ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Кочетов Алексей Владимирович, д. б. н.

Подразделение: 091. Руководство (Дирекция)
Заведующий: 054. Лаб. генной инженерии
044. Проектный отдел
Отделение генетики растений
120. Лаб. генетические маркеры картофеля
Совместительство: 069. Научно-образовательный отд.
Должность: заместитель директора по научной работе
Комната: 3217
Email: ak@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-94*3217


Персональная информация

Рабочий адрес

Г.  Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия

Дата рождения

02.01.1967

Образование

НГУ – 1991 – специальность "биолог"

к.б.н. (по специальности "генетика") - 1998 год

доцент (по специальности "генетика") - 2004 год

д.б.н. (по специальностям "генетика" и "математическая биология и биоинформатика")

член-корреспондент РАН (2016 г)

Редакционная и издательская деятельность

Член редколлегии Вавиловского журнала генетики и селекции, Plant Gene (Elsevier)

Награды

премия Президиума СО РАН имени Д.К. Беляева (1999 год)

Идентификаторы

Scopus Author ID: 7006026170

РИНЦ ID: 85276

 

Область научных интересов

генетика, генная инженерия, молекулярная биология, биоинформатика



Публикации

2017 Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots
N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova
[SCI REP-UK]
Genome Editing System CRISPR/CAS9 and Peculiarities of Its Application in Monocots
S. V. Gerasimova, E. K. Khlestkina, A. V. Kochetov, V. K. Shumny
[RUSS J PLANT PHYSL+]
СИСТЕМА CRISPR/CAS9 ДЛЯ РЕДАКТИРОВАНИЯ ГЕНОМОВ И ОСОБЕННОСТИ ЕЕ ПРИМЕНЕНИЯ НА ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЯХ
С. В. Герасимова, Е. К. Хлесткина, А. В. Кочетов, В. К. Шумный
[Физиология растений]
2016 AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs
Kochetov Alex V., Allmer Jens, Klimenko Alexandra I., Zuraev Bulat S., Matushkin Yury G., Lashin Sergey A.
[BIOINFORMATICS]
Expression of extracellular ribonuclease gene increases resistance to Cucumber mosaic virus in tobacco
Sugawara T., Trifonova E.A., Kochetov A.V., Kanayama Y.
[BMC PLANT BIOL]
Plant Cell Wall and Mechanisms of Resistance to Pathogens
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Production of recombinant proteins in plant cells
Gerasimova S.V., Smirnova O.G., Kochetov A.V., Shumny V.K.
[RUSS J PLANT PHYSL+]
База данных генов, повышающих устойчивость пшеницы и родственных ей злаков к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Индуцированная экспрессия гена рибонуклеазы III Serratia marcescens в трансгенных растениях табака Nicotiana tabacum L. cv. SR1.
Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Романова А.В., Филипенко Е.А., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
Наработка рекомбинантных белков в клетках растений
С. В. Герасимова, О. Г. Смирнова, А. В. Кочетов, В. К. Шумный
[Физиология растений]
Трансгенные растения как генетические модели для изучения функций генов
Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2015 Promoters of Plant Genes Responsive to Pathogen Invasion.
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Вирус-индуцируемый сайленсинг как метод изучения функций генов высших растений
Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
Роль клеточной стенки растений в защитном ответе
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Трансгенная экспрессия нативной и мутантной нуклеазы Serratia marcescens модулирует устойчивость табака Nicotiana tabacum L. к вирусу табачной мозаики
Трифонова Е. А., Савельева А. В., Романова А. В., Филипенко Е. А., Сапоцкий М. В., Малиновский В. И., Кочетов А. В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
2014 Agrobacterium-mediated transformation of sunflower (Helianthus annuus L.) in vitro and in planta using Lba4404 strain harboring binary vector pBi2E with dsRNA-suppressor of proline dehydrogenase gene.
Tishchenko O.M., Komisarenko A.G., Mykhalska S.I., Sergeeva L.E., Adamenko N.I., Morgun B.V., Kochetov A.V.
[Цитология и генетика]
Artificial genetic constructs to direct the synthesis of transmissible self-replicating RNAs
Kochetov A.V.
[BIOESSAYS]
Промоторы генов, регулирующих ответ на патогены у растений.
