Likhoshvai, A.V. Ratushny, N.N. Podkolodnaya, and N.A. Kolchanov.
[NUCLEIC ACIDS RES]
Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития
Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
2004 Интегрированная компьютерная система по регуляции экспрессии генов эукариот.
Н. А. Колчанов, О. А Подколодная, Е. А. Ананько, Д. А. Афонников, О. В. Вишневский, Д. В. Воробьев, Е. В. Игнатьева, В. Г. Левицкий, В. А. Лихошвай, Н.А.Омельянчук, Н.Л. Подколодный, А. В. Ратушный
[Molecular Biology]
2003 Data Mining Techniques in Bioinformatics
Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V.
[Pattern Recognition and Image Analysis]
2002 GeneNet database: Description and Modeling of Gene Networks.
Kolchanov N.A., Nedosekina E.A., Ananko E.A., Likhoshvai V.A., Podkolodny N.L., Ratushny A.V., Stepanenko I.L., Podkolodnaya O.A., Ignatieva E.V., Matushkin Yu.G.
[In Silico Biology]

Монографии

2017 On the potential for multiscale oscillatory behavior in HIV
Ratushny A.V., De Leenheer P., Bazhan S.I., Bocharov G.A., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.

2010 German/Russian Network of Computational Systems Biology. R. Hofestadt and N. Kolchanov (Eds).
E.L. Mishchenko, N.V. Ivanisenko, A.M.Mishchenko, V.A.Likhoshvai, V.A. Ivanisenko, R. Hofestadt, N.A. Kolchanov

Nandbook of Drug Targeting and Monitoring. B.Andreev and V. Egorov ( Eds).
E.L. Mishchenko, K.D. Bezmaternykh, V.A. Likhoshvai, V.A. Ivanisenko, N.A. Kolchanov

Компьютерный генетический конструктор для моделирования молекулярно-генетических процессов в бактериальной клетке: анализ циклической генной сети Изд-во СО РАН, Новосибирск. 2010, Глава 6.5, С. 392-404.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.

Компьютерный генетический конструктор: математическое моделирование генетических и метаболических подсистем E. coli
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Ратушный А.В., Лашин С.А., Турнаев И.И., Подколодная О.А., Ананько Е.А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Колчанов Н.А.

Роль микроорганизмов в функционировании живых систем: фундаментальные проблемы и биоинженерные приложения
И. С. Андреева, А. В. Брянская, С. М. Жмодик, В. А. Лихошвай, Б. Б. Намсараев, Д. Ю. Рогозин, О. П. Таран, С. Е. Ткачев, Е. А. Ананько, K. Aсано, Д. А. Афонников, Т. Г. Банзаракцаева, Д. Д. Бархутова, Ж. Батаа, В. В. Бахвалова, С. И. Беликов, В. М. Белолипецкий, П. В. Белолипецкий, Т. К. Белянин, А. А. Богуш, Е. В. Болдырева, Е. Н. Болдарева, A. В. Брушков, Л. И. Бурцева, С. П. Бурюхаев, В. В. Власов, С. Н. Генова, Н. А. Гольцова, В. М. Горленко, К. В. Гунбин, Э. В. Данилова, А. Г. Дегерменджи, М. А. Дымова, Е. К. Емельянова, В. И. Жираковский, А. В. Задорожный, С. С. Ибрагимова, Л. И. Иванов, Г. В. Калмыкова, Т. П. Камынина, А. В. Качко, И. В. Козлова, Л. П. Козырева, Ю. П. Колмогоров, Н. А. Колчанов, В. Н. Компаниченко, Е. В. Лаврентьева, Е. В. Лазарева, С. А. Лашин, С. Г. Ливанов, Н. Н. Ливанова, Ю. Г. Матушкин, И. B. Морозов, О. В. Морозова, З. Б. Намсараев, С. Ф. Орешкова, Д. Ю. Ощепков, В. В. Панов, В. Н. Пармон, С. Е. Пельтек, Н. И. Печуркина, О. А. Подколодная, В. А. Пономарчук, И. Г. Прокопкин, В. Г. Пугачев, Н. М. Пуховская, Л. И. Пучкова, В. А. Рар, А. В. Ратушный, В. Е. Репин, А. С. Розанов, Е. И. Рябчикова, Ю. В. Сабитова, И. В. Саранина, Д. В. Семенова, В. А. Симонов, О. Г. Смирнова, К. Н. Сорокина, Т. Ю. Степанова, О. В. Стронин, В. В. Суслов, M. Taнака, О. С. Таранов, Н. В. Тикунова, И. И. Турнаев, Т. Торок, О. Д. Тотменина, М. Ю. Трусова, M. Утсуми, М. Л. Филипенко, Н. В. Фоменко, M. Фукуда, М. А. Хаснатинов, Т. М. Хлебодарова, Д. Д. Цыренова

Экспериментально-компьютерное конструирование и анализ бактериальных геносенсоров для детекции токсичности окружающей среды
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Лихошвай В.А., Качко А.В., Степанова Т.Ю., Ощепков Д.Ю., Задорожный А.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.

2008 «Системная компьютерная биология». Отв. Редакторы: Н.А.Колчанов, С.С.Гончаров., В.А. Лихошвай, В.А. Иванисенко , Н: Изд. СО РАН, , 2008, 761с
Н.А.Колчанов, С.С.Гончаров., В.А. Лихошвай, В.А. Иванисенко

Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование.
Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.

Компьютерная транскриптомика. Трансляция. В монографии «Системная Компьютерная Биология». Под ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Кочетов А.В., Вишневский О.В., Волкова О.А., Владимиров Н.В., Лихошвай В.А. Матушкин Ю.Г., Григорович Д.А., Нишида Х., Сараи А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Пономаренко М.П., Титов И.И., Колчанов Н.А.

Методы моделирования динамики молекулярно-генетических систем
Лихошвай В.А., Ратушный А.В., Бажан. С.И., Ощепкова Е.А., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М., Колчанов Н.А.

Моделирование эволюции сообществ: программа “Эволюционный конструктор” // В монографии: Системная компьютерная биология. Ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Лашин С.А., Суслов В.В., Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.

