ИЦиГ  

Система учета научной деятельности (ASSA)

  Вход  

Волкова Оксана Анатольевна, к. б. н.

Подразделение: 054. Лаб. генной инженерии
Должность: научный сотрудник
Комната: 1131, 3201, 3009
Email: ov@bionet.nsc.ru
Рабочий: +7 (383) 363-49-63*1131


Персональная информация

Рабочий адрес

Г.  Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева д. 10, Россия

Дата рождения

10 февраля

Образование

КГУ – 1998 – специалист (клиническая биохимия)

МГУ – 1998 – повышение квалификации (молекулярная биология)

Аспирантура

ИЦиГ СО РАН, лабортория генной инженерии -1998-2001

Область научных интересов

биоинформатика, генетика, генная инженерия

Область рабочих интересов

регуляция инициации трансляции

Хобби

 

Контакты в социальных сетях, блогах и т.д.

 



Публикации

2016 Assessment of translational importance of mammalian mRNA sequence features based on Ribo-Seq and mRNA-Seq data
Oxana A. Volkova,Yury V. Kondrakhin†, Ivan S. Yevshin, Tagir F. Valeev,Ruslan N. Sharipov
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Оценка трансляционной значимости характеристик нуклеотидной последовательности мРНК млекопитающих на основе данных рибосомного профилирования
O.A.Волкова, Ю.В. Кондрахин, Р.Н.Шарипов
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2015 Влияние загрязнения атмосферного воздуха взвешенными веществами на сердечно-сосудистую систему.
А.Ф. Колпакова, Р.Н. Шарипов, О.А. Волкова
[Сибирский медицинский журнал]
2014 RiboSeqDB – a repository of selected human and mouse ribosome footprint and RNA-seq data
Sharipov R.N., Yevshin I.S., Kondrakhin Y.V., Volkova O.A.
[Virtual Biology]
2013 Hidden coding potential of eukaryotic genomes: non-AUG started ORFs
Kochetov A.V., Prayaga P.D., Volkova O.A., Sankararamakrishnan R.
[J BIOMOL STRUCT DYN]
2011 Tandem termination signal in plant mRNA
Kochetov A.V., Volkova O.A., Poliakov A., Dubchak I., Rogozin I.B.
[GENE]
2010 Interrelations between the nucleotide context of human start AUG codon, N-end amino acids of the encoded protein and initiation of translation
Volkova O.A. Kochetov A.V.
[J BIOMOL STRUCT DYN]
2008 uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs
Kochetov A.V., Ahmad S., Ivanisenko V., Volkova O.A., Kolchanov N.A., Sarai A.
[FEBS LETT]
2006 Взаимосвязь контекстной организации сигнала инициации трансляции и аминокислотной последовательности на N-конце белков эукариот
Волкова О.А., Титов С.Е., Кочетов А.В.
[BIOFIZIKA+]
Потенциальные открытые рамки считывания в 5”-нетранслируемых районах эукариотических мРНК
Волкова О. А., Кочетов А. В., Титов С. Е., Колчанов Н. А.
[BIOFIZIKA+]

Монографии

2008 Компьютерная транскриптомика. Трансляция. В монографии «Системная Компьютерная Биология». Под ред. Колчанов Н.А., Гончаров С.С., Лихошвай В.А., Иванисенко В.А.
Кочетов А.В., Вишневский О.В., Волкова О.А., Владимиров Н.В., Лихошвай В.А. Матушкин Ю.Г., Григорович Д.А., Нишида Х., Сараи А., Смирнова О.Г., Ибрагимова С.С., Пономаренко М.П., Титов И.И., Колчанов Н.А.


