ICG  

Accounting System of Scientific Activity (ASSA)

      

Konstantin Gunbin, Cand. Sci. (Biol.)

Department: Center of Brain Neurobiology and Neurogenetics
Pluralist: Mammalian genomics and evolution
Position: Senior Researcher
Room: 1301
Email: genkvg@bionet.nsc.ru
Work phone: +7 (383) 363-49-63*1301


Publications

2017 Data on the time of integration of the human mitochondrial pseudogenes (NUMTs) into the nuclear genome
Gunbin K, Peshkin L, Popadin K, Annis S, Ackermann RR, Khrapko K.
[Data in Brief]
Evolution of Brain Active Gene Promoters in Human Lineage Towards the Increased Plasticity of Gene Regulation.
Gunbin KV, Ponomarenko MP, Suslov VV, Gusev F, Fedonin GG, Rogaev EI.
[MOL NEUROBIOL]
Orthoscape: a cytoscape application for grouping and visualization KEGG based gene networks by taxonomy and homology principles
Zakhar Sergeevich Mustafin, Sergey Alexandrovich Lashin, Yury Georgievich Matushkin, Konstantin Vladimirovich Gunbin, Dmitry Arkadievich Afonnikov
[BMC BIOINFORMATICS]
2016 Complete genome sequences of two Newcastle disease virus strains isolated from a wild duck and a pigeon in Russia
Kabilov M.R., Alikina T.Y., Yurchenko K.S., Glushenko A.V., Gunbin K.V., Shestopalov A.M., Gubanova N.V.
[Genome Announcements]
Integration of mtDNA pseudogenes into the nuclear genome coincides with speciation of the human genus. A hypothesis.
Konstantin Gunbin, Leonid Peshkin, Konstantin Popadin, Sofia Annis, Rebecca R. Ackermann, and Konstantin Khrapko.
[MITOCHONDRION]
The Molecular Mechanisms of Heterochromatin Expansion in Rye Chromosomes
Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Safar J, Dolezel J, Vershinin AV
[CYTOGENET GENOME RES]
The expansion of heterochromatin blocks in rye reflects the co-amplification of tandem repeats and adjacent transposable elements.
Evtushenko EV, Levitsky VG, Elisafenko EA, Gunbin KV, Belousov AI, Šafář J, Doležel J, Vershinin AV.
[BMC GENOMICS]
2015 Divergence and population traits in evolution of the genus Pisum L. as reconstructed using genes of two histone H1 subtypes showing different phylogenetic resolution
Olga O. Zaytseva, Konstantin V. Gunbin, Anatoliy V. Mglinets, Oleg E. Kosterin
[GENE]
Identification of the relationship between the variability of the expression of signaling pathway genes in the human brain and the affinity of TATA-binding protein to their promoters.
Ponomarenko MP, Suslov VV, Gunbin KV, Ponomarenko PM, Vishnevsky OV, Kolchanov NA.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Plant auxin biosynthesis did not originate in charophytes
Turnaev II, Gunbin KV, Afonnikov DA.
[TRENDS PLANT SCI]
The evolution of Homo sapiens denisova and Homo sapiens neanderthalensis miRNA targeting genes in the prenatal and postnatal brain
Gunbin K.V., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A., Derevianko A.P. and Rogaev E.I.
[BMC GENOMICS]
2014 Mitochondrial DNA mutations and cancer: lessons from the parathyroid.
Popadin K, Gunbin KV, Khrapko K.
[AM J PATHOL]
Program complex SNP-MED for analysis of single-nucleotide polymorphism (SNP) effects on the function of genes associated with socially significant diseases
N. L. Podkolodnyy, D. A. Afonnikov, Yu. Yu. Vaskin, L.O. Bryzgalov, V. A. Ivanisenko, P. S. Demenkov, M.P. Ponomarenko, D.A. Rasskazov, K. V. Gunbin, I. V. Protsyuk, I.Yu. Shutov, P.N. Leontyev, M.Yu. Fursov, N.P. Bondar, E.V. Antontseva, T.I. Merkulova, and N.A. Kolchanov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Выявление связи вариабельности экспрессии генов путей передачи сигналов в мозге человека со сродством ТАТА-связывающего белка к промоторам этих генов
М.П. Пономаренко, В.В. Суслов, К.В. Гунбин, П.М. Пономаренко, О.В. Вишневский, Н.А. Колчанов
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
ПОИСК ПЕРЕПРЕДСТАВЛЕННЫХ ХАРАКТЕРИСТИК ГЕНОВ: ОПЫТ РЕАЛИЗАЦИИ ПЕРЕСТАНОВОЧНОГО ТЕСТА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРОВ
А.А. Якименко, К.В. Гунбин, М.С. Хайретдинов
[Автометрия]
2013 Abundances of microRNAs in human cells can be estimated as a function of the abundances of YRHB and RHHK tetranucleotides in these microRNAs as an ill-posed inverse problem solution
Ponomarenko MP, Suslov VV, Ponomarenko PM, Gunbin KV, Stepanenko IL, Vishnevsky OL, Kolchanov NA
[Frontiers in Genetics]
BioUniWA – СИСТЕМА ГЕНЕРАЦИИ WEB-СЕРВИСОВ И КОНВЕЙЕРОВ ДЛЯ УНИФИЦИРОВАННОГО ДОСТУПА К РЕСУРСАМ В ОБЛАСТИ БИОИНФОРМАТИКИ
Е.Г. Комышев, М.А. Генаев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Evolution of General Transcription Factors
Gunbin KV, Ruvinsky A.
[J MOL EVOL]
Phylogenetic Analysis of Housekeeping Archaeal Proteins and Early Stages of Archaea Evolution
K. V. Gunbin, V. V. Suslov, D. A. Afonnikov
[PALEONTOL J+(RUS)]
SNP_TATA_COMPARATOR: Web-СЕРВИС ПРИМЕНЕНИЯ УРАВНЕНИЯ РАВНОВЕСИЯ ТВР/ТАТА-КОМПЛЕКСА В СРАВНИТЕЛЬНОЙ ОЦЕНКЕ SNPs ПРОМОТОРОВ ГЕНОВ, СВЯЗАННЫХ С БОЛЕЗНЯМИ ЧЕЛОВЕКА
Д.А. Рассказов, К.В. Гунбин, П.М. Пономаренко, О.В. Вишневский, М.П. Пономаренко, Д.А. Афонников.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Программный комплекс SNP-MED для анализа влияния однонуклеотидных полиморфизмов на функцию генов, связанных с развитием социально значимых заболеваний
Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, Ю.Ю. Васькин, Л.О. Брызгалов, В.А. Иванисенко, П.С. Деменков, М.П. Пономаренко, Д.А. Рассказов, К.В. Гунбин, И.В. Процук, И.Ю. Шутов, П.Н. Леонтьев, М.Ю. Фурсов, Н.П. Бондарь, Е.В. Антонцева, Т.И. Меркулова, Н.А. Колчанов.
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
2012 BioInfoWF – система автоматической генерации веб-интерфейсов и веб-сервисов для биоинформационных исследований
М.А. Генаев, Е.Г. Комышев, К.В. Гунбин, Д.А. Афонников
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Computer System for Analysis of Molecular Evolution Modes (SAMEM): Analysis of molecular evolution modes at deep inner branches of the phylogenetic tree
Gunbin KV, Suslov VV, Genaev MA, Afonnikov DA.
[In Silico Biology]
Computer and Statistical Analysis of Transcription Factor Binding and Chromatin Modifications by ChIP-seq data in Embryonic Stem Cell
Yuriy Orlov, Han Xu, Dmitri Afonnikov, Bing Lim, Jian-Chien Heng, Ping Yuan, Ming Chen, Junli Yan, Neil Clarke, Nina Orlova, Mikael Huss, Konstantin Gunbin, Nikolay Podkolodnyy, Huck-Hui Ng
[Journal of Integrative Bioinformatics]
Detection of mitochondrial DNA from domestic cattle in European bison (Bison bonasus) from the Altai Republic in Russia
Yudin N.S., Kulikov I.V., Gunbin K.V., Aitnazarov R.B., Kushnir A.V., Sipko T.P., Moshkin M.P.
[ANIM GENET]
ICGenomics: программный комплекс анализа символьных последовательностей геномики
Ю.Л. Орлов, А.О. Брагин, И.В. Медведева, К.В. Гунбин, П.С. Деменков, О.В. Вишневский, В.Г. Левицкий, Д.Ю. Ощепков, Н.Л. Подколодный, Д.А. Афонников, И. Гроссе, Н.А. Колчанов
[Вавиловский журнал генетики и селекции]
Важная роль изменений микроРНК в эволюции Homo neanderthalensis и Homo Denisova.
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Колчанов Н.А., Деревянко А.П.
[Археология, этнография и антропология Евразии]
2011 Molecular evolution of cyclin proteins in animals and fungi.
Gunbin K.V., Suslov V.V., Turnaev I.I., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[BMC EVOL BIOL]
Важная роль гидрофобных взаимодействий при адаптации белков к высоким давлениям
Афонников Д.А., Медведев К.Е., Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
[Doklady Biochemistry and Biophysics]
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков: анализ эволюции циклинов B
Гунбин К.В., Генаев М.А., Турнаев И.И., Афонников Д.А.
[Вестник ТГУ]
2010 A Computerized System for the Analysis of Molecular Evolution Modes of Protein-Encoding Genes (SAMEM): the Relationship between Molecular Evolution and Phenotypic Traits