Теория генных сетей. В «Системная компьютерная биология». Отв. Редакторы: Н.А.Колчанов, С.С.Гончаров. В.А. Лихошвай и В.А. Иванисенко, Н: Изд. СО РАН, , 2008, с. 397-480.
Лихошвай В.А., Голубятников В.П., Демиденко Г.В., Евдокимов А.А., Матвеева И.И., Фадеев С.И.

2006 Modeling of gene expression by the delay equation. In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N.Kolchanov, R. Hofestaedt and L. Milanesi) Springer Science+Business Media, Inc. 2006, pp. 421-431.
V.A. Likhoshvai, G.V. Demidenko, S.I. Fadeev

On the problem of search for stationary points in regulatory circuits of gene networks. In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N.Kolchanov, R. Hofestaedt and L. Milanesi) Springer Science+Business Media, Inc. 2006, pp. 415-420.
V.A. Likhoshvai

Periodic trajectories and andronov-hopf bifurcations in models of gene networks. In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. Eds. N.Kolchanov, R. Hofestaedt and L. Milanesi) Springer Science+Business Media, Inc.2006, pp. 405-414.
V.P. Golubyatnikov, V.A. Likhoshvai, E.P. Volokitin, Yu.A. Gaidov, A.F. Osipov

STUDY OF THE INTERACTIONS BETWEEN VIRAL AND HUMAN GENOMES DURING TRANSFORMATION OF B CELLS WITH EPSTEIN-BARR VIRUS
E. Ananko, D. Oshchepkov, E. Nedosekina, V. Levitsky, I. Lokhova, O. Smirnova, V. Likhoshvai, N. Kolchanov.

Self-oscillations in hypothetical gene networks. In: Bioinformatics of Genome Regulation and Structure II. (Eds. N.Kolchanov, R. Hofestaedt and L. Milanesi) Springer Science+Business Media, Inc. 2006, pp. 391-404.
V.A. Likhoshvai, V.V. Kogai, S.I. Fadeev

Групповой отбор в популяции с многолетним жизненным циклом развития: разработка технологии построения портретных моделей на примере популяции земноводных. В «Биоразнообразие и динамика экосистем: информационные технологии и моделирование». Отв. Редакторы: В.К.Шумный, Ю.И.Шокин, Н.А.Колчанов. Изд. СО РАН, Новосибирск, 2006, с. 368-374.
Лихошвай В.А., Северцов А.С.

Молекулярно-эпигенетические механизмы возникновения биоразнообразия. В «Биоразнообразие и динамика экосистем: информационные технологии и моделирование». Отв. Редакторы: В.К.Шумный, Ю.И.Шокин, Н.А.Колчанов. Изд. СО РАН, Новосибирск, 2006, с. 401-411.
Лихошвай В.А., Матушкин Ю.Г.