Конференции

2016 ASSESSMENT OF TRANSLATION EFFICENCY FROM RIBOSOME PROFILING AND MRNA-SEQ DATA
I.S. Yevshin, R.N. Sharipov, O.A. Volkova
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. BGRS2016 Novosibirsk, Russia]
ASSESSMENT OF TRANSLATIONAL IMPORTANCE OF MAMMALIAN MRNA SEQUENCE FEATURES BASED ON RIBO- AND MRNA-SEQ DATA
Yu.V. Kondrakhin, R.N. Sharipov, O.A. Volkova
[The Tenth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. BGRS 2016 Novosibirsk, Russia]
Оценка эффективности трансляции на основании данных рибосомного профилирования и mRNA-seq
ИС Евшин, ОА Волкова,ФА Колпаков
[NGS в медицинской генетике]
2015 Estimation of translational importance of mammalian mRNA nucleotide sequence characteristics based on ribosomal profiling data
O.A. Volkova, Y.V. Kondrakhin, R.N. Sharipov
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15)]
2014 The mRNA features important for translation initiation revealing using ribosome profiling data
Gluschenko O., Sharipov R. N., Kondrakhin Yu.V., Volkova O.A.
[The Ninth International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. BGRS\SB-2014]
2011 The mRNA characteristics potentially involved in recognition of non-AUG start codons in yeast mRNAs
Volkova O. A., Kochetov A. V.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology]
2010 Role of N-end amino acids in translation of human proteins
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
2009 Interrelation between the translation initiation signal and the N-end of encoded protein in human mRNAs
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Moscow]
2008 Fine structure of mammalian translation initiation signal
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
2007 Contextual organization of 3’-end context of translation start site in eukaryotic mRNAs
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Moscow Conference on Computational Molecular Biology]
Взаимосвязь контекстной организации сигнала инициации трансляции и аминокислотной последовательности на N-конце белков ряда эукариот
Волкова О.А., Кочетов А.В.
[Международная молодежная научно-методическая конференция "Проблемы молекулярной и клеточной биологии", г. Томск]
2006 Amino acid preferences at the N-terminal part of eukaryotic proteins correlating with a specific contextual organization of translation initiation signal. Proc. 5th Intern.
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Bioinformatics of Genome Regulation and Structure]
Interrelationship between N-terminal region of eukaryotic proteins and specific contextual organization of translation start site
Volkova O.A., Kochetov A.V.
[Translational Control and Non-Coding RNA Meeting]

Гранты

2014 Построение модели и предсказание эффективности трансляции мРНК млекопитающих по ее первичной последовательности на основе данных по рибосомному профилированию.
Шарипов Руслан Нильевич, инж.-прогр. 1 кат. ФГБУН КТИ ВТ СО РАН, исполнитель Кондрахин Юрий Bасильевич, с.н.с. ФГБУН КТИ ВТ СО РАН, исполнитель Евшин Иван Сергеевич, инж.-прогр. 1 кат. ФГБУН КТИ ВТ СО РАН, исполнитель Свичкарев Анатолий Владленович, студ. ФГАОУВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет» (НГУ), исполнитель.

2010 Молекулярные механизмы стресс-специфического контроля экспрессии генов животных
Дымшиц Г.М., Меркулова Т.И., Раушенбах И.Ю., Кочетов А.В., Грунтенко Н.Е., Попова Н.А., Адоньева Н.В., Васильев Г.В., Левицкий В.Г., Вишневский О.В., Антонцева Е.В., Пахарукова М.Ю., Карпова Е.К., Богомолова Е.В., Иванов М.К., Федосеева Л.А., Ощепков Д.Ю., Шарипов Р.Н., Глушков С.А., Ведерников В.Е., Брызгалов Л.О., Климова Н.В., Сангаев С.С., Волкова О.А., Ершов Н.И., Герасимова С.В., Брагин А.Г., Прасолова М.А., Рязанова М.А., Прокопьев Р.А., Горелова В.В., Савельева А.В., Попов Е.Г., Шевелев О.Б., Климов Л.О.

Исследование роли экстраклеточных рибонуклеаз в механизме вирусоустойчивости растений
Кочетов Алексей Владимирович Волкова Оксана Анатольевна Сангаев Содном Сергеевич Трифонова Екатерина Александровна Ибрагимова Салмаз Магомедсаидовна

2009 Разработка программно-информационного комплекса для исследования механизмов регуляции экспрессии генов эукариот
Кочетов А.В., Подколодный Н. Л., Игнатьева Е. В., Подколодная О. А., Ананько Е. А., Рассказов Д. А., Подколодная Н. Н., Волкова О. А.


Диссертации

2012 Трансляционно-значимые характеристики 5`-нетранслируемых районов мРНК эукариотических генов [Кандидат]
© 2010-2017 ИЦиГ СО РАН. Все права защищены.