Eduard Fomin Department: Laboratory of Evolutionary Bioinformatics and Theoretical Genetics Room: 1323 Email: fomin@bionet.nsc.ru Work phone: +7 (383) 363-49-63*1323

Publications

2023	Phenological Reactions of Perennial Plants to Climate Change in Western Siberia. Fomin E.S.,Fomina T.I. [CONTEMP PROBL ECOL]
	Synthesis, crystal structure and NMR-study new mononuclear paramagnetic Er (III) complex based on imine derivatives of thiacalix[4]arene E.N. Zapolotsky, S.P. Babailov, M.V. Kniazeva, Y.V. Strelnikova, A.S. Ovsyannikov, A.T. Gubaidullin, S.E. Solovieva, I.S. Antipin, E.S. Fomin, I.P. Chuikov [INORG CHIM ACTA]
2022	STUDY OF THE STRUCTURE AND PARAMAGNETIC PROPERTIES OF THE [Dy(H2O)(n)(CyDTA)](-) COMPLEX IN AN AQUEOUS SOLUTION USING NMR DATA Zapolotsky E. N., Babailov S. P. , Fomin E. S. [J STRUCT CHEM+]
	Structure Determination of Binuclear Triple-Decker Phthalocyaninato Complexes by NMR via Paramagnetic Shifts Analysis Using Symmetry Peculiarities Sergey P. Babailov, Eugeny N. Zapolotsky, Eduard S. Fomin, Marina A. Polovkova, Gayane A. Kirakosyan, Alexander G. Martynov, Yulia G. Gorbunova [MOLECULES]
	Switching of shifting and relaxational NMR-thermosensor properties of iron (II) tris-(pyrazol-1-yl) methane complexes due to spin-crossover S.P.Babailov,E.N.Zapolotsky,V.V.Kokovkin,O.G.Shakirova,I.V.Mironov,I.P.Chuikov,E.S.Fomin [POLYHEDRON]
2021	Changes in the Phenology of Perennial Plants in Western Siberia against the Background of Global Warming E. S. Fomin, T. I. Fomina [CONTEMP PROBL ECOL]
2020	A Nonparametric Model for Analysis of Flowering Patterns of Herbaceous Multi-flowered Monocarpic Shoots Fomin E., Fomina T. [B MATH BIOL]
	Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain. Anna S. Pavlova, Georgii D. Ozhegov, Georgij P. Arapidi, Ivan O. Butenko, Eduard S. Fomin, Nikolai A. Alemasov, Dmitry A. Afonnikov, Dina R. Yarullina, Vadim T. Ivanov, Vadim M. Govorun, Airat R. Kayumov [PROTEIN J]
	Phenotypic intraspecific variability of Campanula altaica Ledeb. (Campanulaceae) in the Western Siberian forest steppe. Tatyana I. Fomina, Eduard S. Fomin [Journal of Asia-Pacific Biodiversity]
	Study of flowering patterns of Campanula L. species using computer modeling Tatyana I. Fomina, Eduard S. Fomin [BIO Web of Conferences]
2019	A Simple Approach to the Reconstruction of a Set of Points from the Multiset of Pairwise Distances in n2 Steps for the Sequencing Problem: III. Noise Inputs for the Beltway Case. Fomin E.S. [J COMPUT BIOL]
	Two types of conformational dynamics and thermo-sensor properties of praseodymium-DOTA by 1 H/13C NMR S.P. Babailov, E.N. Zapolotsky, A.I. Kruppa, P.A. Stabnikov, I.A. Godovikov, E.V. Bocharov, E.S. Fomin [INORG CHIM ACTA]
2018	Паттерны и модели цветения некоторых видов семейства Сampanulaceae Juss. Фомин Э.С., Фомина Т.И. [Vavilov journal of genetics and breeding]
2017	Molecular structure and paramagnetic properties of bis-diisobutyldithiophosphinate complexes of Europium(III), Ytterbium(III) and Lutetium(III) with 2,2-bipyridyl using NMR. Babailov S. P., Zapolotsky E. N., Fomin E. S., Qu Y. [POLYHEDRON]
2016	A Simple Approach to the Reconstruction of a Set of Points from the Multiset of n^2 Pairwise Distances in n^2 Steps for the Sequencing Problem: I. Theory E. S. Fomin [J COMPUT BIOL]
	A Simple Approach to the Reconstruction of a Set of Points from the Multiset of n^2 Pairwise Distances in n^2 Steps for the Sequencing Problem: II. Algorithm E. S. Fomin [J COMPUT BIOL]