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Энхансеры трансляции для генной инженерии растений.
Кочетов А.В., Филипенко Е.А., Смирнова О.Г., Шумный В.К.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2013 Hidden coding potential of eukaryotic genomes: non-AUG started ORFs
Kochetov A.V., Prayaga P.D., Volkova O.A., Sankararamakrishnan R.
[J BIOMOL STRUCT DYN]
PR-белки с рибонуклеазной активностью и устойчивость растений к патогенным грибам.
175. Филипенко Е.А., Кочетов А.В., Kanayama Y., Малиновский В.И., Шумный В.К.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets.
Sommer B., Kormeier B., Demenkov P., Arrigo P., Hippe K., Ates O., Kochetov A.V., Ivanisenko V., Kolchanov N.A., Hofestaedt R.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Анализ эффективности использования двухцепочечного рнк-супрессора гена пролиндегидрогеназы для повышения уровня устойчивости подсолнечника (Helianthus annuus L.) К водному дефициту и засолению.
Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Известия Самарского научного центра Российской академии наук]
Аналіз запасних білків кукурудзи, трансформованої in planta з використанням обеззброєнних штамів Agrobacterium tumefaciens.
Матвєєва О.Ю., Сірант Л.В., Курчій В.М., Моргун Б.В., Тищенко О.М., Кочетов О.В.
[Физиология растений и генетика]
Исследование содержания свободного пролина в растениях кукурузы, трансформированных in planta с использованием LBA4404, несущего pBI2E с двухцепочечным РНК-супрессором гена пролиндегидрогеназы.
Михальская С.И., Матвеева А.Ю., Сергеева Л.Е., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Известия Самарского научного центра Российской академии наук.]
Компьютерный анализ данных экспрессии генов в клетках мозга, полученных с помощью микрочипов и высокопроизводительного секвенирования
Медведева И.В., Вишневский О.В., Сафронова Н.С., Кожевникова О.С., Генаев М.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Орлов Ю.Л.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Роль ауто- и гетерологичных рибонуклеаз семейства III в механизмах устойчивости к патогенам и регуляции экспрессии генов высших растений.
Жирнов И.В., Трифонова Е.А., Кочетов А.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2012 Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
Extensive translatome remodeling during ER stress response in mammalian cells
Ventoso I., Kochetov A., Montaner D., Dopazo J., Santoyo J.
[PLoS One]
Inducible expression of the gene of Zinnia elegans coding for extracellular ribonuclease in the SR1 Nicotiana tabacum plants
Trifonova E.A., Romanova A.V., Sangaev S.S., Sapotsky M.V., Malinovsky V.I., Kochetov A.V.
[BIOL PLANTARUM]
Possible link between the synthesis of GR alpha isoforms and eIF2 alpha phosphorylation state.
Kochetov AV, Merkulova TI, Merkulov VM
[MED HYPOTHESES]
Research progress on the medicinal and nutritional properties of sea buckthorn (Hippophae rhamnoides)
Kanayama Y., Kato K., Stobdan T., Galitsyn G.G., Kochetov A.V., Kanahama K.
[J HORTIC SCI BIOTECH]
Simple database to select promoters for plant transgenesis.
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В.
[TRANSGENIC RES]
TGP – база данных промоторов для трансгенеза растений
Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Кочетов А.В.
[Математическая биология и биоинформатика]
Wheat Promoter Sequences for Transgene Expression.
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Информационная поддержка экспериментов по трансгенезу растений в базе данных трансляционных энхансеров.
Смирнова О.Г., Рассказов Д.А., Кочетов А.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Информационный портал "Биотехнология растений" - Интернет ресурс для поддержки экспериментов в области генной инженерии растений, генетики и селекции пшеницы.
Кочетов А.В., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Рассказов Д.А., Афонников Д.А., Генаев М.А., Дорошков А.В., Пшеничникова Т.А., Симонов А.В., Морозова Е.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Промоторы пшеницы для экспрессии трансгенов
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Частичная супрессия гена пролиндегидрогеназы увеличивает устойчивость растений к различным видам абиотических стрессов.
