Evgeniy Elisafenko Department: Laboratory of Developmental Epigenetics Room: 1334, 1005 Email: antares@bionet.nsc.ru Work phone: +7 (383) 363-49-63*1334

Publications

2023	Calling and Phasing of Single-Nucleotide and Structural Variants of the LDLR Gene Using Oxford Nanopore MinION //Int. J. Mol. Sci. 2023. DOI: Nazarenko M.S., Sleptcov A.A., Zarubin A.A., Salakhov R.R., Shevchenko A.I., Tmoyan N.A., Elisaphenko E.A., Zubkova E.S., Zheltysheva N.V., Ezhov M.V., Kukharchuk V.V., Parfyonova Ye.V., Zakian S.M., Zakharova I.S. [INT J MOL SCI]
	Genetic Redundancy in Rye Shows in a Variety of Ways Alexander V. Vershinin, Evgeny A. Elisafenko and Elena V. Evtushenko [Plants]
2022	Induced pluripotent stem cell line ICGi036-A generated by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with familial hypercholesterolemia caused due to compound heterozygous p.Ser177Leu/p.Cys352Arg mutations in LDLR Zakharova IS, Shevchenko AI, Tmoyan NA, Elisaphenko EA, Zubkova ES, Sleptcov AA, Nazarenko MS, Ezhov MV, Kukharchuk VV, Parfyonova YV, Zakian SM [STEM CELL RES]
	Induced pluripotent stem cell line ICGi037-A, obtained by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with familial hypercholesterolemia due to heterozygous p.Trp443Arg mutations in LDLR Irina S. Zakharova, Alexander I. Shevchenko, Narek A. Tmoyan, Eugeny A. Elisaphenko, Alexander P. Kalinin, Aleksei A. Sleptcov, Maria S. Nazarenko, Marat V. Ezhov, Valery V. Kukharchuk, Yelena V. Parfyonova, Suren M. Zakian [STEM CELL RES]
	Induced pluripotent stem cell line ICGi038-A, obtained by reprogramming peripheral blood mononuclear cells from a patient with familial hypercholesterolemia due to compound heterozygous c.1246C > T/c.940 + 3_940 + 6del mutations in LDLR Irina S. Zakharova, Alexander I. Shevchenko, Narek A. Tmoyan, Eugeny A. Elisaphenko, Ekaterina S. Zubkova, Aleksei A. Sleptcov, Maria S. Nazarenko, Marat V. Ezhov, Valery V. Kukharchuk, Yelena V. Parfyonova, Suren M. Zakian [STEM CELL RES]
	Investigating Antisense Transcription at the HTT Locus Eugeny A. Elisaphenko, Anastasia A. Malakhova [8th Scientific and Practical Conference "Biotechnology: Science and Practice"]
	The Precise Breakpoint Mapping in Paracentric Inversion 10q22.2q23.3 by Comprehensive Cytogenomic Analysis, Multicolor Banding, and Single-Copy Chromosome Sequencing Tatyana V. Karamysheva, Tatyana A. Gayner, Eugeny A. Elisaphenko, Vladimir A. Trifonov, Elvira G. Zakirova, Konstantin E. Orishchenko, Mariya A. Prokhorovich, Maria E. Lopatkina, Nikolay A. Skryabin, Igor N. Lebedev, Nikolay B. Rubtsov [Biomedicines]
2021	Expression of Two Rye CENH3 Variants and Their Loading into Centromeres Elena V. Evtushenko, Evgeny A. Elisafenko, Sima S. Gatzkaya, Veit Schubert, Andreas Houben, Alexander V. Vershinin [Plants]
	Prenatal Diagnosis of Small Supernumerary Marker Chromosome 10 by Array-Based Comparative Genomic Hybridization and Microdissected Chromosome Sequencing. BIOMEDICINES. 2021. Lebedev I.N. Karamysheva T.V., Elisaphenko E.A., Makunin, A.I., Zhigalina D.I., Lopatkina M.E., Drozdov G.V., Cheremnykh A.D., Torkhova N.B., Seitova G.N., Vasilyev S. A., Kashevarova A.A., Nazarenko, L.P., Rubtsov, N.B. [Biomedicines]