Конференции

2017 Расстройства аутистического спектра как проявление нарушений функций синапсов.
Трифонова Е.А., Хлебодарова Т.М., Когай В.В., Лихошвай В.А.
[Всероссийская научно-практическая конференции с международным участием "Современные проблемы клинической психологии и психологии личности"]
Эмпирический критерий существования хаоса в уравнениях с запаздывающим аргументом
Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Математика в современном мире. Международная конференция, посвященная 60-летию Института математики им. С. Л. Соболева.]
Сложная динамика локальной трансляции в синапсе: математическая модель
Е.А. Трифонова, Т.М. Хлебодарова, В.В. Когай, В.А. Лихошвай
[Международная конференция, посвященная столетию со дня рождения академика АН СССР Д.К.Беляева «Беляевские чтения»]
Эмпирический критерий существования хаоса в уравнениях с запаздывающим аргументом
Лихошвай В.А., Когай В.В., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[Марчуковские научные чтения]
Membrane potential as a new factor, modulating periplasmic nitrite reductase activty.
Ree N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[The Ninth International Yong Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics”]
Стазис, периодичность и прерывистость в эволюции глобальных экосистем: математическая модель.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[III Международная конференция «Современные проблемы биологической эволюции», посвященной 130-летию со дня рождения Н.И. Вавилова и 110-летию со дня основания Государственного Дарвиновского музея]
2016 Минимальная логистическая модель эволюции глобальной экосистемы
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[VI Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика"]
Фенотипическая множественность клеточного цикла – следствие универсальных свойств сопряженной системы транскрипции-трансляции
Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[VI Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика"]
Biomolecular systems models semi-automatic reconstruction based on structural and quantitative information
F.V. Kazantsev, I.R. Akberdin, S.A. Lashin, Natalia Ree, Vladimir Timonov, A.V. Ratushny, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai
[BGRS/SB’16, Novosibirsk]
Chaos and hyperchaos in the alternative splicing model.
Kogai V.V., Likhoshvai V.A., Fadeev S.I., Khlebodarova T.M.
[The 2nd International Conference «Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology».]
Role of membrane potential in nitrite utilization by Escherichia coli cells under low substrate concentration: the mathematical model.
Ree N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[The Tenth IC on Bioinformatics of Genome Regulation\Systems Biology.]
Математическая биология гена: генные сети и хаос.
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И., Когай В.В.
[8-я международная молодежная научная школа-конференция «Теория и численные методы решения обратных и некорректных задач».]
2015 Осциллирующие и хаотические траектории в моделях генных сетей.
Голубятников В.П., Лихошвай В.А.
[Семинар, посвященный 100-летию со дня рождения Игоря Андреевича Полетаева.]
Явление хаоса в математической модели альтернативного сплайсинга мРНК
Когай В.В., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Хлебодарова Т.М.
[«Актуальные проблемы вычислительной и прикладной математики», посвященной 90-летню со дня рождения академика Г.И. Марчука.]
2014 Complex dynamics in systems of alternative mRNA splicing: a mathematical model.
Kogai V.V., Fadeev S.E., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology]
Computation modeling of vascular patterning in plant roots
ES Novoselova, VV Mironova, FV Kazantsev, NA Omelyanchuk, VA Likhoshvai
[The 9th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB’14)]
GENE NETWORKS MODELING: SPECIFICATION LANGUAGE
Kazantsev F.V.,Akberdin I.R., Podkolodnyy N.L., Likhoshvai V.A.
[Mathematical Modeling and High Performance Computing in Bioinformatics, Biomedicine and Biotechnology (MM-HPC-BBB-2014)]
KINET 1.0 - a new web database on kinetics data and parameters for E.coli metabolic pathways
Ermak T.V., Akberdin I.R., Timonov V.S., Mischenko E.L., Oshchepkova E.A., Perfilyeva O.A., Smirnova O.G., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
Kinetic modeling of pyrimidine biosynthesis is a first step to in silico bacterial cell
Akberdin I.R., Ermak T.V., Kazantsev F.V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[9th BGRS\SB-2014]
TAT-REV regulation of HIV-1 replication: Mathematical model predicts the existence of oscillatory dynamics.
Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Bazhan S.I., Gainova I.A., Chereshnev V.A., Bocharov G.A.
[9-th IC on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology,]
Кинетическое моделирование метаболических путей в бактериальной клетке
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Шестой съезд ВОГиС]
Математическое моделирование Tat-Rev регуляции репликации HIV-1
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Бажан С.И., Гайнова И.А., Черешнев В.А., Бочаров Г.А.
[V МК “Математическая биология и биоинформатика” (ICMBB'2014)]
Математическое моделирование влияния ауксина на формирование сосудистого паттерна корня растения.
Новоселова Е.С., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Казанцев Ф.В., Лихошвай В.А.
[18-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология - наука XXI века"]
О механизмах утилизации нитрита клетками Escherichia coli при микромолярных концентрациях субстрата в хемостате.
Ри Н.А., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Математическая биология и биоинформатика (ICMBB’2014)]
О типе закона роста бактериальной клетки
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[Математическая биология и биоинформатика” (ICMBB’2014)]
Реконструкция механизмов регуляции экспрессии гена dps Escherichia coli при стрессе по кинетическим данным.
Хлебодарова Т.М., Степанова Т.Ю., Ощепков Д.Ю., Бабкин И.В., Тикунова Н.В., Лихошвай В.А.
[V МК “Математическая биология и биоинформатика” (ICMBB’2014)]
Суперкомпьютерные технологии в решении задач биоинформатики
Глинский Б.М., Кучин Н.В., Черных И.Г., Орлов Ю.Л., Подколодный Н.Л., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.
[Национальный Суперкомпьютерный форум-2014 (НСКФ-2014)]
2013 Математические модели метаболических процессов в бактериальной клетке
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Методы создания, исследования и идентификации математических моделей]
Computational study of translation elongation features in Mycoplasma
В.С. Соколов, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'13)]
Mathematical modeling of gene network dynamics in E. coli
I. Akberdin, F. Kazantsev, T. Ermak, V. Timonov, T. M. Khlebodarova, V. A. Likhoshvai
[38-ой Конгресс FEBS]
KiNET – a new web database on kinetics data and parameters for E.coli
Ермак Т., Акбердин И.Р., Тимонов В.С., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Пятая международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» - 5th International Young Scientists School «Systems Biology and Bioinformatics», SBB’2013]
Gene expression and mRNA secondary structures in Mycoplasma strains
В.С. Соколов, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[Пятая международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика» - 5th International Young Scientists School «Systems Biology and Bioinformatics», SBB’2013]
The mathematical model of auxin distribution in the plant root meristem
Kazantsev F.V., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[Regional Interdisciplinary Conference – Humboldt Kolleg «Magnetic resonance as a tool for interdisciplinary research»]
MGSmodelsDB – a new database on mathematical models of biomolecular systems
F.V. Kazantsev, I.R. Akberdin, V.V. Timonov, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai
[BREW 2013: Bioinformatics Research and Education Workshop]
2012 Компьютерное моделирование динамики функционирования молекулярно-генетических систем E.coli
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ермак Т.В, Ри Н.А., Тимонов В.А., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[Четвертая международная конференция «Математическая биология и биоинформатика»]
Построение и анализ математической модели mTOR сигнального пути
Акбердин И.Р., Трифонова Е.А., Гайнова И.А., Макашева В.А., Шорина А.Р., Лихошвай В.А.
