ICG  

Accounting System of Scientific Activity (ASSA)

      

Nadezhda Omel`yanchuk

Department: Sector of Systems Biology of Plant Morphogenesis
Position: Senior Researcher
Room: 3408
Email: nadya@bionet.nsc.ru
Work phone: +7 (383) 363-49-63*3408


Publications

2017 Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots
N. A. Omelyanchuk, D. S. Wiebe, D. D. Novikova, V. G. Levitsky, N. Klimova, V. Gorelova, C. Weinholdt, G. V. Vasiliev, E. V. Zemlyanskaya, N. A. Kolchanov, A. V. Kochetov, I. Grosse, V. V. Mironova
[SCI REP-UK]
Diversity of cis-regulatory elements associated with auxin response in Arabidopsis thaliana
Pavel Cherenkov, Daria Novikova, Nadya Omelyanchuk, Victor Levitsky, Ivo Grosse, Dolf Weijers, Victoria Mironova
[J EXP BOT]
2016 A detailed expression map of the PIN1 auxin transporter in Arabidopsis thaliana root
N.A. Omelyanchuk, V.V. Kovrizhnykh, E.A. Oshchepkova, T. Pasternak, K. Palme, V.V. Mironova.
[BMC PLANT BIOL]
Meta-analysis of transcriptome data identified TGTCNN motif variants associated with the response to plant hormone auxin in Arabidopsis thaliana L.
Zemlyanskaya EV, Wiebe DS, Omelyanchuk NA, Levitsky VG, Mironova VV.
[J Bioinform Comput Biol.]
Механизмы регуляции передачи сигнала этилена у растений
Землянская Е.В., Омельянчук Н.А., Ермаков А.А., Миронова В.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Системно-биологический анализ гена WOX5 и его функций в нише стволовых клеток корня
Е.А. Ощепкова, Н.А. Омельянчук, М.С. Савина, Т. Пастернак, Н.А. Колчанов, Е.В. Землянская
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2014 Computational analysis of auxin responsive elements in the Arabidopsis thaliana L. genome
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Wiebe DS, Levitsky VG
[BMC GENOMICS]
КЛЮЧЕВАЯ РОЛЬ PIN-БЕЛКОВ В ТРАНСПОРТЕ АУКСИНА В КОРНЕ ARABIDOPSIS THALIANA L.
В.В. Коврижных, Н.А. Омельянчук, Т.П. Пастернак, В.В. Миронова
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Ключевая роль PIN белков в транспорте ауксина в корне Arabidopsis thaliana L.
В.В. Коврижных, Н.А. Омельянчук, Т.П. Пастернак, В.В. Миронова.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Компьютерный анализ и функциональная аннотация сайтов связывания транскрипционных факторов AP2/ERF в геноме Arabidopsis thaliana L.
Черных О.А., Левицкий В.Г., Омельянчук Н.А., Миронова В.В
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Математическая модель регуляции фитогормонами формирования меристематической зоны корня
Лавреха В.В., Омельянчук Н.А., Миронова В.В.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Моделирование механизмов регуляции поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток: кинетический и стохастический подходы
Акбердин И.Р.,, Иванисенко Н.В., Казанцев Ф.В., Ощепкова Е.А., Омельянчук Н.А., Матушкин Ю.Г., Афонников Д.А.
[Математическая биология и биоинформатика]
2013 How multiple auxin responsive elements may interact in plant promoters: a reverse problem solution
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Savina M.S., Ponomarenko P.M., Ponomarenko M.P., Likhoshvai V.A., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
MATHEMATICAL MODELING OF AUXIN TRANSPORT IN PROTOXYLEM AND PROTOPHLOEM OF ARABIDOPSIS THALIANA ROOT TIPS
Novoselova ES, Mironova VV, Omelyanchuk NA, Kazantsev FV, Likhoshvai VA
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Исследование математической модели перераспределения вещества в кольцевом ансамбле клеток
С. И. Фадеев, В. В. Когай, В. В. Миронова, Н. А. Омельянчук, В. А. Лихошвай
[Сибирский журнал вычислительной математики]
2012 Combined in silico/in vivo analysis of mechanisms providing for root apical meristem self-organization and maintenance
Mironova VV, Omelyanchuk NA, Novoselova ES, Doroshkov AV, Kazantsev FV, Kochetov AV, Kolchanov NA, Mjolsness E, Likhoshvai VA.
[ANN BOT-LONDON]
2011 From published expression and phenotype data to structured knowledge: The Arabidopsis gene net supplementary database and its applications
Denis Ponomaryov, Nadezhda Omelianchuk, Victoria Mironova, Evgeny Zalevsky, Nikolay Podkolodny, Eric Mjolsness, and Nikolay Kolchanov
[Lecture Notes in Artificial Intelligence]
Особенности нуклеотидных последовательностей зрелых микроРНК могут влиять на сродство к белкам AGO2 И AGO3 человека
Омельянчук Н.А, Пономаренко П.М., Пономаренко M.П.
[Molecular Biology]
2010 A plausible mechanism for auxin patterning along the developing root
Mironova V.V., Omelyanchuk N.A., Yosiphon G, Fadeev S.I., Kolchanov N.A., Mjolsness E., Likhoshvai V.A.
