Transcriptomic Data Meta-Analysis Sheds Light on High Light Response in Arabidopsis thaliana L. Бобровских Александр Владимирович
Зубаирова Ульяна Станиславовна
Бондарь Евгения Ивановна
Лавреха Виктория Вадимовна
Дорошков Алексей Владимирович INT J MOL SCI, 2022, 23(8), 4455
2020
Potential regulatory SNPs in the ATXN7L3B and KRT15 genes are associated with gender-specific colorectal cancer risk Elena Yu Leberfarb, Arina O Degtyareva, Ilya I Brusentsov, Vladimir N Maximov, Mikhail I Voevoda, Alexander I Autenshlus, Dmitriy V Morozov, Andrey V Sokolov, Tatiana I Merkulova PERS MED, 2020, Jan;17(1):43-54
2019
The role of long non-coding RNAs in the pathogenesis of hereditary diseases. Sparber P., Filatova A., Khantemirova M., Skoblov M. BMC MED GENOMICS, 2019
Opisthorchis felineus infection provokes time-dependent accumulation of oxidative hepatobiliary lesions in the injured hamster liver Maria Y. Pakharukova, Oxana G. Zaparina, Yaroslav K. Kapushchak, Nina V. Baginskaya, Viatcheslav A. Mordvinov PloS One, 2019, PLoS ONE 14(5): e0216757.
Unique mutational spectrum of the GJB2 gene and its pathogenic contribution to deafness in Tuvinians (Southern Siberia, Russia): a high prevalence of rare variant c.516G>C (p.Trp172Cys). Posukh O.L., Zytsar M.V., Bady-Khoo M.S., Danilchenko V.Yu., Maslova E.A., Barashkov N.A., Bondar A.A., Morozov I.V., Maximov V.N., Voevoda M.I. Genes, 2019, Jun 5;10(6). pii: E429
The Evaluation of Genetic Relationships within Acridid Grasshoppers (Orthoptera, Caelifera, Acrididae) on the Subfamily Level Using Molecular Markers Sukhikh I., Ustyantsev K., Bugrov A., Sergeev M., Fet V., Blinov A. FOLIA BIOL-KRAKOW, 2019, 67(3):119-126
Inhibition of Opisthorchis felineus glutathione-dependent prostaglandin synthase by resveratrol correlates with attenuation of cholangiocyte neoplasia in a hamster model of opisthorchiasis. Pakharukova MY, Zaparina OG, Kovner AV, Mordvinov VA. INT J PARASITOL, 2019, 2019;49:963-973.
Diversity of mariner-like elements in Orthoptera K. Ustyantsev, M. Biryukov, I. Sukhikh, N.V. Shatskaya, V. Fet, A. Blinov, I. Konopatskaia Vavilov journal of genetics and breeding, 2019, 23(8):1059-1066
Examining causal effects of body mass index on back pain: a Mendelian randomization study Elizaveta E. Elgaeva, Yakov Tsepilov, Maxim B. Freidin, Frances M. K. Williams, Yurii Aulchenko, Pradeep Suri EUR SPINE J, 2019
2018
An Unusual Burial of a Xiongnu-Sarmatian Era Warrior in the Western Siberian Forest-Steppe: Results of a Paleogenetic Analysis Pilipenko A.S., Cherdantsev S.V., Trapezov R.O., Pozdnyakov D.V., Chikisheva T.A., Molodin V.I. Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2018, Vol. 46, N. 4, P. 123-131.
Mitochondrial DNA diversity in a Transbaikalian Xiongnu population Aleksandr S. Pilipenko, Stepan V. Cherdantsev, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vladimir N. Babenko, Dmitri V. Pozdnyakov, Prokopiy B. Konovalov, Natalia V. Polosmak Archaeological and Anthropological Sciences, 2018, Vol. 10, Issue 7, P. 1557-1570.