	The origin and evolution of a two- component system of paralogous genes encoding the centromeric histone CENH3 in cereals Evgeny A. Elisafenko , Elena V. Evtushenko and Alexander V. Vershinin [BMC PLANT BIOL]
	Эффективность программируемых нуклеаз SpCas9 и AsCpf1 (Cas12a) в геномных локусах safe harbor клеток линии HEK293 Павлова С.В., Елисафенко Е.А., Шаяхметова Л.Ш., Медведев С.П. [Альманах клинической медицины]
2020	Получение и характеристика эмбриональных стволовых клеток человека с повышенной экспрессией HIF-2A Живень М.К., Захарова И.С., Шевченко А.И., Елисафенко Е., Орищенко К.Е., Закиян С.М. [Гены и клетки]
	Генетический анализ пациентов с гипертрофической кардиомиопатией Дементьева Е.В., Вяткин Ю.В., Кретов Е.И., Елисафенко Е.А., Медведев С.П., Закиян С.М. [Гены и клетки]
2018	Impact of Xist RNA on chromatin modifications and transcriptional silencing maintenance at different stages of imprinted X chromosome inactivation in vole Microtus levis Shevchenko A.I., Grigor'eva E.V., Medvedev S.P., Zakharova I.S., Dementyeva E.V., Elisaphenko E.A., Malakhova A.A., Pavlova S.V., Zakian S.M. [CHROMOSOMA]
	Синдром удлиненного интервала QT: генетический анализ пациентов Дементьева Е.В., Медведев С.П., Елисафенко Е.А., Байрамова С.А., Покушалов Е.А., Агладзе К.И., Закиян С.М. [Гены и клетки]
2017	Chromosomal assignment of centromere-specific histone CENH3 genes in rye (Secale cereale L.) and their phylogeny Yulia A. Lipikhina, Elena V. Evtushenko, Evgeny A. Elisafenko, Alexander V. Vershinin [COMP CYTOGENET]
	Conserved molecular structure of the centromeric histone CENH3 in Secale and its phylogenetic relationships E. V. Evtushenko, E. A. Elisafenko, S. S. Gatzkaya, Y. A. Lipikhina, A. Houben & A. V. Vershinin [SCI REP-UK]
	Ecological preferences of Metarhizium spp. from Russia and neighboring territories and their activity against Colorado potato beetle larvae Vadim Kryukov, Olga Yaroslavtseva , Maksim Tyurin, Yuriy Akhanaev, Evgeniy Elisaphenko, Ting-Chi Wen, Oksana Tomilova, Yuri Tokarev, Viktor Glupov [J INVERTEBR PATHOL]
	Genome-wide profiling and differential expression of microRNA in rat pluripotent stem cells Sherstyuk V.V., Medvedev S.P., Elisaphenko E.A., Vaskova E.A., Ri M.T., Vyatkin Y.V., Saik O.V., Shtokalo D.N., Pokushalov E.A., Zakian S.M. [SCI REP-UK]
	ПОЛУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИ-МОДИФИЦИРОВАННОЙ ЛИНИИ ПЛЮРИПОТЕНТНЫХ СТВОЛОВЫХ КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА, ЭКСПРЕССИРУЮЩЕЙ HIF-ФАКТОР, ИНДУЦИРУЕМЫЙ ГИПОКСИЕЙ ЗАХАРОВА И.С., СМИРНОВА А.М., ЖИВЕНЬ М.К., ШЕВЧЕНКО А.И., ГРИГОРЬЕВА Е.В., ЕЛИСАФЕНКО Е.А., ЗАКИЯН С.М. [Гены и клетки]
	Паттерн экспрессии и альтернативный сплайсинг гена HTT в тканях человека Малахова А.А., Елисафенко Е.А. [Гены и клетки]
	ФЕНОТИПИЧЕСКИЕ И ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ИЗМЕНЕНИЯ ЭНТОМОПАРАЗИТИЧЕСКОГО АСКОМИЦЕТА BEAUVERIA BASSIANA ПРИ ПАССИРОВАНИИ ЧЕРЕЗ РАЗНЫХ ХОЗЯЕВ В. Ю. Крюков, У. Н. Роцкая, О. Н. Ярославцева, Е. А. Елисафенко, Б. А. Дуйсембеков, В. В. Глупов [Паразитология]
2016	The Molecular Mechanisms of Heterochromatin Expansion in Rye Chromosomes Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Safar J, Dolezel J, Vershinin AV [CYTOGENET GENOME RES]