С.С. Ибрагимова, Я.С. Колодяжная, С.В. Герасимова, А.В. Кочетов
[Физиология растений]
2011 Alternative translation start sites are conserved in eukaryotic genomes
Bazykin G.A., Kochetov A.V.
[NUCLEIC ACIDS RES]
Production of recombinan HIV-1 GAG polyprotein fused to yellow Fluorescent Protein (EYFP) in Leishmania tarentolae
156. Razumova Ju.V., Cheresiz S.V., Kochetov A.V., Beklemishev A.B.
[Вестник уральской медицинской академической науки]
Tandem termination signal in plant mRNA
Kochetov A.V., Volkova O.A., Poliakov A., Dubchak I., Rogozin I.B.
[GENE]
Активность сахаросинтетазы и инвертазы эндосперма кукурузы (Zea mays L.), инфицированной in planta обезоруженными штаммами Agrobacterium tumefaciens
Матвеева А.Ю., Сакало В.Д., Курчий В.М., Моргун Б.В., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Вісник Українського товариства генетиків та селекціонерів]
Анализ транскрипционной активности промотора гена дельта-орнитинаминотрансферазы Arabidopsis thaliana
Герасимова С.В., Горелова В.В., Дорогина О.В., Жмудь Е.В., Коваль В.С., Романова А.В., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
Метаболизм сахарозы на ранних этапах онтогенеза кукурузы (Zea mays L.), трансформированной in planta обезоруженными штаммами штаммом Agrobacterium tumefaciens
Тищенко Е.Н., Сакало В.Д., Матвеева А.Ю., Курчий В.М., Моргун Б.В., Кочетов А.В.
[Биотехнология]
Функции дельта-аминотрансферазы у растений
Герасимова С.В., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Шумный В.К.
[Успехи современной биологии]
2010 Interrelations between the nucleotide context of human start AUG codon, N-end amino acids of the encoded protein and initiation of translation
Volkova O.A. Kochetov A.V.
[J BIOMOL STRUCT DYN]
On nucleotide solvent accessibility in RNA structure
Singh H., Andrabi M., Kahali B., Ghosh T.C., Miziguchi K., Kochetov A.V., Ahmad S.
[GENE]
Sensibility to phytorhabdoviruses of transgenic tobacco plants
Spivak N.Ya., Kochetov A.V., Lozova O.I., Levenko B.A., Yuzvenko L.V., Nikolaychuk M.V., Levchuk O.B., Didenko L.F., Trifonova E.A., Sangaev S.S.
[Sc. Bull. Uzhgorod Univ. (Ser. Biol.)]
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches
Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R
[J INTEGR BIOINFORM]
Инактивация гена Nk1 в растениях табака Nicotiana tabacum SR1 за счет РНК-интерференции
Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В.
[RUSS J GENET+]
Индукция регенерации in vitro при Agrobacterium-опосредованной трансформации инбредных линий подсолнечника
Комисаренко А.Г., Михальская С.И., Кочетов А.В., Тищенко Е.Н.
[Биотехнология]
Роль различных метаболитов в формировании стрессоустойчивости растений
Ибрагимова С.С., В.В. Горелова, А.В. Кочетов, В.К. Шумный
[Вестник НГУ]
Роль экстраклеточных рибонуклеаз в физиологических процессах высших растений
Сангаев С.С., Кочетов А.В., Ибрагимова С.С., Левенко Б.А., Шумный В.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
Трансформанты табака, экспрессирующие кДНК гена орнитинаминотрансферазы Medicago truncatula
Герасимова С.В., Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Романова А.В., Коваль В.С., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Информационный вестник ВОГИС]
2009 Dark and light green tissues of tobacco leaves systemically infected with tobacco mosaic virus
Burundukova O.L., Sapotsky M.V., Kochetov A.V., Trifonova E.A., Malinovsky V.I.
[BIOL PLANTARUM]
Трансгенные растения, толерантные к абиотическим стресса
Колодяжная Я.С, Куцоконь Н.К., Левенко Б.А., Cютикова О.С., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В.
[RUSS J GENET+]
2008 Alternative translation and hidden coding potential of eukaryotic mRNAs
Kochetov A.V.
[BIOESSAYS]
uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs
Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A.
[FEBS LETT]
Высокоэффективная экспрессия В-субъединицы термолабильного энтеротоксина Escherichia coli в растениях с помощью вируса-вектора на основе генома X-вируса картофеля
Равин Н.В., Куприянов В.В., Замчук Л.А., Кочетов А.В., Дорохов Ю.Л., Атабеков И.Г., Скрябин К.Г.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
2007 AUG_hairpin: prediction of a downstream secondary structure influencing the recognition of a translation start site