Maternal genetic features of the Iron Age Tagar population from Southern Siberia (1st millennium BC) Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Stepan V. Cherdantsev, Vladimir N. Babenko, Marina S. Nesterova, Dmitri V. Pozdnyakov, Vyacheslav I. Molodin, Natalia V. Polosmak PloS One, 2018, 13(9): e0204062
2017
Ancestry and demography and descendants of Iron Age nomads of the Eurasian Steppe Martina Unterländer, Friso Palstra, Iosif Lazaridis, Aleksandr Pilipenko, Zuzana Hofmanová, Melanie Groß, Christian Sell, Jens Blöcher, Karola Kirsanow, Nadin Rohland, Benjamin Rieger, Elke Kaiser, Wolfram Schier, Dimitri Pozdniakov, Aleksandr Khokhlov, Myriam Georges, Sandra Wilde, Adam Powell, Evelyne Heyer, Mathias Currat, David Reich, Zainolla Samashev, Hermann Parzinger, Vyacheslav I. Molodin, and Joachim Burger NAT COMMUN, 2017
Палеогенетическое исследование родства погребенных из курганов саргатской культуры в Барабинской лесостепи (Западная Сибирь) А.С. Пилипенко, С.В. Черданцев, Р.О. Трапезов, В.И. Молодин, Л.С. Кобелева, Д.В. Поздняков, Н.В. Полосьмак Археология, этнография и антропология Евразии, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
Kinship Analysis of Human Remains from the Sargat Mounds, Baraba Forest-Steppe, Western Siberia A.S. Pilipenko, S.V. Cherdantsev, R.O. Trapezov, V.I. Molodin, L.S. Kobeleva, D.V. Pozdnyakov, N.V. Polosmak Archaeology, Ethnology & Anthropology of Eurasia, 2017, Том 45, № 4, С. 132-142
2016
Stress and hypertensive disease: adrenals as a link. Experimental study on hypertensive ISIAH rat strain Yegor V. Antonov, Yuriy V. Alexandrovich, Olga E. Redina, Michael A. Gilinsky & Arcady L. Markel Clinical and Experimental Hypertension, 2016, Volume 38, Issue 5, 415-423
Molecular determinants of the adrenal gland functioning related to stress-sensitive hypertension in ISIAH rats Larisa A. Fedoseeva, Leonid O. Klimov, Nikita I. Ershov, Yury V. Alexandrovich, Vadim M. Efimov, Arcady L. Markel, Olga E. Redina BMC GENOMICS, 2016, 2016, 17(Suppl 14):989
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребального комплекса эпохи бронзы Бертек-56 (II тыс. до н.э., Республика Алтай, Россия) А.С. Пилипенко, В.И. Молодин, Р.О. Трапезов, С.В. Черданцев, А.А. Журавлев Археология, этнография и антропология Евразии, 2016, Том 44, № 4, С. 141-149
Полиморфизм регуляторной области гена LCT в некоторых тюркоязычных популяциях Алтае-Саянского региона. И.В. Пилипенко, М.С. Пристяжнюк, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода, А.С. Пилипенко Vavilov journal of genetics and breeding, 2016, 2016;20(6):887-893
2015
MtDNA Haplogroup A10 Lineages in Bronze Age Samples Suggest That Ancient Autochthonous Human Groups Contributed to the Specificity of the Indigenous West Siberian Population Aleksandr S. Pilipenko, Rostislav O. Trapezov, Anton A. Zhuravlev, Vyacheslav I. Molodin, Aida G. Romaschenko PloS One, 2015
Mitochondrial DNA diversity in the gene pool of the Neolithic and Early Bronze Age Cisbaikalian human population R. O. Trapezov, A. S. Pilipenko, V. I. Molodin Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2015, January 2015, Volume 5, Issue 1, pp 26-32
Молекулярно-генетический анализ останков людей из погребения 1 кургана 1 могильника Ак-Алаха-3 А.С. Пилипенко, Р.О. Трапезов, Н.В. Полосьмак Археология, этнография и антропология Евразии, 2015, Том 43 № 2, стр. 138-145
Палеогенетическое исследование носителей пазырыкской культуры из могильника Ак-Алаха-1 (Горный Алтай) Пилипенко А.С., Трапезов Р.О., Полосьмак Н.В. Археология, этнография и антропология Евразии, 2015, Том 43, № 4, стр. 144 - 150
Применение сопряжённых уравнений для исследования чувствительности в модели симпластного роста клеток линейного листа А.В. Пененко, У.С. Зубаирова, С.В. Николаев Труды Международной конференции АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ ВЫЧИСЛИТЕЛЬНОЙ И ПРИКЛАДНОЙ МАТЕМАТИКИ – 2015 посвященной 90-летию со дня рождения академика Г. И. Марчука, 2015, С.562-572