	The expansion of heterochromatin blocks in rye reflects the co-amplification of tandem repeats and adjacent transposable elements. Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Šafář J, Doležel J, Vershinin AV. [BMC GENOMICS]
	Профили экспрессии нетранслируемых РНК в центре инактивации у мышевидных грызунов Елисафенко Е.А., Шевченко А.И., Закиян С.М. [Гены и клетки]
	СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ИММУННОГО ОТВЕТА ЛИЧИНОК КОЛОРАДСКОГО ЖУКА ПРИ РАЗВИТИИ МИКОЗОВ, ВЫЗВАННЫХ METARHIZIUM ROBERTSII, M. BRUNNEUM И M. PEMPHIGI М. В. Тюрин, В. Ю. Крюков, О. Н. Ярославцева, Е. А. Елисафенко, И. М. Дубовский, В. В. Глупов [Журнал эволюционной биохимии и физиологии]
2015	Transcriptome characteristics and X-chromosome inactivation status in cultured rat pluripotent stem cells Vaskova E.A., Medvedev S.P., Sorokina A.E., Nemudryy A.A., Elisaphenko E.A., Zakharova I.S., Shevchenko A.I., Kizilova E.A., Zhelezova A.I., Evshin I.S., Sharipov R.N., Minina J.M., Zhdanova N.S., Khegay I.I., Kolpakov F.A., Sukhikh G.T., Pokushalov E.A., Karaskov A.M., Vlasov V.V. Ivanova L.N., Zakian S.M. [STEM CELLS DEV]
	Инструменты геномной инженерии, предназначенные для создания изогенной модели бокового амиотрофического склероза Валетдинова К.Р., Устьянцева Е.И., Елисафенко Е.А., Жарков Д.О., Тупикин А.Е., Кабилов М.Р., Медведев С.П., Закиян С.М. [Медицинская генетика]
2013	МикроРНК, эволюция и рак. Колесников Н.Н., Титов С.Е., Веряскина Ю.А., Карпинская Е.В., Шевченко C.П., Ахмерова Л.Г., Иванов М.К., Козлов В.В., Елисафенко Е.А., Гуляева Л.Ф., Жимулев И.Ф. [Цитология]
	ОРГАНИЗАЦИЯ И ЭВОЛЮЦИЯ СУБТЕЛОМЕРНЫХ РАЙОНОВ ХРОМОСОМ РЖИ Евтушенко Е.В., Елисафенко Е.А., Вершинин А.В. [Цитология]
	СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНЫЙ АНАЛИЗ 5'-РЕГУЛЯТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА NANOG ПОЛЕВКИ М. А. Сорокин, Е. А. Елисафенко, Н. А. Мазурок, С. М. Закиян [Doklady Akademii Nauk]
	Структурно-функциональный анализ 5'-регуляторной области гена Nanog полёвки Сорокин М.А., Елисафенко Е.А., Мазурок Н.А., Закиян С.М. [Doklady Akademii Nauk]
2012	A regulatory potential of the Xist gene promoter in vole M. rossiaemeridionalis. Orishchenko KE, Pavlova SV, Elisaphenko EA, Sherstyuk VV, Prinz AV, Shevchenko AI, Dementyeva EV, Zakian SM [PloS One]
	ИЗМЕНЕНИЕ ТЕМПЕРАТУРНЫХ ПРЕФЕРЕНДУМОВ ИЗОЛЯТОВ BEAUVERIA BASSIANA В ШИРОТНОМ ГРАДИЕНТЕ СИБИРИ И КАЗАХСТАНА В. Ю. Крюков, О. Н. Ярославцева, Е. А. Елисафенко, П. В. Митьковец, Г. Р. Леднев, Б. А. Дуйсембеков, С. М. Закиян, В. В. Глупов [MICROBIOLOGY+]
2011	Functional Analysis of the Xist Promoter Region in Mouse Mus musculus A. M. Korotkova, E. A. Elisaphenko, and S. M. Zakian [RUSS J GENET+]
	Variability of sequence surrounding the Xist gene in rodents suggests taxon-specific regulation of X chromosome inactivation Shevchenko A.I., Malakhova A.A., Elisaphenko E.A., Mazurok N.A., Nesterova T.B., Brockdorff N., Zakian S.M. [PloS One]
2010	Difference between random and imprinted X inactivation in common voles E.V. Dementyeva, A.I. Shevchenko, O.V. Anopriyenko, N.A. Mazurok, E.A. Elisaphenko, T.B. Nesterova, N. Brockdorff, S.M. Zakian. [CHROMOSOMA]