[Четвертая международная конференция «Математическая биология и биоинформатика»]
Программное обеспечение для компьютерного исследования особенностей элонгации трансляции (на примере одноклеточных организмов рода Mycoplasma)
В.С. Соколов, В.А. Лихошвай, Ю.Г. Матушкин
[XIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям]
Modeling and analysis of dynamics of the gene networks: automatic generation and storage in a new database
Akberdin I.R., Kazantsev F.V., Ree N.A., Timonov V.S., Oshchepkova E.A., Ratushny A.V., Khlebodarova T.M., Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Likhoshvai V.A.
[Международный симпозиум "Syspatho-Системная биология и медицина"]
A stochastic model for suppression of subgenomic hepatitis C virus replication in Huh-7 cells.
N.V. Ivanisenko, E.L. Mishchenko, I.R. Akberdin, P.S. Demenkov, V.A. Likhoshvai, M.G. Samsonova, D. Clausznitzer, L. Kaderali, N.A. Kolchanov and V.A. Ivanisenko
[Международный симпозиум "Syspatho-Системная биология и медицина"]
Correlation between transcription efficiency initiation and translation efficiency for Sacharromyces cereviciae and Schizosaccharomyces_pombe
Matushkin Y.G., Levitsky V.G., Orlov Y.L., Likhoshvai V.A.
[The eighth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure \ System biology (BGRS\SB'2012)]
ABOUT SHIFT FUNCTION OF IRREGULAR POLYMERS SYNTHESIS IN MODELS OF THE MATRIX SYNTHESIS.
V.A. Likhoshvai, S.I. Fadeev, T.M. Khlebodarova
[The Eighth IC on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology]
HIGH PERFORMANCE COMPUTING WITH MGSMODELLER
Kazantsev F.V., Akberdin I.R., Mironova V.V., Podkolodnyy N.L., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
KINET – A NEW WEB DATABASE ON KINETICS DATA AND PARAMETERS FOR E. COLI
Ermak T., Timonov V.S., Akberdin I.R., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
MATHEMATICAL BIOLOGY OF GENE
Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
MATHEMATICAL MODEL OF AUXIN RESPONSIVE REPORTER DR5 ACTIVITY IN PLANT CELL
Savina M.S., Mironova V.V., Akberdin I.R., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
MODELING AND ANALYSIS OF DYNAMICS OF THE RIBOPYRIMIDINES DE NOVO BIOSYNTHESIS IN E. COLI
Khlebodarova T.M., Akberdin I.R., Fadeev S.I., Likhoshvai V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
Multiple solutions under modeling of the nitrate utilization system in Escherichia coli.
Ri N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[The Eighth IC on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology]
Role of auxin dose-dependent control in specification of root vascular cells
Новоселова ЕС., Миронова ВВ, Казанцев ФВ, Омельянчук НА, Лихошвай ВА
[Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB’12)]
SUPPRESSION OF SUBGENOMIC HCV RNA BY NS3 PROTEASE ANTIVIRALS IN CELLS: A BASIC STOCHASTIC MATHEMATICAL MODEL
Ivanisenko N.V., Mishchenko E.L., Akberdin I.R., Demenkov P.S., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A., Ivanisenko V.A.
[The Eighth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
Математическое моделирование ауксин зависимого контроля дифференцировки сосудистых клеток корня
Новоселова ЕС, Миронова ВВ, Омельянчук НА, Казанцев ФВ, Лихошвай ВА
[II(X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге]
Математическое моделирование клеточного цикла прокариот: согласование темпов роста объема клетки и репликации ДНК
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М.
[IV Международная конференция “Математическая биология и биоинформатика”,]
Математическое моделирование метаболизма нитрита при культивировании клеток Escherichia coli в проточном хемостате.
Ри Н.А., Хлебодарова Т.М., Когай В.В., Фадеев С.И., Лихошвай В.А.
[IV Международная конференция “Математическая биология и биоинформатика”]
Язык моделирования молекулярно-генетических систем SiBML
Ф.В. Казанцев, В.В. Миронова, Е.С. Новоселова, Н.Л. Подколодный, В.А. Лихошвай
["Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ) 2012"]
2011 Новая база математических моделей элементарных подсистем клетки Escherichia coli
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ри М.Т., Ри Н.А., Насонов В.В., Тимонов В.С., Лашин С.А., Ощепкова Е.А., Ратушный А.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»]
A mathematical model for the suppression of subgenomic Hepatitis C virus replication in Huh-7 cells in the presence of the NS3 protease inhibitors
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[International Conference on Systems Biology (ICSB 2011), Хайдельберг, Германия, 28 августа-1 сентября]
A plausible mechanism for the root apical meristem patterning.
V.V. Mironova, E.S. Novoselova, S.S. Sangaev, F.V. Kazantsev, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai
[7th International Conference on Structure and Function of Roots]
A plausible mechanism for the root apical meristem self-organization
Victoria Mironova, Ekaterina Novoselova, Nadya Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow]
Automatic generation of mathematical models of molecular-genetic systems
Akberdin I., Kazantsev F., Ree M., Ree N., Timonov V., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2011)]
Computer simulation confirmed auxin dose-dependent control of root vascular cells specification
E.S. Novoselova, V.V. Mironova, S.S. Sangaev, F.V. Kazantsev, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai
[7th International Symposium on Structure and Function of Roots]
GeneNetworks theory
Likhosvai V.A.
[RCIBC seminar, Novosibirsk, april 19-20, 2011]
MGSMODELSDB – Новая база математических моделей элементарных подсистем клетки Escherichia coli
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ри М.Т., Ри Н.А., Тимонов В.С., Ощепкова Е.А., Ратушный А.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[VI Московский международный конгресс. «Биотехнология: состояние и перспективы развития»]
MGSmodelsDB – web-ресурс для накопления математических моделей элементарных подсистем молекулярно-генетических систем
Казанцев Ф.В., Акбердин И.Р., Насонов В.В., Тимонов В.С., Лихошвай В.А.
[Третья школа молодых ученых “Биоинформатика и системная биология”]
Modelling auxin transport in root provascular tissue.
Novoselova E.S., Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[8th European conference on mathematical and theoretical biology (ECMTB-2011)]
The combined mechanisms of the reverse fountain and the reflected flow provide for self-organization and maintenance of the root apical meristem.
Mironova V.V., Novoselova E.S., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A.
[8th European conference on mathematical and theoretical biology (ECMTB-2011)]
Математическая модель подавления репликации субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке с ингибитором NS3 протеазы SCH503034
Мищенко Е., Иванисенко Н., Акбердин И., Лихошвай В., Козлов К., Гурский В., Самсонова М., Колчанов Н., Иванисенко В.
[Санкт-Петербургский научный форум “Наука и общество. Физиология и медицина 21 века. VI Петербургская встреча лауреатов нобелевской премии”, Санкт-Петербург, Россия, 19-23 сентября]
Математическая модель распределения ауксина в корне растений
Миронова В.В., Новоселова Е.С., Лихошвай В.А.
[Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики, Новосибирск]
Математическая модель распределения ауксина в корне растений
Миронова В.В., Новоселова Е.С., Лихошвай В.А.
[Международная конференция "Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики"]
Математическое моделирование биосинтеза нуклеотидов de novo у Escherichia coli
Ри М.Т., Захарцев М.В., Хлебодарова Т.М., Лихошвай В.А.
[II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинфоратика»]
Математическое моделирование транспорта ауксина в центральном цилиндре корня A. Thaliana
Новоселова Е.С., Миронова В.В., Казанцев Ф.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Третья школа молодых ученых “Биоинформатика и системная биология”]
Моделирование метаболизма пуринов и пиримидинов de novo в клетке E. coli
Лихошвай В.А., Ри М.Т., Когай В.В, Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И.
[VI Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», часть II, Москва, март 21-25, 2011, стр. 385-386]
Об исследовании математических моделей многостадийного синтеза вещества
Фадеев С.И., Лихошвай В.А., Штокало Д.Н., Королёв В.К.