A computational model of the effect of symplastic growth on cell mechanics in a linear leaf blade Zubairova U., Golushko S., Penenko A., Nikolaev S. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2015, Vol. 13, No. 1 1540005
2014
Разнообразие линий митохондриальной ДНК в генофонде населения Прибайкалья эпохи неолита и ранней бронзы Трапезов Р.О., Пилипенко А.С., Молодин В.И. Vavilov journal of genetics and breeding, 2014, 2014 год, том 18, №3, стр. 469-477
2013
Разнообразие микроорганизмов в образцах из археологических комплексов пазырыкской культуры (IV-III вв. до н.э.) Северо-Западной Монголии Ханаева Т.А., Суслова М.Ю., Земская Т.И., Молодин В.И., Пилипенко А.С., Парцингер Г. МИКРОБИОЛОГИЯ, 2013
Modeling of plant embryo morphodynamics at early developmental stages S. V. Nikolaev, N. A. Kolchanov, S. K. Golushko, J. -C. Palauqui, A. Urban, E. V. Amelina, A. V. Yurchenko, K. S. Golushko, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, A. Trubuil Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2013, May 2013, Volume 3, Issue 3, pp 176-183
Модель регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега Arabidopsis thaliana С. В. Николаев, У. С. Зубаирова, А. В. Пененко, Э. Д. Мелснесс (E. D. Mjolsness), Б. Е. Шапиро (B. E. Shapiro), Н. А. Колчанов Doklady Akademii Nauk, 2013, том 452, № 3, с. 336–338
Model of Structuring the Stem Cell Niche in Shoot Apical Meristem of Arabidopsis thaliana S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, A. V. Penenko, E. D. Mjolsness, B. E. Shapiro, and Academician N. A. Kolchanov Doklady Biological Sciences, 2013, Vol. 452, pp. 316–319
Модели регуляции структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме побега У.С. Зубаирова, С.В. Николаев Vavilov journal of genetics and breeding, 2013, том 17, № 4/1, с. 738-747
2012
Моделирование роста и развития растительных тканей в формализме L-систем Зубаирова У.С., Пененко А.В., Николаев С.В. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16, №4/1, С. 816-824
Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-К., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А. Vavilov journal of genetics and breeding, 2012, том 16, №4/1, С. 805-815
Генофонд мтДНК населения восточного варианта пахомовской культуры Молодин В.И., Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Археология, этнография и антропология Евразии, 2012, № 4 (52). С. 62-69.
Древняя ДНК заговорила Пилипенко А.С. Наука из первых рук, 2012, № 1. С. 38-39.
2011
Paleogenetic analysis in archeological studies Pilipenko A.S., Molodin V.I. Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2011, Volume 1, Number 1, 51-72
Митохондриальная ДНК женщины из пещеры Каминная (Горный Алтай) эпохи позднего неолита Пилипенко А.С., Молодин В.И., Ромащенко А.Г. Vavilov journal of genetics and breeding, 2011, Том 15, № 4, стр. 633-643
A Study of a One-Dimensional Model of Regulation of the Renewing Zone Size in a Biological Tissue Accounting for Cell Division S. V. Nikolaev, U. S. Zubairova, S. I. Fadeev, E. Mjolsness, N. A. Kolchanov Journal of Applied and Industrial Mathematics, 2011, Vol. 5, No. 4, pp. 1–14.
2010
Исследование одномерной модели регуляции размеров возобновительной зоны в биологической ткани с учётом деления клеток Николаев С.В., Зубаирова У.С., Фадеев С.И., Мйолснесс Э., Колчанов Н.А. Сибирский журнал индустриальной математики, 2010, том 13, № 4 (44) С. 70-82
Палеогенетический анализ в археологических исследованиях Пилипенко А.С., Молодин В.И. Информационный вестник ВОГИС, 2010, T. 14. № 2. С. 280-311.
Mitochondrial DNA studies of the Pazyryk people (4th to 3rd centuries BC) from northwestern Mongolia Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Molodin V.I., Parzinger H., Kobzev V.F. Archaeological and Anthropological Sciences, 2010, V. 2. N. 4. P. 231-236.
Древняя ДНК и стабильные изотопы – новые ответы на старые вопросы Молодин В.И., Пилипенко А.С. Наука из первых рук, 2010, № 2. С. 72-81.
