ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Ефимов Вадим Михайлович, д. б. н.

Подразделение: 013. Лаб. молекулярно-генетич. систем
Совместительство: 108. Лаб. системной генетики
Должность: ведущий научный сотрудник
Комната: 1319
Email: efimov@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*1319


Персональная информация

Рабочий адрес

630090. Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия

Дата рождения

19.12.1948

Образование

ММФ НГУ – 1970 – математика

Награды

Лауреат премии Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры

Медаль "За заслуги перед Томским государственным угиверситетом"

Область научных интересов

Экология, биоинформатика

Область рабочих интересов

Многомерный анализ биологических данных

Хобби

Работа, танцы

Контакты в социальных сетях, блогах и т.д.

Одноклассники



Публикации

2016 COMPARATIVE TRANSCRIPTIONAL PROFILING OF HYPOTHALAMUS IN ISIAH RATS WITH INHERITED STRESS-INDUCED ARTERIAL HYPERTENSION AND NORMOTENSIVE WISTAR ALBINO GLAXO RATS
Klimov Leonid, Ershov Nikita, Efimov Vadim, Markel Arkady, Redina Olga
[J HYPERTENS]
Genome-wide transcriptome analysis of hypothalamus in rats with inherited stress-induced arterial hypertension
Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel and Olga E. Redina
[BMC GENET]
Molecular determinants of the adrenal gland functioning related to stress-sensitive hypertension in ISIAH rats
Larisa A. Fedoseeva, Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Yury V. Alexandrovich, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel, Olga E. Redina
[BMC GENOMICS]
The gene-expression profile of renal medulla in ISIAH rats with inherited stress-induced arterial hypertension
Marina A. Ryazanova, Larisa A. Fedoseeva, Nikita I. Ershov, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel and Olga E. Redina
[BMC GENET]
The role of environmental factors for the composition of microbial communities of saline lakes in the Novosibirsk region (Russia)
Bryanskaya Alla V., Malup Tatyana K., Lazareva Elena V., Taran Oxana P., Rozanov Alexey S., Efimov Vadim M., Peltek Sergey E.
[BMC MICROBIOL]
2015 Asynchrony between Host Plant and Insects-Defoliator within a Tritrophic System: The Role of Herbivore Innate Immunity.
Martemyanov V.V., Pavlushin S.V., Dubovskiy I.M., Yushkova Y.V., Morosov S.V., Chernyak E.I., Efimov V.M., Ruuhola T., Glupov V.V.
[PLoS One]
Identification of Bacillus strains by MALDI TOF MS using geometric approach
Konstantin V. Starostin, Evgeny A. Demidov, Alla V. Bryanskaya, Vadim M. Efimov, Alexey S. Rozanov & Sergey E. Peltek
[SCI REP-UK]
2014 Разработка программного комплекса JACOBI 4 для многомерного анализа микрочиповых данных.
Полунин Д.А., Штайгер И.А., Ефимов В.М.
[Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии]
2013 Directional Asymmetry of Morphological Traits During Postnatal Ontogeny in Root Vole Microtus oeconomus Pall.(Rodentia, Cricetidae)
Kovaleva, Vera Yu, Vadim M. Efimov, Yuri N. Litvinov.
[Journal of Siberian Federal University. Biology]
Геометрические свойства эволюционных дистанций
В.М. Ефимов, М.А. Мельчакова, В.Ю. Ковалева
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Землеройки (SORICIDAE, EULIPOTYPHLA) Сибири и Дальнего Востока: комбинирование и поиск конгруэнтности молекулярно–генетических и морфологических данных
В.Ю. Ковалева, Ю.Н. Литвинов, В.М. Ефимов.
[Зоологический журнал]
Цикличность водяной полевки как фактор биоразнообразия в экосистемах Западной Сибири
Ю.Н. Литвинов, В.М. Ефимов, В.Ю. Ковалева, Ю.К. Галактионов.