[Российская конференция «Методы сплайн-функций», посвящённой 80-летию со дня рождения Ю. С. Завьялова, 31 января–2 февраля 2011, Новосибирск, Россия, Институт математики СО РАН, стр.90-91]
2010 Automatic generation and numerical analysis of mathematical models for molecular-genetic objects in an integrated system of MGS-generator and STEP+ modules
I.R. Akberdin,F.V. Kazantsev, V.A. Likhoshvai, S.I. Fadeev, I.A. Gainova, V.K. Korolev, A.E. Medvedev.
[Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure and Systems Biology (BGRS_SB’10),Новосибирск, Россия, 20-27 июня]
MGSmodelsDB – the database for storing mathematical models of molecular genetic systems
F.V. Kazantsev, I.R. Akberdin, M.T. Ree, N.A. Ree, K.D. Bezmaternykh, V.A. Likhoshvai.
[Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure and Systems Biology (BGRS_SB’10),Новосибирск, Россия, 20-27 июня]
Reduction of gene net dynamic models using proper orthogonal decomposition
V.M. Efimov, A.S. Novikov, A.A. Tikhonov, I.R. Akberdin, V.A. Likhoshvai
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
The mathematical modeling of nitrite metabolism regulation in Escherichia coli cell during nitrate respiration under anaerobic conditions.
Ree N.A., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M.
[International conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB’10)]
Control of Escherichia coli dps gene expression in response to toxic action of cadmium.
Stepanova T.Y., Likhoshvai V.A., Babkin I.V., Khlebodarova T.M.
[International conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology. (BGRS/SB’10)]
Correlation between nucleosome formation potential of 5’-UTR and elongation efficiency index of coding sequences of S.cerevisiae genome
Yu.G.Matushkin, V.A.Likhoshvai, V.G.Levitsky.
[2nd Moscow International Сonference "Molecular phylogenetics" (MolPhy-2). May 18-21, 2010. Moscow]
Development of shoot apical meristem in silico under phytohormone regulation
I.R. Akberdin, F.V. Kazantsev, S.I. Fadeev., I.A. Gainova, V.A. Likhoshvai
[Международная конференция Plantgen, Новосибирск, Россия, 7-10 июня, 2010]
Development of shoot apical meristem in silico under phytohormones regulation
I.R. Akberdin, F.V. Kazantsev, S.I. Fadeev, I.A. Gainova,V.A. Likhoshvai
[The Joint Russian-French Workshop "Genomics, Bioinformatics and Life Science Modeling"]
Evolution of trophically linked populations of unicellular organisms; translation efficiency in unicellular organisms
Yu.G.Matushkun, S.A. Lashin, V.V. Suslov, V.A.Likhoshvai, V.G.Levitsky
[Joint Indo-Russian Workshop "Predictive Biology using Systems and Integrative analysis and Methods", November 15-19, 2010, p 8-9, Chandigarh, India]
Mathematical modeling of nucleotide biosynthesis in Escherichia coli.
Ree M.T., Khlebodarova T.M., Likhoshvai V.A.
[International conference on bioinformatics of genome regulation and structure/systems biology (BGRS/SB’10)]
New computer technologies for construction and numerical analysis of mathematical models of molecular genetic systems
I.R. Akberdin, S.I. Fadeev, I.A. Gainova, F.V. Kazantsev, V.K. Korolev, V.A. Likhoshvai and A.E. Medvedev
[Progress in Analysis and its Applications, Proc.of the 7th ISAAC Congress, World Scientific Publ., Singapore]
STABILITY OF SOLUTIONS OF DELAY DIFFERENTIAL EQUATIONS WITH PERIODIC COEFFICIENTS
G.V. Demidenko, V.A. Likhoshvai, I.I. Matveeva
[Seven international conference on bioinformatics of genome regulation and structure (BGRS/SB_2010), Novosibirsk, 2010, p. 180]
The mathematical model for investigation of auxin-regulated root patterning in wild type and under treatments
V.V. Mironova, E.S. Novoselova, N.A. Omelyanchuk, V.A. Likhoshvai.
[the Joint Russian-French seminar "Genomics, Bioinformatics and Life Science Modeling" 18-21 June, Novosibirsk]
Математическое моделирование развития меристемы побега на различных иерархических уровнях
Гайнова И.А., Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Королев В.К., Медведев А.Е.
[Всероссийская конференция (с международным участием) "Математические модели и информационные технологии в сельскохозяйственной биологии: итоги и перспективы", Санкт-Петербург, 14–15 октября, 2010]
Механизмы поддержания ниши стволовых клеток в корнях растений: математическая модель распределения ауксина в корне и ее анализ
Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Биология развития: морфогенез репродуктивных структур и роль стволовых клеток в онтогенезе. Санкт-Петербург, 13-16 декабря 2010 г.]
Моделирование динамики молекулярно-генетических систе
Лихошвай В.А.
[Вторая международная научная школа-конференция памяти академика М.М. Лаврентьева "Теория и численные методы решения обратных и некорректных задач", 21-29 сентября 2010, Новосибирск]
Моделирование динамики молекулярно-генетических систем
Лихошвай В.А.
[Вторая молодежная международная научная школа-конференция памяти М.М.Лаврентьева «Теория и численные методы решения обратных и некорректных задач, 21-29 сентября 2010]
Об исследовании нелинейных моделей многостадийного синтеза вещества
Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Штокало Д.Р.
[III международная конференция, Математическая биология и биоинформатика, 10-15 октября 2010г., Пущино]
2009 A novel promoter of the Escherichia coli yfiA gene and pathways of its regulation under oxidative stress conditions
T.M. Khlebodarova, A.V. Zadorozhny, V.A. Likhoshvai, N.V. Tikunova, D.Yu. Oschepkov, N.A. Kolchanov.
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 09)]
Experimental study of predicted regulation pathways of E.coli/pYFI-GFP genosensor under oxidative stress
A.V. Zadorozhny, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai, D.Yu. Oschepkov, N.V. Tikunova.
[German-Russian Forum Biotechnology GRFB'09]
Mathematical modelling of a plant development on the different levels
Akberdin I.R., Kazantsev, Fadeev S.I., Gainova I.A., Likhoshvai V.A.
[Третий международный конгресс Gene-2009, Фошань, Китай, 1-7 декабря, 2009]
New computer technologies for the construction and numerical analysis of mathematical models for molecular genetic systems
I.A.Gainova, I.R Akberdin, F.V.Kazantsev, V.A.Likhoshvai, S.I.Fadeev, V.K.Korolev, A.E.Medvedev
[Седьмой Международный Конгресс ISAAC, Лондон, Великобритания, 13 – 18 Июля, 2009]
Prediction of the regulation pathways of the Еscherichia coli dps gene expression under stress conditions.
T.Yu. Stepanova, D.Yu. Oshchepkov, V.A. Likhoshvai, A.V. Zadorozhny, N.V. Tikunova, T.M. Khlebodarova.
[German-Russian Forum Biotechnology GRFB'09]
Интегрированная компьютерная система для построения и численного анализа математических моделей молекулярно-генетических систем
И.Р.Акбердин, Ф.В.Казанцев, В.А.Лихошвай, С.И.Фадеев, И.А.Гайнова, В.К.Королев, А.Е.Медведев
[Всероссийская конференция по вычислительной математике КВМ-2009, Академгородок, Новосибирск, Россия, 23-25 июня 2009]
Математическое моделирование и компьютерный анализ генных сетей
Лихошвай В.А.
[пятый международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития, Москва,16-20 марта 2009г, часть2, с384]
Математическое моделирование и компьютерный анализ генных сетей
Лихошвай В.А.
[V международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития, Москва,16-20 марта 2009г, часть2, с384.]
Моделирование молекулярно-генетических механизмов регуляции развития растений
И.Р. Акбердин, Ф.В. Казанцев, В.А. Лихошвай
[5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.]
Реконструкция механизмов регуляции экспрессии гена dps Еscherichia coli в присутствии ионов кадмия.
Т.Ю. Степанова, В.А. Лихошвай, А.В. Задорожный, Н.В. Тикунова, Д.Ю. Ощепков, Т.М. Хлебодарова.
[Съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Ч. Дарвина и Пятый съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров]
2008 Approval method for transcription termination sites prediction in firmicutes
S.A. Lashin, Yu.G. Matushkin, T.M, Khlebodarova, V.A. Likhoshvai.
[Sixth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure (BGRS)]
Auxin regulation of its own transport determines the root tip structure in plants
V.V. Mironova, N.A. Omelyanchuk, S.I. Fadeev, V.V Koga2, G. Yosiphon, E. Mjolsness, V.A.Likhoshvai
[6th international conference on bioinformatics of genome regulation and structure BGRS’2008, Novosibirsk, June 22-28]
CONDITIONS OF CORRECTNESS OF MODELLING OF NON-LINEAR AND REVERSIBLE MATRIX PROCESSES BY THE DELAY EQUATION
D.N.Shtokalo, S.I.Fadeev, V.A.Likhoshvai