2008
Особенности захоронения младенцев в жилищах городища Чича-1 в Баабинской лесостепи по данным анализа структуры ДНК Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И. Археология, этнография и антропология Евразии, 2008, № 2, Т. 34, С. 57-67
Полиморфизм гена холодового рецептора TRPM8 в этнических группах Сибири и Дальнего Востока Потапова Т.А., Юдин Н.С., Бабенко В.Н., Пилипенко И.В., В.Ф. Кобзев И.В., Гырголькау Л.А., Воевода М.И. Информационный вестник ВОГИС, 2008, №4, Том 12, С. 749-754
Спектр мутаций гена рецептора липопротеинов низкой плотности в российской популяции М.И. Воевода, И.В. Куликов, Е.В. Шахтшнейдер, В.Н. Максимов, И.В. Пилипенко, И.П. Терещенко, В.Ф. Кобзев, А.Г. Ромащенко, Ю.П. Никитин RUSS J GENET+, 2008, №10, том 44, с. 1374-1378
Взаимосвязь полиморфных вариантов гена-онкосупрессора р53 и хемокинового рецептора CCR5 с риском возникновения рака молочной железы у женщин репродуктивного периода и менопаузы. Е.С. Григорьева, Н.Н. Бабышкина, Е.А. Малиновская, Н.В. Чугунова, М.В. Завьялова, И.В. Пилипенко Сибирский онкологический журнал, 2008
АССОЦИАТИВНЫЙ АНАЛИЗ ПОЛИМОРФИЗМОВ ГЕНОВ P53 И C-FMS С РАЗВИТИЕМ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ У РУССКИХ ЖЕНЩИН И.В. Пилипенко, О.В. Горчакова, В.Ф. Кобзев, М.И. Воевода,Н.Н. Бабышкина, Н.В. Чугунова, А.В. Дорошенко, А.Г. Ромащенко Сибирский онкологический журнал, 2008
Монографии
2013
Мультидисциплинарные исследования населения Барабинской лесостепи V - I тыс. до н.э.: археологический, палеогенетический и антропологический аспекты Молодин В.И., Пилипенко А.С., Чикишева Т.А., Ромащенко А.Г., Журавлев А.А., Поздняков Д.В., Трапезов Р.О.
2012
Human migrations in the southern region of the West Siberian Plain during the Bronze Age: Archaeological, palaeogenetic and anthropological data Molodin V.I., Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Zhuravlev A.A., Trapezov R.O., Chikisheva T.A., Pozdnyakov D.V.
К этногенезу культур эпохи бронзы на юге Западной Сибири Молодин В.И., Чикишева Т.А., Пилипенко А.С.
2009
Особенности структуры генофонда митохондриальной ДНК населения городища Чича-1 Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Куликов И.В., Кобзев В.Ф., Поздняков Д.В., Новикова О.И.
2008
Глава 6. Компьютерная биология развития. Раздел 6.3. Морфогенез растений: реконструкция в базах данных и моделирование. Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Подколодный Н.А., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Акбердин И.Р., Озонов Е.А., Лихошвай В.А., Фадеев С.И., Пененко А.В., Лавреха В.В., Зубаирова У.С., Колчанов Н.А.
Конференции
2019
Итоги многолетних исследований наследственной глухоты у коренного населения Сибири: от эпидемиологии до молекулярной генетики, клеточной биологии и компьютерного моделирования. Посух О.Л.,Барашков Н.А., Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Маслова Е.А., Пшенникова В.Г., Романов Г.П., Соловьёв А.В., Кларов Л.А., Федорова С.А., Терютин Ф.М., Лашин С.А., Орищенко К.Е., Морозов И.В., Бондарь А.А. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Существенный вклад мутаций гена SLC26A4 в этиологию наследуемой потери слуха у коренного населения Республики Тыва. Данильченко В.Ю., Зыцарь М.В., Маслова Е.А., Бады-Хоо М.С., Морозов И.В., Бондарь А.А., Посух О.Л. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Распространённость мутации c.35delG (ген GJB2), ассоциированной с потерей слуха, у населения России и реконструкция предковых гаплотипов, включающих c.35delG, в регионах Сибири. Зыцарь М.В., Бады-Хоо М.С., Данильченко В.Ю., Бондарь А.А., Морозов И.В., Барашков Н.А., Соловьёв А.В., Максимов В.Н., Посух О.Л. VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. 18-22 июня 2019г, Санкт-Петербург.
