1. Основное направление фундаментальных и фундаментально-ориентированных исследований
Механизмы регуляции и эволюция мейотический рекомбинации у животных (группа мейоза).
Разработка и применение методов генетического анализа для идентификации и картирования генов, контролирующих разнообразие по сложным признакам в популяциях животных и человека (группа методов генетического анализа).
2. Задачи, решаемые в настоящее время в рамках бюджетного проекта
В рамках базового бюджетного проекта VI.53.1.4.«Молекулярная и функциональная организация и эволюция хромосом эукариот» (координатор - д.б.н. Н.Б. Рубцов) проводится изучение молекулярного состава, пространственной организации и особенностям синапсиса, рекомбинации и сегрегации половых хромосом, находящихся на разных стадиях их эволюции – от возникновения до деградации. Результаты данного исследования позволят пролить свет на механизмы возникновения и эволюции половых хромосом животных и специфику действия этих механизмов в разных таксонах. В рамках данного проекта будут установлены причины утраты способности к синапсису и рекомбинации между половыми хромосомами у асинаптических видов млекопитающих и выявлены альтернативные механизмы ахиазматической сегрегации половых хромосом. Результаты данного исследования могут быть полезны для выявления механизмов нарушения синапсиса, рекомбинации и сегрегации половых хромосом человека и сельско-хозяйственных животных.
В рамках базового бюджетного проекта «Молекулярно-генетические механизмы процесса доместикации, комплексных поведенческих, морфологических и физиологических признаков: экспериментальные исследования на селекционных моделях животных» (координатор – д.б.н., проф. А.Л. Маркель), проводится разработка и исследование свойств методов генетического картирования, основанных на региональном анализе ассоциаций и позволяющих суммарно учитывать вклад большого числа редких аллелей одного или нескольких генетических локусов на формирование признака. В результате этих разработок будут созданы методы, позволяющие вовлекать в анализ ассоциаций результаты секвенирования экзома и одновременно тестировать все редкие варианты в пределах одного гена или метаболического пути. Разработанные методы позволят не только идентифицировать дополнительные локусы, не выявляемые полногеномным анализом ассоциаций, но и однозначно указать на ген, лежащий в этом локусе.
3. Прикладные разработки
Разработаны и представлены в открытом доступе пакеты программ для идентификации и картирования генов, контролирующих разнообразие по сложным признакам в популяциях животных и человека.
4. Иллюстрированное описание лучших результатов, полученных подразделением за последние 5 лет
1. Разработан новый метод полногеномного анализа ассоциаций – главного инструмента картирования генов человека. По точности анализа новый метод GRAMMAR-Gamma соответствует лучшим из существующих методов, тогда как по скорости превышает их на порядки. Это – единственный метод, который может быть использован для анализа данных, полученных при секвенировании генома. Статья, описывающая метод, опубликована в журнале Nature Genetics.
Svishcheva GR, Axenovich TI, Belonogova NM, van Duijn CM, Aulchenko YS, Rapid variance-components based method for whole genome association analysis, Nature Genetics, 2012, 44(10):1166-70.
Рисунок 1. Сравнение времени работы GRAMMAR-Gamma и самых быстрых из существующих методов.
Впервые получены данные, свидетельствующие о зависимости степени синаптической подгонки от локализации сайтов рекомбинации в пределах инверсии. Если кроссинговер произошел в середине инверсионной петли, то замещение гомологичного синапсиса негомологичным начнется с двух концов петли, достигнет середины, и линейный бивалент сформируется практически беспрепятственно. Если же обмен произошел где угодно, но не в середине петли, то процесс подгонки «упрется» в рекомбинационную точку.
Биваленты хромосомы 1 у мыши, гетерозиготной по инверсии в этой хромосоме. Клетки окрашены антителами к белку синаптонемного комплекса (красный сигнал) и белку MLH1 (зеленый сигнал). Стрелками показаны границы инверсии. Инверсионная петля варьирует по размеру от 60% длины хромосомы (слева) до 0% – справа. Во всех случаях инвертированный участок содержит один сигнал MLH1 – одну точку кроссинговера. Статья, описывающая это явление, опубликована в журнале Chromosome Research. Torgasheva A.A., Rubtsov N.B., Borodin P.M. Recombination and synaptic adjustment in oocytes of mice heterozygous for a large paracentric inversion // Chromosome Research. 2013. V. 21. P. 37-48.