	Dynamic NMR under nonstationary conditions: Theoretical model, numerical calculation, and potential of application S. P. Babailov, P. A. Purtov and E. S. Fomin [J CHEM PHYS]
2015	Interaction sorting method for molecular dynamics on multi-core SIMD CPU architecture Matvienko S., Alemasov N., and Fomin E. [Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
	Reconstruction of sequence from its circular partial sums for cyclopeptide sequencing problem Fomin ES [Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
2014	Восстановление аминокислотной последовательности циклических пептидов из масс-спектров Фомин Э.С. [Vavilov journal of genetics and breeding]
2013	Molecular structure and paramagnetic properties of bis-diisobutyl-dithiophosphinate complexes of neodymium(III), europium(III) and ytterbium(III) with 1,10-phenanthroline using NMR S. P. Babailov, E.N. Zapolotsky, E.S. Fomin [POLYHEDRON]
	NET-Q модель учета переноса заряда и поляризации для молекулярной динамики Фомин Э.С., Васенин А.Е. [Вестник НГУ. Серия: математика, механика, информатика.]
	Сортировка массивов коротких последовательностей на GPU для метода сортировки взаимодействий в молекулярной динамике Фомин Э.С. [Вестник УГАТУ]
2012	A Study of the Thermal Stability of Mutant Barnase Protein Variants with MOLKERN Software E.S. Fomin, N.A. Alemasov [Russian Journal of Genetics: Applied Research]
	Исследование термостабильности мутантных форм белка барназы с использованием программного комплекса MOLKERN Фомин Э.С., Алемасов Н.А. [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Компьютерные методы исследования термостабильности белков и их применение в биологии Алемасов Н.А., Фомин Э.С. [Vavilov journal of genetics and breeding]
	Программный комплекс L-MOLKERN для расчетов разностей свободных энергий с учетом эффектов перераспределения заряда Фомин Э.С., Алемасов Н.А. [Mathematical Biology & Bioinformatics]
2011	Consideration of Data Load Time on Modern Processors for the Verlet Table and Linked Cell Algorithms Fomin E.S. [J COMPUT CHEM]
2010	Expression and molecular characterization of the Mycobacterium tuberculosis PII protein Bandyopadhyay A, Arora A, Jain S, Laskar A, Mandal C, Ivanisenko VA, Fomin ES, Pintus SS, Kolchanov NA, Maiti S, Ramachandran S. [J BIOCHEM]
	Сравнение метода Верлет таблицы и метода связанных ячеек для последовательной, векторизованной и многопоточной реализаций Фомин Э.С. [Вычислительные методы и программирование]
	Эффективная реализация алгоритма расчёта ближних невалентных взаимодействий на процессоре PowerXCell8i Алемасов Н.А., Фомин Э.С. [Вычислительные технологии]
2009	Implementation of a Non-bonded Interaction Calculation Algorithm for the Cell Architecture Fomin E.S., Alemasov N.A. [Lect Notes Comput Sci]
2007	Phylogenetic analysis of the p53 and p63/p73 gene families Pintus S.S., Fomin E.S., Oshurkov I.S., Ivanisenko V.A. [In Silico Biology]
2006	Библиотека программных компонент MOLKERN для построения программ молекулярного моделирования Фомин Э.С., Алемасов Н.А., Чирцов А.С., Фомин А.Э. [BIOPHYSICS]
	Подтверждение функциональности дополнительного Zn2+ сайта связывания в мутантной форме G245C белка p53 Э. С. Фомин, В. А. Иванисенко [BIOPHYSICS]
	Филогенетический анализ семейства p53 Пинтус С.С., Фомин Э.С., Иванисенко В.А., Колчанов Н.А. [BIOPHYSICS]