Kochetov A.V., Palyanov A., Titov I.I., Grigorovich D., Sarai A., Kolchanov N.A.
[BMC BIOINFORMATICS]
Protection of transgenic tobacco plants expressing bovine pancreatic ribonuclease against tobacco mosaic virus
Trifonova E. A., Sapotsky M.V., Komarova M. L., Scherban A.B., Shumny V.K., Polyakova A.M., Lapshina L.A., Kochetov A.V., Malinovsky V.I.
[PLANT CELL REP]
Молекулярные механизмы системной устойчивости растений к вирусным инфекциям и способы повышения вирусоустойчивости путем трансгенеза
Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Успехи современной биологии]
Трансгенные растения табака Nicotiana tabacum SR1, экспрессирующие экстраклеточную рибонуклеазу Zinnia elegans
Сангаев С.С., Трифонова Е.А., Титов С.Е., Романова А.В., Колодяжная Я.С., Комарова М.Л., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
Трансформанты табака, экспрессирующие антисмысловую последовательность гена пролиндегидрогеназы, проявляют устойчивость к тяжелым металлам оследовательность гена пролиндегидрогеназы, проявляют устойчивость к тяжелым металлам
Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В., Трифонова Е.А., Романова А.В., Комарова М.Л., Коваль В.С., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
2006 Альтернативные сайты инициации трансляции и их вклад в протеом эукариотических клеток
Кочетов А.В.
[Molecular Biology]
Взаимосвязь контекстной организации сигнала инициации трансляции и аминокислотной последовательности на N-конце белков эукариот
Волкова О.А., Титов С.Е., Кочетов А.В.
[BIOFIZIKA+]
Оценка солеустойчивости растений табака Nicotiana tabacum, несущих антисмысловой супрессор гена пролиндегидрогеназы
Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В., Комарова М.Л., Романова А.В., Коваль В.С., Шумный В.К.
[RUSS J GENET+]
Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК
Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А.
[BIOFIZIKA+]
Трансгенез как способ увеличения устойчивости растений к повышенным концентрациям тяжелых металлов
Колодяжная Я.С., Кочетов А.В., Шумный В.К.
[Успехи современной биологии]
2003 Data Mining Techniques in Bioinformatics
Zagoruiko N.G., Kolchanov N.A., Pichueva A.G., Kutnenko O.A., Borisova I.A., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Nikolaev S.V., Likhoshvai V.A., Ratushnyi A.V.
[Pattern Recognition and Image Analysis]
1999 GENEEXPRESS: интегратор баз данных и компьютерных систем, доступных по сети Интернет и предназначенных для изучения экспресии генов эукариот
Н.А.Колчанов, М.П.Пономаренко, А.Э.Кель, Ю.В.Кондрахин, А.С.Фролов, Ф.А.Колпаков, Т.Н.Горячковская, О.В.Кель, Е.А.Ананько, Е.В.Игнатьева, О.А.Подколодная, И.Л.Степаненко, Т.И.Меркулова, В.В.Бабенко, Д.В.Воробьев, С.В.Лаврюшев, Ю.В.Пономаренко, А.В.Кочетов, Г.Н.Колесов, Н.Л.Подколодный, Л.Миланези, Э.Вингендер, Т.Хейнемайер, В.В.Соловьев, Г.К.Овертон
[BIOFIZIKA+]
Integrated databases and computer systems for studying eukaryotic gene expression.
Kolchanov N.A., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Ananko E.A., Kolpakov F.A., Ignatieva E.V., Podkolodnaya O.A., Goryachkovskaya T.N., Stepanenko I.L., Merkulova T.I., Babenko V.N., Ponomarenko J.V., Kochetov A.V., Podkolodny N.L., Vorobyev D.G., Lavrushev S.V., Grigorovich D.A., Kondrakhin Yu.V., Milanesi L., Wingender E., Solovyev V.V., Overton G.C.
[BIOINFORMATICS]
Prediction of eukaryotic mRNA traslational properties.
Kochetov A.V., Ponomarenko M.P., Frolov A.S., Kisselev L.L., Kolchanov N.A.
[BIOINFORMATICS]
1998 Eukaryotic mRNAs encoding abundant and scarce proteins are statistically dissimilar in many structural features.
Kochetov AV, Ischenko IV, Vorobiev DG, Kel AE, Babenko VN, Kisselev LL, Kolchanov NA.
[FEBS LETT]
GeneExpress: a computer system for description, analysis, and recognition of regulatory sequences in eukaryotic genome.
N.A. Kolchanov, M.P. Ponomarenko, A.E. Kel, A.S. Frolov, F.A. Kolpakov, T.N. Goryachkovsky, O.V. Kel, E.A. Ananko, E.V. Ignatieva, O.A. Podkolodnaya, V.N. Babenko, I.L. Stepanenko, A.G. Romashchenko, T.I. Merkulova, D.G. Vorobiev, S.V. Lavryushev, A.V. Kochetov, G.B. Kolesov, V.V. Solovyev, L. Milanesi, N.L. Podkolodny, E. Wingender, T. Heinemeyer
[Proc. Int. Conf. Intell. Syst. Mol. Biol. (ISMB)]