Gunbin K.V., Genaev M.A., Afonnikov D.A., Kolchanov N.A.
[Moscow University Biological Sciences Bulletin]
Адаптация к бездне
Афонников Д.А., Гунбин В.К., Суслов В.В.
[Химия и жизнь]
Анализ вырожденных олигонуклеотидных мотивов в промоторах генов миРНК, экспрессирующихся в различных тканях млекопитающих
О.В.Вишневский, К.В.Гунбин, А.В.Бочарников, Е.В.Березиков
[Вестник Московского университета Серия 16. Биология]
Компьютерная система анализа режимов молекулярной эволюции генов и белков
Гунбин К.В., Генаев М.А., Афонников Д.А.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
Компьютерная система филогенетического анализа генных сетей: изучение эволюции генной сети клеточного цикла животных
Тимонов В.С., Турнаев И.И., Генаев М.А., Гунбин К.В.
[Труды ТГУ. Серия: Биологическая]
2009 Molecular evolution of the hyperthermophilic archaea of the Pyrococcus genus: analysis of adaptation to different environmental conditions
Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA
[BMC GENOMICS]
Адаптивная эволюция генов археобактерий рода Pyrococcus, связанная с приспособлением к обитанию в условиях высоких давлений
Гунбин К.В., Афонников Д.А., Болдырева Е.В., Колчанов Н.А.
[Доклады Академии Наук]
Эволюция ключевых белков клеточного цикла коррелирует с увеличением сложности эукариотических организмов
Турнаев И.И., Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
[Доклады Академии Наук]
2008 Молекулярно-генетические системы развития: динамика функционирования и молекулярная эволюция
Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
[BIOCHEMISTRY-MOSCOW+]
2007 Accumulation of slightly deleterious mutations in mitochondrial protein-coding genes of large versus small mammals
Popadin K., Polishchuk L.V., Mamirova L., Knorre D., Gunbin K.
[P NATL ACAD SCI USA]
Model of the reception of hedgehog morphogen concentration gradient: comparison with an extended range of experimental data
Gunbin K.V., Omelyanchuk L.V., Kogai V.V., Fadeev S.I., Kolchanov N.A.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
The evolution of the Hh-signaling pathway genes: a computer-assisted study
Gunbin K.V., Afonnikov D.A. and Kolchanov N.A.
[In Silico Biology]
The location of the gene regions under selective pressures: PLATO algorithm parallelization
Vyatkin Yu. V., Gunbin K.V., Snytnikov A.V., Afonnikov D.A.
[Lect Notes Comput Sci]
Vasa-related genes and their expression in stem cells of colonial parasitic rhizocephalan barnacle Polyascus polygenea (Arthropoda: Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala)
Shukalyuk A.I., Golovnina K.A., Baiborodin S.I., Gunbin K.V., Blinov A.G., Isaeva V.V.
[Cell Biology International]
Ароморфозы и адаптивная молекулярная эволюция
Гунбин К.В., Суслов В.В., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
2006 Численное исследование модели рецепции градиента концентрации морфогена Hedgehog
В.В.Когай, К.В.Гунбин, Л.В.Омельянчук, С.И. Фадеев, Н.А.Колчанов
[Сибирский журнал индустриальной математики]
2005 Новосибирская школа системной компьютерной биологии: исторический экскурс и перспективы развития
Ратушный А.В., Лихошвай В.А., Ананько Е.А., Владимиров Н.В., Гунбин К.В., Лашин С.А., Недосекина Е.А., Николаев С.В., Омельянчук Л.В., Матушкин Ю.Г., Колчанов Н.А.
[Информационный вестник ВОГИС]
2004 Генетические механизмы кодирования биологической сложности
Суслов В.В., Гунбин К.В., Колчанов Н.А.
[Экологическая генетика]
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть I.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
Генетические механизмы морфологической эволюции. Часть II.
Гунбин К.В., Суслов В.В., Омельянчук Н.А., Колчанов Н.А.
[Сибирский экологический журнал]
Моделирование биологической эволюции: регуляторные генетические системы и кодирование сложности биологической организации
Колчанов Н.А., Суслов В.В., Гунбин К.В.
[Информационный вестник ВОГИС]
© 2010-2017 ICG SB RAS. All rights reserved.