5. Задачи, планируемые на перспективу
1. Изучение влияния половых и кортикостероидных гормонов, а также их синтетических аналогов, используемых в клинический и ветеринарной практике, на синапсис нормальных и перестроенных хромосом, на частоту и распределение рекомбинационных событий по хромосомам, на эффективность репарации двунитевых разрывов ДНК, на апоптоз генеративных клеток млекопитающих с использованием современных методов молекулярной цитогенетики и иммуноцитохимии и с применением современных средств световой, электронной и лазерной микроскопии. Решение данной задачи позволит выявить новый уровень регуляции процесса рекомбинации, сделать важный шаг к открытию надхромосомных факторов, обеспечивающих быструю реакцию организма на изменяющиеся условия среды и влияющих на размах и спектр генетического разнообразия в потомстве и его совокупную приспособленность, установить возможные эффекты гормональных препаратов на синапсис, рекомбинацию и сегрегацию хромосом и, следовательно, на репродуктивные характеристики человека и животных.
2. Расширение методической базы для картирования комплексных признаков человека и сельскохозяйственных животных, используя информацию о нуклеотидных последовательностях экзома или полного генома. Работа будет направлена на создание новых методов и алгоритмов генетического анализа, на увеличение мощности существующих методов и на создание пакетов программ, реализующих эти методы, открытых для свободного доступа. Решение данной задачи позволит получать дополнительную информацию о генетическом контроле сложных признаков, в том числе распространенных болезней человека и хозяйственно-ценных признаков животных.
Rapid variance components-based method for whole-genome association analysis Svishcheva GR, Axenovich TI, Belonogova NM, van Duijn CM, Aulchenko YS. NAT GENET, 2012, 44 (10): 1166-1170. doi: 10.1038/ng.2410. 2012
2010
Распространение свиных эндогенных ретровирусов у разных форм Sus scrofa L. 1758 (Suidae, Mammalia) Айтназаров Р.Б., Никитин С.В., Князев С.П., Кобзев В.Ф., Бекенев В.А., Деева В.С., Гончаренко Г.М., Юдин Н.С., Ермолаев В.И. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2010, №9, стр. 49-54.
Редкое сочетание двух новых однонуклеотидных полиморфизмов в интроне 16 гена рецептора рианодина RYR1 у свиней кемеровской породы Юдин Н.С., Князев С.П., Айтназаров Р.Б., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Игнатьева Е.В., Никитин С.В., Ермолаев В.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, №1, Т.14, С. 116-121
Репродуктивная стратегия соболя (MARTES ZIBELLINA LINNAEUS, 1758): анализ наследуемости размеров приплода в промышленных популяциях Г.Р. Свищёва, С.Н. Каштанов Информационный вестник ВОГИС, 2010, Т. 14, № 3, C. 444-450.
Рецензия на книгу Ю.Ф. Богданова и О.Л. Коломиец "Синаптонемный комплекс – индикатор динамики мейоза и изменчивости хромосом" (М., Товарищество научных изданий КМК, 2007. 358 с.) Бородин П.М., Торгашева А.А., Высоцкая Л.В. RUSS J GENET+, 2010, т. 46, № 5, С. 718–720
Синапсис и рекомбинация хромосом у муйской полевки (Microtus mujanensis) Бородин П.М., Башева Е.А., Торгашева А.А., Голенищев Ф.Н., Картавцева И.В. Вестник НГУ Серия: Биология, клиническая медицина, 2010, т. 8, №3, С. 124-130
Сравнительный анализ кариотипов Opisthorchis felineus из Западной Сибири Поляков А.В., Катохин А.В., Бочарова Т.А., Романов К.В., Львова М.Н., Бонина О.М., Юрлова Н.И., Мордвинов В.А. Cибирский экологический журнал, 2010, Т. 1. С. 3-6.
Частота мейотической рекомбинации в G- и R-районах хромосом обыкновенной бурозубки (Sorex araneus) Белоногова НМ, Бородин ПМ. Doklady Akademii Nauk, 2010, Т. 433(4). С. 563-565.
Число и расположение сосков у свиней как показатель стабильности развития популяции Князев С.П., Никитин С.В., Швебель Т.И. Сельскохозяйственная биология, 2010, 2, 25-28
Differentiation of wild boar and domestic pig population based on the frequency of chromosomes carring endogenous retroviruses Nikitin S.V., Yudin N.S., Knyazev S.P., Aitnazarov R.B., Bekenev V.A., Deeva V.S., Goncharenko G.M., Kobzev V.F., Savina M.A., Ermolaev V.I. Natural Science, 2010, V.2, N.6, 527-534.