[Экология]
2012 Анализ соответствия и комбинирование молекулярно-генетических и морфологических данных в зоологической систематике
Ковалева В. Ю., Абрамов С. А., Дупал Т. А., Ефимов В. М., Литвинов Ю. Н.
[Известия РАН. Серия биологическая]
2011 Effects of the alpha- and gamma-polymorphs of glycine on the behavior of catalepsy prone rats
Markel A.L., Achkasov A.F., Alekhina T.A., Prokudina O.I., Ryazanova M.A., Ukolova T.N., Efimov V.M., Boldyreva E.V., Boldyrev V.V.
[PHARMACOL BIOCHEM BE]
Влияние географических популяций сосны на элементный состав фитомассы и почв
Тараканов В.В., Чанкина О.В., Куценогий К.П., Наумова Н.Б., Макарикова Р.П., Милютин Л.И., Роговцев Р.В., Ефимов В.М.
[Поверхность. Рентгеновские, синхротронные и нейтронные исследования]
Наследуемые изменения фенотипа в динамике численности водяной полевки (Arvicola terrestris L.) в Северной Барабе
Ковалева В.Ю., Ефимов В.М., Галактионов Ю.К. Назарова Г.Г.
[Сибирский экологический журнал]
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем
Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А.
[Вестник НГУ Серия:Информационные технологии]
Распределение мобильных элементов на политенных хромосомах до и после селекции по количественному признаку у Drosophila melanogaster
Захаренко Л.П., Перепелкина М.П., Антоненко О.В., Выхристюк О.В., Ефимов В.М., Васильева Л.А.
[Cell and Tissue Biology]
Статистические оценки экспрессии мобильных элементов в геноме человека на основе клинических данных экспрессионных микрочипов
Ю.Л. Орлов, В.М. Ефимов, Н.Г. Орлова
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2010 SNPs in the HIV-1 and HIV-2 TATA Box and the AIDS pandemic
Suslov V.V., Ponomarenko M.P., Savinkova L.K., Ponomarenko P.M., Efimov V.M., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Динамика направленной асимметрии билатеральных признаков в популяционном онтогенезе полевки-экономки
В.Ю. Ковалева, В.М. Ефимов, Ю.Н. Литвинов.
[ZOOL ZH]
Применение методов многомерной статистики для ранней диагностики лучших по росту популяций сосны в географических культурах
Ефимов В.М., Тараканов В.В., Роговцев Р.В.
[Хвойные бореальной зоны]
2009 Многомерный анализ изменчивости морфологических, химических и хозяйственных признаков в роде (Amaranthus L.)
В. М. Ефимов, Н. Б. Железнова, А. В. Железнов
[Информационный вестник ВОГИС]
Применение неметрического многомерного шкалирования для мультиплатформенной обработки микрочиповых экспрессионных данных
Ефимов В.М. Катохин А.В.
[Информационный вестник ВОГИС]
2008 Эпизоотический процесс бешенства: роль диких млекопитающих, периодичность
Сидоров Г.Н., Сидорова Д.Г., Колычев Н.М., Ефимов В.М.
[Сибирский вестник сельскохозяйственной науки]
2006 Rats with inherited stress-induced arterial hypertension (ISIAH strain) display specific quantitative trait loci for blood pressure and for body and kidney weight on chromosome 1
OE Redina, NA Machanova, VM Efimov and AL Markel
[CLIN EXP PHARMACOL P]
Многомерный анализ и функциональная аннотация ДНК-чиповых профилей транскрипции генов, участвующих в адипогенезе
Катохин А.В., Ефимов В.М., Бадратинов М.Ш., Камнева О. К., Мордвинов В.А.
[S AFR J CHEM-S-AFR T]
Пространственная организация сообществ животных: теоретические и эмпирические представления
Равкин Ю.С., Ефимов В.М.
[ZOOL ZH]
Роль генетических факторов в ландшафтно-географической изменчивости водяной полевки (Arvicola terrestris L.)
Ковалева В.Ю., Ефимов В.М, Фалеев В.И, Галактионов Ю.К., Абрамов С.А., Назарова Г.Г., Музыка В.Ю., Епифанцева Л.Ю
[RUSS J ECOL+]