Experimental model of Opisthorchis felineus liver fluke infection: mechanistic insights into biliary neoplasia formation Maria Pakharukova, Oxana Zaparina, Nina V. Baginskaya, Viatcheslav A. Mordvinov the Asian Neglected Tropical Disease Conference - NTDASIA2019
Функциональная аннотация регуляторных полиморфизмов, связанных с развитием онкологических заболеваний. Леберфарб Е.Ю., Дегтярева А.О., Брусенцов И.И., Ефимова Е.Г., Меркулова Т.И. VI Съезд биофизиков России
Окислительные повреждения в печени при экспериментальном описторхозе накапливаются в зависимости от времени течения инфекции Запарина О.Г., Ковнер А.В., Мордвинов В.А., Пахарукова М.Ю. Паразитологические исследования в Сибири и на Дальнем Востоке
Accumulation of oxidative damage markers due to opistorchiasis in an experimental model Zaparina O.G. Международная научная конференция студентов и молодых ученых «Farabi alemi»
2016
Genetic and molecular mechanisms crucial for hypertension development in the ISIAH rats. O.E. Redina, L.O. Klimov, M.A. Ryazanova, L.A. Fedoseeva, T.O. Abramova, Yu.V. Alexandrovich, S.E. Smolenskaya, Ye.V. Antonov, N.I. Ershov, V.M. Efimov, A.L. Markel. Десятая Международная конференция по биоинформатике регуляции и структуры геномов и системной биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology), BGRS\SB-2016.
2015
How symplastic mode of growth effects on cell mechanics in unidirectional growing plant tissue Zubairova U.S., Golushko S.K., Penenko A.V., Nikolaev S.V The 3rd International Conference “Plant Genetics, Genomics, Bioinformatics and Biotechnology”
Исследование чувствительности и параметрическая идентификация модели симпластного роста линейного листа Пененко А.В., Зубаирова У.С., Николаев С.В. Седьмая международная молодежная научная школа-конференция «Теория и численные методы решения обратных и некорректных задач», посвященная 90-летию со дня рождения академика Гурия Ивановича Марчука
2012
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ геномов представителей древнего и современного населения Сибири Колчанов Н.А., Мордвинов В.А., Афонников Д.А., Гунбин К.В., Пилипенко А.С., Молодин В.И., Деревянко А.П. Мега-структура евразийского мира: основные этапы сложения
Микробиота древних захоронений Алтая Андреева И.С., Пилипенко А.С., Пучкова Л. И., Емельянова Е.К., Молодин В.И. Всероссийская научная конференция «Сибирь в исторической перспективе и проблемы сохранения народов и культур»
Activation of CLV3 gene expression in model of the stem cell niche structure regulation in the shoot apical meristem Zubairova U.S., Nikolaev S.V. The eighth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure \ System biology (BGRS\SB'2012)
2011
Компьютерный анализ дифференциально экспрессирующихся генов у крыс гипертензивной линии НИСАГ. Александрович Ю.В., Орлов А.В., Пыльник Т.О., Смоленская С.Э., Редина О.Е. , Орлов Ю.Л. , Маркель А.Л. II Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика», Новосибирск, 2011
The Cell Growth and Division Can Destroy Stem Cell Niche in a Reaction-Diffusion Model Ulyana Zubairova European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB 2011)
Миграция андроновского населения в Западную Сибирь: археологический, антропологический и палеогенетический аспекты Молодин В. И., Чикишева Т.А., Поздняков Д.В. Пилипенко А.С., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Труды III (XIX) Всероссийского археологического съезда. 2011, Т. I. С. 249-250.