A Genome-Wide Screen for Depression in Two Independent Dutch Populations Schol-Gelok S, Janssens AC, Tiemeier H, Liu F, Lopez-Leon S, Zorkoltseva IV, Axenovich TI, van Swieten JC, Uitterlinden AG, Hofman A, Aulchenko YS, Oostra BA, van Duijn CM. BIOL PSYCHIAT, 2010, 68(2): 187-196
Genetic Architecture of Plasma Adiponectin Overlaps With the Genetics of Metabolic Syndrome-Related Traits Henneman P, Aulchenko YS, Frants RR, Zorkoltseva IV, Zillikens MC, Frolich M, Oostra BA, van Dijk KW, van Duijn CM. DIABETES CARE, 2010, 33(4): 908-913
A powerful genome-wide feasible approach to detect parent-of-origin effects in studies of quantitative traits Belonogova NM, Axenovich TI, Aulchenko YS EUR J HUM GENET, 2010, 18(3):379-84
Linkage and Genome-wide Association Analysis of Obesity-related Phenotypes: Association of Weight With the MGAT1 Gene OBESITY Johansson A, Marroni F, Hayward C, Franklin CS, Kirichenko AV, Jonasson I, Hicks AA, Vitart V, Isaacs A, Axenovich T, Campbell S, Floyd J, Hastie N, Knott S, Lauc G, Pichler I, Rotim K, Wild SH, Zorkoltseva IV, Wilson JF, Rudan I, Campbell H, Pattaro C, P OBESITY, 2010, 18 (4): 803-808
MQScore_SNP software for multipoint parametric linkage analysis of quantitative traits in large pedigrees Axenovich TI, Aulchenko YS. ANN HUM GENET, 2010, 73 : 286-289
ParallABEL: an R library for generalized parallelization of genome-wide association studies Sangket U, Mahasirimongkol S, Chantratita W, Tandayya P, Aulchenko YS. BMC BIOINFORMATICS, 2010, 0,609027778
Ped_Outlier software for automatic identification of within-family outliers Zorkoltseva IV, Aulchenko YS, van Duijn CM, Axenovich TI. COMPUT BIOL CHEM, 2010, 30(4):242-243
ProbABEL package for genome-wide association analysis of imputed data Aulchenko YS, Struchalin MV, van Duijn CM. BMC BIOINFORMATICS, 2010, 0,551388889
Synapsis and recombination in inversion heterozygotes Torgasheva A.A., Borodin P.M. BIOCHEM SOC T, 2010, V. 38. P. 1676-1680.
The apolipoprotein E gene and its age-specific effects on cognitive function Liu F, Pardo LM, Schuur M, Sanchez-Juan P, Isaacs A, Sleegers K, de Koning I, Zorkoltseva IV, Axenovich TI, Witteman JC, Janssens AC, van Swieten JC, Aulchenko YS, Oostra BA, van Duijn CM. NEUROBIOL AGING, 2010, 31 (10): 1831-1833
Variance heterogeneity analysis for detection of potentially interacting genetic loci: method and its limitations Struchalin MV, Dehghan A, Witteman JC, van Duijn C, Aulchenko YS. BMC GENET, 2010, 0,522222222
Анализ химер, полученных агрегацией эмбрионов и эмбриональных стволовых клеток разной плоидности Поварницына П.Ю., Голубица А.Н., Железова А.И., Кизилова Е.А. В мире научных открытий, 2010, № 6.1 (12) стр. 347-350
Аналитическая оценка мощности сцепления в больших родословных Свищева Г.Р., Аксенович Т.И. RUSS J GENET+, 2010, T. 46, № 1, С. 118-126
Association between Type 2 Diabetes Loci and Measures of Fatness Pecioska S, Zillikens MC, Henneman P, Snijders PJ, Oostra BA, van Duijn CM, Aulchenko YS PloS One, 2010, Jan 1;5(1):e8541.
