ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Колмыков Семён Константинович

Подразделение: -
Совместительство: 143. Лаб.репродуктив. геномики человека
Комната: 3409
Email: kolmykovsk@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*5103


Scopus: https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=57205372843



Публикации

2021 Whole-exome sequencing analysis of human semen quality in Russian multiethnic population
Kolmykov S., Vasiliev G., Osadchuk L., Kleshchev M., Osadchuk A.
[Frontiers in Genetics]
2020 Analysis of NGS data on the transcriptional regulation
Kolmykov S.K., Evshin I.S., Kolpakov F.A.
[CEUR workshop proceedings]
Description, Characteristic And Algorithm For Creation Of A Dictionary Of Cell Types And Tissues In The Gtrd Database
Kulyashov M.A., Kolmykov S.K., Evshin I.S., Kolpakov F.A.
[CEUR workshop proceedings]
Disruptive natural selection by male reproductive potential prevents underexpression of protein-coding genes on the human Y chromosome as a self-domestication syndrome.
Ponomarenko M., Kleshchev M., Ponomarenko P., Chadaeva I., Sharypova E., Rasskazov D., Kolmykov S., Drachkova I., Vasiliev G., Gutorova N., Ignatieva E., Savinkova L., Bogomolov A., Osadchuk L., Osadchuk A., Oshchepkov D.
[BMC GENET]
GTRD: An integrated view of transcription regulation
Semyon Kolmykov, Ivan Yevshin, Mikhail Kulyashov, Ruslan Sharipov, Yury Kondrakhin, Vsevolod J Makeev, Ivan V Kulakovskiy, Alexander Kel, Fedor Kolpakov
[NUCLEIC ACIDS RES]
2019 Population size estimation for quality control of ChIP-Seq datasets
Semyon K. Kolmykov, Yury V. Kondrakhin, Ivan S. Yevshin, Ruslan N. Sharipov, Anna S. Ryabova, Fedor A. Kolpakov
[PloS One]
BioUML: an integrated environment for systems biology and collaborative analysis of biomedical data
Fedor Kolpakov, Ilya Akberdin, Timur Kashapov, Ilya Kiselev, Semyon Kolmykov, Yury Kondrakhin, Elena Kutumova, Nikita Mandrik, Sergey Pintus, Anna Ryabova, Ruslan Sharipov, Ivan Yevshin, Alexander Kel
[NUCLEIC ACIDS RES]
2018 GTRD: a database on gene transcription regulation - 2019 update
Yevshin I., Sharipov R., Kolmykov S., Kondrakhin Y., Kolpakov F.
[NUCLEIC ACIDS RES]
2016 The effect of xenobiotics on microRNA expression in the rat liver
Gulyaeva L.F., Chanyshev M.D., Kolmykov S.K., Ushakov D.S., Nechkin S.S.
[Biochemistry (Moscow). Suppl B.]
Сопряженность уровней микроРНК в сыворотке крови с количеством и функциональной активностью клеток гемо- и лимфопоэза при экспериментальном раке молочной железы
Коненков В.И., Лыков А.П., Кабаков А.В., Райтер Т.В., Бондаренко Н.А., Повещенко О.В., Казаков О.В., Повещенко А.Ф., Стрункин Д.Н., Колмыков С.К., Чанышев М.Д., Гуляева Л.Ф.
[Вопросы онкологии]
Эффект ксенобиотиков на экспрессию микроРНК в печени крыс
Гуляева Л.Ф., Чанышев М.Д., Колмыков С.К., Ушаков Д.С., Нечкин С.С.
[Биомедицинская химия]
2015 МикроРНК, как маркеры опухолевой прогрессии и супрессии экспериментального рака молочной железы у крыс WISTAR
Кабаков А.В., Райтер Т.В., Лыков А.П., Бондаренко Н.А., Повещенко О.В., Казаков О.В., Повещенко А.Ф., Стрункин Д.Н., Колмыков С.К., Чанышев М.Д., Гуляева Л.Ф., Коненков В.И.
[Исследования и практика в медицине]
Сопряженность тканевой экспрессии микроРНК при экспериментальном раке молочной железы у крыс WISTAR с циркулирующими уровнями микроРНК в крови и лимфе
Лыков А.П., Кабаков А.В., Райтер Т.В., Бондаренко Н.А., Повещенко О.В., Казаков О.В., Повещенко А.Ф., Стрункин Д.Н., Колмыков С.К., Чанышев М.Д., Гуляева Л.В., Коненков В.И.
[МЕЖДУНАРОДНЫЙ ЖУРНАЛ ПРИКЛАДНЫХ И ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ]
Уровни микроРНК в лимфе при экспериментальной модели рака молочной железы
Лыков А.П., Кабаков А.В., Райтер Т.В., Бондаренко Н.А., Повещенко О.В., Казаков О.В., Повещенко А.Ф., Стрункин Д.Н., Колмыков С.К., Чанышев М.Д., Гуляева Л.Ф., Коненков В.И.
[МЕЖДУНАРОДНЫЙ ЖУРНАЛ ПРИКЛАДНЫХ И ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ]
Уровни микроРНК в тканях молочной железы при экспериментальной модели рака молочной железы
Лыков А.П., Кабаков А.В., Райтер Т.В., Бондаренко Н.А., Повещенко О.В., Казаков О.В., Повещенко А.Ф., Стрункин Д.Н., Колмыков С.К., Чанышев М.Д., Гуляева Л.В., Коненков В.И.
[УСПЕХИ СОВРЕМЕННОГО ЕСТЕСТВОЗНАНИЯ]
2014 БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЕ И ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ ПОДХОДЫ К ИЗУЧЕНИЮ РОЛИ микроРНК В ВИДОСПЕЦИФИЧНОЙ ИНДУКЦИИ ЦИТОХРОМА Р4502В
Гуляева Л. Ф., Чанышев М. Д., Колмыков С. К., Колесников Н. Н.
[Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина]