[VI Intern. Conf. on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2008),2008, p227]
Genetic constructor: a computer resource for molecular-genetic systems modeling
V.A. Likhoshvai, N.V. Tikunova, A.V. Kachko, T.M. Khlebodarova.
[Sixth International Conference On Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
Mathematical model of auxin metabolism in shoots of Arabidopsis thaliana L.
Akberdin I. R., Kazantsev F. V., Omelyanchuk N. A., Likhoshvai V. A.
[2nd International Conference "Mathematical Biology and Bioinformatics", Pushchino, Moscow region, September 7-13, 2008]
Mathematical model of auxin-mediated root patterning
Mironova V.V., Likhoshvai V.A.
[International Autumn School for Young Scientists on Computational Systems Biology and Bioinformatics]
Mathematical modeling of genetic regulation of pyrimidine biosynthesis in Escherichia coli
M.T. Ri, T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai.
[Sixth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure]
Prediction of the regulatory mechanisms of Escherichia coli yfiA gene expression
T.M. Khlebodarova, V.A. Likhoshvai, D.Y. Oshchepkov, A.V. Kachko, N.V. Tikunova.
[Sixth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure (BGRS)]
Математическое моделирование репликации репликона ВГС в клетке. Исследование возможных клеточных факторов
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А
[IV съезд микробиологов Узбекистана, тезисы докладов, г. Ташкент, 9-10 октября 2008]
Эффект потенциальных лекарственных препаратов на репликацию субгеномного репликона вируса гепатита С в клетке: математическая модель
Е.Л. Мищенко, К.Д.Безматерных, В.А. Лихошвай, В.А. Иванисенко
[IV Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине", г. Новосибирск, 2008 г.]
2007 2d modelling and analysis of spatially distributed cells types of primary shoot apical meristem (SAM) of Arabidopsis thaliana
Ilya R. AKBERDIN, Evgeny A. OZONOV, Victorya V. MIRONOVA, Dmitry N. GORPINCHENKO, Nadezda A. OMELYANCHUK, Vitaly A. LIKHOSHVAI, Denis S. MIGINSKY, Nikolai A. KOLCHANOV
[Proceedings of the 3-rd Moscow conference on computional molecular biology. Moscow, Russia]
Deducing the mechanisms underlying expression regulation of a polyfunctional genosensor based on the promoter of Escherichia coli gene yfiA.
T.M. Khlebodarova, A.V. Kachko, D.Yu. Oshchepkov, N.V. Tikunova, V.A. Likhoshvai.
[«Basic sciences - medicine»]
Mathematical model of the Arabidopsis thaliana L. morphogenesis in a cellular automaton terms
Akberdin I.R., Ozonov E.A., Mironova V.V., Gorpinchenko D.N., Omelyanchuk N.A., Likhoshvai V.A., D.N., Kolchanov N.A.
[7th YSF "Molecular Networks", Vienna, Austria, 5 – 7 July 2007]
Комбинационная терапия как средство борьбы с лекарственной устойчивостью вируса гепатита С, результаты математического моделирования
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А
[III Международная конференция "Фундаментальные науки - медицине", г. Новосибирск, 2-8 сентября 2007 г.]
Математическая модель репликации репликона вируса гепатита С в клетках Huh-7
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А.
[XLV международная научная студенческая конференция: Студент и научно-технический прогресс, Новосибирск 10-12 апреля 2007г.]
Математическое моделирование комбинационного действия лекарственных препаратов против вируса гепатита С.
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Иванисенко В.А., Лихошвай В.А.
[Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск]
Моделирование морфогенеза зародыша Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата
Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Миронова В.В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[Сборник материалов Международной молодёжной научно-методической конференции "Проблемы молекулярной и клеточной биологии" г. Томск]
Моделирование морфогенеза зародыша Arabidopsis thaliana в терминах клеточных автоматов
Озонов Е.А., Акбердин И.Р., Миронова В.В., Горпинченко, Д.Н, Лихошвай В.А
[Всероссийская научная конференция студентов физиков ВНКСФ-13]
одномерная математическая модель паттерна распределения ауксина в корне растения
Лихошвай В.А., Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Фадеев С.И.
[Тезисы докладов Российской конференции "Математика в современном мире", Новосибирск, 2007]
2006 A mathematical model for the Influenza virus life cycle.
Akberdin I.R., Kashevarova (Ree) N.A., Khlebodarova T.M., Bazhan S.I., Likhoshvai V.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
A minimum mathematical model for suppression HCV RNA replication in cell culture.
Bezmaternikh K.D., Mishenko E.L., Likhoshvai V.A., Khlebodarova T.M., Ivanisenko V.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
AGNS database and cellular automaton to model the development of shoot meristems of Arabidopsis thaliana
Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А.
[II Всероссийская конференция "Инфокоммуникационные и компьютерные технологии и системы", Улан-Удэ, Россия (Июль 1-4)]
Bioinformatics and mechanisms of molecular pathology
N.A. Kolchanov, V. Ivanisenko, M. Ponomarenko, E. Aman, E. Ignatieva, T. Kuznetsova, V. Mordvinov, P. Demenkov, A. Ratushny, V.Likhoshvai, E. Ananko, N. Podkolodny, N. Podkolodnaya, A.. Romaschenko
[Геномика, протеомика, биоинформатика и нанотехнологии для медицины – GPMB-2006 Новосибирск, июль 2006]
Genetic constructor for computer modeling
Likhoshvai V., Nedosekina E., Tikunova N.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
MGSmodeller - компьютерная система для конструирования, расчета и анализа моделей молекулярно-генетических систем
Казанцев Ф.В. , Подколодная Н.Н., Акбердин И.Р., Безматерных К.Д., Крокус И.В., Лашин С.А., Ратушный А.В., Лихошвай В.А.
[7 Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Красноярск, Россия, (Ноябрь 1-3)]
MGSmodeller – the computer system for construction, calculation and analysis of model of genetic molecular system
Kazantcev F.V., Podkolodnaya N.N., Akberdin I.R., Bezmaternich K.D., Krokus I.V., Lashin S.A., Ratushny A.V., Likhoshvai V. A.
[VII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. Красноярск. 2006]
Mathematical modeling of the purine biosynthesis in Escherichia coli
Nedosekina E., Likhoshvai V.A.
[Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnologies for Medicine]
Modeling of morphogenesis of Arabidopsis thaliana in cellular automaton terms
Akberdin I. R., Evgeniy A. Ozonov, Victoria V. Mironova, Nadezda A. Omelyanchuk, Vitaly A. Likhoshvai
[VII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. Красноярск. 2006]
Optimal control tasks in terms of the gene network models
Bezmaternykh K.D., Nikulichev Yu.V., Likhoshvai V.A., Matushkin Yu.G., Latipov A.F., Kolchanov N.A
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
System computer biology in Institute of Cytology of SB RAS
Yu. Matushkin, E. Ananko, D. Afonnikov, V. Golomolzin, V. Ivanisenko, E. Ignat’eva, A. Katokhin, V.Likhoshvai, D. Miginskii, N. Omelyanchuk, S. Peltek, T. Khlebodarova, N. Kolchanov
[Saint-Petersburg International Workshop on NanoBiotechnologies]
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков.
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г.
[International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.]
Математическая модель подавления репликации РНК репликона вируса гепатита С в клеточной структуре
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Иванисенко В.А.
[Доклад на VII всероссийской конференции молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, г. Красноярск]
Минимальная математическая модель подавления репликации РНК репликона ВГС в клеточной культуре", доклад на 5-ой Российской мульти-конференции
Безматерных К.Д., Мищенко Е.Л., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Иванисенко В.А.
[5-ая Российская мульти-конференция "Математика, Информатика, Управление" (МИУ’06) Иркутск, Россия]
Моделирование морфогенеза растений в терминах клеточного автомата
Акбердин И.Р, Озонов Е.А, Миронова В.В, Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А
[VII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям. Красноярск. 2006]
2005 Modelling of signal transduction and gene expression regulation in immune system cells.
Nedosekina E.A., Ananko E.A., Likhoshvai V.A., Oshchepkov D.Yu., Kolchanov N.A.
[Сonference on modeling and simulation in biology, medicine and biomedical engineering. Linkoping, Sweden, 2005, May 26-27]