Конференции

2016 Comparative transcriptional profiling of hypothalamus in ISIAH rats with inherited stress-induced arterial hypertension and normotensive Wistar Albino Glaxo rats
Leonid Klimov, Nikita Ershov, Vadim Efimov, Arcady Markel, Olga Redina
[Hypertension Seoul 2016]
Genetic and molecular mechanisms crucial for hypertension development in the ISIAH rats.
O.E. Redina, L.O. Klimov, M.A. Ryazanova, L.A. Fedoseeva, T.O. Abramova, Yu.V. Alexandrovich, S.E. Smolenskaya, Ye.V. Antonov, N.I. Ershov, V.M. Efimov, A.L. Markel.
[Десятая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology), BGRS\SB-2016.]
Microbial Community of the Extremal Ecosystems of the Uzon Caldera (Kamchatka)
S.E. Peltek, A.V. Bryanskaya, Y.E. Uvarova, A.S. Rozanov, T.V. Ivanisenko, T.K. Malup, V.A. Ivanisenko, E.V. Lazareva, O.V. Saik, V.M. Efimov, S.M. Zhmodik, O.P. Taran, N.M. Slynko, S.V. Shekhovtsov, V.N. Parmon, N.L. Dobretsov, N.A. Kolchanov
[7th World Congress onMicrobiology]
Поиск мишеней для лекарственной терапии стресс-зависимой формы артериальной гипертензии на модели крыс НИСАГ.
Редина О.Е., Абрамова Т.О., Рязанова М.А., Антонов Е.В., Смоленская С.Э., Ефимов В.М., Маркель А.Л.
[Форум «Биомедицина - 2016»: Перспективы развития медицинской науки в период нового синтеза знаний.]
2015 Генетические основы центральных механизмов формирования стресс-зависимой артериальной гипертензии у крыс линии НИСАГ.
Редина О.Е., Федосеева Л.А., Абрамова Т.О., Климов Л.О., Смоленская С.Э., Ефимов В.М., Маркель А.Л.
[Седьмая всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Фундаментальные аспекты компенсаторно-приспособительных процессов»]
МНОГОМЕРНЫЙ АНАЛИЗ КЛИМАТИЧЕСКИХ РЯДОВ В СВЯЗИ С ПРОБЛЕМОЙ ГЛОБАЛЬНОГО ПОТЕПЛЕНИЯ MULTIDIMENSIONAL ANALYSIS OF CLIMATE SERIES IN CONNECTION WITH THE PROBLEM OF GLOBAL WARMING
Ефимов В.М., Гончаров Н.П.
[4-е МЕЖДУНАРОДНОЕ СОВЕЩАНИЕ ПО СОХРАНЕНИЮ ЛЕСНЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ СИБИРИ]
Модель сортов пшениц нового поколения: скороспелость и несимбиотическая азотфиксация
Гончаров Николай Петрович, Степаненко Ирина Лембитовна, Ефимов Вадим Михайлович
[международная конференция “Генетическая интеграция прокариот и эукариот: фундаментальные исследования и современные агротехнологии”]
2012 Recognition of NFAT5 binding sites.
Ananko E.A., Levitsky V.G., Efimov V.M., Afonnikov D.A.
[The Eighth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS'2012)]
2011 Age- and sex-associated variations in the directional asymmetry of root vole traits
Vera Yu. Kovaleva, Yuri N. Litvinov, Vadim M. Efimov.
[VI-th European Congress of Mammalogy (ECM 2011)]
Многомерный анализ микрочиповых данных для выявления потенциальных маркеров болезни Хантингтона
Шайдуллин И.И., Катохин А.В., Ефимов В.М.
[Межд. конф. "Совр. пробл. математики, информатики и биоинформатики", посв. 100-летию А.А. Ляпунова]
О метрических свойствах эволюционных расстояний
Мельчакова М.А., Ефимов В.М.
["Совр. пробл. математики, информатики и биоинформатики", посв. 100-летию А.А. Ляпунова]
2010 Reduction of gene net dynamic models using proper orthogonal decomposition
V.M. Efimov, A.S. Novikov, A.A. Tikhonov, I.R. Akberdin, V.A. Likhoshvai
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
Association Between Aggressive Behavior And Candidate Gene Polymorphisms: The Brain Serotonergic System In Pigs
Terenina E., Bazovkina D., Efimov V., Rousseau S., Salin F., Monllor S., D’Eath R., Turner S., Kulikov A., Mormede P
[9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production Leipzig, Germany, 2010]
Bioinformatic analysis of rare single-nucleotide polymorphism combinations in the human genome.
Yudin N.S., Ignatieva E.V., Efimov V.M.
[The Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure \ Systems Biology (BGRS'2010)]
SNP ТАТА-бокса ВИЧ-1 и пандемия СПИД
Суслов В.В., Пономаренко П.М., Пономаренко М.П., Ефимов В.М., Савинкова Л.К., Колчанов Н.А.
[Проблемы экологии. Чтения памяти проф. М.М.Кожова. Иркутск, 2010]
SNPs IN THE HIV-1 TATA BOX AND THE AIDS PANDEMIC
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov (6)
[IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky Crimean meeting."Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution".]