A- and B-chromosome pairing and recombination in male meiosis of the silver fox (Vulpes vulpes L., 1758, Carnivora, Canidae) Basheva E.A., Torgasheva A.A., Sakaeva G.R., Bidau C., Borodin P.M. CHROMOSOME RES, 2010, V. 18. P. 689-696
Заселение гонад химерных мышей потомками ЭС клеток различного происхождения и плоидности Белокрылова Д.О., Голубица А.Н, Железова А.И., Ходенёва Н.Н., Кизилова Е.А. Труды ТГУ. Серия: Биологическая, 2010, т. 275, стр. 96-99
Carrier frequency of GJB2 gene mutations c.35delG, c.235delC and c.167delT among the populations of Eurasia Dzhemileva L.U., Barashkov N.A., Posukh O.L., Khusainova R.I., Akhmetova V.L., Kutuev I.A., Gilyazova I.R., Tadinova V.N., Fedorova S.A., Khidiyatova I.M., Lobov S.L., Khusnutdinova E.K. J HUM GENET, 2010, 55(11):749-54.
Иммунофлуоресцентный и электронно-микроскопический анализ спаривания и рекомбинации хромосом в мейозе четырех видов полевок рода Microtus (Arvicolinae, Rodentia) Бородин П.М., Башева Е.А., Голенищев Ф.Н., Дашкевич О.А., Картавцева И.Н., Потапов М.А., Сакаева Г.Р., Торгашева А.А., Фрисман Л.В. Информационный вестник ВОГИС, 2010, т. 14, № 1, C. 89-95
Common variants in the JAZF1 gene associated with height identified by linkage and genome-wide association analysis Johansson A, Marroni F, Hayward C, Franklin CS, Kirichenko AV, Jonasson I, Hicks AA, Vitart V, Isaacs A, Axenovich T, Campbell S, Dunlop MG, Floyd J, Hastie N, Hofman A, Knott S, Kolcic I, Pichler I, Polasek O, Rivadeneira F, Tenesa A, Uitterlinden AG, Wi HUM MOL GENET, 2009, 18 (2): 373-380
Перечитывая "Происхождение видов" Бородин П.М. Природа, 2009, №3 с. 4-12.
Происхождение видов". 150 лет спуст Бородин П.М. Информационный вестник ВОГИС, 2009, т. 13. с. 480-494.
Распределение теломерной ДНК в хромосомах обыкновенной бурозубки Sorex araneus, Eulipotyphla Жданова Н.С., Рогозина Ю.И., Минина Ю.М., Бородин П.М., Рубцов Н.Б. Cell and Tissue Biology, 2009, т. 51. с. 577-584
A genome-wide association study of northwestern Europeans involves the C-type natriuretic peptide signaling pathway in the etiology of human height variation Estrada K, Krawczak M, Schreiber S, van Duijn K, Stolk L, van Meurs JB, Liu F, Penninx BW, Smit JH, Vogelzangs N, Hottenga JJ, Willemsen G, de Geus EJ, Lorentzon M, von Eller-Eberstein H, Lips P, Schoor N, Pop V, de Keijzer J, Hofman A, Aulchenko YS, Oost HUM MOL GENET, 2009, 18(18):3516-24.
FGF4 independent derivation of trophoblast stem cells from the common vole Grigor'eva EV, Shevchenko AI, Mazurok NA, Elisaphenko EA, Zhelezova AI, Shilov AG, Dyban PA, Dyban AP, Noniashvili EM, Slobodyanyuk SY, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM PloS One, 2009, 4(9): e7161.
Genetic Determinants of Circulating Sphingolipid Concentrations in European Populations Hicks AA, Pramstaller PP, Johansson A, Vitart V, Rudan I, Ugocsai P, Aulchenko Y, Franklin CS, Liebisch G, Erdmann J, Jonasson I, Zorkoltseva IV, Pattaro C, Hayward C, Isaacs A, Hengstenberg C, Campbell S, Gnewuch C, Janssens AC, Kirichenko AV, König PLOS GENET, 2009, 5 (10): Art. No. e1000672
Immunocytological analysis of meiotic recombination in the American mink (Mustela vison) Borodin P.M., Basheva E.A., Zhelezova A.I. ANIM GENET, 2009, V. 40(2) P. 235-8
Linkage analysis of adult height in a large pedigree from a Dutch genetically isolated population Axenovich T.I., Zorkoltseva I.V., Belonogova N.M. Struchalin, MV; Kirichenko, AV); Kayser, M); Oostra, BA; van Duijn, CM; Aulchenko, YS . HUM GENET, 2009, 126(3):457-71
PedStr Software for Cutting Large Pedigrees for Haplotyping, IBD Computation and Multipoint Linkage Analysis Kirichenko A.V., Belonogova N.M., Aulchenko Y.S., Axenovich, TI ANN HUM GENET, 2009, V. 73. P. 527-531.
