ICG  

Accounting System of Scientific Activity (ASSA)

      

Nikolay Alemasov

Is not an employee of the Institute
Department: Laboratory of Computer-Assisted Proteomics
Room: 1330
Email: alemasov@bionet.nsc.ru
Work phone: +7 (383) 363-49-63*1330


Publications

2022 Computer analysis of the relation between hydrogen bond stability in SOD1 mutants and the survival time of amyotrophic lateral sclerosis patients
Alemasov, N. A., Timofeev, V. S., Ivanisenko, N. V., Kolchanov, N. A., & Ivanisenko, V. A.
[J MOL GRAPH MODEL]
2021 Correlation of Metabolic Profiles of Plasma and Cerebrospinal Fluid of High-Grade Glioma Patients
A. D. Rogachev, N. A. Alemasov, V. A. Ivanisenko, N. V. Ivanisenko, E. V. Gaisler, O. S. Oleshko, S. V. Cheresiz, S. V. Mishinov, V. V. Stupak, A. G. Pokrovsky
[Metabolites]
2020 Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain.
Anna S. Pavlova, Georgii D. Ozhegov, Georgij P. Arapidi, Ivan O. Butenko, Eduard S. Fomin, Nikolai A. Alemasov, Dmitry A. Afonnikov, Dina R. Yarullina, Vadim T. Ivanov, Vadim M. Govorun, Airat R. Kayumov
[PROTEIN J]
Learning the changes of barnase mutants thermostability from structural fluctuations obtained using anisotropic network modeling
Nikolay A.Alemasov, Nikita V. Ivanisenko, Vladimir A.Ivanisenko
[J MOL GRAPH MODEL]
2019 Improved regression model to predict an impact of SOD1 mutations on ALS patients survival time based on analysis of hydrogen bond stability
Nikolay A.Alemasov, Nikita V. Ivanisenko, Bhupesh Taneja, Vibha Taneja, Srinivasan Ramachandran, Vladimir A. Ivanisenko
[J MOL GRAPH MODEL]
2018 Molecular mechanisms underlying the impact of mutations in SOD1 on its conformational properties associated with amyotrophic lateral sclerosis as revealed with molecular modelling
Nikolay A. Alemasov, Nikita V. Ivanisenko, Srinivasan Ramachandran, Vladimir A. Ivanisenko
[BMC STRUCT BIOL]
Компьютерное предсказание патогенных свойств мутантов белка SOD1, ассоциированных с боковым амиотрофическим склерозом
Алемасов Н.А., Иваниесенко Н.В., Иванисенко В.А.
[Международный журнал гуманитарных и естественных наук]
2017 Regression model for predicting pathogenic properties of SOD1 mutants based on the analysis of conformational stability and conservation of hydrogen bonds.
Alemasov N. A., Ivanisenko N. V., Ivanisenko V. A.
[J MOL GRAPH MODEL]
2016 Dynamic properties of SOD1 mutants can predict survival time of patients carrying familial amyotrophic lateral sclerosis
Nikolay A. Alemasova, Nikita V. Ivanisenko, Sergey P. Medvedev, Suren M. Zakian, Nikolay A. Kolchanov & Vladimir A. Ivanisenko
[Journal Of Biomolecular Structure & Dynamics]
2015 Interaction sorting method for molecular dynamics on multi-core SIMD CPU architecture
Matvienko S., Alemasov N., and Fomin E.
[Journal of Bioinformatics and Computational Biology]
Structural and dynamic properties of mutant SOD1 proteins associated with amyotrophic lateral sclerosis
Alemasov, N. A., Ivanisenko, N. V., Ivanisenko, V. A.
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
2014 Molecular dynamics simulations of the Nip7 proteins from the marine deep- and shallow-water Pyrococcus species
Kirill E Medvedev, Nikolay A Alemasov, Yuri N Vorobjev, Elena V Boldyreva, Nikolay A Kolchanov, Dmitry A Afonnikov
[BMC STRUCT BIOL]
Структурные и динамические особенности мутантов белка SOD1, ассоциированных с боковым амиотрофическим склерозом
Алемасов Н.А., Иванисенко Н.В., Иванисенко В.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
2012 A Study of the Thermal Stability of Mutant Barnase Protein Variants with MOLKERN Software
E.S. Fomin, N.A. Alemasov
[Russian Journal of Genetics: Applied Research]
Исследование термостабильности мутантных форм белка барназы с использованием программного комплекса MOLKERN
Фомин Э.С., Алемасов Н.А.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
Компьютерные методы исследования термостабильности белков и их применение в биологии
Алемасов Н.А., Фомин Э.С.
[Vavilov journal of genetics and breeding]
Программный комплекс L-MOLKERN для расчетов разностей свободных энергий с учетом эффектов перераспределения заряда
Фомин Э.С., Алемасов Н.А.
[Mathematical Biology & Bioinformatics]
2010 Эффективная реализация алгоритма расчёта ближних невалентных взаимодействий на процессоре PowerXCell8i
Алемасов Н.А., Фомин Э.С.
[Вычислительные технологии]
2009 Implementation of a Non-bonded Interaction Calculation Algorithm for the Cell Architecture
Fomin E.S., Alemasov N.A.
[Lect Notes Comput Sci]
2006 Библиотека программных компонент MOLKERN для построения программ молекулярного моделирования
Фомин Э.С., Алемасов Н.А., Чирцов А.С., Фомин А.Э.
[BIOPHYSICS]
© 2010-2024 ICG SB RAS. All rights reserved.