SNPs in the hiv-1 TATA box and the aids pandemic
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, M.P. Ponomarenko, L.K. Savinkova, N.A. Kolchanov
[Crimean meeting. IIIrd International conference, deducated to N.W. Timofeeff-Ressovsky "Modern problems of genetics, radiobiology, radioecology and evolution". Alushta, 9-14 october, 2010]
Search for genetic loci associated with the manifestation of physiological characteristics of rats based on incomplete experimental data with the usage of artificial neural networks.
Tikhonov A.A., Redina O.E., Efimov V.M., Markel A.L.
[The Seventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS 2010), Novosibirsk, Russia June 20-27, 2010. P 285.]
The transcriptional profile of retinal pigment epithelium/choroid of oxys rat as a background for the retinopathy development
Anton Markovets. Kozhevnikova O.S. Efimov V.M., Kolosova N.G.
[7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk]
Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем
Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В., Ефимов В.М., Колчанов Н.А.
[XIII Российская конференция с участием иностранных ученых "Распределенные информационные и вычислительные ресурсы"(DICR'2010). Новосибирск, ИВТ СО РАН, 30 ноября - 4 декабря 2010 г. № гос. регистрации 0321100051]
2009 SNPs in the HIV-1 TATA Box and the AIDS Pandemic
V.V. Suslov, P.M. Ponomarenko, V.M. Efimov, L.K. Savinkova, M.P. Ponomarenko, N.A. Kolchanov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow]
Многомерные методы мультиплатформенной обработки микрочиповых экспрессионных данных
Ефимов В.М. Катохин А.В.
[Материалы Пятого Московского международного конгресса "Биотехнология: состояние и перспективы развития" . Часть II. (Москва, 16-20 марта 2009 г.) –М.: ЗАО "Экспо-биохим-технологии", РХ ТУ. С. 393-394.]
Регрессия "последовательность→сродство" ТАТА-бокса к ТВР и эволюция ВИЧ-1
В.В. Cуслов, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, В.М. Ефимов, Н.А. Колчанов
[5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.]
2008 Применение многомерного неметрического шкалирования в экологических исследованиях
В.М.Ефимов, В.Ю.Ковалева
[Всероссийская конференция "Актуальные проблемы строительной отрасли" (8-10 апреля 2008, НГАСУ (Сибстрин), Новосибирск). – Новосибирск: НГАСУ (Сибстрин)]
Эффективность экспрессии генов как функция их нуклеотидного состава
Матушкин Ю.Г., Лихошвай В.А., Ефимов В.М., Вишневский О.В.
[II-ая Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика" г. Пущино Московской области 7-13 сентября 2008 г.]
2007 Анализ поведения серых крыс: эффекты отбора по оборонительным реакциям на человека и перекрестного воспитания
И.З. Плюснина, В.М. Ефимов.
[Current Evolutionary Thinking in Biology, Medicine and Sociology. International Conference Dedicated to 90 Anniversary of Prof. Dmitry K. Belyaev 7-9 August 2007, Novosibirsk, Russia]
Идентификация высоко наследуемых "химических" признаков-компонент в популяции сосны
Ефимов В.М, Тараканов В.В, Наумова Н.Б, Ковалева В.Ю., Куценогий К.П, Макарикова Р.П, Чанкина О.В.
[Первое Международное совещание по сохранению лесных генетических ресурсов в Сибири (30 июля – 4 августа 2007, Барнаул, Россия).]
2006 EPI-GIS: GIS assisted computer tools for data accumulation, computer analysis and modeling in molecular epidemiology
Kolchanov N.A., Orlova G.V., Bachinsky A.G., Bazhan S.I., Shvarts Ya.Sh., Golomolzin V.V., Popov D.Yu., Efimov V.M., Tololo I.V., Ananko E.A., Podkolodnaya O.A., Il’ina E.N., Rogov S.I., Tretiakov V.E., Kubanova A.A., Govorun V.M.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Interpretation of results of som analysis of microarray data by principal components
Efimov V.M., Badratinov M.S., Katokhin A.V.
[5th International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS'2006), Novosibirsk, Russia (July 14-22)]
Генетические факторы краниометрической изменчивости природной популяции полевки-экономки (Microtus oeconomus)
Ковалева В.Ю., Ефимов В.М.
[Популяционная экология животных / Мат. межд. конф. "Проблемы популяционной экологии животных", посв. пам. И.А.Шилова. –Томск: ТГУ]