Исследование генофонда мтДНК населения Барабинской лесостепи эпохи неолита и раннего металла (VI – IV тысячелетие до н.э.) Трапезов Ростислав Олегович XVIII Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов»
К вопросу о связях населения территории современного Казахстана и Барабинской лесостепи в эпоху бронзы (по материалам археологии, антропологии и палеогенетики) Молодин В.И., Пилипенко А.С., Чикишева Т.А., Журавлев А.А., Поздняков Д.В., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. Маргулановские чтения
Применение методов палеогенетики для этногенетических реконструкций Пилипенко А.С., Молодин В.И., Журавлев А.А., Трапезов Р.О., Ромащенко А.Г. II международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине: геномика, протеомика, биоинформатика»
SNP polymorphism of cold and mentol receptor 1 (CMR1, TRPM8) in native and caucasian populations of North Asia Voevoda M., Potapova T., Babenko V., Pilipenko I., Yudin N., Kulikov I., Romaschenko A. Human Genome Meeting
МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ОБРАЗЦОВ, ВЗЯТЫХ ПРИ РАСКОПКАХ МЕРЗЛОТНЫХ КУРГАНОВ ПАЗЫРЫКСКОЙ КУЛЬТУРЫ ОЛОН-КУРИН-ГОЛ. Андреева И.С., Пилипенко А.С., Пучкова Л. И., Емельянова Е.К., Саранина И.В., Репин В. Е., Молодин В.И. «Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний»
2010
A Model of Shoot Apocal Meristem Compartmentalization Based on CLV/WUS Interplay Nikolaev SV, Zubairova US, Mjolsness ED, Shapiro BE, Smal PA, Kolchanov NA 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
The cell growth and division can destroy stem cell niche in a reaction-diffusion model S. Nikolaev, U. Zubairova, S. Fadeev, E. Mjolsness, N. Kolchanov 7th International conference on bioinformatics of genome regulation and structure\system biology (BGRS/SB'20010). June 20-27, 2010, Novosibirsk
Модель типа реакция-диффузия механизма регуляции пространственной структуры апикальной меристемы побега Николаев С. В. , Зубаирова У.С., Мьолснесс Э., Смаль П.А., Шапиро Б., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
Нестабильность структуры клеточного ансамбля в модифицированной модели трехцветного флага в результате роста и деления клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мьолснесс Э., Колчанов Н.А. III Международная конференция "Математическая биология и биоинформатика", 10-15 октября 2010 г., Пущино
Migrations in the south of West Siberian plain during the Bronze Age (IV-II millenium BC): archaeological, paleogenetic and anthropological data Molodin V.I., Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Jhuravlev A.A., Trapezov R.O., Chikisheva T.A., Pozdnyakov D.V. International conference "Migrations in Prehistory and Early History. Stable Isotopes and population genetics – New Answers to Old Questions?", Berlin, Germany, March 24-26
A reaction-diffusion model of shoot apical meristem compartmentalization based on CLV/WUS interplay Nikolaev S.V., Zubairova U.S., Mjolsness E., Smal P.A., Shapiro B., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
Modified French Flag model: instability of the structure under cell growth and division Zubairova U.S., Nikolaev S.V., Fadeev S.I., Mjolsness E., Kolchanov N.A. Proceedings of the 3rd International Conference on Mathematical Biology and Bioinformatics, Pushchino, Russia
Палеогенетическое исследование населения усть-тартасской культуры Барабы эпохи энеолита (конец V – начало IV тысячелетия до н.э.) Трапезов Р.О., Пилипенко А.С. XLVIII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно- технический прогресс", г. Новосибирск, 10-14 апреля 2010 г.
Возмущения за счет деления клеток в пространственно‐распределенной модели регуляции структуры ниши стволовых клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В., Фадеев С.И., Мелснесс Э., Колчанов Н.А. Международная конференция "Стохастические модели в биологии и предельные алгебры", 2—7 августа 2010 Омск Россия
Миграция носителей андроновской культуры в лесостепную зону Западной Сибири по данным анализа мтДНК (вторая половина II тысячелетия до н.э.) Журавлев А.А., Пилипенко А.С., Трапезов Р.О. Международный молодежный научный форум "ЛОМОНОСОВ-2010". Секция "Биология", Москва, МГУ им. М.В. Ломоносова, апрель
Моделирование динамических систем с динамической структурой на примере камбиальных клеток Зубаирова У.С., Николаев С.В. Сборник трудов VIII Всероссийской научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых учёных "Молодёжь и современные информационные технологии", 3-5 марта 2010 года
2009
Оценка влияния миграционных процессов на генофонд мтДНК населения Западной Сибири 4-1 тыс. до н.э. Пилипенко А.С., Ромащенко А.Г., Молодин В.И., Журавлев А.А., Куликов И.В., Кобзев В.Ф. 5-й съезд ВОГИС, посвященный 200-летию со дня рождения Чарльза Дарвина, Москва, 21-28 июня 2009 г.
Особенности структуры генофонда мтДНК населения позднекротовской культуры Барабы (вторая половина 2 тыс. до н.э.) Журавлев А.А., Пилипенко А.С. XLVII Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс" (МНСК-47) г.Новосибирск, 11 – 15 апреля 2009 г.