Монографии

2016 Векторы, репликоны и биопродукция в растениях
Герасимова С.В., Назаренко А.В., Кочетов А.В.

2015 mRNA translational enhancers as a tool for plant gene engineering
Kochetov A.V., Filipenko E.A., Nikulin P.S

2013 Degrees of Freedom.
Ponomarenko M, Babenko V, Kochetov A, Kolchanov N

2010 Visualization and Analysis of Biological Networks combining Text Mining and Data Warehouse Approaches
Björn Sommer, Evgeny S. Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian J. Janowski, Timofey V. Ivanisenko, Anatoly O. Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel S. Demenkov, Alexey V. Kochetov, Vladimir A. Ivanisenko, Nikolay A. Kolchanov and Ralf Hofestädt

2008 Компьютерная транскриптомика. Трансляция. В монографии «Системная Компьютерная Биология». Под ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Кочетов А.В., Вишневский О.В., Волкова О.А., Владимиров Н.В., Лихошвай В.А. Матушкин Ю.Г., Григорович Д.А., Нишида Х., Сараи А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Пономаренко М.П., Титов И.И., Колчанов Н.А.


Конференции

2016 Доклад по проекту СБИ «Селекционный центр». Заседание рабочей группы представителей территорий - участников программы «Сибирская биотехнологическая инициатива» (СБИ)
Колчанов Николай Александрович, Лаврюшев Сергей Вячеславович, Кочетов Алексей Владимирович
[Площадка открытых коммуникаций OPENBIO 2016 – комплекс мероприятий, посвященных коммерциализации идей и развитию бизнеса в сфере наук о жизни. Форум для бизнеса, науки, власти и инфраструктуры]
ALTORFEV: A NOVEL TOOL FOR PREDICTION OF ALTERNATIVE ORFS BASED ON THE LINEAR SCANNING MODEL
B.S. Zuraev, A.V. Kochetov, A.I. Klimenko, S.A. Lashin
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology]
Knockout of Nud and Vrs genes in barley using CRISPR/Cas system
Gerasimova S.V., Kochetov A.V., Khlestkina E.K.
[The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
Reconstruction of the gene network of the wheat response to fungal pathogens
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
The plant δOAT gene is active in proliferating tissues
Egorova A.A., Kochetov A.V., Gerasimova S.V.
[The 1st International Workshop "Plant Genetics and Genomics for Food Security" (PGGFS-2016)]
База данных генов устойчивости пшеницы к патогенным грибам
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Всероссийская конференция с международным участием «50 лет ВОГиС: успехи и перспективы»]
Состояние и перспективы использования маркёр-ориентированной и геномной селекции растений
Н.А. Колчанов, А.В. Кочетов, Е.А. Салина, Л.А. Першина, Е.К. Хлесткина, В.К. Шумный
[Научная сессия общего собрания членов РАН на тему: «Генетические ресурсы растений, животных и микроорганизмов на службе человечества»]
2015 Plant promoters for specific transgene expression in tomato
Smirnova O.G., Kochetov A.V.
[The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology” PlantGen 2015]
2013 Computer analysis of transcription factor binding sites in genome scale based on ChIP-seq data
Yuriy L. Orlov, Vladimir A. Ivanisenko, Alexey V. Kochetov, Nikolay A. Kolchanov
[German-Russian Forum Biotechnology, Rostock 2013]
Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L.
Миронова В.В., Кузнецова Л.С., Филипенко Е.А., Климова Н.В., Васильев Г.В., Кочетов А.В.
[International Conference ” High-Throughput Sequencing in Genomics”]
База данных БВИР-интернет ресурс для поддержки и планирования экспериментов по трансгенезу растений.
Ибрагимова С.М., Смирнова О.Г., Рассказов Д. А., Кочетов А.В.
[Инновационные направления современной физиологии растений]
Генно-инженерный подход к решению проблемы устойчивости растений к абиотическому стрессу.
Ибрагимова С.М., Кочетов А.В.
[X Международная конференция «Биология клеток растений in vitro и биотехнология»]
Использование информационного ресурса TGP для создания генетических конструкций с чувствительными к солевому стрессу промоторами
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[Конференция ВОГиС «Проблемы генетики и селекции»]
2012 THE MODEL FOR AUXIN REGULATED AtPIN1 EXPRESSION IN THE ROOT APICAL MERISTEM
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, С.С. Сангаев, Н.А. Омельянчук, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[The 2nd International Conference "Plant Genetics, Genomics and Biotechnology"]