[BMC SYST BIOL]
Эффективность связывания TBP c промотором ARF-генов растений коррелирует с характером влияния ARF белков на транскрипцию (активатор/репрессор)
В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, П.М. Пономаренко, М.П. Пономаренко, Н.А. Колчанов
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
2009 Key Players in the Gene Networks Guiding ESCs toward Mesoderm
N Omelyanchuk, I Orlovskaya, I Schraufstatter, S Khaldoyanidi
[Journal of Stem Cells]
Генетика развития растений: интеграция информации из различных наблюдений и экспериментов в базах данных
Омельячук НА., Миронова ВВ., Колчанов НА
[RUSS J GENET+]
Математическое моделирование метаболизма ауксина в клетке меристемы побега растения
Акбердин И.Р., Казанцев Ф.В., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А
[Информационный вестник ВОГИС]
Моделирование регуляции ауксином инициации латеральных органов у Arabidopsis thaliana
В.А. Лихошвай, Н.А. Омельянчук, В.В. Миронова, Ф.В. Казанцев, И.Р. Акбердин, В.К. Королев, С.И. Фадеев, Н.А. Колчанов
[Информационный вестник ВОГИС]
2008 Исследование математической модели авторегуляции синтеза белка Hes7
Фадеев С.И., Омельянчук Н.А., Лихошвай В.А
[Сибирский журнал индустриальной математики]
Математическое моделирование морфогенеза растений
Г.Г. Лазарева, В.В. Миронова, Н.А. Омельянчук, И.В. Шваб, В.А. Вшивков, Д.Н. Горпинченко, С.В. Николаев, Н.А.Колчанов.
[Журнал Вычислительной Математики]
О математическом моделировании паттерна распределения ауксина в корне растений
Фадеев С.И., Когай В.В., Омельянчук Н.А. , Лихошвай В.А
[Сибирские электронные математические известия]
Содержание микроРНК В Arabidopsis thaliana коррелирует с наличием в последовательностях тетрануклеотидов WRHW и DRYD
Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Савинская С.А., Колчанов Н.А
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
2007 А cellular automaton to model the development of primary shoot meristems of Arabidopsis Thaliana
Ilya Akberdin, Evgeniy Ozonov, Victoria Mironova, Nadezda Omelyanchuk, Vitaly Likhoshvai, Dmytry Gorpinchenko, Nikolay Kolchanov
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Математическая модель паттерна распределения ауксина в корне растения
Лихошвай В. А., Омельянчук Н. А., Миронова В. В., Фадеев С. И., Мелснесс Э. М., Колчанов Н. А.
[RUSS J DEV BIOL+]
2006 A model of Arabidopsis thaliana morphogenesis in cellular automaton terms
I. R. Akberdin, E. A. Ozonov, V.V. Mironova, D. N. Gorpinchenko,N. A. Omelyanchuk, V. A. Likhoshvai, N. A. Kolchanov
[BIOFIZIKA+]
Pattern of locally positioned dinucleotides correlates with microRNA abundance in plants
Khomicheva I.V., Levitsky V.G., Omelyanchuk N.A., Kolchanov N.A., Savinskaya S.A.
[BIOFIZIKA+]
МиРНК – новые регуляторы активности генов у эукариот
А.В. Катохин, Т.Н. Кузнецова, Н.А. Омельянчук
[Информационный вестник ВОГИС]
Моделирование морфогенеза Arabidopsis thaliana в терминах клеточного автомата
Акбердин И. Р., Озонов Е. А., Миронова В. В., Горпинченко Д.Н., Омельянчук Н. А., Лихошвай В. А., Колчанов Н.А.
[BIOFIZIKA+]
Паттерн определенных динуклеотидов микроРНК арабидопсиса связан с уровнем их содержания в растении.
Левицкий В.Г., Хомичева И.В., Омельянчук Н.А., Пономаренко М.П., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: I. База данных AGNS
Омельянчук Н.А., Миронова В.В., Залевский Е.М., Шамов И.С.,Поплавский А.С., Подколодный Н.Л., Пономарев Д.К., Николаев С.В., Мелснесс Э.Д., Мейеровитц Е.M., Колчанов Н.А.
[BIOFIZIKA+]
Системный подход к исследованию морфогенеза Arabidopsis Thaliana: II. Моделирование регуляции структуры апикальной меристемы побега
Николаев С.В., Фадеев С.И., Пененко A.В., Лавреха В.В., Миронова В.В., Омельянчук Н.А., Мелснесс Э.Д., Колчанов Н.А.
[BIOFIZIKA+]
Содержание микроРНК в Arabidopsis thaliana коррелирует с встречаемостью тетрануклеотидов WRHW и DRYD
Пономаренко М.П., Омельянчук Н.А., Катохин А.В., Колчанов Н.А
[Информационный вестник ВОГИС]
2005 Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития
Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
2004 Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
Интегрированная компьютерная система по регуляции экспрессии генов эукариот.
Н. А. Колчанов, О. А Подколодная, Е. А. Ананько, Д. А. Афонников, О. В. Вишневский, Д. В. Воробьев, Е. В. Игнатьева, В. Г. Левицкий, В. А. Лихошвай, Н.А.Омельянчук, Н.Л. Подколодный, А. В. Ратушный
[Molecular Biology]
© 2010-2017 ICG SB RAS. All rights reserved.