Археология и палеогенетика. Некоторый опыт и перспективы мультидисциплинарных исследований Молодин В.И., Ромащенко А.Г., Пилипенко А.С. Всероссийская (с международным участием) конференция "Роль естественно-научных методов в археологических исследованиях", Барнаул, 23-27 августа
Эндонуклеазы рестрикции, выделенные из психрофильных и термофильных микроорганизмов экстремальных зон Пучкова Л.И., Андреева И.С., Емельянова Е.К., Морозова О.В., Саранина И.В., Пилипенко А.С., Молодин В.И., Репин В.Е. Всероссийская конференция "Биоразнообразие: результаты и перспективы исследований"
2008
Психрофильный штамм асinetobacter SP. ОК-103P – продуцент эндонуклеазы рестрикции, узнающей нуклеотидную последовательность 5’- GGATCC-3’ АНДРЕЕВА И.С., ПУЧКОВА Л. И., ПЕЧУРКИНА Н. И., ПИЛИПЕНКО А.С., РЕПИН В.Е., МОЛОДИН В.И. 5-й съезд Общества биотехнологов России имени Ю.А. Овчинникова состоится 2–4 декабря 2008, г. Москва
Процессы формирования населения лесостепной полосы Западной Сибири эпохи бронзы по данным полиморфизма мтДНК Пилипенко А.С. Международная школа молодых ученых по молекулярной генетике "Геномика и эволюция". 1-5 декабря 2008, г. Звенигород.
Ассоциативный анализ полиморфизмов генов TP53 и C-FMS с развитием рака молочной железы у русских женщин И.В. Пилипенко Сборник материалов III региональной конференции молодых ученых им. академика РАМН Н.В. Васильева. 29 апреля 2008 г., Томск
Формирование этнокультурных сообществ в западносибирской лесостепи на основе данных палеогенетики (первые результаты) А.С. Пилипенко, А.Г. Ромащенко, В.И. Молодин, А.А. Журавлев, А.Е. Гришин, Д.В. Поздняков, И.В. Куликов, Т.А. Чикишева, В.Ф. Кобзев Труды II (XVIII) Всероссийского археологического съезда в Суздале. Т. III, 2008, Москва, Институт археологии РАН
2007
Similarity of mitochondrial DNA patterns in ancient and modern indigenous West Siberian populations Pilipenko A.S., Romaschenko A.G., Kulikov I.V., Kobzev V.F., Grishin A.E., Pozdnyakov D.V., Molodin V.I. II International Conference "Biosphere Origin and Evolution" October 28 - November 2, 2007, Loutraki, Greece
Применение формализма dL-систем для изучения модели регуляции размеров возобновительной зоны в растущей ткани Зубаирова У.С., Николаев С.В. VIII Всероссийская конференция молодых ученых по математическому моделированию и информационным технологиям, Новосибирск, 27-29 ноября 2007
Изучение влияния однонуклеотидного полиморфизма G215C гена р53 на формирование предрасположенности к развитию рака молочной железы у русских женщин Пилипенко И.В., Голубева Д.В., Кобзев В.Ф., Чердынцева Н.В., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. VIII Съезд Украинского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова, Алушта, Украина, 24-28 сентября
2006
Анализ возможной связи полиморфизмов G215C и IVS 3 (ins) гена р53 с развитием рака легкого у человека Мягкова И.В. (Пилипенко И.В.), Голубева Д.В., Морозова О.А., Кобзев В.Ф., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. 10-я Пущинская школа-конференция молодых ученых, Россия, Пущино (Московская область)
Этнические особенности патологии человека в Сибири. Генетические основы предрасположенности к распространенным заболеваниям М.И. Воевода, А.Г. Ромащенко, В.Н. Максимов, Е.В. Шахтшнейдер, Н.С. Юдин, А.В. Бархаш, В.Ф. Кобзев, И.В. Куликов, С.В. Михайлова, Т.М. Мишакова, Т.В. Найкова, И.В. Мягкова (Пилипенко И.В.), Т.А. Потапова, Ю.П. Никитин 13-го Международный конгресс по приполярной медицине. 12-16 июня 2006 г., г. Новосибирск
Анализ гаплотипического разнообразия митохондриальной ДНК представителей кротовской культуры (середина II тысячелетия до н.э.) из могильников Барабинской лесостепи Пилипенко А.С. XLIV Международная научная студенческая конференция "Студент и научно-технический прогресс"
Палеогенетические исследования останков носителей Пазырыкской культуры IV-II вв до н.э. Куликов И.В., Нефедова М.В., Шульгина Е.О., Губина М.А., Пилипенко А.С., Дамба Л.Д., Кобзев В.Ф., Воевода М.И., Ромащенко А.Г. Всероссийский археологический съезд "Современные проблемы Археологии России", 23 – 28 октября 2006 г, Новосибирск