Гранты

2013 Интеллектуальный анализ и комбинирование гетерогенных данных
Ковалева Вера Юрьевна Штайгер Ирина Александровна Полунин Денис Андреевич

Изучение структуры генетической изменчивости морфологических (скелетных) признаков лисиц в условиях отбора по поведению
Харламова Анастасия Владимировна Ефимов Вадим Михайлович Владимирова Анастасия Владимировна Гулевич Римма Глебовна Шихевич Светлана Геннадьевна Шепелева Дарья Владимировна Мухамедшина Ирина Андреевна

2009 Анализ генетической детерминации интегрированных признаков организма с использованием методологии многомерной статистики и искусственных нейронных сетей
Трут Людмила Николаевна, Ефимов Вадим Михайлович, Оськина Ирина Николаевна, Харламова Анастасия Владимировна, Гулевич Римма Глебовна, Редина Ольга Евгеньевна, Смоленская Светлана Эдуардовна, Антонов Егор Владимирович, Рязанова Марина Анатольевна, Пыльник Татьяна Олеговна, Гербек Юрий Эмильевич, Кайковский Владислав Чеславович, Белокрылова Дина Олеговна, Серяпина Алиса Алексеевна


Учебные курсы

2015 Биометрия
Биостатистика
Биостатистика
Инженерная экология
Многомерный анализ биологических данных
Теория селекции
Шумный В.К., Хлесткина Е.К., Ефимов В.М.

2011 Экология
Многомерный анализ биологических данных

Патенты

2008 Программный пакет анализа портрета личности P-analyzer
Мигинский Д.С., Завьялов В.Ю., Ефимов В.М., Тимонов В.С., Сурнина Н.Ю.

© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.