Гранты

2016 Математические проблемы биологии гена
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Фадеев С.И., Когай В.В.

2013 Математическая биология гена
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Новоселова Е.С., Перфильева О.А., Фадеев С.И., Когай В.В.

2012 ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО-РАЗНОСТНЫЕ И ИНТЕГРОДИФФЕРЕНЦИАЛЬНЫЕ УРАВНЕНИЯ. ПРИЛОЖЕНИЯ К ЗАДАЧАМ ЕСТЕСТВОЗНАНИЯ
общее кол-во = 72 человека

2011 Экспериментально-теоретическое изучение молекулярно-генетических механизмов распределения ауксина в корне растений
Миронова Виктория Владимировна Лихошвай Виталий Александрович Омельянчук Надежда Анатольевна Новоселова Екатерина Сергеевна Казанцев Фёдор Владимирович Сангаев Содном Сергеевич Ибрагимова Салмаз Магомедсаидовна Пономаренко Михаил Павлович

2010 Симметрия и хаос в генных сетях
Лихошвай Виталий Александрович руководитель Акбердин Илья Ринатович исполнитель Казанцев Федор Владимирович исполнитель Когай Владислав Владимирович исполнитель Фадеев Станислав Иванович исполнитель Хлебодарова Тамара Михайловна исполнитель Новоселова Екатерина Сергеевна исполнитель Ри Наталья Александровна

EU-FP7 Research Project SysPatho
Акбердин И.Р., Мищенко Е.Л., Иванисенко Н.В., Деменков П.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А., Колчанова Н.А.

2009 Биоинформатика генетической изменчивости: исследование влияния мутаций на молекулярно-генетические системы организмов
Акбердин Илья Ринатович, Гунбин Константин Владимирович, Захаренко Л.П., Иванисенко Владимир Александрович, Игнатьева Елена Васильевна, Казанцев Федор Владимирович, Левицкий Виктор Георгиевич, Лихошвай Виталий Александрович, Омельянчук Надежда Анатольевна, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Пинтус Сергей Сергеевич, Пономаренко Михаил Павлович, Пономаренко Петр Михайлович, Ри Максим Тексенович, Савинкова Людмила Кузминична, Суслов Валентин Владимирович, Турнаев Игорь Иванович, Хлебодарова Тамара Михайловна

Методы исследования дифференциально-разностных уравнений и приложения к задачам биологии и химии
Лихошвай В.А., Хлебодарова Т.М., Омельянчук Н.А., Акбердин И.Р., Безматерных К.Д., Миронова В.В., Ри М.Т., Казанцев Ф.В., Новоселова Е.С. и др.