Выявление генетических маркеров предрасположенности к распространенным онкологическим заболеваниям Пилипенко И.В. Научно-практическая конференция "Перспективы использования молекулярно-генетических исследований в практическом здравоохранении". 25 мая 2006 г., г. Новосибирск
Особенности гаплотипического разнообразия мтДНК представителей Кротовской культуры Барабы Пилипенко А.С., Куликов И.В., Ромащенко А.Г., Кобзев В.Ф., Гришин А.Е., Поздняков Д.В., Молодин В.И. Современные проблемы археологии России, Новосибирск, Ин-т археологии и этнографии СО РАН
Гранты
2020
Сходство и различия трех видов эпидемиологически
значимых трематод семейства Opisthorchiidae (Opisthorchis felineus, O. viverrini, Clonorchis sinensis): поиск механизмов патогенности РФФИ, номер гранта 20-04- 00370А
2019
Изучение генетической программы формирования репродуктивной системы плоских червей с помощью транспозонного мутагенеза РНФ, номер гранта 19-74-00029
2016
Реконструкция некоторых фенотипических черт представителей древнего населения Западной Сибири методами палеогенетики РФФИ, номер гранта 16-06-00495 А
2013
Экспрессия генов, принимающих участие в регуляции водно-солевого гомеостаза и артериального давления у гипертензивных крыс НИСАГ. РФФИ, номер гранта 13-04-01492-А
2012
Генофонд митохондриальной ДНК средневекового населения юга Западной Сибири (тюркское и монгольское время, вторая половина I - первая половина II тысячелетия н.э.) РФФИ, номер гранта РФФИ 12-04-31818
Междисциплинарный интеграционный проект СО РАН № 32 "Этногенез населения юга Западной Сибири в эпоху голоцена (по данным археологии, антропологии и палеогенетики)", 2012-2014 гг. СО РАН, номер гранта № 32
2011
Компьютерный анализ и моделирование процессов развития апикальной меристемы побега РФФИ, номер гранта 11-04-01748
Участие в 8-й европейской конференции по математической и теоретической биологии (ECMTB 2011) РФФИ, номер гранта 11-04-09431-моб_з
Формирование билатеральной симметрии в зародышах двудольных растений РФФИ, номер гранта 11-04-91397-НИСИ_а
Реконструкция процессов антропогенеза: анализ митохондриальных геномов представителей древнего и современного населения Сибири РФФИ, номер гранта 11-06-12006
2010
Волосы из древних погребений, как объект междисциплинарного исследования (изучение останков носителей культуры хунну) РФФИ, номер гранта 10-06-00406-а
Элементы социальной структуры пазырыкского общества и их проявления в особенностях погребальной обрядности (по данным археологии, антропологии, палеогенетики и дендрохронологии) РГНФ, номер гранта 10-01-00193а
2009
Интеграционный проект СО РАН № 115 "Антропогенетические, экологические и социально-культурные составляющие этногенеза древнего населения Западной Сибири (V-I тыс. до н.э.) Сибирское Отделение Российской Академии Наук, номер гранта 115
Этногенез и этническая история в эпоху развитой бронзы на юге Западносибирской равнины (по данным археологии, палеогенетики, антропологии) РФФИ, номер гранта 09-06-00357-а
2008
Компьютерное моделирование и анализ механизма гомеостаза структуры ниши стволовых клеток в апикальной меристеме Arabidopsis thaliana РФФИ, номер гранта 08-04-01214-а
Молекулярно-генетические механизмы комплексных поведенческих, морфологических и физиологических признаков: экспериментальное исследование на селекционных моделях животных. Программа Президиума РАН
Научное руководство
2011
Особенности структуры генофонда митохондриальной ДНК населения позднекротовской культуры Барабы (вторая половина II тыс. до н.э.) Журавлев Антон Александрович генетика и цитология, 2011-11-29
2010
Палеогенетическое исследование представителей усть-тартасской культуры Барабы эпохи энеолита (конец V - начало IV тыс. до н.э.) Трапезов Ростислав Олегович генетика и цитология, 2010-05-29
Учебные курсы
2017
Эволюция жизни на Земле Гражданкин Д.В., Пилипенко А.С., Шеховцов С.В. НГУ, ФЕН, кафедра генетики, семестров: 1
2015
Генетика Хлесткина Е.К., Кочетов А.В., Баттулин Н.Р., Пилипенко А.С., Шеховцов С.В. для аспирантов 2-го курса Научно-образоватлеьного отдела ИЦиГ СО РАН, семестров: 2