THE ROLE OF EXTRACELLULAR NUCLEASES AND RNA-BINDING ACTIVITY IN THE RESISTANCE OF HIGHER PLANTS TO PHYTOPATHOGENS
E.A. Trifonova, A.V. Savelyeva, A.V. Romanova, E.A. Filipenko, M.V. Sapotsky, V.I. Malinovsky, A.V. Kochetov
[2nd International Conference “Plant Genetics, Genomics, and Biotechnology”]
Быстрый поиск промоторов растений для трансгенеза
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[IV Всероссийский симпозиум "ТРАНСГЕННЫЕ РАСТЕНИЯ: технология создания, биологические свойства, применение, биобезопасность"]
Исследование регуляторных районов PIN1 гена Arabidopsis thaliana L. (Study of PIN1 regulatory regions in Arabidopsis thaliana L.
А.А. Ермаков, В.В. Чернова, А.В. Дорошков, И.В. Миронова, С.С. Сангаев, А.В. Кочетов, В.В. Миронова
[II (X) Международная Ботаническая Конференция молодых ученых в Санкт-Петербурге, 11-16 ноября 2012 года]
РОЛЬ РНК-СВЯЗЫВАЮЩЕЙ И ГИДРОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЕЙ В УСТОЙЧИВОСТИ РАСТЕНИЙ К ФИТОПАТОГЕНАМ
Трифонова Е.А., Романова А.В., Филипенко Е.А., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Кочетов А.В.
[Научное наследие Н.И. Вавилова и современность]
2011 Computational genomics: looking for new knowledge in old data
Kochetov A.V.
[German/Russian Workshop on Integrative Biological Pathway Analysis and Simulation]
The mRNA characteristics potentially involved in recognition of non-AUG start codons in yeast mRNAs.
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 11)]
VISUALIZATION AND ANALYSIS OF A CARDIO VASCULAR DISEASE-RELATED BIOLOGICAL NETWORK COMBINING TEXT MINING AND DATA WAREHOUSE APPROACHES
Ralf Hofestädt, Björn Sommer, Evgeny Tiys, Benjamin Kormeier, Klaus Hippe, Sebastian Janowski, Timofey Ivanisenko, Anatoly Bragin, Patrizio Arrigo, Pavel Demenkov, Alexey Kochetov, Vladimir Ivanisenko, Nikolay Kolchanov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology 2011]
Visualization and analysis of a cardio vascular disease- and MUPP1-related biological network combining text mining and data warehouse approaches
Hofestädt R., Sommer B., Tiys E.S., Kormeier B., Hippe K., Janowski S.J., Ivanisenko T.V., Bragin F.O., Arrigo P., Demenkov P.S., Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Kolchanov N.A.
[International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB 11)]
Wheat promoter sequences for transgene expression.
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.
[The International Conference Wheat Genetic Resources and Genomics (WGRG 2011)]
Супрессия активности гена пролиндегидрогеназы повышает неспецифическую устойчивость растений к абиотическим стрессам.
Колодяжная Я.С., Коваль В.С., Романова А.В., Титов С.Е., Кочетов А.К
[2-й Всероссийский симпозиум "Физиология трансгенного растения и проблемы биобезопасности", Москва.]
2010 A database of plant promoters for transgenesis.
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В.
[International Conference Plant Genetics, Genomics and Biotechnology]
Computational genomics: searching for new proteome components
Kochetov A.V.
[Joint Indo-Russian Workshop "Predictive Biology using Systems and Integrative analysis and Methods", November 15-19, 2010, p 8-9, Chandigarh, India]
The physiological role of deltaOAT gene in plant development and stress response
Gerasimova S.V., Gorelova V.V., Romanova A.V., Koval V.S., Kochetov A.V.
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
The role of dsRNA binding and hydrolytic activities in the virus-resistance of higher plants
Trifonova E.A., Saveleva A.V., Romanova A.V., Sangaev S.S., Kochetov A.V.
[Plant Genetics, Genomics and Biotechnology Conference. Novosibirsk]
2009 Interrelation between the translation initiation signal and the N-end of encoded protein in human mRNAs
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow]
TGP (Transgene Promoters): a database of biotechnologically important plant gene promoters.
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Кочетов А.В.
[The 5th German-Russian Forum Biotechnology]
Трансгенные растения рапса и редьки масличной с повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам
Сютикова О.С., Любинская А.В., Левенко Б.А., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В.
[Мат. 5 Межд. Конгр. "Биотехнология:состояние и перспективы развития"]