Predicting human height by Victorian and genomic methods Aulchenko Y.S., Struchalin M.V., Belonogova N.M. Axenovich, TI; Weedon, MN; Hofman, A; Uitterlinden, AG; Kayser, M; Oostra, BA; van Duijn, CM; Janssens, ACJW; Borodin, PM. EUR J HUM GENET, 2009, V. 17. P. 1070-1075
Predicting human height by Victorian and post-genomic methods Aulchenko Y.S., Struchalin M.V., Belonogova N.M. Axenovich, TI; Weedon, MN; Hofman, A; Uitterlinden, AG; Kayser, M; Oostra, BA; van Duijn, CM; Janssens, ACJW; Borodin, PM. ANN HUM GENET, 2009, 73 : 1070-1075
AFLP diversity between the Novosibirsk and Tomsk chromosome races of the common shrew (Sorex araneus) Polyakov A.V., Ilyashenko V.B., Onischenko S.S., Panov V.V., Borodin P.M. COMP CYTOGENET, 2009, V. 3. P. 85-89
Анализ генов 12S rRNA и tRNASer(UCN) мтДНК у больных несиндромальной сенсоневральной тугоухостью/глухотой, из различных регионов России Джемилева Л.У., Посух О.Л., Тазетдинов А.М., Барашков Н.А., Журавский С.Г., Пониделко С.Н., Маркова Т.Г., Тадинова В.Н., Федорова С.А., Хуснутдинова Э.К. RUSS J GENET+, 2009, Т.45. №7. С.982-991.
Association of FGFR2 gene polymorphisms with the risk of breast cancer in population of West Siberia Boyarskikh UA, Zarubina NA, Biltueva JA, Sinkina TV, Voronina EN, Lazarev AF, Petrova VD, Aulchenko YS, Filipenko ML EUR J HUM GENET, 2009, 9(8):997-1003.
Влияние пола и порядка генов на частоту и распределение рекомбинационных событий в хромосоме 1 домовой мыши Торгашева А.А., Железова А.И., Рубцов Н.Б., Бородин П.М. Doklady Akademii Nauk, 2009, том 429, № 5, с. 710–712
Возрастные аспекты репродуктивной функции самцов крыс с обычным и ускоренным темпом старения Белоусова И. Гладких Д.В., Железова А.И., Стефанова Н.А., Колосова Н.Г., Амстиславская Т.Г. , 2009, T. 95. - № 11. – С. 1258-1267.
Динамика гетерозиготности и её связь с приспособленностью в популяции домашних свиней С.В., Князев С.П., Швебель Т.И., Гончаренко Г.М. RUSS J GENET+, 2009, 10, 45, 1401-1410.
Дифференциация популяций диких и домашних свиней по частоте хромосом, содержащих эндогенные ретровирусы Юдин Н.С., Айтназаров Р.Б., Князев С.П., Бекенёв В.А., Деева В.С., Гончаренко Г.М., Кобзев В.Ф., Савина М.А., Ермолаев В.И., Никитин С.В. Информационный вестник ВОГИС, 2009, т.13, № 4, с.741-750
2008
Линии стволовых клеток экстраэмбриональной эндодермы обыкновенных полевок рода Microtus А. И. Шевченко, В. В.Демина, Н. А. Мазурок, А. И. Железова, Я. Р. Ефремов, А. Г. Шилов, А. И. Шевела, А. В. Белеванцева, В. В. Власов, С. М. Закиян RUSS J GENET+, 2008, Т. 44. N 11. С. 1477-1485
Рекомбинация и эволюция Бородин П.М., Башева Е.А., Белоногова Н.М., Торгашева А.А. Информационный вестник ВОГИС, 2008, 12, №1/2, 197-205
General pattern of meiotic recombination in male dogs estimated by MLH1 and RAD51 immunolocalization Basheva EA, Bidau CJ, Borodin PM CHROMOSOME RES, 2008, 16, 709-19
Karyotype analysis of five species of earthworms (Oligochaeta: Lumbricidae) Kashmenskaya M.N., Polyakov A.V. COMP CYTOGENET, 2008, 2, 2, 121-125
Recombination map of the common shrew, Sorex araneus (Eulipotyphla, Mammalia) Borodin PM, Karamysheva TV, Belonogova NM, Torgasheva AA, Rubtsov NB, Searle JB. GENETICS, 2008, Feb;178(2):621-32.