	Взаимное расположение двух семейств тандемных повторов в гетерохроматине ржи Евтушенко Е.В., Елисафенко Е.А., Вершинин А.В. [Molecular Biology]
	Изучение молекулярного состава прицентромерного гетерохроматина хромосомы 2 малярийных комаров (Diptera, Culicidae) Сайджафарова А. О., Елисафенко Е. А., Стегний В. Н. [RUSS J GENET+]
	Исследование регуляторной области гена Tsix полевки Microtus rossiaemeridionalis Жукова О.А., Елисафенко Е.А., Закиян С.М. [RUSS J GENET+]
	Роль замены G(-43)A в промоторном районе гена Xist при неслучайной инактивации Х-хромосомы у межвидовых гибридов обыкновенных полевок Орищенко К.Е. , Елисафенко Е.А., Закиян С.М. [RUSS J GENET+]
	Сравнительная организация и происхождение некодирующих регуляторных РНК генов центра инактивации Х-хромосомы человека и мыши Колесников Н. Н. и Елисафенко Е. А. [RUSS J GENET+]
	Сравнительный анализ регуляторного района DXPas34 грызунов Малахова А.А., Пяткова М.С., Елисафенко Е.А., Шевченко А.И., Кель А.Э., Закиян С.М. [RUSS J GENET+]
	Экзон-интронная структура гена Xist слона, броненосца и предка плацентарных млекопитающих  Колесников Н. Н. и Елисафенко Е. А. [RUSS J GENET+]
2009	FGF4 independent derivation of trophoblast stem cells from the common vole Grigor'eva EV, Shevchenko AI, Mazurok NA, Elisaphenko EA, Zhelezova AI, Shilov AG, Dyban PA, Dyban AP, Noniashvili EM, Slobodyanyuk SY, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM [PloS One]
	Молекулярно-генетическая организация и особенности экспрессии гена Nanog у полевки Microtus rossiaemeridionalis С.П. Медведев, Е.А.Елисафенко, А.И. Шевченко, Н.А. Мазурок, С.М. Закиян [Doklady Biochemistry and Biophysics]
	Молекулярно-генетическая характеристика регуляторного района гена xist полевки microtus rossiaemeridionalis К. Е. Орищенко, Е. А. Елисафенко, А. Э. Кель, С. М. Закиян [RUSS J GENET+]
2008	A Dual Origin of the Xist Gene from a Protein-Coding Gene and a Set of Transposable Elements E.A. Elisaphenko, N.N. Kolesnikov, A.I. Shevchenko, I.B. Rogozin, T.B. Nesterova, N. Brockdorff, S.M. Zakian [PloS One]
	Structure and expression pattern of Oct4 gene are conserved in vole Microtus rossiaemeridionalis Medvedev SP, Shevchenko AI, Elisaphenko EA, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM. [BMC GENOMICS]
	Реконструкция предкового гена XIST и пути его эволюции у млекопитающих Елисафенко Е. А., Колесников Н.Н., Шевченко А. И., Закиян С. М. [Информационный вестник ВОГИС]
2007	DNA content of the B chromosomes in grasshopper Podisma kanoi Storozh. (Orthoptera, Acrididae) Bugrov AG, Karamysheva TV, Perepelov EA, Elisaphenko EA, Rubtsov DN, Warchalowska-Sliwa E, Tatsuta H, Rubtsov NB [CHROMOSOME RES]
	Genes flanking Xist in mouse and human are separated on the X chromosome in American marsupials Shevchenko AI, Zakharova IS, Elisaphenko EA, Kolesnikov NN, Whitehead S, Bird C, Ross M, Weidman JR, Jirtle RL, Karamysheva TV, Rubtsov NB, Vandeberg JL, Mazurok NA, Nesterova TB, Brockdorff N, Zakian SM [CHROMOSOME RES]
	The structure and evolution of the MaSMC4 gene of common vole Microtus arvalis (Arvicolidae, Rodentia) Pavlova SV, Elisafenko EA, Zakiian SM [RUSS J GENET+]
2006	Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeck [GENOMICS]