2008 ANDCell: a tool for automated knowledge extraction from PubMed and reconstruction of association networks
Ivanisenko V.A., Yarkova E.E., Demenkov P.S., Kochetov A.V.
[Proceedings of the 5th International Symposium on Integrative Bioinformatics. P 327, 20-22 August 2008, Germany]
Генетически модифицированные растения картофеля (Solanum tuberosum L.), характеризующиеся повышенной устойчивостью к засолению
Кирсанова С.Н., Колодяжная Я.С., Кочетов А.В.
[Нанотехнологии в сельском хозяйстве. РГАУ-МСХА, Москва, 9-11 декабря 2008]
Генетически модифицированные растения табака с пониженной активностью пролиндегидрогеназы характеризуются повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам
Колодяжная Я.С., Левенко Б.А., Кочетов А.В.
[Тез. IX Междун. конференции "Биология клеток растений in vitro и биотехнология", Звенигород]
Получение и анализ трансгенных растений, несущих ген пирролин-5-карбоксилатсинтeтазы Medicago truncatula
Сютикова О.С., Рахметов Д.Б., Кочетов А.В., Левенко Б.А.
[Тез. IX Междун. конференции "Биология клеток растений in vitro и биотехнология", Звенигород]
2007 Signals influencing general translational efficiency of eukaryotic mRNAs
Ivanisenko VA, Mischenko EL, Kochetov A.V., Ivanisenko V.A., Titov I.I., Kolchanov N.A., Sarai A.
[3-rd Moscow Conference on Computational Molecular Biology "MCCMB' 2007". July 27-31, 2007, Moscow, Russia]
Перспективы получения ГМ растений картофеля, несущих антисмысловой супрессор гена пролиндегидрогеназы и обладающих повышенной устойчивостью к абиотическим стрессам
Колодяжная Я.С., Титов С.Е., Кочетов А.В
[Международная научно-практическая конференция "Картофелеводство XXI века: проблемы и решения", 10-12 июля, Минск]
Повышенная устойчивость трансгенных растений табака, экспрессирующих ген панкреатической рибонуклеазы быка, к вирусу табачной мозаики
Трифонова Е.А., Сапоцкий М.В., Комарова М.Л., Кочетов А.В., Малиновский В.И.
[Материалы Международной конференции "Современная физиология растений: от молекул до экосистем" Сыктывкар]
Супрессия активности гена пролиндегидрогеназы повышает неспецифическую устойчивость растений к абиотическим стрессам
Колодяжная Я.С., Коваль В.С., Романова А.В., Титов С.Е., Кочетов А.К.
[2-й Всероссийский симпозиум "Физиология трансгенного растения и проблемы биобезопасности" (Москва 22-25 октября 2007 г.)]
Трансгенные растения табака, экспрессирующие гены экстраклеточных рибонуклеаз, как модель для изучения молекулярных механизмов неспецифической устойчивости растений к падля изучения молекулярных механизмов неспецифической устойчивости растений к патогенам
Трифонова Е.А., Сапоцкий М.В., Романова А.В., Сангаев С.С., Малиновский В.И., Кочетов А.В
[Всероссийская научная конференция "Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды". Иркутск]
2006 Alternative coding potential of mammalian mRNAs
Kochetov A.V.
[Conf. on Translational Control and Non-coding RNA. Nove Hrad, Czech Rep., Nov. 8-12]
Distant education and collaborative projects: the Network www-site
Kochetov A.V.
[4th Meeting of German/Russian Virtual Network of Bioinformatics. Bielefeld, Germany, October 9-10]
TGP (Transgene Promoters): a database of biotechnologically important plant gene promoters.
Smirnova O.G., Ibragimova S.S., Grigorovich D.A., Kochetоv A.V.
[The 5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006)]
The contribution of alternative translation start sites to human protein diversity
Kochetov A.V., Sarai A., Kolchanov N.A.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
The role of alternative translation start sites in generation of eukaryotic protein diversity
Kochetov A.V.
[8th International Engelhardt Conference on Mollecular Biology "RNA-protein interactions", Moscow, August 19-24]
Компьютерные подходы к исследованию влияния полиморфизмов на экспрессию генов и функцию белков.
Колчанов Н.А., Иванисенко В.А., Кочетов А.В., Игнатьева Е.В., Пономаренко М.П., Орлова Г.В., Меркулова Т.И., Ощепков Д.Ю., Аман Е.Э., Кузнецова Т.Н., Мордвинов В.А., Деменков П.С., Пинтус С.С., Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Подколодный Н.Л., Подколодная Н.Н., Турнаев И.И., Апасьева Н.В., Губина М.А., Ромащенко А.Г.
[International conference “Basic Science for Biotechnology and Medicine” September 3-7, 2006, Novosibirsk. Russia.]