An approach for cutting large and complex pedigrees for linkage analysis Liu F, Kirichenko A, Axenovich TI, et al. EUR J HUM GENET, 2008, 16,7, 854-860
The apolipoprotein E gene and its age-specific effects on cognitive function Liu F, Pardo LM, Schuur M, Sanchez-Juan P, Isaacs A, Sleegers K, de Koning I, Zorkoltseva IV, Axenovich TI, Witteman JC, Janssens AC, van Swieten JC, Aulchenko YS, Oostra BA, van Duijn CM. NEUROBIOL AGING, 2008, 31 (10): 1831-1833
The Russian Old Believers: genetic consequences of their persecution and exile, as shown by mitochondrial DNA evidence Rubinstein S., Dulik M.C., Gokcumen O., Zhadanov S., Osipova L., Cocca M., Mehta N., Gubina M., Posukh O., Schurr T.G. HUM BIOL, 2008, V. 80, N. 3, P. 203-237.
Генетические компоненты вариации толщины шпика у свиней кемеровской породы Князев С.П., Швебель Т.И., Никитин С.В. Свиноводство, 2008, №6, с. 5-7
Гибридные зоны хромосомных рас обыкновенной бурозубки Западной Сибири Поляков А.В. Сибирский экологический журнал, 2008, 5, 773-777
Breaking loops in large complex pedigrees Axenovich TI, Zorkoltseva IV, Liu F, Kirichenko AV, Aulchenko YS HUM HERED, 2008, 65, 2, 57-65
Иммуно-флуресцентный анализ мейотической рекомбинации и интерференции у домашней кошки Бородин П.М., Карамышева Т.В., Рубцов Н.Б. Cell and Tissue Biology, 2008, 1 (6) 503-507
2007
К 90-летию Дмитрия Константиновича Беляева (1917-1985) Трут Л.Н., Маркель А.Л., Бородин П.М., Аргутинская С.В., Захаров И.К., Шумный В.К. RUSS J GENET+, 2007, № 7. Т. 43. С. 869-872.,
Моделирование структуры супергенов, контролирующих некоторые полиаллельные системы групп крови свиньи и лошади Князев С.П. Никитин С.В. RUSS J GENET+, 2007, 43:382-392,
Предисловие приглашенного редактора Бородин П.М. Информационный вестник ВОГИС, 2007, 11(2):3-4
A genomewide screen for late-onset Alzheimer disease in a genetically isolated Dutch population Liu F, Arias-Vásquez A, Sleegers K, Aulchenko YS, Kayser M, Sanchez-Juan P, Feng BJ, Bertoli-Avella AM, van Swieten J, Axenovich TI, Heutink P, van Broeckhoven C, Oostra BA, van Duijn CM AM J HUM GENET, 2007, 81,1, 17-31
Genomewide rapid association using mixed model and regression: A fast and simple method for genomewide pedigree-based quantitative trait loci association analysis Aulchenko YS, de Koning DJ, Haley C GENETICS, 2007, 177 , 1,577-585
Heritability of blood pressure traits and the genetic contribution to blood pressure variance explained by four blood-pressure-related genes van Rijn MJ, Schut AF, Aulchenko YS, Deinum J, Sayed-Tabatabaei FA, Yazdanpanah M, Isaacs A, Axenovich TI, Zorkoltseva IV, Zillikens MC, Pols HA, Witteman JC, Oostra BA, van Duijn CM J HYPERTENS, 2007, 25, 3,565-570
Inheritance of litter size at birth in farmed arctic foxes (Alopex lagopus, Canidae, Carnivora) Axenovich TI, Zorkoltseva IV, Akberdin IR, Beketov SV, Kashtanov SN, Zakharov IA, Borodin PM. HEREDITY, 2007, 98, 2, 99-105
Optimal peeling order for pedigrees with incomplete genotypic information Belonogova NM, Axenovich TI COMPUT BIOL CHEM, 2007, 31, 3, 173-177
Quantitative trait locus analysis of hybrid pedigrees: variance-components model, inbreeding parameter, and power Svischeva GR BMC GENET, 2007, 8(5)