ПОСТГЕНОМНАЯ БИОИНФОРМАТИКА: КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ СИСТЕМ
76 человек

2008 Компьютерная реконструкция потенциальных регуляторных районов E.coli и механизмов их функционирования. Экспериментальное подтверждение разработанных моделей
Лихошвай Виталий Александрович, Бабкин Игорь Викторович, Качко Алла Васильевна, Ощепков Дмитрий Юрьевич, Ри Наталья Александровна, Степаненко Ирина Лембитовна, Степанова Татьяна Юрьевна, Тикунова Нина Викторовна

2007 Разработка универсальных геносенсоров для детекции общей токсичности, мутагенности и техногенных стрессов
Д.А.Афонников В.А.Лихошвай О.В. Ефремова Т.М.Хлебодарова И.Л.Степаненко Ю.Г.Матушкин Н.В.Тикунова И.В. Бабкин А.В. Качко Л.Я. Кучумова

2006 РОЛЬ МИКРООРГАНИЗМОВ В ФУНКЦИОНИРОВАНИИ ЖИВЫХ СИСТЕМ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ И БИОИНЖЕНЕРНЫЕ ПРИЛОЖЕНИЯ
113 исполнителей из 10 Институтов СО РАН


Научное руководство

2011 Исследование математической модели перераспределения вещества в кольцевом ансамбле клеток [СМИРНОВа А.А.]
2010 МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ АУКСИНА НА РИЗОТАКСИС У ARABIDOPSIS THALIANA (L.) HEYNH. [Новоселова Екатерина Сергеевна]
КОМПЬЮТЕРНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ РОЛИ АУКСИНА В МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЙ РЕГУЛЯЦИИ РАЗВИТИЯ КОРНЯ РАСТЕНИЙ [Миронова Виктория Владимировна]
Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana L. [Акбердин Илья Ринатович]
2008 МАТЕМАТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ РЕГУЛЯЦИИ БИОСИНТЕЗА ПИРИМИДИНОВЫХ НУКЛЕОТИДОВ В КЛЕТКЕ ESCHERICHIA COLI [Ри Максим Тексенович]
2007 Моделирование морфогенеза зародыша Arabidopsis Thaliana в терминах клеточного автомата [Озонов Е.А.]
2006 Математическая модель Тайсона цикла клеточного деления делящихся дрожжей. [Турко М.И.]
Исследование симметричных генных сетей с регуляторными связями, обуславливающими возможность возникновения хаотических колебаний [Руднева Д.С.]
О ВОССТАНОВИМОСТИ ДИСКРЕТНЫХ МОДЕЛЕЙ ГЕННЫХ СЕТЕЙ [Комаров А.В.]
ПРЕДЕЛЬНЫЙ ПЕРЕХОД К УРАВНЕНИЮ С ЗАПАЗДЫВАЮЩИМ АРГУМЕНТОМ В МОДЕЛИ СИНТЕЗА ВЕЩЕСТВА С УЧЁТОМ ОБРАТИМОСТИ И СТОКОВ [Штокало Д.Н.]
2004 МАТЕМАТИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ ГЕННОЙ СЕТИ TNFalpha ИНДУЦИРУЕМОЙ АКТИВАЦИИ NF-kappaB [Гурьева Я.П.]

Учебные курсы

2013 Математическое моделирование молекулярно-генетических систем
2012 Математическое моделирование молекулярно-генетических систем
Лихошвай В.А., Акбердин И.Р.

2011 Математическое моделирование генных сетей
2010 математическое моделирование генных сетей
2009 Математическое моделирование генных сетей
2008 Математическое моделирование генных сетей
2007 Математическое моделирование генных сетей
2006 Математическое моделирование генных сетей

Патенты

2013 Программа для доступа и отображения кинетических данных биохимических реакций (Веб-КиНЕТ)
Лихошвай В.А., Акбердин И.Р., Ермак Т.В., Тимонов В.С., Хлебодарова Т.М.

2012 База данных "Элементарные подсистемы: метаболизм E.coli" (ЭлСи: E.coli)/ Database "Elementary subsystems: E.coli metabolism" (ElSy: E.coli)
Лихошвай В.А., Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Ри М.Т., Ри Н.А., Хлебодарова Т.М., Лашин С.А., Ощепкова Е.А., Ратушный А.В.

2011 Программа визуализации и компиляции математических моделей генных сетей (МГСмодели) / Software tool for gene networks mathematical models view and compile (MGSmodelsDB)
Лихошвай В.А., Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Насонов В.В., Тимонов В.С.

2010 Рекомбинантная плазмидная ДНК pYfi-gfp, кодирующая продукцию флюоресцентного белка GFPaav и штамм бактерий Escherichia coli JM109-pYfi продуцирующий флюоресцентный белок GFPaav в присутствии токсических агентов
Хлебодарова Т.М., Тикунова Н.В., Качко А.В., Лихошвай В.А., Колчанов Н.А.

2008 Компьютерная система для конструирования, расчета и анализа моделей молекулярно-генетических систем (МГСмоделлер)/ A computer system for reconsnruction/ Calculation and analysis matimatical models of molecular genetic system (MGSmodeller)
Лихошвай В.А., Казанцев Ф.В., Акбердин И.Р., Безматерных К.Д. Лашин С.А., Подколодная Н.Н., Ратушный А.В

Программа автоматической генерации математических моделей генных сетей (МГСгенератор) / Software tool for mathematical models autogeneration on basis of the gene networks structure (MGSgenerator)
Лихошвай В.А., Казанцев Ф.В., Акбердин И.Р., Безматерных К.Д.


Диссертации

2008 МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ И КОМПЬЮТЕРНЫЙ АНАЛИЗ ГЕННЫХ СЕТЕЙ [Доктор]
1985 Математическая модель онтогенеза бактериофага лямбда [Кандидат]
© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.