Гранты

2010 Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных
Дымшиц Г.М., Меркулова Т.И., Раушенбах И.Ю., Кочетов А.В., Грунтенко Н.Е., Попова Н.А., Адоньева Н.В., Васильев Г.В., Левицкий В.Г., Вишневский О.В., Антонцева Е.В., Пахарукова М.Ю., Карпова Е.К., Богомолова Е.В., Иванов М.К., Федосеева Л.А., Ощепков Д.Ю., Шарипов Р.Н., Глушков С.А., Ведерников В.Е., Брызгалов Л.О., Климова Н.В., Сангаев С.С., Волкова О.А., Ершов Н.И., Герасимова С.В., Брагин А.Г., Прасолова М.А., Рязанова М.А., Прокопьев Р.А., Горелова В.В., Савельева А.В., Попов Е.Г., Шевелев О.Б., Климов Л.О.

Исследование роли экстраклеточных рибонуклеаз в механизме вирусоустойчивости растений
Кочетов Алексей Владимирович Волкова Оксана Анатольевна Сангаев Содном Сергеевич Трифонова Екатерина Александровна Ибрагимова Салмаз Магомедсаидовна

2009 Разработка программно-информационного комплекса для исследования механизмов регуляции экспрессии генов эукариот
Кочетов А.В., Подколодный Н. Л., Игнатьева Е. В., Подколодная О. А., Ананько Е. А., Рассказов Д. А., Подколодная Н. Н., Волкова О. А.

2006 Хромосомная и генетическая инженерия как метод изучения генома и экспрессии генов у растений
Дейнеко Елена Викторовна Першина Лидия Александровна Салина Елена Артемовна Кочетов Алексей Владимирович Загорская Алла Алексеевна Сидорчук Юрий Владимирович Пермякова Наталья Владиславовна Маренкова Татьяна Владиславовна Филипенко Елена Анатольевна Щапов Николай Семенович Щапова Антонина Ивановна Леонова Ирина Николаевна Трифонова Екатерина Александровна Хлесткина Елена Константиновна Добровольская Оксана Борисовна Бильданова Лариса Леонидовна Трубачеева Наталия Викторовна Ефремова Татьяна Тимофеевна Лайкова Людмила Ивановна Силкова Ольга Геннадьевна Адонина Ирина Григорьевна


Научное руководство

2012 Трансляционно-значимые характеристики 5’-нетранслируемых районов мРНК эукариотических генов
Кочетов А.В.
[Волкова Оксана Анатольевна]
Исследование роли гена орнитинаминотрансферазы в развитии и стрессоустойчивости растений
Кочетов А.В.
[Герасимова Софья Викторовна]
2010 Изучение роли экстраклеточных рибонуклеаз на модели трансгенных растений табака (Nicotiana tabacum L.)
Кочетов А.В.
[Сангаев Содном Сергеевич]

Учебные курсы

2015 Генетика
Хлесткина Е.К., Кочетов А.В., Баттулин Н.Р., Пилипенко А.С., Шеховцов С.В.

2011 практикум по генной инженерии
2003 Организация и функционирование молекулярно-генетических систем II: регуляторные геномные последовательности (отв. за чтение курса - Игнатьева Е.В.)

Патенты

2016 Гены устойчивости к грибным патогенам (ГУГП)/ Pathogenesis-Related Genes (PRG)
Смирнова О.Г., Кочетов А.В., Рассказов Д.А.

2015 Программный комплекс для предсказания потенциально транслируемых открытых рамок считывания «AUGWeb»/ Software package for prediction of efficiently translated hidden alternative open reading frames «AUGWeb»
Лашин С.А., Кочетов А.В., Афонников Д.А., Зураев Б.С., Клименко А.И.

2012 База данных "Внешние информационные ресурсы" (ВИР)/ DATABASE "External Information Resources" (EIR)
Ибрагимова Салмаз

База данных «Трансляционные сигналы» (ТРАНСИГ)/ Database «TRANslational SIGnals» (TRANSIG)
Смирнова О.Г., Кочетов А.В.

2010 Рекомбинантная плазмида, обеспечивающая экспрессию гена экстраклеточной рибонуклеазы Zinnia elegans в трансгенных растениях (варианты), и способ получения вирусоустойчивых форм растений
145. Трифонова Е.А., Сангаев С.С., Романова А.В., Кочетов А.В., Сапоцкий М.В., Малиновский В.И., Шумный В.К.

2007 Способ получения трансгенных растений, устойчивых к вирусной инфекции
Трифонова Е.А., Кочетов А.В., Комарова М.Л., Шумный В.К., Малиновский В.И., Сапоцкий М.В.

База данных: Трансген-Промотор (TGProm)
Смирнова О.Г., Ибрагимова С.М., Кочетов А.В., Григорович Д.А., Колчанов Н.А.


Диссертации

2013 Структурно-функциональная организация района инициации трансляции в мРНК эукариотических генов [Доктор]
© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.