Standard DAPI karyotype of the common shrew Sorex araneus L. (Soricidae, Eulipotyphla) Minina J.M., Borodin P.M., Searle J.B., Volobouev V.T., Zhdanova N.S. Russian J Theriology, 2007, V. 6, P. 3-6
Temporal and spatial distribution of Rad51 protein in spermatocytes of the common shrew (Sorex araneus L.: Soricidae, Eulipotyphla) T.V. Karamysheva,NM Belonogova, MI Rodionova, N.B. Rubtsov, AV Polyakov,JB Searle and P. M. Borodin Russian J Theriology, 2007, 6(1):15-19
Анализ локусов количественных признаков гибридных родословных животных Свищева ГР RUSS J GENET+, 2007, 43(2):200-209
Биологические особенности свиноматок кемеровской породы с разным потенциалом многоплодия Князев С.П., Швебель Т.И., Никитин С.В. Свиноводство, 2007, № 6. С. 7-9,
Вариационно-ковариационная модель для анализа гибридной родословной c инбридингом Свищева ГР RUSS J GENET+, 2007, 43(8):947-953
2006
Changes in litter size in Kerry Blue Terrier dogs with abnormal dentition Zorkoltseva I.V., Akberdin I.R., Kulikova A.V, Knyazev S.V, Borodin P.M, Axenovich T.I. RUSS J GENET+, 2006, Vol. 42, 3, pp. 339-340
Картирование генов, детерминирующих распространенные болезни человека Аксенович Т.И. Медицинская генетика, 2006, 2, 11-15
Компоненты репродуктивного потенциала свиноматок кемеровской породы Швебель Т.И., Князев С.П., Тараканов Е.А., Никитин С.В., Данильченко Н.В. Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук, 2006, № 1. С. 38–40.
Методологические подходы и стратегии картирования генов, контролирующих комплексные признаки человека Аульченко Ю.С., Аксенович Т.И. Информационный вестник ВОГИС, 2006, 10, 1, 189-202
Chromosome-wise dissection of the genome of the extremely big mouse Bevova MR, Aulchenko YS, Aksu S, Renne U, Brockmann GA. GENETICS, 2006, 172(1):401-10.
Comparative analysis of life-history traits in two species of Calomys (Rodentia: Sigmodontinae) in captivity. Araripe LO., Aprigliano P., Olifiers N., Borodin P., Cerqueira R. MAMMALIA, 2006, 70: 2–8
Оценка мощности in silico картирования. Аксенович Т.И., Зыкович А.С. RUSS J GENET+, 2006, 42, 850-857
Полиморфизм гена агрекана в семьях с идиопатическим сколиозом Шарипов Р.Н., Зайдман А.М., Зоркольцева И.В., Аксенович Т. И., Дымшиц Г. М. Molecular Biology, 2006, т.40, №3, с.554-557.
Полиморфизм зубной формулы и сегрегация ее вариантов в родословной домашней собаки породы Керри-Блю-Терьер Аксенович Т.И., Зоркольцева И.В., Князев С.П., Куликова А.В., Бородин П.М. RUSS J GENET+, 2006, 42(3): 414-420
Пренатальная приспособленность свиней и гетерозиготность по генам систем групп крови D, E, F, G Князев С.П., Никитин С.В. Сельскохозяйственная биология, 2006, № 2. С.95–102.
Разнообразие популяций диких и домашних свиней по комплексу аллотипов сыворотки крови Никитин С.В., Князев С.В., Николаев А.Г., Волох А.М., Кириченко А.В., Савина М.А., Ермолаев В.И., Юдина О.П., Бекенёв В.А., Айтназаров Р.Б. RUSS J GENET+, 2006, № 3, т. 42, с. 403-413
Diversity of wild and domestic pig populations estimated by a set of serum allotypes Nikitin SV, Knyazev SP, Nikolaev AG, Voloch AM, Kirichenko AV, Savina MA, Yermolaev VI, Yudina OP, Bekenev VA, Aytnazarov RB RUSS J GENET+, 2006, 42 (3): 317-326
Heritability of fasting glucose levels in a young genetically isolated population Santos RL, Zillikens MC, Rivadeneira FR, Pols HA, Oostra BA, van Duijn CM, Aulchenko YS. DIABETOLOGIA, 2006, 49(4):667-672.