Конференции

2021 Полноэкзомный анализ сперматогенеза в преселектированной выборке из российских мультиэтнических популяций
Осадчук А.В., Колмыков С.К., Васильев Г.В., Клещев М.А., Осадчук Л.В.
[NGS в медицинской генетике. Пятая международная научно-практическая конференция.]
2020 Whole-exome sequencing association studies on impaired spermatogenesis in different ethnic groups in Russia.
Kolmykov S.K. Vasiliev G.V. Ponomarenko M.P. Kleshev M.A. Osadchuk A.V. Osadchuk L.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/ Systems Biology The 12th International Multiconference]
2019 Combining GTRD ChIP-Seq datasets with FANTOM5’s transcription start sites for prediction of gene expression levels
Yuriy Kondrakhin, Semyon Kolmykov, Ivan Yevshin, Ruslan Sharipov, Anna Ryabova, Mikhail Kulyashov, Fedor Kolpakov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)]
GTRD: A DATABASE ON GENE TRANSCRIPTION REGULATION
Yevshin I.S., Sharipov R.N., Kolmykov S.K., Kondrakhin Yu.V., Kolpakov F.A
[INTERNATIONAL CONGRESS «BIOTECHNOLOGY: STATE OF THE ART AND PERSPECTIVES»]
Human cistrome - genome-wide map of human transcription factor binding sites derived from GTRD database
Semyon Kolmykov, Yuriy Kondrakhin, Ivan Yevshin, Ruslan Sharipov, Mikhail Kulyashov, Fedor Kolpakov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB)]
АНАЛИЗ NGS ДАННЫХ ПО РЕГУЛЯЦИИ ТРАНСКРИПЦИИ
Колмыков С.К., Евшин И.С., Колпаков Ф.А.
[АСПРЕДЕЛЕННЫЕ ИНФОРМАЦИОННО-ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫЕ РЕСУРСЫ. ЦИФРОВЫЕ ДВОЙНИКИ И БОЛЬШИЕ ДАННЫЕ (DICR-2019)]
ОПИСАНИЕ, ХАРАКТЕРИСТИКА И АЛГОРИТМ СОЗДАНИЯ СЛОВАРЯ КЛЕТОЧНЫХ ТИПОВ И ТКАНЕЙ В БАЗЕ ДАННЫХ GTRD
Куляшов М.А., Колмыков С.К., Евшин И.С., Колпаков Ф.А.
[РАСПРЕДЕЛЕННЫЕ ИНФОРМАЦИОННО-ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫЕ РЕСУРСЫ. ЦИФРОВЫЕ ДВОЙНИКИ И БОЛЬШИЕ ДАННЫЕ (DICR-2019)]
2018 New method for estimation of number of transcription factor binding sites using results of processing of ChIP-seq data by different peak callers
Kolmykov S., Kondrakhin Y.V., Kolpakov F.A.
[BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE\SYSTEMS BIOLOGY (BGRS\SB-2018)]

Гранты

2019 Интеграция и анализ омиксных данных по регуляции транскрипции, оценка влияния SNV
Колпаков Ф. А., Колмыков С. К., Кондрахин Ю. В.,Евшин И. С., Киселев И. Н., Кутумова Е. О., Пинтус С. С., Рябова А. С., Мандрик Н. В., Шарипов Р. Н.

© 2010-2021 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.