Identification of all pachytene bivalents in the common shrew using DAPI-staining of synaptonemal complex spreads Belonogova NM, Karamysheva TV, Biltueva LS, Perepelov EA, Minina JM, Polyakov AV, Zhdanova NS, Rubtsov NB, Searle JB, Borodin PM CHROMOSOME RES, 2006, 14, 673-679
Ignoring distant genealogic loops leads to false-positives in homozygosity mapping Liu F., Elefante S., van Duijn CM., Aulchenko YS ANN HUM GENET, 2006, 70: 965-970
Polymorphism of aggrecan gene in families with idiopathic scoliosis Sharipov RN, Zaidman AM, Zorkol'tseva IV, Aksenovich TI, Dymshits GM. Molecular Biology, 2006, 40(3):554-7.
Polymorphism of dental formula and segregation of its variants in a pedigree of kerry blue terrier dogs Aksenovich TI, Kulikova AV, Kniazev SP, Zorkal'tseva IV, Borodin PM. RUSS J GENET+, 2006, 42(3):414-20
Reproductive isolation due to the genetic incompatibilities between Thrichomys pachyurus and two subspecies of Thrichomys apereoides (Rodentia, Echimyidae) Borodin PM, Barreiros-Gomez SC, Zhelezova AI, Bonvicino CR, D'Andrea PS. GENOME, 2006, 49(2):159-167.
Solution for underflow problem in linkage and segregation analysis Axenovich T.I., Aulchenko Y.S. COMPUT BIOL CHEM, 2006, 30,382-385
Анализ полиморфизма гена Агрекана в связи с идиопатическим сколиозом у человека Шарипов Р.Н., Зайдман А.М., Зоркольцева И.В., Аксенович Т.И., Дымшиц Г.М. Molecular Biology, 2006, 40(3): 554-557
Ассоциации эндогенных ретровирусов разных типов с генетическими маркерами в популяциях домашних и диких свиней Айтназаров Р.Б., Ермолаев В.И., Никитин С.В., Савина М.А., Кобзев В.Ф., Князев С.П., Гончаренко Г.М., Бекенёв В.А., Юдин Н.С. Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук, 2006, № 4. C. 39–43.
Изменение размера помета у собак с аномалиями зубной формулы Зоркольцева И.В., Акбердин И.Р, Князев С.П., Куликова А.В., Бородин П.М., Аксенович Т.И. RUSS J GENET+, 2006, 42(3): 427-429
Конференции
2010
Заселение гонад химерных мышей потомками ЭС клеток различного происхождения и плоидности Белокрылова Д.О., Голубица А.Н., Железова А.И., Ходенёва Н.Н., Кизилова Е.А. 1 Всероссийская МНК "Фундаментальные и прикладные аспекты современной биологии", Томск, 6-9 октября 2010
2009
Иммунофлуоресцентный анализ мейотической рекомбинации у красной лисицы (Vulpes vulpes) Башева Е.А. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
Полногеномный анализ сцепления когнитивных функций и когнитивного старения в большой голландской родословной Зоркольцева И.В., Кириченко А.В., M. Шур, Дж.C. ван Свитен, И. Конинг, Б.A. Остра, Ю.С. Аульченко , Т.И Аксенович, К.М. ван Дуин 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
Происхождение видов: 150 лет спустя Бородин П.М. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
Частота и распределение сайтов рекомбинации у мышей, гетерозиготных по парацентрической инверсии Торгашева А.А. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина
2007
Анализ генов MTRNR1 (12S RRNA) и MTTS1 (TRNASER(UNC)) у больных с острой нейросенсорной тугоухостью Тазетдинов А.М., Джемилева Л.У., Посух О.Л., Барашков Н.А., Хуснутдинова Э.К. 11-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых. 29 октября - 2 ноября 2007г.
2006
The prevalence of serological markers of hepatitis B and C infections among the population of Turukhansk district of Krasnoyarsk region, West Siberia Netesova I.G., Posukh O.L., Osipova L.P., Manuilov V.A., Netesov S.V. 13 International Congress on Circumpolar Health. Novosibirsk, Russia, June 12-16
Genome-wide screen for late onset Alzheimer’s disease in a complex pedigree from a genetically isolated population F. Liu, A. Arias-Vбsquez, Y. S. Aulchenko, K. Sleegers, P. Sanchez- Juan, A. M. Bertoli-Avella, B. J. Feng, A. Isaacs, P. Heutink, C. van Broeckhoven, B. A. Oostra, C. M. van Duijn 38th European Human Genetics Conference, Amsterdam, Holland, May